BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-271B14
Chromosome5 (Build37)
Map Location 95,198,106 - 95,347,293
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665499, LOC624698, LOC100041179
Upstream geneLOC666081, EG665802, LOC100040408, LOC100040981, EG622719, LOC100041003, BC061212, EG622744, LOC100041032, LOC100041042, LOC624421, AA792892, LOC665521, LOC665551, LOC100041102, LOC665560, LOC100041115, LOC624507, LOC621203, LOC100041153
Downstream geneLOC624655, LOC100041166, LOC665469, LOC622894, EG666121, LOC666125, EG666133, LOC100041296, LOC100041253, LOC100041264, EG624049, EG666159, LOC666164, EG666169, D5Ertd577e, LOC100041354, LOC100040503, LOC666187, EG622731, LOC100041380, EG666203, EG666209, LOC665943, LOC433921
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-271B14.bB6Ng01-271B14.g
ACCGA073271GA073272
length1,1661,154
definitionB6Ng01-271B14.b B6Ng01-271B14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,198,106 - 95,199,264)(95,346,142 - 95,347,293)
sequence
gaattcttaaagttagatattttattctactcagacaagaggaacgaaat
ctaaaaaagaacccatgtactatgtattcacttaatattacagtgaagaa
caaaaagtgtacaagtccatgacaaaggatctagctaatctgtcctggca
gagtccactcataccatccaagttgtctttatcactccacaaggcaccta
accgcacagtctgttccccatgtcaagctcagcctccaaggtcccaatta
ctgttcatccttttctttccaagcatctgtacactgcctaaagtcacagt
ctctgagcaccccagatgagaggtatgtcccaaacctgtcattgattcac
atgtagaaattctgtatccatgttcaccgctagcaaaagcaaagtctggc
tctcttgccatagacacaacactcgccacatttgtggcatacacgtgtag
caaaagagaggcacttgggctgccttattgccctcagtgtatccatgaga
tcctgaaaaattgggcaaatctttctacagcgacatgacccaactcatta
tagcactccagaggggcagggtattgttccgcattcatcttgctccagat
ggctgtgtgctgtaaaaggttctgcaggatgggcatggagaagtcattgt
tgtagaagttgatcttggtgagctgagagcattgtatgagggaaggtagg
agtgcattgagctggtagtccttcatcctacatccctgcaaattcagagt
ctcaagagtttttaaccactttctctaagaaacctctcagaggcctcaca
tccaaaacctgtaagaccacacctttcatctccagatgttttagctgaaa
gagactctgacagcaagagaacgaatccaagtctgactgtgaaatttggt
agtgagtgatggagagggactcccagggtatcatcacgcacctagagata
aatgagaccagatggtttagttcaggcaaaaggtaatggagaacatggag
tggtggttttacacagtcgtcagtgaccaagtgactaagttcagtgtgac
ccaatgaccatagatattatcctgagatgctttctttgagatcagcttag
tcaggtcacaaccccacgactaatcagctcttgcctcagtctcaagccga
aatcctgatttagcac
gaattctcctcctgctggccagggtcttcttcaagtgcaaacaaatgctt
ggtgaatccgtgctccaactctgtagcacagggacccttttagggaagct
ctggcagtgtctcttgaccaaggtacaatctctgggtaaagtttgtggaa
ctctagaggtggtcatgttttatgggaagcataaaggttaagccaaacac
atttatgtacccattggacacactttaaattgtgttacaattagcaatca
tctgtttttgtaataatttctgtcagtaagtgaactaaacataacttcaa
aagggggaagccctatcaggtacaggaagttctatactctataaggatga
aggggagaattgtcacccagtcaccatcagtctttaaggttaatttagtt
agtgtctcctttggggttctatttatcttctctacctggcctgatttctg
gtgtctataagcacatgaaatttccagtcaatccccagaatattagctaa
tctctaacttacctaggacacaaatgtaggtccattatctgaccctataa
acttaaaaaatatatatcttggaagaatttctttgttaccatctgtatag
tttcatgttaattgggaaagtctcaatctatcctggtaagatatctataa
atatcagcaaatgtttgtacccagatttatttggttttatttctgtagag
tccattccctgatagactcttggcttggtgatatgatattgagtatcagg
gtctttctcattgtcaaccacattagttaattgacaggcctcatagttct
taacaatgtcaactggtttcaaattggcatcctctatcattaattatgac
actgagacatgggccagttttggcctagatcacatcttctgactggtcag
agtgtgtgggatctcctgggtctagtgaaatcaaggacatgagaagtcca
aattctagggccatccactggggctgacttctttcccactggttggaatc
tagtcattgacagtgaatgatgccagccttttaggctcctatagaagcct
aagtatgaagagatatccctcttatattttgataatccctcctgggttgg
tgagtaggcctcctttctttataatagccttacagaatggagcgagtagc
aaag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_95198106_95199264
seq2: B6Ng01-271B14.b_43_1208

