BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050M08.T7 (MSMg01no050_m08.b1) | MSMg01-050M08.TJ (MSMg01no050_m08.g1) |
ACC | AG279745 | AG279746 |
length | 1,241 | 1,258 |
length of high quality (start - end) | 280 (114 - 393) | 336 (120 - 455) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTCCTTCC
AATTGGGGCCCTTTAAGCCTTCCCAGCTAACCTCTTTGGAGACATCCTCA
CCCTTATATCCCGAAGTGTTTCCATAGTGACTGTAAGTGTATGGAGCTGC
CTATTAAGATTCATTACCACAGCTGGGCAGTGGTGGCGCTCGCCTTCAAT
CCCAACACTTGGGAGGCAGAGGTAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGC
CTGGGCTACAGAGTGAGTTCCAGCACAGCCAGGACTACATAGAGAAACCC
TGTCTCAAAACAAAACAAAACAAAACACAACAAAACAAAACAAAACAAAA
CAAAACACAAACACAAACACCAACACAAACACAAACACAAACAAATTTTA
TCACAAACAAACACAAGAGTCATTACCACAGAGAAGGTTTTGCTGTGTGC
TGGACACCGCATCGGTGGAGAACATCAACATCCTACCACCAGTTTAGTTC
TTGAGTCTTGTCTCGAGTTCAATCTACCCTCCTGGAATCTATTAGTCCAG
CTGCTTGAGCAAACTGATGCTTAATTTAATGGTCAGCTTGATGACCTGTC
CATACCAAGTTGACCTCTGGTATGTCCGCGGCATGCATTGTCTTAACTGT
CCTAATTACTATGTGATCACCTACTCTAATCCTCATTTATATCCTCTGGT
ATCCTGTATAATATAACTTCCCCTTTCCCGTGTCTTCTTGACCTTCTACC
CTTGCTGAACCACTCTTCCCCTCACCCCATCTTTTGTTGCTTTGAACTCC
CTGGCCTCGAAAAAAAATTCAATTTATTTCCCCCTTTCCCCTCGCGTTTT
AAAATTATCCCTTTTTCTACTAAATACTTCATTCCTGTTCCCTATGCTTG
TTATTTCCTCTTTTCTTTCCCCCCAAAATTCTAATTAAACCACTTTCTTC
CTTTCTTTATCTATCTTATTTTGTCTTTTTTACTTACTATATGTTTCTTG
GTTTTTCTCCATGCGTTATCTTTTACCCCTTTCATCTTATCCTTTCTTCC
AACTCTTTCTCAATAACTCTCTCCCCTTCTTATGCTCTCTTCCTTCTTTC
TTATTAACCATATTCAAATATTCTTTTTATTCTTTATTCTCTTTAATTTG
TATCAACTATCTCTCTGCTTACTTACACTTATTCACTATATCTTTCTCAT
CATTTCTCTCACTCTTCTTTTCTTCATACTTTCATCTCTTG
| NTTTAGCATGGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCTCCTTTGGAGAAAAATGGATTGCTATCATGAATAC
AAAGCACCCTTTGACCCCCTCATCACACATGAGATGCATGCCAGAGAAGC
TATGGGTCATGCGAACAGCTGCGTATGGAGTCACTTACACAGCCTGGGAA
CTTTTCCCAGAGGGACGATCCGATCCGAAAGTATGACTAAAACTCATCCT
TTAAGAATTTTAATAATCTTATCAAACAGGTTTTTTTAATTTCTCCTGTA
TTGACATGTTTCTCACCACAGACATTCCAGGAAAGGGGATCTGTACCAAC
TTTCTACATGCATTCATTGTTACCTTTCGTTAAATTAGAATCTTATATTA
TTTATACATGTTCCCTTCATTAGAAGGATTGTTTTGCCCTGCTTCTGCCC
ATCTCTTTGCCCCCCCGACACCCCATGTGTCCCATGCGCAATTGTGCCTT
TTAAACATTTCTAAAAGTCTATCGTGGGGCTTTCCAACCTTCAGATCTCT
TAAAGTATATCAACCCCCTTCCCCAAAAAAATGCTCTCAGAATTAAGTTC
CCTTGCTCTGGGGCAGAAATTTTAGAAAGGTTGTGGGAAAGCAGCATATA
TCCCCCCAATCTGAGACTCTGGTCTTCTTTACTAAATGATAGGGAGGGAG
GCATTTATTATCTAATGAATGCAGCTTGATCGACAAAAGCACTTCCTAAC
ATTGCACCTAAAGAACAAGAGATAAAAGATGCCCATGTAAAGTCCCAACC
CAAATGAAGATGAATTGCTTTGGCATAAGGTAAAATGCCCCTTAGGCACT
GCAAATTCCTTTATTCCCCCAGGAAATGATTTAATCCTCCTTTCTACTCG
GTTGGCCTGTCATTGGTCCCCACATCCTATGGAATATATACGCCCATAAT
TTCATGGCTTTCTTGTCCTTTGCAAGAAATGCTCTAATTTATAAAGGCCC
TAAACGTGGTGAATTATAAACCTCCCCTATTTTGTTTTTCCTAACTATTT
TACTTTCCACTTCCCTACTCCCTGCCATGCTCTTCTTATAATAACCTGCA
TCATATGGGCCTCTTCTCATATCACGATATTGAATGTAATACACTTTCTC
TCAAAACAAATCTCTTCTCTAATGCTTTATAACCCCTTCTCTCCTGGATT
CTTTTCCCATTTTTTTTGTCTATAATCAAACTAATCGTGTCATTTTCTCA
TCTAATTG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 8 9 9 9 13 22 13 10 9 9 9 9 9 9 10 23 19 31 33 31 31 36 32 36 36 42 47 47 47 47 48 34 40 37 36 40 37 37 48 48 59 57 57 41 34 25 24
24 34 26 41 34 26 15 12 9 10 12 15 9 6 6 6 6 8 12 18 28 24 27 25 33 31 31 31 36 36 36 50 50 50 38 38 36 39 39 39 43 43 41 41 33 37 27 23 10 10
10 12 10 10 10 10 12 12 16 15 8 8 8 12 10 32 34 47 50 50 36 43 24 22 16 26 26 34 39 48 48 48 48 48 42 37 37 37 41 42 48 57 48 54 54 54 48 48 47 41
41 41 41 41 36 42 47 47 44 57 42 47 47 47 47 47 57 47 47 47 47 39 42 32 32 22 23 27 33 33 35 42 42 31 31 33 42 42 44 50 57 54 54 57 57 57 48 48 50 44
44 43 35 35 43 43 52 57 44 44 32 23 23 32 44 44 47 35 35 35 43 38 38 43 43 43 43 38 39 43 57 59 59 59 59 57 52 52 44 44 39 39 39 43 43 43 41 39 33 33
43 43 33 24 24 11 11 12 27 27 45 45 57 57 41 41 52 43 43 43 30 32 19 19 15 38 27 37 37 43 43 37 37 37 50 50 52 43 42 43 35 35 35 47 47 52 52 54 57 57
57 50 57 47 50 50 43 43 43 43 43 43 43 43 44 44 44 42 42 35 35 33 35 28 28 24 13 13 13 32 32 48 48 48 47 44 43 43 43 43 43 43 46 46 43 43 43 43 43 47
43 47 46 48 43 43 43 43 43 41 41 30 33 33 39 35 37 25 25 18 19 19 26 21 23 23 28 28 32 30 35 39 39 39 43 32 32 28 11 11 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8
9 9 16 22 25 32 32 34 25 25 28 16 18 17 17 17 20 18 21 11 11 11 23 25 37 32 23 23 23 18 24 18 23 28 28 28 28 28 26 19 18 24 19 19 17 24 28 20 20 18
21 13 12 12 11 11 11 11 11 11 13 16 18 16 16 24 22 26 14 11 8 10 10 12 14 13 20 23 23 28 23 25 12 12 11 23 23 30 30 32 36 42 39 43 46 46 40 40 25 33
36 36 40 30 28 28 28 31 28 32 32 26 26 21 24 16 16 28 24 28 28 16 16 17 24 26 31 48 48 48 57 37 28 19 13 13 13 23 27 24 23 15 23 10 10 10 10 8 8 8
8 8 11 15 21 26 25 12 12 11 12 12 13 12 21 19 10 10 10 10 10 18 26 29 29 20 19 12 10 10 10 13 11 12 12 21 18 31 19 15 10 8 8 8 15 10 10 9 8 8
12 12 21 17 24 17 24 21 23 23 14 19 15 15 13 15 18 18 10 10 10 8 12 13 24 16 16 11 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 10 10 12 12 15 15 11 14 12
16 18 10 9 9 10 9 9 9 20 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 21 21 10 10 10 10 10 9 9 8 8 10 8 8 8 10 12 16 18 18 16 13 14 11 8 8
11 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 13 10 15 15 15 14 16 15 12 10 8 8 8 8 8 10 12 13 17 12 10 9 9 8 8 15 15 18 14 12 12
10 8 8 8 10 11 16 10 10 10 10 10 9 8 10 10 10 10 10 12 10 11 8 10 9 9 10 9 6 6 6 6 8 8 6 9 10 7 6 8 8 9 8 8 11 10 8 8 8 8
10 11 9 8 8 8 11 9 7 10 8 10 10 11 11 11 10 8 8 8 8 8 10 15 9 9 8 8 6 6 8 8 10 15 14 16 10 10 10 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9
9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 10 13 11 8 8 8 9 9 10 10 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10
9 9 9 9 10 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 9 9 13 13 15 15 11 15 10 10 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8
8 8 10 10 7 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 10 11 11 11 11 11 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 10 11 11 11 11 8 8
8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 8 8 6 6 6 8 12 19 11 11 11 11 16 11 13 10 10 8 8 8 10 8 8 10 10 11 13 13 11 12 11 9 8 8 8
8 11 12 8 8 12 10 10 13 14 9 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 11 11 10 9 9 10 9 8 8 8 8 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 15 12 13 8 6
8 8 8 8 8 12 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 8 10 15 10 8 10 10 13 10 9 9 10 8 8 8 10 15 12 9 10 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 6 6
6 8 8 7 9 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 6 6 8 8 8 8 11 9 9 9 9 9 9 10 9 10 9 9 8 10 12 9 9 9 8 6 6 6 8 10 12 12 9 12 9
9 9 16 13 15 10 10 8 10 6 9 10 12 7 7 8 7 7 11 10 12 11 9 9 9 10 9 8 8 10 8 8 7 6 8 6 6 8 8 6 6 | Open.Hide. 0 3 8 6 6 6 6 7 7 10 8 14 8 8 8 8 8 15 9 9 9 8 8 11 9 3 0 3 17 19 19 8 8 11 22 23 28 24 24 35 43 35 36 36 37 37 37 39 39 39
39 50 59 50 50 50 50 50 50 47 31 27 11 8 6 6 6 8 8 11 13 10 12 12 17 18 20 20 23 30 34 47 59 59 59 57 53 53 53 53 53 47 48 48 57 47 53 37 44 37
37 34 36 23 23 9 9 12 13 18 13 19 12 13 20 24 28 30 21 21 15 26 28 48 48 57 44 35 33 17 24 14 28 34 59 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 59 47 46 41 47
47 47 42 46 43 40 43 48 48 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 48 41 42 42 41 41 41 43 43 24 24 12 12 12 32 32 57 48 43 44 39 43 44 57 50 57 50 54 54 57
57 57 57 57 59 57 57 52 59 59 54 57 54 57 57 57 57 57 59 52 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 57 52 52 43 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 27 27 12 16 15 30 32 57 57 59 59 38 23 9 9 9 20 21 54
57 57 59 59 57 43 43 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 46 43 43 43 43 57 57 39 39 32 32 33 42 44 47 48 48 46 46 46 46 48 48 48 48 57 57 48 48 48
