BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-280L08.T7 (MSMg01no280_l08.b1) | MSMg01-280L08.TJ (MSMg01no280_l08.g1) |
ACC | AG417733 | AG417734 |
length | 758 | 760 |
length of high quality (start - end) | 239 (130 - 368) | 237 (133 - 369) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_l08.b1 PHD_FILE: MSMg01no280_l08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:21:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no280_l08.g1 PHD_FILE: MSMg01no280_l08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:21:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCCAACTCATTTCCCGAGTACTCTACCTCCTGCTCCCAGCTCATGCA
TAATCCATCTCTCCATTAAATTTTACCAATAAAGCACGCGACCTATGGGT
TGTAGATGAGACTCAGTTGGGAGAGGGCTCACCTAGCATACACAAACTCA
TGGGTTTGATCCCAGCAGCACACAAACTGATTATGGTAACACATGATGTC
ATACCGTACCCTGCTTCTCTGCTTGGGGTGCCTGGAGTGGCACCTGCATG
CCACCAGAAGAAGGCAGGGCCAAGTCCAACGTGGGGAGTTCACAGTGGTT
CCTGGTCACTTCTCTGTTTTTTGGAGTGACATTGCCAAAGCACTGTGAGA
GGGAATTGGGAACTGAGGATCCACAGGTCTGCATGTCAAGCAAAGAGGGG
AAAGGTGGAGAACGTTGGTGGATGCTGGTTTGATTCAGAGTCGGTGCTGA
GAGTGCTGGGGGCTGAAGGAGAGACCTTCCTCCGGAGTTCTGGGCACAGT
TCTTTAAGGCCTTCCTGGTGGTGATCCTTATTTAAGAAACAATCCTTGCT
TATTCATATTAGTGTATTTTGATGGTGAATATGAATTCATACCCTTTATT
CATGGTGAACCATGAATTAAATGTCTTTTTCAGGAAGGAATGCCCAACAA
GGGAAGCTCATTGGCTGAACACTTGGCGGCTATCTAGATACCTCATCAGC
ATGGAGAA
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACACAGTATTACCTTTGACCAGA
GAAACTCATTCACAGCCCATGATTTTCATCGAGGCATGCTACCTGCTAGC
TTGCTCAGACTCATTCTAGGACCACATACTTAGGTACTGGGCCCTCCCAA
TACCAATAAGCAATTAAAAAAAAAGAAAGAAAGAAAAACCCACAGACATG
CTCACAGGCAAGAATGATCTGGAAAATCTCTCAATTGAGACTCCCTTCTC
AGGGGACTGTGTCAAGTTAACAATTAAGCTAACTAGATGACTCCTGGTAT
ATGCATAAAATTTTGTTTGTAGGTTCCATTGCCCACCCCCACCATATAAA
CAGCGGATCTAATGTGATAGCTCATCATATAAACAAAAAAAAACAGAACT
GGGAACAAGGCCGGGTATGACTGCACATACCTTCACTCCTAGCACTTGGA
AGGCAGAGGCAGGTAGATCTATGACTGTAAAGCCAGCCTGGTCTACACAG
ATAATGGTTCTTCCTTTGTCCTCTTTTGGCTCTCTACATATCTGAGAACT
TTATTGCTATAATCTACTTACATGTCTCTCTCCTGCACTGGACAGCTAGC
TTCTGTACTCCAACACCCTTTTCACTCTTTCCTTGCATTATTAACAGGGC
AGCACTAAAAACATCACACACACACACACCCATATACATACACGTATATA
TACACACACC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 12 11 11 15 28 39 39 33 32 30 27 28 37 37 37 37 37 41 37 44 48 48 29 28 28 28 25 27 22 13 9 9 10 9 12 14 28 20 25 22 18 20 28 41 53 57 36
38 38 36 36 36 36 31 30 30 31 31 30 21 21 10 10 10 10 9 18 15 18 18 26 26 39 59 47 50 53 57 57 59 59 59 59 59 57 57 53 53 53 47 47 47 47 47 50 57 57
57 53 57 53 53 42 38 38 36 53 50 33 33 33 33 31 22 21 11 11 12 27 23 23 7 7 6 6 6 6 20 27 37 41 42 42 47 48 48 50 53 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 28 30 25 25 25 25 28 32 37 42 48 57 57 68 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 43 46 30 27 16 12 12 14 14 14 11 16 11 11 11 12 12 11 15 11 11 11 9 9 9 9 9 11 21 28 32 41 50 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 34 32 31 19 21 13 18 12 12 12 11 12 15 19 25 36 59 59 59 59 59 48 48
