BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-176H10.T7 (MSMg01no176_h10.b1) | MSMg01-176H10.TJ (MSMg01no176_h10.g1) |
ACC | AG371155 | AG371156 |
length | 1,311 | 1,226 |
length of high quality (start - end) | 329 (126 - 454) | 556 (127 - 682) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_h10.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_h10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_h10.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_h10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:15 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCGCCACTGCGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TCCATGAGGAACACCGAATGTCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACA
TCCTTAATCTTCAAGAAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCT
CACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCATAAATTCCGGTGACAGCACATGCT
GGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACGCTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGC
AGGCTTATACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGGAAATT
GGACATAGTACTACCGGAGGATCCATCAATACCTCTCCTGGGCATATATC
CAGAAGATGCCCCAACTGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATGTTCATA
TCTTTCTTATTTATAATAGCCAGAAACTGGAAAGAACCCAGATGCCCCTC
ATTTTTTTTTTGCCCCCCAAAAGGTGGTACCTCTACACAAAGAGAGAAGT
ACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATG
GACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGAACTC
ACACAATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAAAACCTAGGATA
CCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAATACATGAAACTCAAGAAAAATG
AAGAGTGAAGTGCGGACACTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAACAAAACA
CCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACTAAGTTTGTAGCTGAGATGAAAGGATG
GTCCCATGTAGAGACTTCCCTATCCAGGGATCCACCCCTTAATCAGCATC
CAAATGCTTACCCCATTGCATACCCTAGCCAGATTTTATTGAAAGGACCC
AGATGTTACTGTCCCTTGTGAAACTATGCTTGTGCCTATCAAACACCTAA
GTGGATGCTCCCAGTCCCCTTATGGATGTATCACAGGGCTTCCCATTGTA
AGACCCAGAAAAATTACCCAAGGAACTTAAGGGTATCTGCATCCGCTATA
GGCCGAAACCACTTTTTTGATTTAACCCTGTACCCTTGCAAGCTCTTGAC
TTCTTATTTGCCTTGGTTCTCAAAAAAGGCCCCTACCCTCCCCCTCCCTG
GTATAAAAAAGCTCCCTTGTGACCCCGCATCTCTTCCTATCCCTCTCTCC
ACGGCTACATCCCGTGTCTCATAATTGTGAAAGGTCTGGTCTTACTCTAT
TCTCTCTTCTCCCTTCTCTATTTCACCCTTCTCACTACTTTCTCTCTCTG
TTTCNTTCCTC
| NNNCCCACACACTGGAGCCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTAAAAATCCCCGACTTTTTGTTTAATAT
GGTAATGTATACTATTTATGACTCCCCTGCTGGTTCTATTTGAAACAATA
GTTTATGAACTTTCTGTCCAATGCTTATTTGGCTTTTTCATACTCTGTCC
CTTTTACAAATTTGTGGTTATTCCCATTTCCATTTGGCTGAAGTAATAGG
TTAGGGTGTTATTTTAAACTTTAGCTAATCACCAAAAAGAATGCTTCTTG
GTGTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTACCAAGAAAAGTAAATTGGAAGTATG
TGAATCCAAAAAAAGGAAAGGACTACTTTTTTGGCTTATGCTGATCAAAA
CATTATTATTTGATTGCTGTTTTTAAACTAATGAAAATACATTCAGAATC
