BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124H17.T7 (MSMg01no124_h17.b1) | MSMg01-124H17.TJ (MSMg01no124_h17.g1) |
ACC | AG333825 | AG333826 |
length | 1,268 | 1,315 |
length of high quality (start - end) | 444 (71 - 514) | 337 (125 - 461) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h17.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_h17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h17.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_h17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:38 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXATCCGCGGAATTCCAGTCCT
GACTTCCTCCGGTGATAACAGCAATATGAGAAGCGTAAGCTGAATAAACC
CTTTCCTCCCCAACTTGCTTCTTGGTCATGGTTTTGTACAAGAATAGAAA
CCCTTAGCCGGGCGTGGTGGCGCCCGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGG
CAGAGGCAGGCGGATTTCTGAGTTCGAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGA
GCTCCAGGACAGCCAGGGCTATTCAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAA
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAATAG
AAACCCTTAGACAAGGTCCTTCCATACAAAATGTATGTTTTCTTATGTAT
CATCTTCCTTAGAGTTTTAAAATGTGTTGAAGTTAATTTCACTAACTGTT
GCTATGTGCAGTGCTTGCTGTTGAGATTTTTAGAGCAACCAGACACTAAC
TGCACTGTAAGCACCATCATATAATAAAGTCAGCATATTCACACAACATA
TACTAAAACTATATATAAACCCGTAGTATCCTATCATTTTGTTTCTATTT
TACACACTTTATTGCACTTGCTATTCTATGTTACACACAATGACTTTGGT
GGATTAAAGTTTCTGACTAAAAATGATAACGGGGTTATGCTCAGCCACTT
AATGGCTATGGCCAACACTTAAAAAGCTCTGTCTCAATGATTGTTTCCGA
GAATATGTTCAAAACAGTCCCCGCCTGATTGTCCATACTTGTATTCTCAT
ATATTCTCATGAAGAGGGAGGAAGCCATCTTTGGCTAATTTGGACCCGCC
CTCTAATTCATTATTATTATTATAATATTAATGACCACCCCCATTATCAT
TTTTTTGTTAAAAACACTTAAGGGGCATAAATTGGATTCCATAATATTTT
CTAAACTCAATTTTGGCTATCTTGTCCCGGTTAAAAAAATCCTCCCTCCC
ATCCTTTTGAATATTAGGTTCCAATGTTGATAGGTAAGTTTTTTAACGTA
AAACATCCCTTCCCTTCATTTTTGGAAAGGAATAACTCATAATGGGGTTA
TAATTACATGGGGGGTTTTTTTTCTCGTGAATTGTTCTACAGTAAATCTA
TTCTATCCTGTTTATGAGATTTAATCAGGACTCCTCTCCCGGTATTTTTT
TTCTGTTAGAATAAAAAAATTCCATCATACCTCCGCGGTATAAATTTCTT
TAAACCCTGGGTCTCCCC
| TTTTTTTAAAGATTGGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTTATAAAACCAGAGACACTGAAACA
TAGAGGAGAAAGCCCTTTAAAACCCTCGAGATATGGGTACAGGGGGAAAA
TTTCTGAATAGAAGGGCAATGGCTTGTGCTGCAAGATCCAGAATCGACAA
ATGGGACCTCATAAAATTGCAAAGCTTCTGCAAGGCAAAAGACACTGTCA
ATAAGACAAAAAGGCCACCAACAGATTGGGAAAGAATCTTTACCTATCCT
AAATCAAATAGGGGACTAATATCCAATACATACATACATACATACATACA
TACATACATACATACATACATACATATATATATATATATATATATATATA
TATATATTTTTTGAAGCTGGACTCCAGAAAATCAAATAATCCCATTAAAA
AATGGGGTTTTTATTTAAACAAAGAATTCTCACCTGAGGAATACTAAATG
GGTGAGAAGCACCTGAAAACATGTTCAACATCCTTAGTCATCAGGGAAAT
GCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCATCTCACACCAGTCAGAATGGCTA
AGATAAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAGA
GGAACATTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTG
GAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGATTTAGTACTACAGGAAG
ATCCTGCAATACTTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCATCCGGT
AAGAATGACACCATGTCTCCACTTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAAT
ATCCAGAATCTGGAAAGAACCCTAATGCTCCTTAACAGAGGATTGGATAC
TGAAAATGTGCTTCTTTTATCCAATGGAGTCCTACTCCGCTTTTAAAAAG
AATGGATTTTATGAAATTTCCTATGCAATGGATTGGTACCTTGAATGGTT
TTGATTCTTGATTTAGTTATTTTTTTTCCCATATGTAATTCTCCCAAATT
TGTATTGCATTTGATAAATATAATATTTACCCCTTAAACCTTAATATTCC
TCCCCTATTTTACAAATATTATTTTGCTTAAAGTGCTTTAAACTTCCAGT
AAATAATAATAATCCTATGTGGGTGAACCTTTTGCCCCTTTCTTATAAAA
TGGTGATACTAATACCTCCTTGTCATGGGATTTTTATAAATATAAATTTG
TGCTCTCTATTACAGAGGGATGGTACCTCTTTAGTATCTTGCCCATATCC
TGGATATCTATCCCN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 8 10 17 15 19 15 13 8 8 8 15 15 34 28 28 33 33 33 33 42 42 47 42 21 21 8 10 8 15 15 39 43 43 46 47 47 47 47 37 36 28 28 28 35 47 53 50
50 50 50 42 59 27 23 9 10 10 9 9 9 10 10 10 9 9 10 18 17 21 30 37 43 44 44 57 59 59 59 59 59 48 48 48 48 47 47 48 48 42 37 42 41 47 44 27 19 12
