BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107C04.T7 (MSMg01no107_c04.b1) | MSMg01-107C04.TJ (MSMg01no107_c04.g1) |
ACC | AG321034 | AG321035 |
length | 1,299 | 1,281 |
length of high quality (start - end) | 325 (133 - 457) | 195 (148 - 342) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c04.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_c04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c04.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_c04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:34 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (51,045,433 - 51,045,757) | (51,182,556 - 51,182,750) |
---|
sequence | CATTTTTNNNNCATCATTGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCTCACAGTAGTATGAAACCCTTTACTACCTCTCTATCTTATGA
CAAATTCAGGTCAGTCCCTTTAGGATACCACGCAACATCATACATCCATT
AATTTCTGAGAAGAATTTAAACTCAGGTGGTCCAGCTTGTGAGTTAGTGT
TCTTTATTGCTGTACTGCACTGTATTTACAGTACAAATGACTAAGATAAG
CATTTGTAAATTGTAATAAGGTTATCTATTTGCTCCAGAAGACTGAGTTC
CTACAGGACAAAGACCATGTTACTCATTTTTATACCTGGCATATAGCAGT
TCGGTGCATAGAAGTGCAATAAATAATTCCCAATGAGTGAAATGGGCTTC
GCATTTATATCTAGCTCTTCCATCCCCAGCTTTCCTCTCTATCGCATTAG
TCACCTCTATTTTATGCCGCCCCCCATCTTCCTGTTATCCATGAATACAA
GAAATGCATCTGCTCTGCTAGTTGAAATAGTAGCTAAGACATTTATTGAA
GAAGACTACTAATCCATTTCAATTATTTCCTTTAATGTTACAACACTTAT
GATTCAAAAAGGAATGCCAATTTCCCTAGGACTAGTCGTGCATAATTAAG
ATGGAGTTTGCCTACCCTTATCGCCTTTCTCATGTGGTAGTTCTCCCTTT
CTTTGTCGGAACAACCCCCCCCTCTTCTGTTCTTACTTTTTTCCTTGCAC
AACTAGCAAACTTTCGGTCCACATTTTTTAAAATTACCTTGGTTGTAAAA
CCTCTTCACTATCCCCTTTTAATATTTCCCTTAACTTTTTATCTCCCCTT
CCCCTTTCCTTTATTGGGCATGCTTCTTTATCTTTCATTTCCTTTATCAT
TTTAGTTCCTGGAAATTTTTACTATCTCCTGTTACCCTTTTCTTCTCTCC
AAATATCCCACCGCATATCCTTTTTTAAATCCTCCTTTTTCCTTTAATTG
ATTTGTTAACCCCCCCCCTCTTTTTCTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCATATCTACCCTATTCTCTACTCCTTTTTTGGTCTCCTCTTTCT
TCTCTCTTTTATTTCACTCTCCCTCCCTCTTAAATATATTATTTTTCTCC
TACACTCCCGTATTAGATACCTTTGCTCACTTCCTCAAATCCTTGTCTCA
CACTTCTGCTTCTTCTATGTTAACCTCCGGCATTGACCCTCTTCTGCTTC
TTTGTTCTTACACCACCTTTTGGTTGATTCTCCTTCCCTCTTGTGACAA
| NCCATAAATANNNNNGAAAGATGGTAGGCGGTXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAAGGTCCACCAGNT
AGAAATAAAATACTAATTGTGTCCTTTAAAAGTGGCTATATTTAAGNAAA
ATTTAAAATTCAAAAATAATATGAAAACTGGTCTCTTGTTGTAGCAATGG
GAGTGGGGTTACAAGGAGAGCTAACTCAGAAGAGATACCATTGGTTCTAA
AAATGGCAGACAAGTTAGACATGGGGAAAATCACTATAGATTCAGTAAGG
TCAAGCTGTAGAAAACCAAGATGCAGGCGTACACACTGCCATCCTTAAAG
ACCACTGAAGAAGAAAAAAGAACTGAAATATTCTAACAGCCTAGACTGGA
GAATTTCTCCACCCTTTTTTTTCTTGTCATCTTTGAGATCTCCTGCTAAT
GTGGAGGAAGGACACTTGTTTTTTTCCCCCCCCCCACAAGCTGTATTGTG
AAAAAAAAAAGAAGGGGGGGTATTGTTATTGGACTGCATGTTAATGAAAT
GGATATCCCTAACTCAGTAGGACTACCAAGTTTTATCTGTTTGCTTTAGC
ACATTAATAAAAAATTTTGTGTAATGAATGATTAATATAAACATATTCTG
TATTAATATAATTTTTTTATATTATATTAATAACTAATATTGTATATTTT
