BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146I21.T7 (MSMg01no146_i21.b1) | MSMg01-146I21.TJ (MSMg01no146_i21.g1) |
ACC | AG350060 | AG350061 |
length | 1,160 | 1,236 |
length of high quality (start - end) | 651 (125 - 775) | 649 (127 - 775) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_i21.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_i21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_i21.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_i21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:08:28 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCGCTTTTTTTNNNNACAATGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTTTGTCTAGNTCTGTCCCTTATATTACTGGGGTTATTTGA
TTTTCTGGAGTCCACCCTTTTAAGTTCTTTATATCCACTGGATATTTGTC
CCCTATCTGATTTAGTATAGGTAAAGATCCTTTCCCACTCTGTTGGTGGC
CTTTTTGTCTTATTGAAGGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCAGTTT
CATGATGTCCCATTTGTCAATTCTTGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTG
TTCTATTAAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTTGAGGCTTTTCCCC
ACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGGTTTTATGTGAAGTTCCTT
GATTTTTTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAGGAATGGATCAATTT
GCATTCTTCTGCATGTTAACAACCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTAAAT
GGTGTCTTTCTTCCACTTGATAGTTTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCAAGT
GACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAATTCTAATCCATTGG
TCTATTTGTCTGTCATTATACCAGTACCTTGTAGTTTTTATCACAATTGC
TCTGTAGTAAAGCTTTAGGTCAAGCATGGTGATTCCACCAGAGGTTCTTT
TATCCTTGAGAAGAATTTTTGCTATCCTATGTCTTTTATTATTCCAGATG
AATTTGCAGATTGCTCTTTCTAATTCGTTGAAGAATTGAGTTGGAATTTT
GATGGGGATTGCATTGAATCTGTAGATTGCTTTTGGCAAGATAGCCCTTT
TTTACATGTTGATCCTGCCCATCCATGAACATGCGAGATCTTTCCCTCTT
CTGAGATCTTCTTTAATTTCTTTCTTCAAAACTTGAAGTTCTTATCATAC
TTATCTTTCATTCCTTAAATAAAGTCCCTCCAAGATATTTATCTTATTTT
CGTTATTGATAAATTGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTCACCTTTTTTTTTTT
TCTAATTTCTCTTTATTTTTCTTTTTCCTTTTATCCTTTGTTTTATCCTC
TTTTTTTCACTTCATTTTTCTTTATTCTTTTTTTTTTTTTTTGTATTTCT
ATCTTTTCTT
| NCCCGCTTTTTNTNNNATGATGTGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAGTTCTTTAGGGGAGTAG
CTACTGTTAGACTGTCCACATTCTAGTAGATGGCCCTGCCCTTCATGTAT
AAGTATACATATAAGTAGCATTAAAAGGTTTCTGAGTGTTAAGTAAACAA
ACAAATGTTCTAGTCTGAATAAATATGGCTCAGACACTCTTATATTTGTA
TACTTGGTACCGAGTTGGTGAAATTCTTTGGGAAAGGTTAGGAGGTGTAG
CCTTGTGGAGGAGGTGTGTCACTGAGGGCGAGCATTGAGGTTTAAAAAGC
CTATTCCTGGTTAGTCCTGTCTCTGCTGCATGTTCAGGACCAAGATATAG
GCTCTCATTCTCTGCCCCAGGGCCACGCCTTCCTGTCTGCTGCCATGCTC
CCAACTATGATGGTCATGTCTGAAACTCTAAGCCACAAATAAAATGATTT
GTGGACATTGGTTTGGTGTCCTTTCATAGCAATAAGAAGGTAGCTAACAC
AATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAATCAAGCAAGCAAGCAAGCAA
GCAAGCAAGCAATAATTTGAAAAAATAAAAAATAATCTCAGGTCAAATGA
CTCTGGATGGATGCACAGATTTGGAAGCTTTGAATATTTAAAGGGAAAAA
AATACTTTACAGTCTCAGAAATTTCAACTTCATTATCTGCTTCAGTACAA
TATAACTTATTTAAGCACTATAAAATAAACGTTATCTACAAGGCGTACGT
TGTGAAACTGATTTTTGTTTGTAGTCATTTTTAAACCTTGTTATGTATTA
GGTACAAAAAGAATTTCTTAAAGTCTAGAATTAAATAAACCGCCCAATTA
AAAATGTGTGCCAAGAGTAAGACAGATACCCTTATTTATGAACAATTGTA
ACAGTTGGCCAAATTACCTTCCTATTAATTGGAGCCCTTTTGTCTTTGTT
