BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-276O19.T7 (MSMg01no276_o19.b1) | MSMg01-276O19.TJ (MSMg01no276_o19.g1) |
ACC | AG414970 | AG414971 |
length | 743 | 738 |
length of high quality (start - end) | 697 (47 - 743) | 286 (77 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no276_o19.b1 PHD_FILE: MSMg01no276_o19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:16:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no276_o19.g1 PHD_FILE: MSMg01no276_o19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:16:57 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCCTTGTTTCCTCTGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCTGC
CACCAAGAAAACAGTTGATGCCAACCGCTGACAAAATAAGGGGAAAGGAG
AGCCTTCATCAGTTGATGCCAAATGCTGACAAAATAAGAGGAAAGGAGAG
CCTTCATACTCTGTCAGTGAACGAGTGCAGCCCCTTGGAAAATGATCTGG
TCGGTTCCTTAGAACTGGAGCCAGAGCTATCACGACCTTGGTATTTCGCT
CCTGGGACTATACCTAAGGACATCACATCCAATTAACAGAACCTTTGCAC
ATTCCTATCCACTACTGTTCTCATCACCACAGCTAGTTCATAGAATTAGC
CTAGGTGGCCATGGATGGATGAATGGATAATAACAATGTGGTGCTTGGAC
ACAATGGAATTGTTTTAGTTGTAAAGAAAAATGAAGTTGAGAAATTGGCA
GGAACATTGGACAGGACCAGAAAATGTACATAGGAAGTGGTGTAGGCCCA
GAGAGACAAACACTGCAGGTTTTCTCTCATATGTGGATCATAGCTTTAAC
TTTTAGATTTTCATGTTCAACTTGGAATGTCTGTTGAAACCAGGAAGCTA
GGAGGGGGCTATGGTGGATTGGCAGCACGGGGTCTGCAGAAGGGCAGATG
GTGGAACCCACATAGCCTGAAAGCAGAGGGAGGATAGTCTGGG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGGATCCAGGGAGATCTTGGGGGA
CAGTAGCCGGCGTGTGCGCTCCCGGCCGGCTCAAGCTTCCTTGGCCTGTT
GCTGTCTTAGACCCCGCGTTACCGAGCAATGGGAATAGTCCTTTCTAACC
AACCGGGCTGCAGGGACCCCGCGGGGGGCGGGTTTACGAGCAGCGAGAAC
AGAGTGGCAGGGAAAGGCGTCGTGGTCTCTCTTGGCAGGGTCTAGGTAGC
CTTCATGCTTGGAGAGGTGGAAAGTCAAAGGGTGTTGTTTCCCCTAAACC
CAAGTGACCAGTTCTGCTACATCTTTGAGACCTGGTCCACAGCGCTATCT
TCCTGGCTCTCAAGGCACGGCTGTGTCTTGATCCCTCTTTGGGCAGTGGT
GATGATAATTATGCTGATGGTGACGATGGCGGTATGTTTGTTCCTCAGTG
AAGTCTCTGGAGGTCCCCAAAGAAATTTAGCATTTTAGATAGGAGTTTTG
TCATTTCTTCTTCCACGCCTAGGAGCTCAACTACAAGTCATCACAAGACC
TAAAAGTAAAGATTAACCTACGATTTTTTTTTAAAGTTGGGACATTTTAA
AATCAGAACTGGTTTCAATGGCGCCTGCAGCTCAGAGACAACAGGACACT
GGTTCTTGAACCAACACTGCCATCTGCTGTCTACTCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 12 24 37 40 43 37 37 37 31 31 37 37 37 37 37 42 37 41 48 50 30 28 31 30 20 16 25 12 12 11 10 10 18 23 37 28 28 28 31 31 35 59 57 57
36 36 31 31 33 33 47 47 59 31 21 8 8 8 8 8 6 17 25 41 39 39 35 35 35 39 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50 50
50 50 50 53 53 50 50 59 57 36 36 36 36 36 31 41 39 39 40 33 25 18 10 8 8 8 8 10 22 28 42 50 50 50 50 53 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 57 54 54 68 68 68 68 68 47 50 50 50 50 50 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 57
57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 42 42 39 35 35 35 37 36 42 42 57 57 57 59 57 54 54 54 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 50 48 41 30 28 15 12 12 12 12 12 18 28 32 37 28 28 23 20 20 18 18 18 18 18 24 28 30 47 59 59 59 59 59 48 48 48 59 57 57 57 57 57
48 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 57 50 54 57 57 57 57 59 59 44 44 37 42 42 35 35 35 35 35 35 40 40 47 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 57
57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 59 54 54 57 57 57 68 57 57 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 43 43 59 59 59 57 50
50 48 48 47 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59 54 54 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 43 43 43 59 47 57 57 59 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 35 35 35 47 47 57 57 57 43 43 43 43 43 43 43 48 57 59 57 57 57 57 37 37 28 28 28 41 32 36 36 43 39 44 41 36 31 35 36 59 59 59 59 47 48 48
48 48 57 57 50 53 59 41 41 31 37 34 34 31 37 26 30 28 37 34 31 29 41 41 41 41 41 41 34 32 39 39 39 37 47 34 32 23 28 28 23 23 26 31 34 26 26 18 26 20
24 31 31 24 24 24 27 28 28 32 37 37 37 36 32 30 24 24 24 24 26 29 30 34 28 28 22 24 24 29 32 7 7 6 6 6 15 19 37 32 29 29 29 | Open.Hide. 9 9 15 15 13 8 8 8 8 15 21 32 32 37 37 37 37 50 39 44 50 53 53 53 41 41 37 37 37 22 19 13 8 8 8 10 11 16 14 18 21 21 29 29 48 53 53 57 57 36
36 33 33 33 33 42 41 25 15 8 6 6 6 8 9 10 25 23 37 30 22 25 30 30 33 36 53 53 53 53 53 53 53 53 37 47 50 47 47 47 50 53 53 59 59 59 59 53 50 50
50 50 50 50 59 59 59 59 57 57 53 53 59 59 47 47 47 47 47 30 17 8 8 8 12 15 37 59 59 50 50 50 50 50 57 59 59 57 53 53 53 53 53 57 57 57 59 59 59 59
57 68 68 68 68 68 57 57 50 50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57
57 54 54 52 57 57 57 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 36 30 28 31 41 32 41 41 41 48 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 57 57 57 53 39 30 34 25 18 19 12 12 11 10 10 10 10 13 19 19 14 14 14 15 15 11 11 11 20 23 23 32 33 36 41 50 50 53 53 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 47 47 46 43 43 46 43 37 28 28 23 23 22 17 10 10 10 13 23 34 47 59 59 59 59 48 48 48 47 47 39 39 39 43 43
48 57 57 57 57 57 48 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 59
68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 59 59 59 59 48 48 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 54
48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 42 42 42 41 39 44 44 37 37 41 43 47 41 46 46 43 43 48 48 48 41 40 40 39 39 39 39 36 31
37 30 30 29 28 35 36 36 36 39 39 41 41 41 31 25 30 34 34 37 39 39 40 43 43 46 46 46 41 37 30 25 22 20 25 25 28 24 29 22 22 22 31 31 30 30 37 33 25 25
37 37 37 37 37 36 25 29 34 36 31 28 39 37 37 32 32 32 30 32 28 35 31 28 24 34 32 32 31 33 32 23 32 20 20 14 18 15 21 14 17 13 12 14 19 26 33 34 28 17
13 15 21 25 27 34 39 39 25 22 22 30 30 30 32 35 39 39 37 37 26 24 17 21 24 26 28 33 22 22 11 13 15 26 19 19 19 16 |