BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-172J01.T7 (MSMg01no172_j01.b1) | MSMg01-172J01.TJ (MSMg01no172_j01.g1) |
ACC | AG368437 | AG368438 |
length | 714 | 712 |
length of high quality (start - end) | 190 (128 - 317) | 573 (77 - 649) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_j01.b1 PHD_FILE: MSMg01no172_j01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no172_j01.g1 PHD_FILE: MSMg01no172_j01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTCGNGACGCGGCGCGGA
ANTCCTATCACTTTCGCAGCAAAGCACACATGNTACATGCCCTTCAGCAT
AAAAATATTAGAAATTTTTTTCCGAGGAGTGATCAGTTAATCCGAAGAGT
GTCAATCATGCCTGTTTCACAGATAGTTACATGATGTTTCTACTGTCACT
TGTTGAATAGATTTATGGAATTTTAGCTGCATACTTTTAGAAAAATGAAA
CTCCTTGTTTGCCAGGAAAACTGATCTGCCCCTAACTGGCTGGCTGTAGG
TGTAAGTGAATTTGAGAGTTTGCTAATTTTAAGGGACTCAAGGACTAGAC
CAGCTTGTTTTTTTTTTCCCACCCCACCCCAATGTCAGAACAGTAGGGAC
TCTCTCTGCACCTGCACAGGATGAACAAAAAATTAATGATTATCTGTGAG
AACAGACAACAAGGAAAATCTACTCTGCTCAGAAGTTCGCAGTGTGGATT
AGCTTCATTGGCATCTAATGTCTGAGTGCCATTGAGCTGATCTTTTTTTT
TTTGTACCTTCTGGCTCCTGCCTCAGGATGTCCGATTCGCTTTGTTTATC
TAGCGTTTTATCTAATTTTGGCACAATTCATCCCACCCATTTTTTCACTC
GCCCCCATTGTCTATGTCTATTTTGCCTATATCATAGGGAATTCAACCCT
TAACTTCACGCCCC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTGAATATAAAACTTTTGAAGAC
AGGAGGATTACTATATGTTCCTTGCCATAAGAAATAGTGTGCCCTTCCGC
TCCACTCGAGCCCCGGGCTACCTTGCCAGCAGAGTCTCGCCCAAAACCCG
CAAGGGCCCACACAGGACTCCCCACGGGATCCTAAGACCCCTGGTGAGCG
GAACACAGCACCTGCCCTAATCCAAACACGCGGAACCTGAGACTGCAGTA
CATAGGGAAGCAGGCTACCCCGGCCTGACCTGGGGTACAAGCCCCTTCCG
CTCCACTTGAGCCCTATGTTACCTTGCCAGCAGAGTCGCCTGACACACGT
AAGGGCCCACACAGGATTCCACACGGATTCCTAAGACCTTTAGTGAGTGG
AACACAACTTCTGCCAGGAGTCTGGTTCGAACACCAGATATCTGGGTACA
TTCCCTGCAAGAAGATAGCTTGCCTGCAGAGAATACTCTGACCACTGAAA
CTAAGGAGAGTGCTACCATCCAGGTCTGCTTATAGATGCTAACAGAGTCA
CCTGAAGAACAAGCTCTTAACAGTGACAACTAAAACAGCTAGCTTCAGAG
ATTACCAGATGGCGAAAGGCAAACGTAAGAATCCTACTACAAGAAATCAA
GACCACTCACCA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 11 21 40 39 37 37 25 20 11 17 17 19 11 11 13 27 27 41 22 19 14 14 11 10 6 6 6 7 6 3 0 3 6 6 6 6 7 8 8 8 19 25 21 21
3 0 3 23 27 35 23 18 9 9 9 9 18 9 6 6 6 6 6 9 9 15 14 16 27 29 37 37 37 23 23 3 0 3 23 23 37 37 37 47 46 48 33 36 36 36 36 34 43 43
57 59 57 57 50 53 44 31 33 33 37 30 21 23 12 12 13 19 16 8 8 8 8 6 6 7 12 17 19 22 34 34 37 34 37 48 48 48 48 53 53 50 50 57 59 59 57 50 53 43
48 47 42 42 48 48 48 48 48 43 43 43 43 48 57 54 57 54 48 48 48 50 50 68 68 68 59 57 46 43 39 46 57 57 57 47 54 54 59 54 54 54 59 59 48 48 48 59 59 59
59 68 68 68 68 57 48 46 43 43 43 46 57 57 59 59 48 48 48 57 57 68 44 59 39 31 31 34 34 36 43 43 48 37 47 43 25 28 24 25 35 39 39 47 47 39 37 37 39 26
28 18 19 18 11 8 8 8 8 8 12 12 17 24 30 34 43 43 48 59 59 43 47 46 48 46 48 48 48 57 48 43 43 43 43 43 34 34 30 30 39 42 42 59 43 26 26 13 13 13
28 30 57 47 47 40 39 39 39 43 41 41 34 34 25 19 12 12 12 19 11 9 9 9 9 9 11 11 10 11 18 23 34 37 59 59 59 59 48 48 48 48 57 57 41 41 23 23 23 41
34 46 46 23 19 10 8 8 8 9 15 18 30 26 24 19 19 12 12 11 11 11 17 15 9 9 9 9 9 12 12 12 24 27 32 41 40 42 43 27 23 14 12 12 15 15 17 32 32 48
