BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-285L17
Chromosome5 (Build37)
Map Location 126,255,041 - 126,396,597
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem132b, EG231736
Upstream geneDnahc10, Ccdc92, Zfp664, 3110032G18Rik, Ncor2, Scarb1, Ubc, Dhx37, Bri3bp, Aacs
Downstream geneLOC100039178, LOC665760, LOC100040327
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-285L17.bB6Ng01-285L17.g
ACCGA084105GA084106
length893480
definitionB6Ng01-285L17.b B6Ng01-285L17.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,395,706 - 126,396,597)(126,255,041 - 126,255,526)
sequence
gaattcttgggaaaggctcagcccgattgaattataaggtggaaaataca
aatttagaaagccaagtctaatccaaactgaatttacgaagttcacaatc
ttctcttttttcaaaaattcactcaacacccccgtcccaagaagtctacc
tcctggaaagacatatgtgactcattcgcaggccaccttgtcttctatgt
tcagagaaatctttcacagtcaacctgcttcccattcctttcttaatgtt
taaacttttgctgacttaaatggatgaggagcatagcatagatttcagtc
agaagagacctgtacatgaataaaagagaataaagattgtagcccctggg
caagacaattataagagaaaatatgaaaagggaattgttgtgaactaaga
gagcagaagatattggtagccttggtctaaacacatctgaggatgtgagt
agagacaggaacctccccccctaagacttcttccaaccacgtcagagtgc
atttcacgtttctcagtggtagtagctccatgactatgacatagtggatc
acctgtataagcctcgtgattggcttcttcatgttccccagcatcgccct
ctcatataggattgtccctaggcagttgtaaggaccaagcagagcaatag
aggtagctgttgctatagtttccagaacaccaagctgactcatgcaagcc
atggggagaatcagcttcaccaccaatgcccaccccgggtcttgctaaaa
aggggattgtattctggtagctctgattccccagtgagctgctgacacca
ggatcctagcggccctcggtatgtgaactttacgtttaaagacttgcgta
gactctctctctctctctctctctctctctctctctctctctc

agtttgcagcacccacacagcagcttacaaccatctgtaaaccaagtatc
aggggactatgtcctcttctggcttctgcaggtactgcacacatgtggta
cacccccatacatgcaaaggaaacactcataccataatatttttttagat
gaatgatgagagtgggaagttggttttaacatggttatgtcttctctgcc
taacgagctcttattccatgttgtaatctcggtttctattcaaaggaaca
gactgcacactgggattccaaggtcacatacatttttctttgggtcccca
tgctttaagctctgtatcttttcctggtttctttccatccatcatatgtg
gactgaattccatttacttttagtatatgtgcatgcatgtgcatgtgtgt
gtatgtatgtatatgtgtatgcttgtatatgtccatttgtagtatgtgta
tgtgtgtatttttgtgtatgttgtgtgtat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_126395706_126396597
seq2: B6Ng01-285L17.b_44_936 (reverse)

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCTACGCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTCTACGCAA  50

seq1  GTCTTTAAACGT-AAGTTCACATACCGAGGGCCGCTAGGATCCTGGTGTC  99
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTTAAACGTAAAGTTCACATACCGAGGGCCGCTAGGATCCTGGTGTC  100

seq1  AGCAGCTCACTGGGGAATCAGAGCTACCAGAATACAATCCCCTTTTTAGC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGCTCACTGGGGAATCAGAGCTACCAGAATACAATCCCCTTTTTAGC  150

seq1  AAGACCCGGGGTGGGCATTGGTGGTGAAGCTGATTCTCCCCATGGCTTGC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACCCGGGGTGGGCATTGGTGGTGAAGCTGATTCTCCCCATGGCTTGC  200

seq1  ATGAGTCAGCTTGGTGTTCTGGAAACTATAGCAACAGCTACCTCTATTGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGTCAGCTTGGTGTTCTGGAAACTATAGCAACAGCTACCTCTATTGC  250

seq1  TCTGCTTGGTCCTTACAACTGCCTAGGGACAATCCTATATGAGAGGGCGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCTTGGTCCTTACAACTGCCTAGGGACAATCCTATATGAGAGGGCGA  300

seq1  TGCTGGGGAACATGAAGAAGCCAATCACGAGGCTTATACAGGTGATCCAC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGGAACATGAAGAAGCCAATCACGAGGCTTATACAGGTGATCCAC  350

seq1  TATGTCATAGTCATGGAGCTACTACCACTGAGAAACGTGAAATGCACTCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTCATAGTCATGGAGCTACTACCACTGAGAAACGTGAAATGCACTCT  400