seq1  GAATTCTTAAAGTTAGATATTTTATTCTACTCAGACAAGAGGAACGAAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAAAGTTAGATATTTTATTCTACTCAGACAAGAGGAACGAAAT  50

seq1  CTAAAAAAGAACCCATGTACTATGTATTCACTTAATATTACAGTGAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAAAAGAACCCATGTACTATGTATTCACTTAATATTACAGTGAAGAA  100

seq1  CAAAAAGTGTACAAGTCCATGACAAAGGATCTAGCTAATCTGTCCTGGCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAAGTGTACAAGTCCATGACAAAGGATCTAGCTAATCTGTCCTGGCA  150

seq1  GAGTCCACTCATACCATCCAAGTTGTCTTTATCACTCCACAAGGCACCTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCCACTCATACCATCCAAGTTGTCTTTATCACTCCACAAGGCACCTA  200

seq1  ACCGCACAGTCTGTTCCCCATGTCAAGCTCAGCCTCCAAGGTCCCAATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGCACAGTCTGTTCCCCATGTCAAGCTCAGCCTCCAAGGTCCCAATTA  250

seq1  CTGTTCATCCTTTTCTTTCCAAGCATCTGTACACTGCCTAAAGTCACAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCATCCTTTTCTTTCCAAGCATCTGTACACTGCCTAAAGTCACAGT  300

seq1  CTCTGAGCACCCCAGATGAGAGGTATGTCCCAAACCTGTCATTGATTCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGCACCCCAGATGAGAGGTATGTCCCAAACCTGTCATTGATTCAC  350

seq1  ATGTAGAAATTCTGTATCCATGTTCACCGCTAGCAAAAGCAAAGTCTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGAAATTCTGTATCCATGTTCACCGCTAGCAAAAGCAAAGTCTGGC  400

seq1  TCTCTTGCCATAGACACAACACTCGCCACATTTGTGGCATACACGTGTAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTGCCATAGACACAACACTCGCCACATTTGTGGCATACACGTGTAG  450

seq1  CAAAAGAGAGGCACTTGGGCTGCCTTATTGCCCTCAGTGTATCCATGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAGAGAGGCACTTGGGCTGCCTTATTGCCCTCAGTGTATCCATGAGA  500

seq1  TCCTGAAAAATTGGGCAAATCTTTCTACAGCGACATGACCCAACTCATTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAAAAATTGGGCAAATCTTTCTACAGCGACATGACCCAACTCATTA  550

seq1  TAGCACTCCAGAGGGGCAGGGTATTGTTCCGCATTCATCTTGCTCCAGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACTCCAGAGGGGCAGGGTATTGTTCCGCATTCATCTTGCTCCAGAT  600

seq1  GGCTGTGTGCTGTAAAAGGTTCTGCAGGATGGGCATGGAGAAGTCATTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGTGTGCTGTAAAAGGTTCTGCAGGATGGGCATGGAGAAGTCATTGT  650

seq1  TGTAGAAGTTGATCTTGGTGAGCTGAGAGCATTGTATGAGGGAAGGTAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAAGTTGATCTTGGTGAGCTGAGAGCATTGTATGAGGGAAGGTAGG  700

