BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-160H07.T7 (MSMg01no160_h07.b1) | MSMg01-160H07.TJ (MSMg01no160_h07.g1) |
ACC | AG360123 | AG360124 |
length | 709 | 705 |
length of high quality (start - end) | 315 (51 - 365) | 293 (77 - 369) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_h07.b1 PHD_FILE: MSMg01no160_h07.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no160_h07.g1 PHD_FILE: MSMg01no160_h07.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:26:25 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NAATATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCCTTCCCTGGGAAGACTTAAACTGTATCACACTTTCCTCAT
TAGTTTCCAATGACAAATGTACACGTGGCCCTATCAGAATCTACCCCGGG
GAACCAAGTAGTTTATTGGGCTTGTTTGCATGGTATGGGTACAAGGTTTC
TGCTGGGAGTATGAACAACCTCAGTGCATCCACACTAGGAGATCAACATG
CAAGGTGGTAACAATACAGATGGAGCCCCTTCAACCATCCGTCCCCAGCC
TCTATATGTGAACACTCTTGAGACCCCAGACTAACTGCAATTGGGGCAGA
ACTGCACACAAATATTTTTTACACACCTCCCCCCCTGGGTGAGAGGCCAA
TGACTCTCCCCATTACCTCCTTCCCCGAAAAAAAAAATGAGGGGGAGGCA
TCAACCATCCACAAGCCCGGACATGATGGTCACTTGTAGGCAGACACTAC
ATACAACCTGATGAAAAGGACCATATTTATAACAGGGACATTAAAGATCC
AAAGTATAGCAGACACATTGACATTATGTGCTGGGCCCTAGTCAGCCCCT
GAGTGCTGAGGTCCAGCCCTCTAGTGCGTTATTCTCTGTCAGACTATTAC
ACCCTTTTCTCTCTCATTAACACCAGATATTTTTGTTCTTTCTTAAATCG
AACTACTTT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAATTGATCCATTCCTATCTCCTT
TTGTACTAAGGTCAAATCTAAGTGGATCAAGGAACTCTACATAAAACCAG
AGACTGTGAAACTTATAGAGGAGAAAGTGGGGAAAAGCCTTGAAGATATG
GGCACAGGGGAAAAATTCCTGAATAGAACAGCAATGGCTTGTGCTGTAAG
ATCGAGAATTGACAAATGGGACCTCATAAAATTGCAAAGCTTCTGTAAGG
CAAAGGACACCATCAATAAGACAAAAAGGCCACCAACACATTGGGAAAGG
ATCTTTACCTATCCTAAATCAGATAGGGGACTAATATCTAATATATAAAA
AGAACTGAAGAATGCCCCACTCCAGAAAGCCAGATAACCCCATTAAAAAA
TGGGGCCTAGAGATAAATATTCTACATTTTAAAAAGCACATATTCAAATT
GACAACATAATGTACCTGCGAAAATGAAATTTTCAGGCAAATAGAACTAG
GGAACACACTGAGTACGGTAATCTTCAGATCCAAAAAGATAAACATCTCA
TGTTCCCAACCAAATGTGGACCTTAGTGTCATACCTTTTGATTTGTGCTC
CAATTACAGCGGCTGTATAATACAGGACGGCCAGAGGAGTAATATCCTCC
TCCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 13 10 10 10 9 10 22 31 36 32 33 32 30 28 28 37 37 37 37 37 37 37 37 37 43 31 26 28 28 28 35 48 48 48 42 34 34 34 37 37 32 32 28 29 29
36 32 43 43 42 42 29 29 42 42 48 48 48 48 48 42 42 37 44 48 57 43 48 54 57 57 57 57 57 47 47 57 57 57 57 47 47 54 54 47 54 57 59 57 54 47 47 54 54 43
43 68 68 59 59 50 50 47 47 50 50 50 50 47 41 50 50 52 54 57 52 52 52 52 52 57 47 47 35 35 43 43 57 44 50 37 50 40 40 32 41 41 52 57 52 52 43 43 43 43
57 42 36 36 52 52 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 52 59 57 59 57 54 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52 57 57 59 59 59 43 43
57 52 43 43 47 44 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 52 52 43 43 39 39 59 59 57 47 57 43 43 41 42 43 42 42 43 44 44 68 57 57 50 50 47 47 57 57 57 57 52
52 52 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 68 68 57 59 50 42 43 43 44 50 50 42 43 47 43 44 44 44 43 43 39 43 43 46 46 48 42 44 35 35
42 42 44 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 46 46 43 43 48 44 44 28 26 14 23 23 27 20 17 30 30 46 43 57 43 43 43 47 43 48 59 48 57 46 47 59 39 43 43 43 43