17 22 19 15 12 17 17 19 18 24 25 28 35 35 32 30 42 50 50 50 50 50 47 47 48 48 48 48 48 50 54 54 54 54 48 48 48 48 46 48 54 54 48 50 48 47 41 41 47 47
47 47 47 42 42 37 39 35 41 43 47 47 47 47 57 57 57 47 42 32 24 12 12 15 15 27 32 47 57 57 57 57 57 57 44 44 43 43 43 44 44 44 43 50 44 46 52 43 44 28
28 31 43 42 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 59 59 59 57 57 57 43 43 43 52 52 52 57 59 43 43 43 57 52 43 43 43 43 45 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 35 35 35 35 43 43 43 43 39 57 57 57 43 45 52 52 43 43 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 43 39 39 43 44 44 43 43 35 35 35
47 43 45 52 43 43 41 41 41 41 35 43 43 43 43 31 31 31 18 18 11 11 11 28 39 43 43 52 43 43 39 35 35 31 31 31 43 39 39 39 39 43 39 41 43 31 27 27 35 24
38 23 23 26 43 43 32 38 34 39 31 43 43 43 47 35 35 35 43 43 43 43 35 43 39 43 39 43 43 44 26 26 12 15 13 30 30 52 38 38 20 20 22 18 11 11 13 15 24 31
39 39 42 39 43 43 43 57 34 34 17 18 18 38 38 52 57 57 57 57 57 38 34 20 20 20 36 38 52 57 52 52 52 52 52 57 52 36 38 20 20 20 38 32 27 27 27 43 38 43
29 29 43 43 43 32 32 32 32 19 14 14 14 38 32 43 33 33 33 33 33 43 43 32 28 28 43 44 57 34 32 12 12 12 24 24 35 32 28 14 14 14 21 21 28 33 36 28 24 22
18 15 11 12 12 32 30 25 20 23 18 15 14 15 15 24 15 13 13 13 15 15 24 28 32 37 41 30 21 20 20 18 18 18 18 20 28 30 34 20 18 15 14 14 14 23 28 28 30 28
22 17 17 18 23 15 22 17 20 19 28 13 13 13 13 13 30 25 28 23 19 15 15 15 23 20 20 30 39 32 37 28 23 23 23 23 29 37 42 42 39 32 27 25 24 32 42 37 42 37
26 24 8 8 8 8 8 14 27 37 37 37 31 25 22 23 23 32 36 35 35 32 32 21 19 12 13 25 32 36 42 24 24 13 13 11 11 11 15 15 17 19 13 12 14 30 27 28 24 20
16 16 30 30 42 22 21 10 10 10 12 10 10 10 15 10 10 10 18 20 23 23 23 18 25 12 12 12 15 15 16 16 20 19 19 17 17 15 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 19 19
10 20 20 28 23 22 8 8 8 8 8 8 12 12 12 11 11 11 11 17 13 14 14 10 10 10 10 10 12 17 18 21 15 13 11 11 11 11 12 22 22 15 14 9 19 15 14 10 9 10
13 13 10 10 9 12 12 9 9 9 13 19 26 15 13 10 10 10 10 10 12 13 13 12 12 17 24 23 16 12 14 10 10 10 21 21 28 20 23 12 10 10 10 10 10 12 12 16 11 9
8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 11 10 10 11 10 10 10 10 12 13 8 8 8 8 10 10 11 18 23 25 8 8 8 8 6 6 8 8 9 12 8 9 10 12 9 9 10 10 9
12 10 8 10 8 6 8 8 8 8 10 10 14 14 11 10 8 6 6 6 8 8 14 14 9 12 8 8 8 12 13 9 9 9 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 11
11 11 11 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 10 15 19 14 11 11 11 11 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 10 13 13 12 12 10 10 17 12 10 6
6 8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 9 13 12 12 8 8 8 8 8 8 9 11 11 10 13 12 13 10 10 10 10 9 10 9 9 9 9 12 12 6 6 6 6 8 8 11 11 10 9
10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 10 6 6 8 6 6 6 7 8 8 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 12 10 15 13 11 11 11 11 15 15 18
10 10 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 18 12 12 9 8 8 8 8 8 8 12 9 9 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 8 8
6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 18 18 11 11 11 14 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8
8 8 8 8 7 9 9 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 9 9 10 12 11 8 8 6 6 8 8 13 13 6 6 6 7 11 12 18 21 24 20 15
8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 9 9 9 9 11 13 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 12 9 9 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 12 10 7 6 8 8 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 19 9 9 9 9 9 9 6 6 7 7 9 9 6 7 8 6 6 8 7 11 10 12 15 8 8 8 8 9 10 14 13 14 9 10 10 19 22 20 17 17 18 29 34 34 36