48 59 59 59 59 59 54 54 43 44 43 43 43 59 43 46 46 57 48 57 57 57 59 57 59 57 59 48 48 48 59 59 59 43 33 36 28 41 34 47 27 28 11 11 11 27 27 34 26 18
12 12 10 10 9 10 10 23 25 41 46 50 47 48 48 46 46 46 46 34 34 28 23 23 37 34 48 48 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 59 59 48 48 46 46 46 48 47 41 28 15
12 10 11 11 11 11 21 15 16 16 23 9 11 11 12 12 10 10 13 25 32 43 43 43 48 48 48 43 39 39 32 39 37 40 33 15 12 10 10 10 10 12 12 10 10 9 12 12 24 31
40 40 28 16 12 15 22 32 36 48 43 40 36 19 19 13 13 13 18 28 40 44 40 32 25 25 23 23 27 27 44 42 43 43 26 21 10 10 10 13 13 26 30 42 42 57 57 34 34 12
12 11 16 24 32 43 50 50 50 52 52 43 42 35 43 44 52 54 52 57 43 38 38 43 43 43 38 42 43 57 57 52 52 52 57 57 59 57 38 25 10 15 15 24 24 34 39 43 57 57
57 57 57 43 37 37 43 43 43 38 32 29 32 27 27 23 27 36 36 37 52 30 30 14 14 14 30 24 35 35 35 28 28 21 19 15 13 13 21 18 18 24 12 14 14 30 32 50 43 44
43 32 32 21 17 13 13 17 24 35 42 42 42 37 22 22 24 24 32 40 24 22 11 11 11 18 18 31 42 26 30 22 19 18 16 25 25 33 29 25 19 19 20 20 20 28 15 15 13 18
15 26 24 31 37 37 39 34 24 14 14 10 10 10 16 24 24 19 15 12 12 12 12 12 22 24 17 11 11 8 8 8 9 9 9 10 16 13 10 12 10 9 8 8 8 6 6 6 8 8
11 10 13 8 9 10 10 19 15 12 11 10 10 10 13 13 11 11 13 14 17 15 16 17 11 9 9 12 9 11 11 14 14 10 9 9 9 11 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8
8 8 9 10 10 14 13 10 9 9 11 8 8 8 10 8 8 11 12 12 13 8 8 8 8 8 8 9 9 11 10 15 16 11 10 10 8 9 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 10
8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 8 10 8 13 13 13 16 15 10 10 11 11 12 9 9 9 9 10 10 12 14 16 16 17 10 8 8 8 8 8 10 15 13 14 13 12 17 9 9 9
9 9 9 9 9 9 9 10 11 11 11 11 12 13 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 10
10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 16 18 11 11 11 9 9 10 12 10 8 8 6 6 8 8 11 11 9 9 9 9 10 10 8 6 6 6 10 8 15 15 12 12 8 8 8 10 8 8
8 10 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 8 13 13 12 12 12 12 12 15 19 12 11 11 10 10 10 11 17 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 8 10
9 9 9 9 10 8 8 8 6 6 6 7 11 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 6 6 8 10 8 9 12 12 12 8 6 6 8 8 13 12 11 11 13 10 8 8 8
6 6 6 8 8 10 10 11 11 11 10 10 8 8 8 6 6 8 10 9 9 9 10 7 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 14
12 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 10 8 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 10 8 9 8 6 8 6 8 13 15 31 33 34 19 17 9 6 6 6 6 6 7 8 8 10 10 8 8 6 8 8 8 7 7 7 8 9 8 8 7 7 7 10 8 8 8 8 8 8
8 8 10 10 10 12 13 11 |