43 43 43 47 47 48 59 59 59 59 22 23 11 12 12 16 13 12 12 11 11 11 15 10 10 9 9 9 9 9 10 14 18 17 12 12 11 12 20 30 59 59 59 59 59 39 39 39 43 43
57 57 57 57 46 47 47 48 48 48 48 48 48 48 48 39 39 39 39 37 32 34 16 9 8 8 8 8 11 15 11 15 13 15 11 10 10 10 19 15 24 31 59 59 59 39 39 30 23 18
21 18 17 25 24 26 28 20 24 17 22 28 36 42 37 30 32 41 39 44 44 54 54 54 59 59 59 44 44 26 26 30 32 26 26 12 24 19 24 20 28 28 47 36 33 33 33 42 42 33
42 42 40 32 24 24 20 20 31 32 42 42 36 32 30 32 32 37 36 35 35 37 39 42 48 48 54 48 48 40 36 25 25 23 32 27 43 43 43 43 39 42 32 30 28 25 25 21 27 21
19 14 17 18 19 18 23 14 14 23 21 15 15 12 12 12 16 16 32 25 19 12 12 11 12 12 24 19 28 20 23 20 22 17 15 14 14 18 18 13 14 11 12 12 14 14 19 24 25 20
22 11 11 13 21 15 15 26 15 13 10 13 13 15 13 15 15 15 21 21 12 12 11 10 8 8 8 8 15 10 12 12 12 18 19 19 20 24 22 28 23 15 10 11 12 14 19 15 17 11
11 11 12 19 21 26 22 10 10 10 10 9 9 9 9 9 11 16 10 10 8 8 8 8 11 10 15 15 19 19 15 9 8 8 15 15 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6
6 7 8 8 8 8 10 18 15 | Open.Hide. 9 9 9 13 12 8 6 6 10 11 30 30 24 30 32 39 32 37 32 37 39 39 39 40 39 41 40 43 43 48 57 43 43 43 47 43 48 48 28 28 24 24 24 32 43 48 48 54 48 42
48 37 37 37 42 43 48 41 43 47 48 30 36 36 36 41 48 44 57 57 46 46 46 46 50 41 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 52 50 44 38 27 20 20 20 32 43 50 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 43 43 35 43 43 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 68 62 62 57 57
57 52 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 52 52
52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 54 57 54 57 57 57 59 59 57 44 43 44 50 47 57 57 59 59 54 54 54 57 59 59
59 59 54 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 48 48 44 44 40 30 25 25 30 36 37 43 43 46 46 48 54 57 57 57 48 48 48 48 59 59 59 48 48 46 46 46 48 59 59 57 57
57 57 57 57 59 59 48 43 43 43 43 43 43 34 30 19 18 15 15 15 12 12 12 15 15 18 24 18 23 32 34 43 48 48 48 48 48 48 59 57 57 57 59 59 57 39 39 30 30 30
39 37 48 43 48 43 32 31 18 15 15 10 9 9 9 9 9 11 11 11 10 11 17 16 22 27 15 14 7 7 8 19 25 41 41 50 41 48 48 48 48 39 34 34 25 25 33 33 43 43
43 37 32 23 23 23 25 26 18 13 13 19 21 28 30 30 30 30 42 42 48 57 43 43 39 39 39 44 39 43 40 40 40 43 37 47 35 35 35 39 39 39 34 34 28 28 24 27 34 59
39 34 28 28 28 28 37 37 39 35 39 39 47 47 47 43 46 43 43 40 40 33 30 37 37 32 29 31 39 37 37 39 39 39 39 32 30 30 30 30 22 24 11 11 11 11 12 26 19 17
14 16 17 18 22 25 19 18 20 21 19 15 14 12 12 21 22 14 24 24 28 33 59 48 30 30 17 17 17 30 30 34 27 19 19 22 28 24 26 31 35 37 37 39 37 29 32 19 17 17
20 21 21 30 25 28 24 15 10 15 14 15 19 20 34 31 31 19 13 13 12 12 13 23 26 33 24 10 10 10 10 10 17 31 33 24 24 22 16 17 23 16 13 14 15 10 10 10 10 12
12 15 16 25 20 11 11 11 13 15 12 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 11 11 13 10 13 13 10 8 8 8 8 10 10 9 9 11 8 9 9 10 17 10 10 12 13 10 9 9 9
9 9 10 9 9 |