BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-307M16
Chromosome5 (Build37)
Map Location 79,031,231 - 79,197,590
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC669227, LOC100039398, Mthfr-ps1, EG384187
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-307M16.bB6Ng01-307M16.g
ACCGA100469GA100470
length1,0371,093
definitionB6Ng01-307M16.b B6Ng01-307M16.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,031,231 - 79,032,061)(79,196,503 - 79,197,590)
sequence
gaattctctgtgtttaagtttattagtgaatgttcaaaaataatttctgt
taagattttttgctaggctttgtatttacatttaatttatactaagctag
tttagataccagttatatagtttcttagaaaactttttcagagcagcttt
gagaagttaaaaaatgagcaaaagtgattaactcaaaattgggtatgaat
tttattttgtatgtagaatattgttgtccttgaatagcttctgaagttaa
ggtttttgttagctatcttctgttgtttccctgaaaattcagtgaataag
aatgtgagagatttttgttttgttttcttttccttttctttttttattag
ttattttatttacttacattctgaatgttgtcccctcgctgacttctcct
ccctgagatcttcaccccatccctccttcactttgtttctgagagggtgc
tcctccacccactccttcctccctcctctaacatcccccctttcctgggg
catcaagtttctacaggattaagctatgcctttcccattaaggtcagaca
aggcagtcctctgtttacatatgtagcaggggctacagagcagcagtgca
catggttgccttcctgacttagcctctggtacctctgagaggtctggtta
tttaatacttttgttcttcctatggggatgcaatgcccttcacctcctcc
agtcctttctctaactcttttataggggcccctgacctcagtccaatggt
tgcctgtaactatctgcctctgtctcttacagctgctgctagaggctctc
ataggacaactatgctaggctgctgtctgaaagttcatggcatcattaag
agtgtcagtttggtgcctgcccatggaatgaatcccaagttgggccagtc
tcttgatagcctttcccacagtctttgctccatttctgtcccttcatttt
ttttttttttaaagacaggagcaattcttgggttatattttgagatgagt
acatgacctcattcctcaactgtgggccatgtctttt
gaattcaggctggttcataattgtctcctggataggaagaacttaaacta
caagaaaatcatgtgtaagctgctcatggataaagggcttatttggaatt
gacctactgtgattcctatgaagcaggcattgaatctgcaaggtgagtta
tgccccttggcgtaatagtggttttatttttgtggggtcaaaagaacaat
ttgttctctagatttgaggccgtcatttatctgaggaaaaatacatgcct
gatactgtacatatggctggcaaataaacaagagcaggggtggttcttga
tgcaaatgaagaacttattattgaaggggaaaaatgttattctctagaga
tcataaaattattgcagccataaattcacaacaactctggtgacccacag
aagaagtctattcagaactggtcattaaagcaggaagggttctcagagtc
ctagctattgaggaagacaataaatcacagttgtacaccattgggctcca
atggatatctccaaaccaatagttgcaggaaaggacctgctttaattcag
tgtgtaccaaaacaacaacaatagcaacaacagcaacaacaaaatagata
agaacataaaagttatttgtggttaaggagtgattgacaagagtagtagg
aaggtggtagttgaaggtgagcagtatatattatgtgcatatgtaaaatc
atgtaagagcaaatttaattactcataaaataacttatgccttgattttc
aactctttataagctcgtatactcaatgatgaagaatccacaatttattt
tccttttcctgtaaatgtaacatttatttaccatatgtaattgtcatctt
agaggcttacttctagataagcacactcttttcttagttctttctgaact
ctaagttattctgaacataaatccctctataagctgactgggttaactgg
gtttctctgagcttcctgaatgaattgttctgtgtagaaaaaccgtatct
gaattccgtgaacctcaactgcactgatacatttgacctgaaactcagtt
ctctgcatttcctgagctcagtcaaactgcccttactcagctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_79031231_79032061
seq2: B6Ng01-307M16.b_44_874

seq1  GAATTCTCTGTGTTTAAGTTTATTAGTGAATGTTCAAAAATAATTTCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGTGTTTAAGTTTATTAGTGAATGTTCAAAAATAATTTCTGT  50

seq1  TAAGATTTTTTGCTAGGCTTTGTATTTACATTTAATTTATACTAAGCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGATTTTTTGCTAGGCTTTGTATTTACATTTAATTTATACTAAGCTAG  100

seq1  TTTAGATACCAGTTATATAGTTTCTTAGAAAACTTTTTCAGAGCAGCTTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATACCAGTTATATAGTTTCTTAGAAAACTTTTTCAGAGCAGCTTT  150

seq1  GAGAAGTTAAAAAATGAGCAAAAGTGATTAACTCAAAATTGGGTATGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGTTAAAAAATGAGCAAAAGTGATTAACTCAAAATTGGGTATGAAT  200

seq1  TTTATTTTGTATGTAGAATATTGTTGTCCTTGAATAGCTTCTGAAGTTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTGTATGTAGAATATTGTTGTCCTTGAATAGCTTCTGAAGTTAA  250

seq1  GGTTTTTGTTAGCTATCTTCTGTTGTTTCCCTGAAAATTCAGTGAATAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTGTTAGCTATCTTCTGTTGTTTCCCTGAAAATTCAGTGAATAAG  300

seq1  AATGTGAGAGATTTTTGTTTTGTTTTCTTTTCCTTTTCTTTTTTTATTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGAGAGATTTTTGTTTTGTTTTCTTTTCCTTTTCTTTTTTTATTAG  350

seq1  TTATTTTATTTACTTACATTCTGAATGTTGTCCCCTCGCTGACTTCTCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTATTTACTTACATTCTGAATGTTGTCCCCTCGCTGACTTCTCCT  400

seq1  CCCTGAGATCTTCACCCCATCCCTCCTTCACTTTGTTTCTGAGAGGGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGATCTTCACCCCATCCCTCCTTCACTTTGTTTCTGAGAGGGTGC  450

seq1  TCCTCCACCCACTCCTTCCTCCCTCCTCTAACATCCCCCCTTTCCTGGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCACCCACTCCTTCCTCCCTCCTCTAACATCCCCCCTTTCCTGGGG  500

seq1  CATCAAGTTTCTACAGGATTAAGCTATGCCTTTCCCATTAAGGTCAGACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAAGTTTCTACAGGATTAAGCTATGCCTTTCCCATTAAGGTCAGACA  550

seq1  AGGCAGTCCTCTGTTTACATATGTAGCAGGGGCTACAGAGCAGCAGTGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGTCCTCTGTTTACATATGTAGCAGGGGCTACAGAGCAGCAGTGCA  600

seq1  CATGGTTGCCTTCCTGACTTAGCCTCTGGTACCTCTGAGAGGTCTGGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTGCCTTCCTGACTTAGCCTCTGGTACCTCTGAGAGGTCTGGTTA  650

seq1  TTTAATACTTTTGTTCTTCCTATGGGGATGCAATGCCCTTCACCTCCTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATACTTTTGTTCTTCCTATGGGGATGCAATGCCCTTCACCTCCTCC  700

seq1  AGTCCTTTCTCTAACTCTTTTATAGGGGCCCCTGACCTCAGTCCAATGGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTTTCTCTAACTCTTTTATAGGGGCCCCTGACCTCAGTCCAATGGT  750

seq1  TGCCTGTAACTATCTGCCTCTGTCTCTTACAGCTGCTGCTAGAGGCTCTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTGTAACTATCTGCCTCTGTCTCTTACAGCTGCTGCTAGAGGCTCTC  800

seq1  ATAGGACAACTATGCTAGGCTGCTGTCTGAA  831
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACAACTATGCTAGGCTGCTGTCTGAA  831

seq1: chr5_79196503_79197590
seq2: B6Ng01-307M16.g_66_1158 (reverse)

seq1  CAGCTGAGTAAGGGCAGTTTGACTGAGCTCAGGAAATGCAGAGGATTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||
seq2  CAGCTGAGTAAGGGCAGTTTGACTGAGCTCAGGAAATGCAGAGAA--CTG  48

seq1  AG-TTCAGGTC-AATGTATTCAGTGCAGTTGA-GTTCACGGAATTCAGAT  97
      || |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AGTTTCAGGTCAAATGTA-TCAGTGCAGTTGAGGTTCACGGAATTCAGAT  97

seq1  ACGG-TTTTCTACACAGAACAATTCATTCA-GAAGCTCAGAGAAACCAGT  145
      |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   
seq2  ACGGTTTTTCTACACAGAACAATTCATTCAGGAAGCTCAGAGAAACCCAG  147

seq1  TTAAACCAGTCAGCTTATAGAGGGATTTATG-TCAGAATAACTTAGAGTT  194
      |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTAACCCAGTCAGCTTATAGAGGGATTTATGTTCAGAATAACTTAGAGTT  197

seq1  CAGAAAGAACTA--GAAAGAGTGTGCTTATCTAGAAGTAAGCCTCTAAGA  242
      ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAAAGAACTAAGAAAAGAGTGTGCTTATCTAGAAGTAAGCCTCTAAGA  247

seq1  TGACAATTACATATGGTAAATAAATGTTACATTTACAGGAAAAGGAAAAT  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAATTACATATGGTAAATAAATGTTACATTTACAGGAAAAGGAAAAT  297

seq1  AAATTGTGGATTCTTCATCATTGAGTATACGAGCTTATAAAGAGTTGAAA  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTGTGGATTCTTCATCATTGAGTATACGAGCTTATAAAGAGTTGAAA  347

seq1  ATCAAGGCATAAGTTATTTTATGAGTAATTAAATTTGCTCTTACATGATT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGCATAAGTTATTTTATGAGTAATTAAATTTGCTCTTACATGATT  397

seq1  TTACATATGCACATAATATATACTGCTCACCTTCAACTACCACCTTCCTA  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATATGCACATAATATATACTGCTCACCTTCAACTACCACCTTCCTA  447

seq1  CTACTCTTGTCAATCACTCCTTAACCACAAATAACTTTTATGTTCTTATC  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTCTTGTCAATCACTCCTTAACCACAAATAACTTTTATGTTCTTATC  497

seq1  TATTTTGTTGTTGCTGTTGTTGCTATTGTTGTTGTTTTGGTACACACTGA  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGTTGTTGCTGTTGTTGCTATTGTTGTTGTTTTGGTACACACTGA  547

seq1  ATTAAAGCAGGTCCTTTCCTGCAACTATTGGTTTGGAGATATCCATTGGA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGCAGGTCCTTTCCTGCAACTATTGGTTTGGAGATATCCATTGGA  597

seq1  GCCCAATGGTGTACAACTGTGATTTATTGTCTTCCTCAATAGCTAGGACT  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAATGGTGTACAACTGTGATTTATTGTCTTCCTCAATAGCTAGGACT  647

seq1  CTGAGAACCCTTCCTGCTTTAATGACCAGTTCTGAATAGACTTCTTCTGT  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGAACCCTTCCTGCTTTAATGACCAGTTCTGAATAGACTTCTTCTGT  697

seq1  GGGTCACCAGAGTTGTTGTGAATTTATGGCTGCAATAATTTTATGATCTC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCACCAGAGTTGTTGTGAATTTATGGCTGCAATAATTTTATGATCTC  747

seq1  TAGAGAATAACATTTTTCCCCTTCAATAATAAGTTCTTCATTTGCATCAA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGAATAACATTTTTCCCCTTCAATAATAAGTTCTTCATTTGCATCAA  797

seq1  GAACCACCCCTGCTCTTGTTTATTTGCCAGCCATATGTACAGTATCAGGC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACCACCCCTGCTCTTGTTTATTTGCCAGCCATATGTACAGTATCAGGC  847

seq1  ATGTATTTTTCCTCAGATAAATGACGGCCTCAAATCTAGAGAACAAATTG  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATTTTTCCTCAGATAAATGACGGCCTCAAATCTAGAGAACAAATTG  897

seq1  TTCTTTTGACCCCACAAAAATAAAACCACTATTACGCCAAGGGGCATAAC  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTGACCCCACAAAAATAAAACCACTATTACGCCAAGGGGCATAAC  947

seq1  TCACCTTGCAGATTCAATGCCTGCTTCATAGGAATCACAGTAGGTCAATT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCTTGCAGATTCAATGCCTGCTTCATAGGAATCACAGTAGGTCAATT  997

seq1  CCAAATAAGCCCTTTATCCATGAGCAGCTTACACATGATTTTCTTGTAGT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAATAAGCCCTTTATCCATGAGCAGCTTACACATGATTTTCTTGTAGT  1047

seq1  TTAAGTTCTTCCTATCCAGGAGACAATTATGAACCAGCCTGAATTC  1088
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTCTTCCTATCCAGGAGACAATTATGAACCAGCCTGAATTC  1093