BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146G19.T7 (MSMg01no146_g19.b1) | MSMg01-146G19.TJ (MSMg01no146_g19.g1) |
ACC | AG349967 | AG349968 |
length | 1,248 | 1,230 |
length of high quality (start - end) | 521 (122 - 642) | 647 (129 - 775) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_g19.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_g19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_g19.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_g19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCTCTTTTTTNNATCATTTGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATCCGC
GGAATTCACCTTGATTAGAGTCTCTTTAAAATGGCAAGAGAGATCTTTCC
TTCTTTCTTTCTTCCTTTCATTATTGTTATTCCACAATTGTATCTATCAT
CTGTCTTATCTATCAATCATCTACCTATACTGAAATATGATCACACTACA
TCTCCATTTTCCACTCCACCTGCATCTCCCACCATACTCCCCCAACATCT
CCCCCTTCCAACTTCATGGTTTTTTTTTTTAACCTAAGTCCAATTAGTGC
TGTGTATATATGCATGGGTATGGGGCCATCCACACCATTAAAAAAGAATG
TCCCTCTCCCAGCAGCCATCAACTGCCAATGGTTCCTCCTAAAAGGATAG
GTTTTTTTGAGCTCCCTCCTCATCCATGCTGGGATCATTGGCTGGCCTGA
CCTGGTACAGGTCTTGAGCAGGTAACCATGGCAGCTGTGAGTTCATGAGT
GCAGTAGCCATGACCATAAGACAGCTTTTCATAGCTCTCCTCCCATCCTC
TAGCTCTTTCACATTATCTCTCTCTTCTTCTGTGATGTTCCCTGATCCTT
GCCAAGGGCTGGAATATCGATGAAGCCATCTTATATAGGGCTAGGCATTC
AAACGACAAGGGGGGAATCTCATGGACTGTCCTAGGGTTACTCTTGCTGT
GATGAATCAGTTTGACCGATAGCAAGTTGAGTAGAGAGGTTTACTTAGCT
TACACTTCCACAGCTCAGTATTCCTTTGTTTGAAGAATCCAGTAGAGGAT
TTCAAACAGTTTCTTGATCTGTTCTCTAGATTTGTTTGCATAGGCCATAT
AGGCTTGCTTTCTTATTGCCATTGCCCCTCATGATTTTCTCACTCTGCTT
TTCTTTTATGCCCCTTTAATACCATATTTATTTATGTCCCCTCTTCCTTT
TCTCTCTATATTATTAAAAATTCTCTATAGGTTTGTCCCATTTAATCTCT
TATTCTTATGGAATTTCTCTTCTTAATTTTTGCTTCTTTCCTCTCATGTC
TTTTTTTTTTCCTTTTTCTCATTCTCTTTTTTCCTCTCTATTGTATTTTT
TTTCTTTTCTTTCTTCTTTCACTTATTTATTTTCTTATTTTATTTATTCT
TCACTTATACTTTTTCTTAGTCTCTCTCACATTACTCAATATCCCTTTCT
TCTTTCATATTTTATTTTCATCTACTCCTACGTATTCTACTTTTCTTT
| NCGTCCCTTTNTNNANAACATGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAATAGAAGCCTAGNATAGGAA
GCAGAGACAGGACTGAGCCCTTAAAATGGAATCTTCCCCCCCCACCTTAC
TTCCATGACCTGCTTCCTCCAGCAAGACCCTGTTTCCCAAAAGCTCCAGA
ATCTCCCAAAACAACGCCACCCCAGCTGAGGGCTGAGAGCTCAATTCTGA
GCTGCTGAGGTGCATTTCAAAACCAAACCTACTGCATTTCCGGCACATGG
AATTCAGACCTCTGACCATGCGTTTTTAAGATGCTAAAACTGATGTGATT
TGAGATAGCGCATGAGGAAACTAATCCATCATGTCCAGTGCTTATCACCT
ACTGGAGTTTTATGACCCTGACACAATTGAGGTTTCAATCTGTAAAATGG
GAATAAACACAACCACCCACAGGTTCACTGTGATTTCTCACCAAAAGTCC
CTGGTATCTAGTAAATGCTCAATAAATTTCATCTTTGGGTTTCTCTCATT
TCCCCTCAAATACACTAAGTACCATGCTCTGTGTGCAGCAAACATCCCAG
CCCTGAGACTGAAAGTGTCATGTGGCTCACATGTCCTCAAGACACAGCCA
CAGACTGGCAACCTTCCCAGTCTACAGGGAGCATCATTGAAATCCTAACC
AATGTGAAGTCAGTGGGACAGAGGATATCCCATTTGAATGATGGAGCTTC