CTCCCCCTTTGGCCTTGGAATATTTATATAATTTTTTTTCACCCTTTAAA
TCTCTTTATTACTTTCTTTACTTTCTATTAGCCTCCTTCTTTTCTTTTGG
TTTAGCGAAAAAGTTTATCTCCATTTTTGTAATATTTTTCTTGTCATATA
GGTAAAAATCAATCCCTTTATCTCATTTCTTTTTGCTACTATCTTCTCTC
CTTCTACACTTCTTTTTTTATTTTTATATATTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 7 8 8 8 10 10 12 3 0 0 0 0 3 3 6 8 6 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 13 15 8 8 8 10 10 8 8 22 19 33 37 37 37 47 47 47 47
47 43 50 53 50 50 53 53 53 50 33 31 30 28 25 25 19 21 3 0 3 18 18 9 9 6 7 7 7 6 6 7 8 10 8 8 9 10 16 25 34 33 33 33 33 41 36 53 53 53
53 53 50 36 36 33 33 33 30 28 25 24 17 19 8 8 8 8 8 8 10 10 10 12 15 29 29 31 31 31 30 23 20 8 8 8 8 8 10 12 22 26 37 50 50 50 50 53 53 57
53 36 38 38 42 42 43 57 57 59 47 47 42 42 42 42 40 40 37 43 43 50 50 53 57 59 59 50 50 50 50 50 47 41 27 23 11 11 11 22 27 34 37 37 37 40 48 48 48 48
57 57 59 57 57 50 50 50 50 48 48 50 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 48 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 59 41 41 28
18 15 14 17 17 17 17 15 27 24 47 59 59 59 50 50 53 53 57 57 57 57 50 50 53 53 57 53 53 50 50 50 50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 41 32 32 39 39
37 37 59 59 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 68 68 57 57 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 52 52 52 43 59 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 52 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 59 59 59 57 38 38 13 13 13 38 38 59
57 59 59 59 59 59 43 43 44 44 47 50 47 48 50 50 50 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 44 40 32 24 24 12 12 12 32 32 57 57
57 57 57 57 57 57 59 44 44 28 28 28 36 36 42 42 48 48 59 48 48 48 59 59 59 57 48 37 27 19 10 10 23 26 50 59 57 57 57 50 50 50 48 41 37 37 37 37 37 37
32 32 43 59 44 47 47 41 41 43 43 37 37 37 35 34 34 39 33 33 34 24 20 21 21 13 12 12 12 23 23 21 19 9 10 13 19 22 37 32 31 28 18 18 28 28 37 41 39 41
39 39 34 27 24 23 23 20 31 26 24 28 24 28 33 28 19 17 10 10 16 27 27 18 11 11 22 22 19 15 12 13 19 19 15 18 11 15 10 22 10 10 10 14 13 8 8 10 23 19
11 11 11 10 10 8 17 26 32 37 28 28 28 28 33 33 21 24 14 10 10 8 8 9 9 10 10 8 8 8 13 8 6 6 6 7 6 9 12 12 14 8 8 8 8 8 8 13 16 24
20 10 11 6 6 8 8 8 8 10 10 10 19 15 8 8 7 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 15 19 30 12 12 10 12 9 9 10 12 15 10 10 10 15 8 11 6
6 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 8 12 13 8 8 6 9 9 9 10 10 10 10 10 16 10 11 11 11 8 8 6 6 8 8 11 15 17 22 11 8 8 8 10 14 19 13 10 6
6 6 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 11 8 9 8 8 6 6 10 10 10 8 8 9 21 13 10 8 6 6 8 8 10 9 8 13 9 10 12 12 18 18 18
16 13 11 11 11 11 8 8 10 8 8 8 10 11 12 11 23 18 21 15 15 12 12 10 13 10 9 9 9 11 9 11 11 8 10 7 7 8 8 9 9 16 12 11 11 11 8 8 6 7
10 12 20 15 10 10 6 6 6 6 8 8 7 9 9 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 12 15 19 15 14 15 15 14 14 12 12 9 10 8 8 8 8 10 15 10 10 8
8 7 7 10 13 14 12 10 9 9 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 9 9 9 9 10 3 0 3 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 11 8 7 9 8 10 10 18 19 19 8 8 10 22 19 21
