BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-147C17.T7 (MSMg01no147_c17.b1) | MSMg01-147C17.TJ (MSMg01no147_c17.g1) |
ACC | AG350512 | AG350513 |
length | 706 | 718 |
length of high quality (start - end) | 467 (87 - 553) | 157 (72 - 228) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no147_c17.b1 PHD_FILE: MSMg01no147_c17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no147_c17.g1 PHD_FILE: MSMg01no147_c17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | ATTCNNTTCATCTATAATTGCGGCGCTAATACGACTCCTATTTCGACACA
ATCCGCGGAATTCCAGGCCATTCCAGAACTTGTCTCATAAACTAATCAAT
TAAAATTTATGGTGGCTACTCCGGGAACACCAGGAAAATGATGCCTTAAC
GGCTCATGTAGGTTTCTTTAAAACCTTGATAATGTCCAGAAACTGTCCAC
AGTTCGGAGGGCGCTTTCTCCACCATCCTCCCCACAGAGGACATTGATAT
GAGTGACCTCCGACCGGTGCCAGAAAGCCAATAAGTTTTCTGCCATCCTG
AGACCGACCAGAGTCTGATCATAGAACTTCTGGAGCTGCAGGCCCACTTG
CAGGGCGAAGCGGCTGCGCCTGCGGCTGCGCGGTACCATTTTGAGGACAT
TGGCGGGGTGCAGGGGGCTAGGGCTGCGCACGTGCTATCTGTGCAGCCTC
ACTGCTTGGAGGACTTATCCCCGAGAGGCTGCTGTCAGGATGCCTGGGTC
CTTCCTGGCAAGCAGCAGGTAGCAAAGGATGCCGCACTGCATCAGGCCTT
GCTTCGGCCGCCCCAGGATCAGACTGATCTTTTGCTCACCTTCAGTCAGT
CTCCCCCCCCCCCCCCCCCAGGGTCCGTGTTCATGCAGGTCTCTTGGCCC
TGGAAATCTGGCATGTCCCGCCTCGGAGCCTGGGTAACTTTGAACCCCTG
GTAACT
| ACTGCTGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTGCACAGCACACACATGTATACAAACAA
CATTTAAAAACAGTTATAATGAAATTAAGAGTGGATGTGTGAGAAGTGGT
TGACTAGAGGAGACAGATGATTGAATTAGACAAGTAATAGGTTGAGAAGG
TGAGTGGGGAGTTATTGTAGGTTAGGCGTTCCCCCCCCCACCACATTTGG
CACCGCTAAGATCCCCTGCCCACATGATAAGCTTGACCTCCCTTCCACCC
CTCCCGGCAGGCGCTGACCGTTTTCTTTATCCTTCGACCCCCGAGCTCCA
TATCCCCCTCCCCGTTCCCCCCCCCCCCCCGGCTCCCCCTCCGCCCCTCC
TGTCCCCCCCCCCCCCCCTCCCTTTCCCTCTTCTCCCTCCCCCTCTCCCG
CCCCCCCCTTCCCCCCCTCCCCCCCCCCTGCCTCCCCCCCCTCCCCCCCC
CCCTCTCCCTCCCCTTTCCCCCCCCCCCCGTTCTCCTCCCCCCCCCCCCC
CCTTCCCCCCCACCCGCCCTCCCCCCTCCCCCCCCCTCCCTCCTCCTCTT
CCCCCTCTTCCCCCCCCTCCCTCTCTTCCCCTCCCCCGTCTTCCCCGCCC
CCCCCGCTCTTCCCCCTTCTCTCCCCCCCCTCCTCCCCCTCCTCCTTTTT
CCCCCCCCCCTCTCCCCC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 3 0 0 3 6 6 6 9 15 23 12 15 9 10 10 19 9 11 11 17 19 20 24 33 33 33 43 43 44 47 27 21 10 10 10 18 10 8 9 9 8 6 6 6 6 6 6
10 12 12 17 19 32 32 33 33 36 50 50 31 31 31 29 21 17 11 12 12 12 12 12 14 14 19 24 24 24 28 20 26 19 10 10 10 21 21 57 57 47 47 43 33 33 22 22 22 42
43 57 57 59 57 57 68 68 68 50 50 48 48 42 42 41 47 48 48 54 54 46 46 48 57 48 48 47 47 30 30 26 26 40 44 50 50 50 50 48 48 48 41 41 47 57 57 57 57 68
59 57 42 42 42 42 50 43 43 50 57 68 68 50 57 50 54 50 57 57 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 46 48 48 48 48 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 33 44 39 39 39 23 23 35 35 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 43 43 38 42 50 43 43 52 52 57 54 59 52 52 52 52 52 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 48 47 47 59 59 59 59 57 57 48 48 48 59 48 54 57 57 57 57 42 42 35 42 42 47 47 54 59 57 54 48 59 48 48 57 59 44 44 43 57 48 57 54 54 54 48 44 43