TGTAAAATTGGGAATGATTATATGGTAAGCCCAAATTCTTTCTCTGCTTA
CTATATTACTTCTATTTAAATTCAATAAGTTTTTCTTGCCTTACCTCACC
CTCTTAAATTTCAGAATGCTTTCAAGTTCAGTAGTGTTCCAAGAGAGGTC
ATGTGACAACTGAACAAAAGGGGCAGCCTTGATGTCAGTCTGCATTGCTT
GTGGATCCTGCTTCCTGGTAGAAGTACTTTCAGCAGCTGGCACTCAACAA
GTGATCAGACCACACAATGCTAATTTTGTTGTTGGTGCTGCTGCTGCTAC
TGTTGCTGTTTTGTTGCTGCCCATCATTTCTCTCCCTCCTCCTATATCCT
TTCTTTTCTCTTCTTCTCCTTCTTATCTTCCTTTTCTTCTTCTTTTCCTC
ATCTCCTCTCCTTCTTTTTCTCTCCCTCCTCCTTCTTCTCTTCCCTTTAC
TCTTTTCCCTTCTTTCCTCTTTCATTCTCCTTTTTTCTCTTTCTTCATCT
CTTATTCTCCCCACTTTCTCCATTCTTTCTTTACTTTCTCCTCTCTTCTC
TCCTCCTTCTTCTTCTCTTCCCTTCCCTTCTCTCATTTTCCTCTCTCTTT
CTTTTTCATCTTCCTCCCTCACTCTTTCTCTTTCTCTCTTCCCTTCCTCT
CTTTCCACTCCCCTCCCTCATTGCCTCTTTAAATACTCCTCTCCCTTTCT
CCTCACATCCCTACATCTCTTCCACTCCCCACATCCACTTTACTCACTAA
CGCCTTTACCTCTTTCTTCCCGCTCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 7 9 9 9 9 11 16 18 20 14 11 8 8 8 8 12 14 9 10 10 8 8 8 19 21 28 24 26 24 28 33 33 33 33 28 24 24 26 23 26 26 30 32 22
13 9 9 23 19 33 33 33 44 36 35 33 23 23 10 19 16 13 8 8 8 8 8 13 18 14 17 18 25 30 23 18 21 24 30 29 36 47 57 57 48 48 48 39 39 30 35 30 37 37
44 37 37 40 37 34 21 18 13 14 11 12 9 9 9 9 9 21 23 30 30 12 12 11 11 16 16 25 29 41 36 37 35 32 32 39 39 39 43 39 39 35 37 37 43 43 43 43 42 48
47 42 48 48 46 39 39 42 40 29 28 30 37 37 57 59 36 36 34 36 33 33 39 47 43 41 41 41 34 34 21 23 15 15 15 21 30 32 32 20 20 16 19 17 17 17 25 28 32 36
37 47 43 32 32 23 23 23 40 37 46 48 48 48 48 48 57 57 59 59 68 68 68 59 44 44 36 36 43 46 44 46 54 46 44 43 37 37 42 39 47 43 43 42 42 35 47 47 48 48
48 46 44 44 44 48 47 46 44 43 43 57 46 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 46 43 43 32 29 44 41 43 43 43 44 43 43 44 38 43 50 44 43 35 35 50 59 59 52 52 52
52 42 42 42 36 36 32 44 43 50 50 57 57 57 57 57 57 50 48 48 46 57 47 47 44 42 39 37 35 35 42 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 59 59 68 68 68 59 59 57 59
47 43 39 39 37 37 43 32 32 43 41 41 41 40 48 42 43 37 35 32 39 33 43 43 39 42 43 43 43 43 47 48 43 57 46 43 43 59 47 48 48 47 47 40 59 40 30 25 10 10
6 6 6 8 8 10 13 34 34 47 48 48 48 48 48 43 47 59 59 59 43 43 48 48 48 43 43 43 40 43 43 43 43 34 34 34 34 33 33 39 39 48 48 50 59 59 59 32 26 13
13 11 11 13 12 15 14 9 8 8 9 9 9 10 8 10 8 8 10 14 25 41 41 20 18 13 13 11 8 11 10 11 8 8 12 11 11 11 11 10 8 8 6 8 9 9 12 12 12 12
18 20 21 25 26 39 43 48 57 59 59 48 48 59 57 57 48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 48 47 59 48 54 47 43 39 42 40 40 29 37 42 39 37 37 43 43 43 43 43 43 39
43 43 44 42 42 30 35 44 44 44 35 35 36 40 35 35 35 42 47 42 42 42 43 43 44 42 42 37 43 42 50 43 47 47 57 57 57 43 37 37 43 43 52 52 52 52 52 52 50 37
37 43 50 47 47 47 50 50 57 59 57 57 57 57 44 36 28 36 37 42 37 42 33 33 33 35 35 42 44 44 32 32 14 14 14 30 24 28 28 30 37 37 32 32 24 25 17 28 28 39