seq1  GACGTGGTTGGAAGAAGTCTTAGGGGGGGAGGTTCCTGTCTCTACTCACA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTGGTTGGAAGAAGTCTTAGGGGGGGAGGTTCCTGTCTCTACTCACA  450

seq1  TCCTCAGATGTGTTTAGACCAAGGCTACCAATATCTTCTGCTCTCTTAGT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCAGATGTGTTTAGACCAAGGCTACCAATATCTTCTGCTCTCTTAGT  500

seq1  TCACAACAATTCCCTTTTCATATTTTCTCTTATAATTGTCTTGCCCAGGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAACAATTCCCTTTTCATATTTTCTCTTATAATTGTCTTGCCCAGGG  550

seq1  GCTACAATCTTTATTCTCTTTTATTCATGTACAGGTCTCTTCTGACTGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACAATCTTTATTCTCTTTTATTCATGTACAGGTCTCTTCTGACTGAA  600

seq1  ATCTATGCTATGCTCCTCATCCATTTAAGTCAGCAAAAGTTTAAACATTA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATGCTATGCTCCTCATCCATTTAAGTCAGCAAAAGTTTAAACATTA  650

seq1  AGAAAGGAATGGGAAGCAGGTTGACTGTGAAAGATTTCTCTGAACATAGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGAATGGGAAGCAGGTTGACTGTGAAAGATTTCTCTGAACATAGA  700

seq1  AGACAAGGTGGCCTGCGAATGAGTCACATATGTCTTTCCAGGAGGTAGAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGGTGGCCTGCGAATGAGTCACATATGTCTTTCCAGGAGGTAGAC  750

seq1  TTCTTGGGACGGGGGTGTTGAGTGAATTTTTGAAAAAAGAGAAGATTGTG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTGGGACGGGGGTGTTGAGTGAATTTTTGAAAAAAGAGAAGATTGTG  800

seq1  AACTTCGTAAATTCAGTTTGGATTAGACTTGGCTTTCTAAATTTGTATTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCGTAAATTCAGTTTGGATTAGACTTGGCTTTCTAAATTTGTATTT  850

seq1  TCCACCTTATAATTCAATCGGGCTGAGCCTTTCCCAAGAATTC  892
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTTATAATTCAATCGGGCTGAGCCTTTCCCAAGAATTC  893


seq1: chr5_126255041_126255526
seq2: B6Ng01-285L17.g_70_555

seq1  GAATTCAGTTTGCAGCACCCACACAGCAGCTTACAACCATCTGTAAACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTTTGCAGCACCCACACAGCAGCTTACAACCATCTGTAAACCA  50

seq1  AGTATCAGGGGACTATGTCCTCTTCTGGCTTCTGCAGGTACTGCACACAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCAGGGGACTATGTCCTCTTCTGGCTTCTGCAGGTACTGCACACAT  100

seq1  GTGGTACACCCCCATACATGCAAAGGAAACACTCATACCATAATATTTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTACACCCCCATACATGCAAAGGAAACACTCATACCATAATATTTTT  150

seq1  TTAGATGAATGATGAGAGTGGGAAGTTGGTTTTAACATGGTTATGTCTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGAATGATGAGAGTGGGAAGTTGGTTTTAACATGGTTATGTCTTC  200

seq1  TCTGCCTAACGAGCTCTTATTCCATGTTGTAATCTCGGTTTCTATTCAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTAACGAGCTCTTATTCCATGTTGTAATCTCGGTTTCTATTCAAA  250

seq1  GGAACAGACTGCACACTGGGATTCCAAGGTCACATACATTTTTCTTTGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACAGACTGCACACTGGGATTCCAAGGTCACATACATTTTTCTTTGGG  300

seq1  TCCCCATGCTTTAAGCTCTGTATCTTTTCCTGGTTTCTTTCCATCCATCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCATGCTTTAAGCTCTGTATCTTTTCCTGGTTTCTTTCCATCCATCA  350

seq1  TATGTGGACTGAATTCCATTTACTTTTAGTATATGTGCATGCATGTGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGACTGAATTCCATTTACTTTTAGTATATGTGCATGCATGTGCAT  400

seq1  GTGTGTGTATGTATGTATATGTGTATGCTTGTATATGTCCATTTGTAGTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTATGTATGTATATGTGTATGCTTGTATATGTCCATTTGTAGTA  450

seq1  TGTGTATGTGTGTATTTTTGTGTATGTTGTGTGTAT  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGTGTGTATTTTTGTGTATGTTGTGTGTAT  486


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |