BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-049H10.T7 (MSMg01no049_h10.b1) | MSMg01-049H10.TJ (MSMg01no049_h10.g1) |
ACC | AG278908 | AG278909 |
length | 1,272 | 1,313 |
length of high quality (start - end) | 597 (28 - 624) | 486 (72 - 557) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h10.b1 PHD_FILE: MSMg01no049_h10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no049_h10.g1 PHD_FILE: MSMg01no049_h10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:11:30 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNAACAGTGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTT
TGTTCAGCTCTGAGTCCTATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTTCTGGAG
TCCACCTTCTTGAGTAATCTACATATATTGGATATTAGTCACCTATCTGA
TTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATTTGTTGGTGGTCTTTTTGTCT
TATTGATGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAGCTTTGCAACTTTATGAGGTCC
CATTTGTCAATTCTTGATCTTAGAGCACAAGCCATTGCTGTTCTATTCAG
GAATTTTTCCCCTGTACCTATATCTTCGAGGCTTTTCCCTACTTTCTCCT
CTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGGAGTTCCTTAATCCACTCT
AGTATTGACCTTACTTAGTACAAGGAGATAGGAACGGATCAATTTGCATT
CTTCTATATGATAACTGCCAGTTTTGCCAGCACCATTTGTTGAAAATGCT
GTCTTTTTTTCCACTGCATGGTTTTAGCTCGCTTGTCAACGATCAATTGA
CCATAGGTGTGTGGGTTCGTCTCTGGGTCTACAATTCCACTTTTAATGGC
AATGAAATGTACCACATTTCTCAAGTGACTGCAAGTACTAATATTGAATT
TTGAACTTTTCTCTTTCTCTCATAAAGCATTCTAGCTTCAACTGATGTTA
ATCCATACTATTTTAAATAGTATTACATCTAAAGTATTTTCTCCAACAAT
AATTAAGTTCTTTTTTCTTTTCTACAATTAGTGACCATGACTTATTCATA
TAAAAACGCCTCCATTCTGTATTCCTCCTTAATTAATAGCACTTTGTACC
TATATTTATTTTTTCTATAACTCTAAGATAATTTTTAATTTCTGCATTGT
AAATAACCTGTAATTTTTTACCCCATGTTTTTGCTTTCTTCCTTGTGATT
TACTTCTAAATGGTCACTAGCCCAATCTGTTCTTCCGTAAAAAGGTTTAA
TAATCATTGCTCTAATCTCATCTTAACCATTTTAATTCTCCTATACTTAA
CTTGTCTCCTCATGCTTCTTTTAACAATTAAAATATCGGCATTATTCTAT
TTTTCCCCAAATTTATTTCACACCCCTTCAACTGTTTTTTGTCTCTCTCT
AATCTTCACCTTTTATCAACCTCTTTTTTGTCTGTATATCTTTCTACCCA
CTCTTTATTTCCTTTTCTCTTCTTTATGCAACATTCTCTATTTTTCTCTT
CTATTTCTCTTCCTTTGTTATT
| TTTTTATGAAGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCAGAAATTTTTGAGAAGGTATTATGT
AAGTTGTTTTTATAGAATTTTTTTGCTTATTTATTCTTTGAATAGATTTT
GTACCTCTAATATTTTAAGCCATAGATAAAAGGGCCTTAATAGGGAACCA
TGAAACATTTGGGAAATGTTTTCTATTAGAAATTATTTTTAGTGTTTAAA
ATAGAATTCCTTCTTTCTACAGGATTATAATATTGTGATTCTTTTGTTTT
GTTTTTTTTTTTAGTTGGTATTTTCACAATCTTAATGACCATCCAGATGT
CTCTGTGGGCACGAAAGAAGCATAAAATATATCGGAAGAAGTTCAACTCA
TATGTTCATAGGAAATCAGCCATAATTCCACTCATCTTATAAGTAAATAT
AGCTATTCTAATCTGAGCAAGAAGTGCAGAATATAAATTCACTCAAAAAG
GCTTAGGAAGTGCTTACCTATTATAATGCAACAATTGTTTAATAACAATA
TATTAATGAACTTGAAAGCAGATTTCACTAAATTTCTGTTATGGACTAGA
CGTAACAAAAAGCAGGAATTAATCTAAGCCTGAGAACTCACCTCTGATTA
CCAGCATATTGAAAGTTGAGTCAGCACGATTCCCTTGAGTGAGAGTCCAT
ACAAGTTTATGATGGATCGGCTTTATTACTATGAGAATGCAACCAATTAA
GATGATTTTATTAATACAAGCTTTAAAATTTCGTCTAATTATTTGCAAGC
ACTTGATCACCAAAATAGTCTTTTTGCTTTAATATGTCATACCATATTTG
TTCGTATTTATCTAATTAAACTGACTGTGTTTCCGGTCTTGTCCCCTTAA
TTTATGCTCTACTTTTTTCCTGTGCTTCTTTCCCAACCTTCCTTATTCTC
TTTTCCCTTTTTAAATAACTCTCTTATCTTCTTCTCTTTAAGATTTTTAT
TTACATTCTTTTCATTTGAATATTGCACTTTTATTATTCTTAACTGACAT
TCTTTACCTTTCTTAATCTTACTCTCTTTAACTTTTTAATCTTTCTCCTT
CTCTTGCATGATTATTGTCTATCTCTCATTCTTACTCAATTATCACATAT
TTATTGTTTGATTGTTTTTCCCCCCNTATTGGTATTTTATTAANTATTTA
TATATATGCAACTCATTCCCCTGATGTAACATCTTGTTCAGCTATCATCG
TGTAACTACTCCTTTCTGTCTTGTCCTTAACTTCACACTGCTCTAAANAT
GATACTTTTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 3 0 3 0 3 11 11 15 15 12 10 10 8 8 8 12 15 9 8 8 8 8 8 15 21 43 37 37 42 42 42 48 48 43 47 43 43 43 39 42 47 47 53 50 50 50
50 50 35 35 30 28 28 30 33 33 33 22 21 11 10 6 8 6 6 6 13 24 37 29 33 30 30 30 37 59 59 36 36 36 36 38 42 57 57 57 57 53 53 53 50 50 50 53 51 51
51 51 43 30 34 24 32 37 42 42 48 48 43 41 41 41 30 23 19 13 13 13 14 19 27 40 50 51 51 68 57 57 57 57 57 50 50 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 68 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 47 39 39 39 43 21
14 8 8 8 8 21 34 59 59 35 43 39 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 43 17 17 17 38 38 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 44 44 31 31 23 43 20 23 20 41 38 52 52 57 57 68 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 34 34 15 12 12 12
12 13 14 26 32 59 59 68 59 59 59 57 57 44 38 24 15 15 10 10 11 29 29 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 59 50 50 50 37 37 42 50 48 57 54 30 32 16 21 32 38
44 34 34 15 13 13 34 34 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 54 44 43 41 39 42 19 21 10 8 8 19 26 19 12 10 10 10 23 34 34 34 12 12 12 11 21 22
28 32 23 26 19 24 29 37 31 20 20 15 19 10 10 14 27 27 32 28 21 23 15 22 22 16 10 11 11 18 17 18 13 19 21 39 39 43 28 23 12 9 12 12 24 23 22 12 12 19
28 34 57 43 43 43 43 43 48 39 39 36 36 23 22 10 7 6 10 10 16 14 12 10 8 8 8 10 21 31 33 33 30 22 12 12 12 19 15 12 8 8 8 13 10 11 10 17 12 9
8 8 8 8 9 9 16 13 19 16 11 11 17 16 13 15 13 16 21 21 22 28 29 27 21 10 11 11 11 11 13 18 15 15 10 10 15 17 17 16 24 23 26 24 24 21 12 8 8 8
8 8 13 19 28 28 15 8 8 10 11 10 9 9 9 10 11 10 10 10 10 10 10 15 20 23 28 26 22 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 9 11 15 15 15 14 10 10 9 10
10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 15 12 10 9 9 9 10 10 8 8 8 10 9 10 8 13 13 8 6 6 9 10 16 11 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 16 13 12 8 8 8 10 8 8 8 6 6 7 12 12 9 8 8 6 6 8 8 10 17 28 13 12 12 19 13 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6
6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 15 16 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 10 11 12 15 15 11 11 11 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10
8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 9 8 10 8 10 8 8 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10
8 8 8 8 6 6 11 8 8 8 6 7 8 8 10 9 10 9 8 10 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 11 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 10 7 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 12 16 12 12 11 11 9 9 10 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 6 6 6 6 8 8 12 8 10 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 8 8 8 8 8 7 7 10 6 9 10
8 8 6 8 8 8 10 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 6 8 8 7 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6
8 10 10 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 11 11 8 10 9 9 10 9 9 10 10 11 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 7 7 11 10 12 8 8 6 6 6 6 8 6 11 12 10 9 9 10 10 10 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 7 8 13 15 8 8 8 7 8 9 11 19 19 22 10 10 10 23 21 33 28 28 32 35 36 36 36 37 37 42
47 47 43 43 48 59 59 57 57 68 57 57 54 57 57 46 46 40 40 39 43 43 43 43 54 54 54 54 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 68
68 68 68 68 68 57 48 44 39 39 47 44 57 50 54 54 59 59 68 59 59 44 30 19 14 10 10 19 27 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 59 59 59 57
54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 59 59 43 45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 52
52 57 57 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62
62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 35 35 35 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43
35 43 43 52 43 43 43 45 62 62 38 38 14 14 14 38 38 62 62 62 68 68 68 68 62 59 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 68 59 59 44 44 23 23 23 44 44 39 43 42
44 33 29 29 38 38 43 39 39 43 43 57 43 43 43 23 23 27 38 38 43 43 52 57 52 52 50 43 38 38 43 50 57 50 43 37 39 39 50 43 52 52 52 52 52 52 54 52 57 52
43 27 27 12 11 11 27 27 57 32 25 11 16 16 32 32 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 54 29 29 12 12 14 34 34 57 57 59 59 59 43 41 37 43 43 54 48 59
48 54 44 44 18 18 9 11 8 8 8 8 10 8 24 24 36 30 30 28 40 40 57 57 57 48 48 43 59 47 39 35 35 47 39 43 43 43 43 43 47 47 41 41 47 25 15 8 8 8
8 8 23 24 15 16 10 19 16 16 19 19 15 15 23 23 30 35 39 40 29 24 17 24 23 26 21 21 12 12 12 20 22 27 39 42 32 24 20 9 9 11 25 28 48 48 42 42 42 32
24 13 13 19 19 28 43 30 37 39 35 28 34 25 25 25 28 30 14 13 12 13 11 10 10 15 10 12 18 22 11 9 9 8 8 8 8 8 10 13 18 13 9 8 8 8 8 8 11 11
16 15 18 20 28 25 25 30 26 18 20 14 15 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 12 10 12 12 13 13 11 9 9 10 8 8 8 8 8 10 8 12 14 9 9 9 8
8 6 6 8 6 8 8 12 14 16 9 10 10 10 10 10 11 10 8 8 6 6 8 13 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6
6 8 8 10 10 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 12 9 8 8 7 7 8 8 10 9 9 9 15 12 17 15 11 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 8 9 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 13 14 10 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 11 9
9 9 9 9 11 9 9 9 9 10 9 11 11 11 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8
8 10 12 9 9 10 9 12 18 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 10 10 11 10 10 10 12 12 8 8 6 6 8 12 10 10 9 8 10 10 10 13 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 9 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11 8 8 8 8 6 6 8 6 6 9 8 13 13 10 10 10 9 8 8 8 8 8 11 15 15 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 8 8 10
13 8 8 8 8 11 11 12 11 11 10 11 12 10 8 8 8 8 8 7 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 10 9 9 9 9 9
9 13 13 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 12 15 15 12 11 19 11 11 3 0 3 7 8 6 7 7 7 8 8 10 11 11 8 8 8 8 3 0 3 6 6 10 8 10
6 6 6 6 10 11 9 9 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 8 6 6 6 6 8 8 9 10 8 8 6 6 7 10 8 10 10 8 10 8 8 8 6 8 6 8 6 7 11 8 9
9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 12 10 8 8 9 10 9 9 9 10 10 9 9 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 12 10 9 10 10 10 6 6 8 3 0 3 8
8 8 8 8 8 10 10 12 10 12 15 12 12 |