ATTGTGAAATGATGGGGGCTGCAGCGGGTAACTGTGCTGCCAAAGCTGCC
TAGACTCACAGAGGGGAGCCACTGTGATCTAAGGGGAGGGGATCTGGCTT
TGAACTCTGAATCATATCGTGAAATATAATGTCGGTGTTCTCAATAAGGA
GAAAGCCTTTTGGAGCACTCCCAGAATTACTGTAAAGTCCTCGTTGAGGC
CCCCTGATGTGAAGGTTACTATACGCTTCCCTGTCCCCTGAATGGCCTTT
TTAGAATTGAGGCCTTGCTGTCATAACGGTTTTCCTTCTATTTTATACTT
TTTAACTCTTCCCTTTCTTCAAAATTATTCTCTCCTTAATTTATCTTTTT
TCTCTTCTCATTATTTCTCTCTCCCTTTCATTTTCCGCAATTCACACTTA
TTCTTCTCTTCTTCTCTTTCCCTGATTACTCTTCATTTCAACTCATCTCT
TCCCCTTCTGTTCTTCCTCGTCTCTCACTC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 9 9 13 3 0 0 3 6 6 7 7 7 6 10 12 10 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 21 18 18 23 19 28 28 28 37 37 37 34 33
32 32 27 16 15 10 9 9 22 15 28 26 28 28 26 27 24 19 19 8 6 7 9 9 12 10 10 10 8 9 8 8 8 9 10 28 25 39 37 37 39 47 39 47 47 50 50 50 47 47
38 36 36 31 31 31 33 33 33 33 23 23 10 10 10 10 10 15 10 9 9 15 23 27 30 33 33 22 22 10 10 9 9 9 9 9 12 22 29 37 37 39 44 41 47 47 53 53 53 50
47 47 42 39 39 40 40 47 43 43 43 43 42 28 32 32 33 42 42 50 50 68 68 50 50 47 48 47 47 47 47 57 46 43 37 43 44 43 43 59 59 57 41 47 47 41 41 42 41 47
47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 50 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 57 57 57 57 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 52 43 38 24 17 17 32 32 43 43 52 38 44 32 32 13 24 26
43 43 52 52 52 52 57 57 54 54 50 57 59 42 30 27 32 26 23 43 44 43 33 33 33 33 41 42 46 47 43 43 47 47 57 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57
57 59 54 57 54 59 59 43 30 30 27 26 30 25 25 25 40 43 59 59 43 43 43 43 43 43 43 47 40 37 30 30 32 32 59 43 57 48 47 47 47 59 59 35 35 35 33 32 25 18
18 18 17 23 12 12 9 11 12 21 28 37 41 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 57 40 34 28 20 20 23 32 40 57 47 34 25 17 17 27 30 25 28 12 19 19 11
11 11 11 15 15 20 31 34 43 43 39 37 39 42 32 34 24 42 34 32 18 20 20 31 41 43 44 41 34 20 20 20 28 28 33 44 44 37 43 28 35 24 32 30 37 26 38 18 27 43
38 43 28 19 18 14 13 13 26 28 43 57 52 52 52 57 44 38 21 20 20 38 38 52 54 54 59 57 57 57 57 57 35 33 33 43 44 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 50
38 38 16 16 28 32 43 44 44 57 52 57 57 52 50 57 54 52 52 52 52 52 57 57 57 57 50 48 48 43 47 43 48 57 57 57 57 50 50 50 59 43 32 32 12 12 12 25 32 44
36 36 28 33 20 32 13 14 14 27 18 26 32 34 30 30 30 15 15 20 32 32 36 28 23 23 36 36 43 48 48 50 50 46 34 32 15 15 18 12 12 18 27 23 17 17 11 11 11 11
12 15 15 17 17 22 28 32 18 15 11 11 12 12 12 12 23 23 30 14 14 8 9 12 12 20 34 28 35 35 39 26 28 23 31 25 21 13 17 13 18 17 26 31 40 39 39 37 35 37