36 40 25 25 25 37 37 42 39 32 31 23 20 20 31 31 22 30 30 37 32 40 39 29 32 31 32 39 39 32 28 20 20 26 21 23 23 21 26 14 26 26 20 19 19 28 37 37 37 34
26 20 23 20 32 31 30 30 18 15 12 11 12 12 12 15 13 13 16 24 32 39 39 36 36 37 39 39 34 37 32 39 30 28 26 21 19 21 21 15 18 24 27 24 28 28 34 19 16 10
10 10 11 16 21 17 20 22 28 24 30 30 32 28 20 30 15 15 15 19 13 13 11 11 9 9 10 10 11 21 12 10 12 11 11 18 17 11 12 12 21 21 12 13 15 15 10 10 13 16
19 22 22 28 24 19 13 12 12 9 9 9 10 10 15 15 13 15 10 12 10 13 13 19 10 10 10 10 10 13 14 13 11 11 17 21 19 12 8 8 8 10 10 9 9 15 15 21 19 24
12 10 10 15 16 25 20 22 21 21 21 18 20 17 22 17 15 11 8 12 8 10 8 10 13 15 8 8 8 6 6 8 8 8 15 19 16 16 13 12 13 12 10 10 10 10 10 13 17 12
11 11 10 12 9 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 11 15 11 10 9 9 9 9 8 9 9 10 10 10 10 7 6 8 8 8 8 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 12 15 13 17 16 12 20 16 16 16 11 15 12 13 10 8 8 8 11 12 10 10 8 9 8 8 8 8 10 12 11 10 10 13 8 8 12 10 10 10 10 11 9 11 11 11 14 15 10
10 10 12 10 8 11 9 10 10 10 11 13 11 11 11 11 11 11 9 9 9 9 9 8 9 9 9 9 9 10 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 6 10 6 6 6 6 7 7 8
8 10 12 10 9 7 7 11 8 13 10 14 11 13 9 8 8 6 6 6 6 6 8 11 11 11 12 13 11 11 11 13 13 17 11 9 8 8 8 8 8 9 9 11 11 8 10 10 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 12 12 12 19 10 8 6 6 8 8 12 8 9 8 6 6 6 10 10 11 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 6
6 10 9 10 10 9 10 11 12 11 8 8 8 8 10 10 11 8 6 6 6 8 12 9 9 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 8 8 8 10 6 6 6 10 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 13 10 10 10 9 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 8 10 13 13 11 8 8 10 10 8 8 9 9 12 10 8 6 6 8 8 8 8 8 10
9 8 8 8 8 8 8 8 15 8 6 6 6 6 8 10 10 9 8 8 8 10 8 6 6 8 10 8 8 8 13 10 8 8 8 6 10 10 15 7 6 6 8 8 8 11 7 7 6 6
9 12 16 3 0 3 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 7 6 6 6 6 6 8 6 6 8 13 6 6 6 6 8 8 12 7 8 8 8 8 7 8 12 13 12 8 8 10 14 19 23 11 19 19 30 28 30 28 28
28 28 22 19 19 25 33 39 39 27 27 3 0 3 3 0 3 10 9 10 10 11 9 9 9 12 14 12 12 12 10 9 10 12 12 22 28 31 37 50 50 50 36 36 36 36 36 36 42 42
42 57 57 48 43 34 33 22 16 14 14 10 10 10 9 10 10 13 16 12 8 8 6 6 6 8 23 25 33 33 33 33 33 33 35 35 36 36 36 36 48 48 48 57 57 47 42 34 42 34
34 39 42 48 48 48 48 48 48 48 57 57 68 68 68 68 50 53 43 41 41 40 42 41 47 47 48 50 50 57 57 57 54 54 59 57 57 57 57 54 48 43 43 39 39 39 40 40 42 57
57 57 42 42 47 47 39 39 48 48 48 47 47 43 43 41 19 15 9 9 9 18 27 37 37 37 39 37 37 43 43 43 48 43 47 36 43 43 47 59 47 43 26 26 21 23 23 24 28 42
42 37 37 37 42 42 48 48 48 54 57 57 57 57 57 54 57 57 59 54 44 44 32 32 37 43 48 57 57 54 54 54 57 57 57 57 47 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43