10 10 24 26 35 35 35 37 42 37 35 30 35 35 36 36 36 41 41 50 50 47 43 27 23 9 9 9 13 11 7 6 6 8 8 10 17 25 19 27 23 29 35 33 36 36 36 36 38 42
38 38 38 36 36 35 35 31 31 31 30 28 27 25 21 19 10 10 10 11 15 19 20 23 22 20 20 19 25 37 48 46 47 23 21 13 11 11 11 12 13 27 27 37 37 37 39 33 33 36
36 36 36 42 42 42 37 50 50 50 50 50 50 40 40 40 47 47 47 54 54 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 50 50 50 50 50 48 47 47 47 47 57 57 68 68 68 68
68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52
52 52 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 53 50 50 50 53 53 57 57 57 57 53 59 59 59
47 47 30 30 24 23 18 14 12 12 12 12 15 28 30 40 43 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 54 47
47 43 43 43 43 48 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 54 57 57 57 57 54 57 57 59 59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 52 59 59 52 52 52 52 50 44 43 33 33 44 44 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57
57 57 59 52 52 52 59 59 52 52 52 59 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 52 52 52 52 52 57 52 52 43 59 39 39 39 43 39 39 38 59
59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 52 57 52 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 48 46 46 50 59 59 59 59 57 57 50 59 39 43 42 47 42 59 59 59 57 48 48 48 57 57 57
57 48 57 57 48 48 47 50 47 47 54 57 57 43 43 43 47 47 54 54 46 48 43 48 44 44 37 43 43 59 59 68 59 59 54 57 59 59 59 43 43 39 39 32 32 32 40 43 48 48
48 57 48 48 48 48 59 59 59 48 48 40 40 40 37 39 30 30 26 31 43 43 39 39 40 37 37 37 37 47 48 48 57 57 57 57 57 50 48 48 48 41 46 59 41 37 37 37 31 27
30 32 33 31 33 47 59 59 59 59 59 34 24 19 31 20 23 24 34 37 32 21 21 11 10 15 10 15 15 11 12 12 17 9 9 9 13 13 8 8 8 9 15 23 23 13 14 12 16 14
11 14 14 31 34 39 28 24 11 16 11 24 24 39 39 33 41 33 30 28 20 18 11 10 8 7 8 9 21 19 28 19 15 13 17 18 19 16 16 15 22 11 15 15 14 15 25 12 10 8
8 8 10 13 11 8 8 8 10 13 10 11 13 11 8 6 6 8 15 13 16 16 13 10 9 9 9 9 9 8 10 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 12 8 10 10 10 9
9 13 8 9 9 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 9 12 10 9 9 10 10 10 15 12 10 11 11 11 15 27 25 11 9 9 9 14 13 8 8 8 6 8 8 8 11 10 10
10 9 9 9 11 15 12 11 9 9 8 6 6 6 8 8 10 11 10 11 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 9 11 10 6 6 6 10 8 10 8 8
8 9 12 8 8 8 8 8 17 18 12 12 10 11 11 11 10 10 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 15 9 7 8 6 6 8 8 6 6 8 8 13 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 9 11 18 18 11 11 13 13 12 13 11 13 13 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 7 6 8 8 12 14 15 18 18 10 10 10
8 8 8 8 8 8 8 10 13 11 10 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 15 16 11 11 15 23 12 11 11 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8
8 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 10 13 10 10 10 11 11 11 10 10 8 10 6 6 8 8 9 10 10 13 11 16 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10
8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 8 10 10 8 8 6 6 6 7 10 8 11 11 8 8 8 8 8 11 8 8 12 12 12 |