33 26 26 12 12 11 15 15 11 12 11 20 18 28 19 21 13 12 12 12 12 11 11 11 11 11 15 23 22 16 11 11 11 11 15 12 13 19 19 22 24 19 16 22 22 25 11 11 11 11
17 11 10 10 10 13 21 19 19 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 18 13 16 16 14 14 9 9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 15 15 9 9 9 9 9 9 9
9 9 13 13 13 11 11 10 12 12 12 10 10 10 12 11 8 8 8 8 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 13 8 8 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 9 9 11 9 9 9
9 8 9 8 8 8 8 8 8 9 11 10 10 10 21 19 23 8 10 10 10 12 8 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 11 10 10 11 10 13 10 9 9 9 9 10 9 12 12 20
11 9 10 9 13 12 11 12 10 8 8 7 8 8 8 8 6 6 8 8 12 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 10 9 13 13 13 10 10 12 10 8 8 8 8
8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 12 13 15 12 10 10 10 10 13 10 9 9 9 9 8 8 10 8 8 8 13 13 21 10 10 10 12 11 10 11 12 12 9 9 10 10 9 10 11 12
18 12 12 9 7 8 6 6 8 6 11 9 12 10 8 8 8 8 7 6 13 8 8 8 12 16 15 14 10 8 6 6 8 8 7 6 8 10 10 10 12 11 15 10 10 9 9 9 8 9
9 9 12 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 12 14 8 8 10 7 7 12 10 8 8 8 9 10 11 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 11 8 17 12
9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 11 13 13 13 13 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 12 9 9 8 12 12 10 13 10 8 6 6 8 8 8 10 9 9 10
9 6 8 6 8 8 10 6 6 6 7 10 10 15 10 10 10 8 8 6 6 8 17 10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8
10 8 9 9 8 8 6 6 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 9 9 9 8 8 6 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 8 8 8 10 13 10 10 10 | Open.Hide. 0 3 9 9 9 13 10 11 9 3 0 3 0 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 11 10 17 9 15 8 8 8 6 8 7 9 13 13 12 8 9 9 15 17 19
8 10 10 24 24 28 28 33 29 28 21 25 19 35 35 36 33 44 39 37 37 41 23 24 8 7 7 7 6 6 6 7 6 6 6 7 8 9 9 9 8 3 0 3 9 9 30 23 41 41
39 39 35 35 39 39 44 48 33 33 33 31 30 23 19 10 7 7 9 8 8 7 9 9 10 10 15 10 15 20 28 34 37 37 23 20 11 11 9 12 18 25 34 37 37 33 33 33 33 47
47 33 33 34 34 34 34 39 42 48 48 57 47 47 48 48 48 43 42 39 43 43 43 46 43 43 43 43 48 48 48 46 46 34 37 43 44 48 39 39 35 37 35 39 43 43 57 48 48 48
44 44 43 44 42 42 35 42 42 44 57 57 57 57 40 43 43 57 59 57 59 59 44 43 43 44 44 57 43 43 44 43 43 35 43 32 44 44 57 52 52 57 52 52 52 52 57 50 57 57
52 50 50 43 52 43 50 38 38 38 43 43 52 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 52 52 57 57 59 57 52 52 52 59 59 59 57 52 52 59 59 57 59 44 44 35
33 43 43 44 43 47 47 57 59 59 68 68 57 57 57 50 43 43 50 50 48 48 48 59 57 68 50 48 37 37 37 48 48 54 48 48 48 48 42 47 42 46 43 43 43 43 43 47 43 48