42 43 35 37 37 43 50 50 46 46 43 43 43 35 35 35 59 59 59 44 43 32 43 42 44 43 25 24 20 20 26 32 25 28 27 28 28 42 42 57 44 42 35 35 42 42 43 47 57 57
59 57 57 57 46 47 43 43 43 43 43 47 43 47 43 43 43 47 43 43 43 48 48 47 57 48 48 48 59 59 47 47 43 43 39 43 43 48 48 48 48 48 39 34 28 23 23 28 28 30
30 21 14 8 8 8 10 19 25 41 40 40 39 43 36 43 39 47 39 43 59 57 47 48 48 27 19 8 12 8 19 22 43 48 42 37 32 28 32 23 31 37 41 34 25 18 26 28 28 39
37 32 32 32 41 39 43 42 34 36 24 21 14 26 24 35 37 39 39 44 44 42 32 34 57 38 38 36 36 43 59 44 24 23 11 11 11 28 41 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 47 44 47 46 59 42 39 35 39 39 43 44 43 46 46 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 59 59 39 35 30 36 28
28 35 43 40 57 46 57 43 43 47 30 29 18 20 25 43 34 46 46 46 37 37 32 35 35 37 37 34 34 25 23 19 25 12 12 19 21 19 30 24 24 26 30 34 25 19 11 11 13 23
23 20 22 22 27 27 28 32 28 32 31 31 20 23 19 22 31 31 31 37 32 19 19 13 13 14 15 26 30 42 46 46 42 36 25 19 17 30 30 43 42 42 47 47 42 40 37 28 28 33
24 24 28 22 19 24 24 29 32 19 19 20 31 32 25 17 9 8 8 8 10 11 21 18 23 28 30 30 24 21 20 10 10 10 13 10 11 19 13 12 10 10 13 19 13 12 12 18 19 14
14 18 25 24 24 21 14 19 22 24 21 28 28 28 28 20 20 14 16 18 25 35 20 15 9 9 9 14 20 14 14 13 18 18 18 11 16 22 32 39 39 27 23 13 11 11 19 9 10 10
17 10 10 8 8 8 8 8 9 9 13 14 12 13 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 9 8 10 7 7 10 8 9 10 11 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6
8 8 10 9 9 10 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 7 9 9 8 8 8 8 8 8 9 9 8 11 8 7 7 7 7 10 10 10 10 8 10 10 10 12 11 11
11 8 12 10 8 7 7 8 7 7 8 8 10 11 11 18 10 10 10 10 10 9 8 8 8 16 10 9 9 9 9 9 9 10 16 16 10 10 10 13 13 11 11 11 11 15 21 16 11 8
8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 10 10 10 11 15 21 10 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6
8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 11 10 13 15 15 10 10 8 10 10 13 10 10 11 12 11 10 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 9 9 11
10 8 6 8 8 8 13 11 11 9 9 10 13 10 12 8 8 8 8 12 12 12 11 10 10 10 9 8 8 11 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 11 11
11 11 11 14 10 9 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 7 7 8 8 9 9 9 10 9 17 12 14 12 11 7 6 8 8 10 8 8 8 11 12 8 8 8 12 8 10 10
21 11 11 11 8 8 8 8 8 12 10 10 10 8 9 10 9 9 9 9 9 9 9 9 11 12 18 10 9 10 11 9 8 8 7 7 8 8 14 10 10 12 12 13 13 15 10 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 10 17 13 16 9 9 9 9 8 10 11 10 12 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 6
6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 8 7 10 10 8 8 8 8 8 6 9 9 9 9 9 |