48 57 57 57 43 43 43 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 48 48 48 48 43 42 43 43 43 57 48 48 57 57 57 57 59 59 59 46
46 48 57 43 48 48 48 48 59 59 59 59 47 47 37 37 37 31 31 37 59 37 41 37 37 37 41 59 59 59 59 59 59 59 46 46 46 47 59 59 59 48 47 47 42 41 41 41 41 37
36 43 59 59 41 47 41 41 37 36 36 41 41 39 39 44 41 41 44 37 37 41 41 41 41 41 41 50 50 50 50 42 41 39 39 41 41 37 43 41 47 41 41 46 47 48 48 48 48 43
43 43 39 39 39 39 48 48 39 43 43 43 43 36 39 39 43 43 48 59 59 46 39 39 37 37 41 37 36 44 44 44 44 41 41 37 37 37 37 30 37 39 41 46 41 37 22 15 8 8
8 15 15 36 32 36 23 21 16 14 14 21 37 41 41 22 16 9 9 9 9 17 15 28 28 30 30 37 37 32 28 27 25 27 24 25 18 16 23 23 23 14 9 8 9 9 10 13 22 19
19 22 24 17 19 30 28 33 27 33 35 32 22 18 20 20 27 20 26 32 36 37 43 30 18 15 21 21 22 28 24 29 23 29 29 21 18 22 28 28 25 30 28 23 18 22 19 20 32 31
37 24 22 22 15 15 12 12 | Open.Hide. 9 9 8 13 13 8 8 8 8 17 19 36 35 39 41 37 37 44 39 39 41 42 50 50 50 50 50 50 57 53 48 27 23 11 11 16 16 15 19 12 18 18 34 23 37 37 32 35 39 39
47 47 50 53 53 53 53 37 37 37 37 27 15 19 8 8 8 8 8 8 8 17 19 24 33 33 33 33 36 36 53 53 53 53 57 59 59 59 57 57 57 57 53 53 47 47 47 47 47 47
57 53 53 53 53 53 53 53 53 53 36 36 36 31 31 31 37 42 27 23 16 16 12 13 15 14 9 9 9 9 9 9 9 18 23 37 41 41 50 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59
59 59 57 53 53 53 50 50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 34 34 24 26 26 18 18 13 13 19 32 37 57 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 29 27 11 11 9 6 6 6 6 6 6 6 6 9 12 12 6 8 6 9 9 9 15 12 10 11 11 11 17 19 36 41 59 47 48
48 48 48 48 57 57 57 50 53 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 47 47 59 59 33 31 14 12 12 15 15 22 35 35 17 15 10 10 10 11 16 21 30 47
39 47 28 28 24 22 23 20 28 28 28 30 37 43 44 57 46 57 48 48 48 50 50 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59
54 54 47 57 47 59 54 59 59 57 57 57 59 59 43 43 43 43 43 57 57 57 57 59 59 48 48 48 48 40 40 40 39 39 39 39 37 34 39 28 28 17 17 17 20 12 12 12 26 32
46 47 47 43 43 44 44 37 37 43 43 44 47 47 50 47 48 48 48 48 47 47 59 59 59 59 44 37 37 44 44 41 59 59 41 47 48 48 48 41 47 47 32 32 20 19 18 25 27 37
37 37 37 29 29 35 37 37 39 40 40 40 48 48 48 48 48 48 47 47 39 39 41 37 47 46 46 41 41 41 39 37 31 39 26 26 15 19 19 26 26 30 30 30 30 30 15 14 14 28
28 43 40 33 33 33 33 32 30 29 25 25 25 32 32 29 29 41 37 32 35 32 25 28 30 33 33 33 37 37 39 35 26 26 28 28 28 34 30 20 16 15 11 11 17 30 15 16 16 17
17 18 23 28 28 37 37 43 43 48 43 30 29 18 15 15 18 18 28 28 19 21 10 10 10 14 10 10 10 21 10 10 10 19 17 17 10 9 9 9 9 9 11 15 11 11 18 18 18 18
13 14 11 11 10 10 10 11 11 11 |