42 47 39 48 57 57 57 57 57 59 59 57 50 50 48 47 47 48 44 48 43 46 43 47 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 48 48 48 43 43 43 43 48 59 59 59 59 59 59 59
59 59 36 28 21 12 16 9 12 8 8 6 6 6 10 21 34 37 42 41 39 37 37 48 48 57 59 57 57 57 57 57 59 59 43 43 43 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 33
26 18 20 16 20 20 20 21 28 36 47 47 54 59 57 57 59 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 57 59 48 47 57 57 57 57 57 57 57 54 48 57 57 57 57 59 50 48 44 44 50
50 50 50 50 54 57 57 57 57 52 52 52 59 59 52 57 57 57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 68 68 57 57 52 57 57 57 59 57 57 57 59 59 59 52 52 52 50 43 39 37 50 43 52 52 43 43 38 43 43 44 35 35
35 43 50 38 38 36 50 36 43 43 50 43 59 57 57 43 43 35 35 35 42 34 44 57 42 42 42 42 43 46 46 57 57 57 43 43 43 47 43 48 42 42 35 35 30 40 28 30 30 37
32 35 35 36 36 28 23 27 37 36 43 43 48 48 54 54 54 42 36 36 40 40 37 48 48 57 48 50 48 40 40 39 43 43 47 47 48 57 57 48 48 43 47 32 30 19 18 15 21 22
19 21 29 30 33 30 34 28 28 30 32 28 30 28 28 13 13 13 28 28 43 43 33 33 25 33 29 42 39 37 32 39 39 43 39 33 36 36 28 33 25 24 19 19 25 25 28 37 19 15
9 8 10 8 10 10 17 17 35 32 32 28 30 28 37 37 43 32 32 24 21 15 19 19 10 12 11 11 10 12 10 9 8 8 8 10 10 14 24 26 36 36 24 23 20 20 20 21 25 22
20 12 11 11 15 23 21 28 28 28 28 25 31 28 19 19 14 13 13 10 10 9 14 11 11 14 16 20 18 17 11 14 14 14 18 28 28 28 19 12 12 11 16 16 12 13 11 10 10 17
23 28 19 12 11 11 10 10 10 9 9 13 12 10 9 9 10 10 11 13 21 21 10 10 8 8 8 8 13 10 10 6 6 8 8 11 11 12 11 10 10 10 8 10 8 9 11 10 11 10
10 10 10 10 10 10 10 11 9 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 10 8 10 10 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 9 8 10 8 10 8 8 8 6 6 10 10 11 11 11 13
12 10 10 9 9 9 9 9 9 10 15 10 9 9 9 10 10 8 14 10 10 10 10 11 12 16 18 20 24 13 10 10 10 10 10 10 8 8 8 10 8 10 10 10 10 9 9 13 13 13
10 17 11 8 8 10 10 8 8 9 10 11 11 13 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 10 12 12 10 11 10 10 10 8 8 8 10 10 11 8 8 6 6 8 8 10
10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 16 8 8 8 8 8 8 10 11 11 12 8 8 10 10
10 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 9 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 12 12 10 11 10 10 9 9 8 7 7 7 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 6
8 8 8 8 8 8 10 13 8 8 8 10 8 9 9 10 10 8 7 7 10 8 10 11 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 9 9 8 8 6 6 10 10 11 12 11 11 9 9 8 8
6 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 8 8 8 6 11 8 8 9 12 11 11 11 8 8 8 8 8 |