TAAAATTTGAAAATATGTTTTTTATATTAATGTGAATAGTCTTGAAAATT
TTTGAATAATAATTTCTTTTTTATTAATAATTATTATATTATTATTGGAT
TTTATGTATTTATTTTATTTATTTTTCTAAATGTAATTTATAAAGATTTA
TTAAAAAATATATATTTAATTTTTTTAAACACAATTATTTATATTTATGT
TATAATTATTTATCTTTTATTATGTATTTTATTTTGTATATTCATATTAT
AATTATCTTCTTTATATCTGTTTTTCTATATTTTTTTATTCTATTGTTAT
TTTAATTTAATATTTATTATTTATTTCTTTATAATTTTATATATATTATA
TTTTTTATTTTTTATTATCAATTTTTAAATTATTGTAATCAATATATAAT
ATAAATGAATTTCTTTTTATTAGTTATTTCTATATTTTTTTTAAGATTTA
ACGTATTTTAATTTTAATGTTTAAATTTTTTCTAATTTATCGTTTTTTTA
TTAACTAATATAATTTATATTAATATCTATTATTAAACATTATATCTATT
GACACTATCTATATTATTAAATATAAGATAT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 9 17 3 0 0 0 0 3 9 6 6 6 7 6 6 8 8 8 8 7 6 6 6 8 13 17 9 8 8 10 12 10 15 15 31 28 28 30 28 33 36 36 34 34 28 28
28 31 31 40 43 37 47 34 34 34 34 24 24 22 16 29 29 33 33 33 41 25 22 8 8 9 12 10 14 12 11 11 11 16 18 15 19 17 19 19 29 32 42 42 47 47 47 48 43 39
35 35 35 43 39 50 50 33 33 33 33 22 21 9 9 9 9 8 8 10 10 9 9 9 9 9 10 11 11 12 11 15 15 21 22 28 39 47 47 53 50 53 50 53 53 50 50 50 50 50
50 50 50 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 47 47 46 39 39 46 46 48 57 57 43 43 37 37 39 42 39 57 57 57 57 57 57 57 57 37 37 37 39 44 42 44 57 44 39 43 42
44 44 46 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 52 52 52 57 57 57 50 43 35 35 42 42 43 37 42 43 52 52 52 52 52 43 43 28 43 43 50 50 52 57
52 52 57 57 57 47 47 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 45 43 43 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 59 57 39 32 38 38 38 52 52 52 52 57 59 57 57 52 57 57 57 57
52 44 43 29 28 32 43 43 52 52 52 52 57 44 44 42 43 43 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 36 36 20 24 20 32
31 47 37 28 23 23 36 41 36 31 25 28 29 37 37 37 32 35 35 41 41 43 39 37 32 32 36 43 42 43 43 43 43 42 40 43 43 43 43 43 43 43 43 43 40 43 43 57 46 48
48 48 47 30 26 15 15 10 10 10 12 11 12 12 22 30 36 59 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 50 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 57 48 48 48 57 59 59 39 35
35 35 39 28 25 15 8 8 8 8 23 30 26 20 16 11 11 10 10 12 8 10 8 10 10 26 28 59 59 59 46 34 32 24 15 15 19 12 12 11 12 12 16 10 8 8 8 8 8 9
11 11 12 12 12 11 12 12 15 15 16 14 28 28 39 39 32 32 35 43 43 46 43 43 36 36 33 28 26 13 11 8 8 10 15 14 18 19 14 17 16 17 24 24 35 32 31 26 26 23
20 18 15 13 14 26 26 32 32 34 30 15 13 16 12 16 18 36 24 31 28 29 24 31 33 36 34 29 34 33 36 31 29 25 25 30 29 25 18 18 15 14 14 10 10 10 18 21 32 32
30 30 23 24 15 13 13 18 24 22 26 17 17 15 21 17 14 14 14 15 22 25 30 19 17 10 10 10 12 20 22 12 11 9 8 8 8 8 13 10 12 10 13 8 9 10 10 18 11 9
9 10 9 9 9 20 17 17 9 11 11 17 12 12 8 8 8 10 10 10 14 10 10 10 9 12 19 8 8 8 15 18 19 18 15 10 10 8 8 8 10 8 8 8 11 8 11 11 12 15
13 27 26 28 21 21 13 13 13 18 21 30 22 18 16 22 19 19 12 14 9 9 9 9 12 10 10 15 10 10 14 13 12 12 12 9 9 10 10 10 10 10 8 8 8 6 12 8 9 8
8 11 11 8 7 9 9 9 9 11 12 22 19 10 10 10 13 12 16 10 10 10 10 10 10 19 18 22 13 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 12 13
9 9 9 10 13 10 8 8 8 8 8 8 9 10 26 13 11 13 19 12 12 9 13 13 12 10 10 9 10 10 10 10 11 11 11 11 11 10 12 10 10 8 7 6 8 8 8 8 8 8
8 8 11 8 8 8 19 15 11 12 10 10 10 9 9 9 9 8 9 9 10 14 13 16 10 10 10 10 10 8 13 10 10 8 8 8 8 8 15 15 10 10 10 14 18 19 15 15 13 13
9 9 8 8 8 8 12 9 12 11 11 11 15 12 11 11 13 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 12 9 6 8 8 8 8 8 10 12 10 10 8 10 10 11 13 11 10
10 10 8 8 8 8 8 8 10 9 13 9 9 8 8 6 6 8 8 13 19 25 13 12 14 15 13 12 11 9 9 10 10 10 12 10 13 21 14 19 19 15 9 9 12 15 13 11 14 10
10 8 8 8 8 8 10 8 8 10 11 9 10 10 11 13 10 12 9 9 9 22 22 15 8 7 7 8 8 12 14 13 16 14 16 12 17 18 17 22 17 22 29 24 29 32 37 37 37 37
30 27 30 23 19 16 14 12 12 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 13 12 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 13 9 6 8
8 8 8 10 10 8 8 8 10 8 6 6 8 6 6 7 6 7 6 8 10 8 8 8 13 9 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 11 11 14 14 21 19 15 15 13 11 10 8 8
8 8 8 8 11 18 14 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 17 17 13 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 12 8 8 8 10 12 12 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 6 8 8 8 10 8 10
10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 8 7 6 8 8 6 6 6 7 7 9 10 10 9 12 8 8 6 6 8 6 8 8 9 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 8 8 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 3 7 8 9 9 11 8 8 6 6 6 6 7 8 9 9 10 12 10 12 12 15 15 8 9 8 8 10 15 8 8 8 8 15 9
12 12 10 15 8 8 8 8 13 8 19 19 28 28 28 33 33 26 26 28 28 15 12 12 3 0 3 8 8 8 8 8 10 10 11 11 13 11 11 12 16 17 22 18 17 23 23 3 0 3
14 14 20 19 22 28 27 27 28 29 35 35 29 31 28 30 28 30 21 21 9 9 9 12 13 15 15 16 10 8 8 8 8 10 10 12 15 16 14 9 10 10 15 18 18 3 0 3 27 27
43 37 37 37 37 41 41 59 48 57 48 48 48 48 43 43 43 43 43 42 48 48 57 57 47 43 36 36 36 42 39 39 43 43 48 48 48 48 43 48 44 39 32 28 21 15 19 19 22 22
27 30 39 39 46 43 43 43 44 57 57 43 43 46 46 46 43 42 42 36 36 20 32 20 32 28 42 31 31 32 41 28 33 33 32 32 38 20 20 20 38 38 36 35 35 37 37 37 50 42
52 52 52 38 27 16 11 11 15 16 38 43 43 43 43 33 20 18 15 11 11 18 27 26 37 38 33 43 43 39 23 24 18 24 17 32 32 43 43 52 59 57 43 41 43 43 43 43 41 27
20 20 16 32 18 38 26 27 12 11 11 15 27 26 12 12 24 26 32 29 27 41 41 21 20 24 15 12 12 20 24 28 43 43 25 22 22 22 22 18 20 24 16 11 11 12 26 32 24 24
14 24 24 25 25 25 36 36 33 33 22 22 15 15 14 15 15 26 23 24 30 27 29 23 36 28 28 28 28 31 33 33 32 28 21 13 12 15 18 24 26 28 14 14 14 15 28 30 28 23
23 23 34 32 36 33 28 28 28 28 19 19 11 12 9 12 12 20 14 11 16 10 11 15 23 28 23 23 23 23 23 28 37 34 30 18 14 14 18 18 19 18 15 15 11 11 11 22 19 29
28 21 19 18 22 23 23 25 32 28 33 23 23 20 16 16 9 10 8 8 8 8 13 9 9 9 9 8 17 10 11 9 9 12 16 12 12 11 15 11 11 11 11 11 11 11 17 11 13 19
13 13 10 9 9 9 12 10 7 6 6 6 6 8 9 9 9 12 11 18 13 16 12 10 9 9 8 8 10 10 10 10 11 11 11 12 12 11 11 8 8 8 12 10 10 12 16 11 15 17
17 10 10 10 13 15 11 10 9 9 9 8 8 8 10 8 9 9 9 10 13 11 13 11 11 11 12 12 12 10 10 12 8 8 8 8 8 8 15 12 12 12 11 11 11 13 15 10 10 9
9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 13 16 15 12 10 9 9 8 12 8 11 10 20 16 22 22 21 24 26 13 13 13 13 18 18 26 15 12 10 10 10 10 16 12 12 12 12 8 10
10 8 8 10 11 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 10 15 11 11 11 10 10 10 13 12 9 9 9 9 12 12 11 10 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10
11 11 9 9 9 12 8 8 10 10 13 10 10 10 10 9 10 10 10 10 8 6 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 9 10 10 10 10 10 10 13 12 14 16 10 10 9 9 9 10 10
10 14 10 10 9 8 10 8 11 11 16 11 11 11 9 9 9 13 13 15 10 10 11 11 11 11 21 18 37 21 21 12 12 10 10 8 10 8 9 9 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6
8 10 8 8 6 6 8 8 9 10 10 10 10 18 13 9 9 9 9 10 10 10 10 14 14 8 8 8 10 13 10 15 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8
11 13 17 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 12 10 10 11 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 14 11 10 10 11 8 12 8 8 8 8 9 9 9 9 10
10 11 8 8 8 8 10 8 10 10 13 10 14 14 14 12 15 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7
6 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 15 9 9 9 10 9 10 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 11 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 6 8 8 8
10 13 10 10 8 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 7 6 10 8 8 8 8 8 9 10 10 12 9 9 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 10 19 10 8 6 6 6 6 8 8 14 10 11 10 8 8 8 11 15 13 13 9 9 9 11 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12
9 9 10 10 12 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 12 11 10 8 10 8 6 9 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 12 15 19 15 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 9
8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 9 15 10 8 6 6 6 10 8 11 10 10 11 17 17 17 16 9 9 9 11 11 11 12 24 22 12 9 9 9 10 13 8 8 8 8 10
8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 8 10 11 8 8 8 8 8 8 10 12 12 12 8 8 8 6 6 8 10 11 6 7 10 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 10 7 6 8 8 10 11 10 8 7 7 8 8 9 9 10 10 10 |