seq1  AGTGCATTGAGCTGGTAGTCCTTCATCCTACATCCCTGCAAATTCAGAGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCATTGAGCTGGTAGTCCTTCATCCTACATCCCTGCAAATTCAGAGT  750

seq1  CTCAAGAGTTTTTAACCACTTTCTCTAAGAAACCTCTCAGAGGCCTCACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAGAGTTTTTAACCACTTTCTCTAAGAAACCTCTCAGAGGCCTCACA  800

seq1  TCCAAAACCTGTAAGACCACACCTTTCATCTCCAGATGTTTTAGCTGAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAACCTGTAAGACCACACCTTTCATCTCCAGATGTTTTAGCTGAAA  850

seq1  GAGACTCTGACAGCAAGAGAACGAATCCAAGTCTGACTGTGAAATTTGGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACTCTGACAGCAAGAGAACGAATCCAAGTCTGACTGTGAAATTTGGT  900

seq1  AGTGAGTGATGGAGAGGGACTCCAAGGGTATCATCAGGCACCTAGAGATA  950
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
seq2  AGTGAGTGATGGAGAGGGACTCCCAGGGTATCATCACGCACCTAGAGATA  950

seq1  AATGAGACCAGATGG-TTAGTTCAGGCAAAAGGTAATGGAGAACATGGAG  999
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAGACCAGATGGTTTAGTTCAGGCAAAAGGTAATGGAGAACATGGAG  1000

seq1  T-GTGG-TTTACACAGTCGTCAAGTGACCAAGTGACTAAGTTCAGTGTGA  1047
      | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTTTTACACAGTCGTC-AGTGACCAAGTGACTAAGTTCAGTGTGA  1049

seq1  CCAAATGACCATAGATATTAT-CTGAGATGCTTCCTTTTGAGATCAGCTT  1096
      || |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||
seq2  CCCAATGACCATAGATATTATCCTGAGATGCTTTC-TTTGAGATCAGCTT  1098

seq1  AGTCAAGT--CAAACCCACACCTAATCAG--CTGGCTTCAGTCTCAAGCA  1142
      ||||| ||  ||| |||||  ||||||||  || || |||||||||||| 
seq2  AGTCAGGTCACAACCCCACGACTAATCAGCTCTTGCCTCAGTCTCAAGCC  1148

seq1  GAAAACCT-ATTTAGCAC  1159
      |||| ||| |||||||||
seq2  GAAATCCTGATTTAGCAC  1166

seq1: chr5_95346142_95347293
seq2: B6Ng01-271B14.g_64_1217 (reverse)

seq1  CTTTGCTACT-GCTCATTTCTGTAGGCCTATTTATAAGAAA-GAGGCCTA  48
      |||||||||| ||||  ||||||| | |||||   |||||| ||||||||
seq2  CTTTGCTACTCGCTCCATTCTGTAAGGCTATTATAAAGAAAGGAGGCCTA  50

seq1  CTCACCAACCCAGGAAGGATTATCAAAAATAT-AGA-GGATATCCTCTTC  96
      ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||
seq2  CTCACCAACCCAGGAGGGATTATC-AAAATATAAGAGGGATAT-CTCTTC  98

seq1  ATACTAAGGCTTCTATAGGAGCCTAAAAAGCTGGCCATCATTCACTGTCA  146
      ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  ATACTTAGGCTTCTATAGGAGCCTAAAAGGCTGG-CATCATTCACTGTCA  147

seq1  ATGACTAGATTCCAACCAGTGGGAAAGAAGTCAG-CCCAGTGGATGGCCC  195
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATGACTAGATTCCAACCAGTGGGAAAGAAGTCAGCCCCAGTGGATGGCCC  197

seq1  TAGAATTTGGACTTCTCATGTCCTTGATTTCACTAGACCCAGGAGATCCC  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAATTTGGACTTCTCATGTCCTTGATTTCACTAGACCCAGGAGATCCC  247