43 43 57 59 59 59 59 54 54 54 54 54 54 57 59 59 59 48 48 43 43 40 40 43 43 48 59 59 48 48 48 43 43 41 43 40 40 40 32 32 28 31 25 32 32 41 43 43 43 39
47 26 17 10 9 10 8 10 16 20 22 34 34 28 28 30 28 28 32 39 41 41 41 41 37 37 39 39 37 37 28 22 13 13 13 26 28 37 32 33 37 24 28 19 21 27 27 23 29 31
27 27 13 13 11 15 10 16 13 19 37 24 23 20 22 20 26 28 28 18 11 8 15 19 19 19 12 12 12 18 30 30 41 40 36 30 25 19 13 12 16 19 22 23 37 36 28 31 23 32
18 25 23 27 27 32 32 37 24 20 21 23 19 14 26 19 8 10 10 10 10 10 13 10 10 12 11 11 12 12 9 9 9 9 12 10 8 8 8 10 15 15 17 17 20 13 13 14 13 17
15 15 15 19 22 13 11 10 10 9 9 12 13 18 31 31 16 18 10 10 8 8 8 10 9 9 9 9 9 9 11 10 10 14 14 14 10 13 17 26 23 20 16 19 15 11 9 8 10 8
8 11 10 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 9 10 10 9 9 10 9 9 9 9 19 16 15 10 12 11 23 21 23 23 18 14 15 24 16 16 9 6 6 6 6 7 10 19 17 11 10 10 10 10 15 23 24 24 20 20 24 31
23 36 33 44 26 25 17 20 21 15 19 11 11 11 12 12 15 19 23 37 31 37 26 26 23 23 36 36 36 36 36 36 36 36 33 33 33 33 33 41 41 21 19 10 10 10 19 11 14 14
23 27 37 37 41 41 35 35 21 16 11 12 15 24 30 37 36 34 28 28 28 24 22 37 37 31 31 24 16 16 21 21 20 23 20 31 25 33 39 37 42 42 59 42 29 28 28 28 36 32
33 42 42 36 36 24 37 37 48 59 48 37 36 23 22 18 38 27 41 46 48 41 30 36 22 19 28 22 26 36 30 28 32 39 42 41 41 41 41 29 42 32 32 42 42 42 48 46 42 37
37 37 42 42 28 28 23 28 27 23 24 28 40 39 33 37 24 28 20 20 20 32 32 22 17 11 11 11 11 12 12 19 16 20 13 13 10 10 8 8 9 9 9 11 12 12 24 24 13 9
8 8 8 8 8 9 11 11 9 8 8 8 8 8 10 19 20 28 19 18 16 12 10 10 12 12 15 12 12 12 11 11 20 18 21 18 12 8 8 8 13 6 6 8 8 11 11 11 18 12
11 10 9 10 9 9 9 9 10 9 9 9 10 13 15 11 13 10 10 10 12 16 11 11 11 11 11 11 11 15 20 16 11 9 9 9 9 9 9 19 11 10 10 8 10 11 9 9 9 13
10 11 11 17 17 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 13 17 21 28 28 28 28 24 24 23 19 12 10 8 8 8 8 8 9 12 12 12 9 9 9 9 9 17 15 13 8 11 11
11 11 11 14 22 21 23 31 20 22 18 21 21 25 30 19 15 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 12 13 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 12 10 8 8 8 15 8 10
10 19 16 20 25 13 15 8 8 8 8 11 8 14 19 16 28 25 24 24 18 13 10 9 8 8 12 8 8 8 10 10 10 11 17 19 34 34 27 17 10 9 9 12 15 20 20 22 19 17
11 14 8 8 7 7 8 19 12 12 12 13 12 10 10 14 12 28 34 34 34 30 20 20 21 21 13 13 9 9 9 9 8 8 8 8 11 10 11 18 28 19 20 19 13 9 9 9 10 14
14 9 9 9 11 13 15 26 23 19 8 7 6 8 6 9 8 11 8 8 8 10 15 16 11 9 12 8 9 9 21 19 19 15 14 12 10 10 10 9 9 8 8 10 10 8 8 10 11 12
12 22 27 27 10 8 8 8 9 10 17 12 13 14 17 21 20 10 10 9 9 8 8 11 11 10 10 10 25 10 10 11 10 14 13 13 9 9 9 8 8 8 10 10 15 7 8 8 17 25
39 37 23 19 10 10 10 10 6 15 9 9 9 7 15 7 7 8 10 13 14 9 11 11 11 19 17 19 15 9 7 6 8 8 8 8 10 19 10 12 12 12 13 13 15 23 23 19 23 11
9 9 10 12 12 11 11 28 23 23 23 10 10 10 21 23 18 14 |