48 57 59 59 59 59 59 47 34 41 25 31 31 23 23 23 26 24 15 15 11 10 10 10 9 9 9 10 12 25 26 36 29 26 26 30 43 41 32 35 35 35 39 39 43 37 27 19 11 11
15 21 15 19 15 24 22 14 14 15 21 23 28 28 23 23 21 28 30 28 32 39 39 46 43 43 41 36 16 18 11 12 11 12 12 24 26 28 28 28 19 19 13 21 18 11 11 23 27 59
28 28 14 26 23 31 31 33 36 29 28 28 19 25 15 15 13 13 12 12 12 12 12 18 8 8 8 8 8 9 12 30 18 18 11 16 18 15 16 20 22 22 25 34 39 39 39 39 41 41
43 31 26 17 14 15 14 14 17 26 17 19 11 10 8 8 8 8 8 18 18 15 14 11 11 13 13 19 15 15 15 15 10 10 8 8 8 8 8 8 12 13 13 8 8 10 8 8 8 11
12 22 18 19 17 17 20 32 32 39 33 28 21 21 23 23 23 13 10 9 9 9 9 11 18 10 10 8 8 8 8 10 16 12 19 18 16 11 9 9 9 9 9 17 19 10 13 10 12 9
9 9 12 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 12 12 12 12 8 10 8 12 8 8 9 9 11 8 8 9 9 8 11 8 8 9 9 12 12 12 12
12 9 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 11 10 8 6 6 8 13 17 29 32 36 37 41 41 47 50 48 48 53 53 57 53 53 48 57 57 48 48 44 43 39 39 36 33 34 42 30 36 36 40 42 44 43 43 43 46 42
50 50 50 50 50 50 50 48 54 54 57 48 41 41 36 41 41 39 39 44 32 46 41 41 43 43 48 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 59 50 47 47
42 40 47 57 47 42 42 42 38 50 59 59 59 53 53 50 34 30 22 18 18 20 28 17 16 14 12 12 22 22 32 33 33 33 33 36 36 50 50 53 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 50 50 50 53 53 48 57 57 57 57 57 43 43 42 44 46 54 47 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 57 50 50 38 38 38 54 50 59 50 57 52 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 57 59 59 57 57 54 54 57 57 57 54 54 50 50 48 57 50 50 43 41 42 44 42 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59
59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 48 54 54 46 44 36 30 30 40 44 46 54 46 48 48 48 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 48 48 57 59 59 59 57
57 57 57 57 57 50 50 48 43 32 26 15 12 11 11 11 11 11 12 15 28 32 31 32 31 26 26 19 19 18 23 18 20 33 41 59 59 43 43 43 43 44 48 48 48 48 25 27 11 11
11 24 26 48 48 48 46 47 48 48 48 57 47 47 48 48 50 50 57 59 59 59 57 57 42 39 35 39 39 47 47 36 36 32 32 37 42 42 54 46 57 57 57 57 47 57 43 43 43 46
57 57 57 57 57 57 59 57 59 50 46 46 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 52 52 52 54 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 54 52 57 52 59 57 52 52 52
54 57 57 57 57 57 57 57 52 48 50 50 47 47 47 47 47 50 57 59 59 59 59 57 59 59 57 43 43 43 57 57 57 57 57 57 48 54 48 57 48 54 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 50 50 48 48 48 48 48 48 57 59 57 48 43 43 40 43 43 48 43 43 30 30 33 37 37 43 48 57 57 57 43 43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 37 34 28 25 25
28 34 39 39 28 31 39 31 28 32 26 26 22 28 28 37 28 30 18 18 22 28 28 32 34 34 35 31 29 29 32 30 28 33 33 39 37 37 43 37 37 30 23 21 19 11 11 15 19 19
10 14 14 23 21 12 12 12 22 15 10 10 12 12 14 15 12 10 9 9 12 11 11 19 26 18 13 13 10 13 14 21 20 20 24 30 12 12 9 11 12 21 23 21 20 19 15 10 10 13
13 21 17 18 15 16 13 12 10 10 12 12 |