seq1  ACACACTCTGACCAGTCAGAAGATGTGATCTAGGCCAAAACTGGCCCATG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTCTGACCAGTCAGAAGATGTGATCTAGGCCAAAACTGGCCCATG  297

seq1  TCTCAGTGTCATAATTAATGATAGAGGATGCCAATTTGAAACCAGTTGAC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGTGTCATAATTAATGATAGAGGATGCCAATTTGAAACCAGTTGAC  347

seq1  ATTGTTAAGAACTATGAGGCCTGTCAATTAACTAATGTGGTTGACAATGA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTAAGAACTATGAGGCCTGTCAATTAACTAATGTGGTTGACAATGA  397

seq1  GAAAGACCCTGATACTCAATATCATATCACCAAGCCAAGAGTCTATCAGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGACCCTGATACTCAATATCATATCACCAAGCCAAGAGTCTATCAGG  447

seq1  GAATGGACTCTACAGAAATAAAACCAAATAAATCTGGGTACAAACATTTG  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGACTCTACAGAAATAAAACCAAATAAATCTGGGTACAAACATTTG  497

seq1  CTGATATTTATAGATATCTTACCAGGATAGATTGAGACTTTCCCAATTAA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATATTTATAGATATCTTACCAGGATAGATTGAGACTTTCCCAATTAA  547

seq1  CATGAAACTATACAGATGGTAACAAAGAAATTCTTCCAAGATATATATTT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAAACTATACAGATGGTAACAAAGAAATTCTTCCAAGATATATATTT  597

seq1  TTTAAGTTTATAGGGTCAGATAATGGACCTACATTTGTGTCCTAGGTAAG  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTTTATAGGGTCAGATAATGGACCTACATTTGTGTCCTAGGTAAG  647

seq1  TTAGAGATTAGCTAATATTCTGGGGATTGACTGGAAATTTCATGTGCTTA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGATTAGCTAATATTCTGGGGATTGACTGGAAATTTCATGTGCTTA  697

seq1  TAGACACCAGAAATCAGGCCAGGTAGAGAAGATAAATAGAACCCCAAAGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACACCAGAAATCAGGCCAGGTAGAGAAGATAAATAGAACCCCAAAGG  747

seq1  AGACACTAACTAAATTAACCTTAAAGACTGATGGTGACTGGGTGACAATT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACTAACTAAATTAACCTTAAAGACTGATGGTGACTGGGTGACAATT  797

seq1  CTCCCCTTCATCCTTATAGAGTATAGAACTTCCTGTACCTGATAGGGCTT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCTTCATCCTTATAGAGTATAGAACTTCCTGTACCTGATAGGGCTT  847

seq1  CCCCCTTTTGAAGTTATGTTTAGTTCACTTACTGACAGAAATTATTACAA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTTTTGAAGTTATGTTTAGTTCACTTACTGACAGAAATTATTACAA  897

seq1  AAACAGATGATTGCTAATTGTAACACAATTTAAAGTGTGTCCAATGGGTA  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGATGATTGCTAATTGTAACACAATTTAAAGTGTGTCCAATGGGTA  947

seq1  CATAAATGTGTTTGGCTTAACCTTTATGCTTCCCATAAAACATGACCACC  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAATGTGTTTGGCTTAACCTTTATGCTTCCCATAAAACATGACCACC  997

seq1  TCTAGAGTTCCACAAACTTTACCCAGAGATTGTACCTTGGTCAAGAGACA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGTTCCACAAACTTTACCCAGAGATTGTACCTTGGTCAAGAGACA  1047

seq1  CTGCCAGAGCTTCCCTAAAAGGGTCCCTGTGCTACAGAGTTGGAGCACGG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAGAGCTTCCCTAAAAGGGTCCCTGTGCTACAGAGTTGGAGCACGG  1097

seq1  ATTCACCAAGCATTTGTTTGCACTTGAAGAAGACCCTGGCCAGCAGGAGG  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACCAAGCATTTGTTTGCACTTGAAGAAGACCCTGGCCAGCAGGAGG  1147

seq1  AGAATTC  1152
      |||||||
seq2  AGAATTC  1154