34 37 43 37 34 33 33 39 43 43 48 48 48 40 40 46 23 19 9 9 9 9 12 10 10 9 9 10 9 9 13 18 28 28 32 37 39 36 36 36 36 36 34 36 37 36 36 47 57 59
48 50 43 43 39 39 46 41 23 24 9 9 9 12 11 14 13 14 17 15 19 13 13 18 19 28 22 28 34 39 47 53 53 53 43 43 43 43 43 43 47 48 53 59 48 48 54 57 57 59
57 50 48 48 48 48 42 43 43 36 36 43 59 59 48 50 43 44 39 32 34 23 23 22 34 32 47 37 43 39 41 30 24 18 11 9 12 12 12 9 12 22 28 39 39 47 43 43 40 40
43 47 47 46 46 43 43 43 57 47 47 48 53 53 57 59 59 59 54 59 43 43 43 43 39 43 39 39 39 39 39 47 42 44 35 35 35 39 47 47 57 47 39 35 39 37 37 37 42 35
35 36 44 33 39 39 42 42 47 43 44 42 42 35 37 37 42 42 43 43 43 44 48 57 57 57 57 48 50 57 57 59 59 57 50 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52
57 52 52 52 52 52 52 52 57 52 57 57 52 52 52 50 50 57 57 57 57 57 57 57 48 48 50 57 57 57 44 43 43 43 57 47 48 48 48 59 48 44 44 44 43 43 57 59 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 42 30 30 30 42 41 41 43 43 43 43 47 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 57 59 59 59 59
59 59 59 30 24 13 13 13 16 15 11 12 16 19 28 28 37 37 41 59 59 48 48 48 48 48 48 32 32 28 32 28 33 33 43 39 42 43 39 43 37 37 43 43 43 59 48 59 57 47
43 48 37 34 28 21 15 15 10 13 11 12 11 11 12 12 18 12 13 13 13 12 18 22 31 34 34 37 39 39 37 37 36 36 39 39 39 42 39 48 43 43 39 36 36 34 30 28 15 15
13 13 13 21 18 18 23 21 32 32 20 20 24 32 37 39 37 37 39 43 48 48 43 43 40 37 28 28 28 26 28 23 30 28 41 31 35 35 34 34 20 23 15 34 23 30 30 42 42 46
43 39 41 35 32 36 36 23 23 31 32 28 30 32 32 35 42 36 40 36 44 44 35 32 27 20 20 27 32 35 42 33 33 33 30 36 32 42 39 37 35 35 42 44 30 30 17 17 17 30
24 20 20 28 28 37 32 31 25 26 25 25 19 20 20 20 32 32 33 36 23 19 15 11 11 11 18 12 14 12 12 11 11 15 22 26 30 35 37 32 32 24 22 22 22 24 20 22 32 32
31 34 34 30 30 24 27 21 22 22 19 26 24 30 28 26 24 28 28 28 28 33 25 25 28 28 34 34 34 24 25 15 19 22 28 34 34 33 28 28 24 23 21 19 23 24 30 34 34 39
39 37 39 32 28 28 22 22 28 24 17 16 11 11 12 17 21 25 18 22 24 21 14 17 17 24 25 32 26 26 12 12 11 12 12 12 12 12 12 12 12 11 15 9 9 9 15 18 10 10
8 8 8 10 24 23 12 12 10 10 9 12 10 12 17 20 26 13 13 10 9 12 12 15 17 17 18 11 10 10 10 8 8 8 11 11 11 11 11 11 13 9 10 9 8 8 10 9 9 12
10 9 9 9 9 9 10 12 12 12 15 21 26 13 10 6 6 8 8 10 9 10 10 19 19 15 8 8 8 8 8 9 11 11 14 10 8 8 8 11 10 14 16 24 15 15 14 11 10 13
12 10 10 11 11 11 11 12 11 11 12 13 15 24 19 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 12 10 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 13 13 10 10 10 13 16
10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 15 12 9 7 10 8 9 9 11 11 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 12 13 10 10 13 10 10 9
9 8 10 9 9 10 10 20 17 11 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 10
10 8 8 8 8 13 11 11 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 7 10 12 9 9 8 10 6 7 8 8 8 8
8 17 12 10 10 13 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 10 11 10 8 6 6 10 8 10 9 9 8 7 6 8 6 6 8 8 10 11 17 13 8 8 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 7 6 7 6 8 8 8 8 10 12 11 7 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 8 9 9 11 9 8 8 6 6
8 8 8 6 6 8 8 10 7 7 10 8 8 8 10 10 10 10 10 9 12 8 8 8 8 8 8 10 11 11 19 25 18 18 17 17 11 13 11 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10
10 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 9 10 10 9 8 8 8 13 12 15 21 11 11 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 12 12 8 8 10 10 8 8 8 6 6 6 8 12 10 10 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 10 9 10 9 9 9 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 10 10 12 13 9 9 8 8 8 8 8 3 0 |