BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-299J09.T7 (MSMg01no299_j09.b1) | MSMg01-299J09.TJ (MSMg01no299_j09.g1) |
ACC | AG426316 | AG426317 |
length | 757 | 755 |
length of high quality (start - end) | 457 (43 - 499) | 355 (68 - 422) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no299_j09.b1 PHD_FILE: MSMg01no299_j09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:36:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no299_j09.g1 PHD_FILE: MSMg01no299_j09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:36:33 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CAAACAACACTGCAAATTAAATACTAGCCCGGGCTACGTTAGACCCTGTT
TCAAAAACCACAAACATTTACTTCTGTTGGGCTCTGGCTAGAACTCAAGA
ACTTGCACATACTAGGTGATCATGTTATCACTGGGCCACACTCCCTGCTT
CTGACTACAATTGTAAATCTCATTCCGAGAATTCGACTGTTGTGTGCCTT
GTCACAAAACAAGAACCAAATTGATGGGCAAGCATCGCCACCTAGTGGCC
ATGATTCACACTGTAGATGTCCTCTTGGTTGCAATTTTCGAAGGGNTTTT
TTTTTTTTTTTAATTTTTATTTACACGCATGTGTGCATATCTGTATGAGT
GAATGCCACATGTGTTCAAGGGACCCTGAAGACAAGACGTCTACGTCAGA
ATCCCTGAGGCTGGAGTTGTTAGGTGGTTGTGAGTCACCTGATATGGGAC
CTGGGATCCAAATTTGAGTCCTATGCAAGAGCAGCAAGCACTCTTTATTT
TTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCTCTGGATGTCATTTGAA
GACAAGGCTGGCCCCGAACTCAGAAATCCGCCTGCCTCTGCCCTCCCAGT
GCTGAGATTAAAGGCGTGTGCCACCACACCCCAGTTTTTTGGGTACCTTT
ATCTTTCGAATTACGGATTCCATATGATCAGCAGACTGTTCCGTAACCAC
GAACGAA
| ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXTTACATGGCTGGCTGCTTTCTTTCCTGCAGCTC
TTATGTCTGTCTAATCCCTCTGCTTCCCCGTCATGATGATTCCCCTCCTC
TTCCTCTCTCAGTTCCTTGCCCAAACAATCTAAAAGTCCAGCCTCTGTCT
TTCTGCCCAGCCATTGGCTTTATGGCAATTTTTTCTTATCAATGGACACC
AGCTAGGGGAAGGGACCCTCAGGTCTGGAAGAGTGGCTTTTGGGGAGCAA
AATAAGACAAAGCATTAGAACCAATTCCCAACATAGGTTGGCCAAAAATG
TGCTCTATAATCTTATGCACATACTGAGTCTTTGTTCCTCCTGACTCTAC
AATGGGATGATGGGGCCCTGTGCCATCAAAACAAGCTTCCCCTTACTTTG
TGACATGTAGAGGACATCCTGAGCTTTCTAAGTCTTCACCCTTTACCTCT
TCCCACAGAGAGGCAAGCATCACTCTCCTAATGGTGAGACAGAAGAAAGT
AAGGAGAAGGCTCAGAAGTTAAATAAGAGAAGTTGGCGTTTGGCAGAGGA
CCTGAATTTAGTTCCCAGAACCCCTGTGGGGTAGCTTACAACCACCTCTA
CCTCCAGCTCCAGAGCAGGGAAACCAATGTCACAGGGAGCTCAAGAGCCC
AGAGTTCAAGGCCATCATGAAGGCTGGCATCCATGCCCAAGTTGGAAAAG
CCCAG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 14 19 59 59 41 39 39 35 34 17 17 9 9 9 17 17 37 39 59 33 33 33 33 33 30 34 24 14 10 10 10 9 9 12 10 10 10 13 16 17 21 23 28 22 33 33 36 53
33 39 33 33 33 30 21 17 9 9 9 9 9 13 17 29 26 26 28 33 33 43 43 39 39 39 39 43 48 43 43 43 43 36 43 43 43 46 48 48 48 59 59 47 47 43 43 43 47 42
42 36 32 32 42 47 44 47 41 41 41 41 41 48 44 44 47 57 59 59 57 57 57 47 47 43 46 44 44 33 33 33 42 42 46 44 57 42 42 35 59 44 57 44 44 25 23 23 43 43
43 46 57 57 57 57 57 52 52 52 59 44 50 35 50 43 50 50 50 50 50 57 57 54 54 54 57 57 52 52 52 44 43 43 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 59 59 51 51 50 50 50 38 52 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 59 59 57 59 59
50 48 48 48 50 50 54 57 57 57 50 48 48 48 57 57 43 42 42 37 42 42 57 57 57 57 48 59 59 68 59 59 57 57 57 59 48 48 44 46 43 42 42 44 44 57 57 47 48 48
48 57 57 57 54 54 46 46 43 43 42 42 25 41 34 40 26 27 24 25 22 26 22 30 23 29 24 39 43 39 43 36 36 35 39 39 43 43 35 35 36 59 29 23 3 0 3 22 23 47
47 47 43 47 39 39 36 39 27 27 19 12 12 12 18 27 32 37 34 34 28 22 15 12 11 12 12 12 12 12 12 15 15 22 23 31 32 35 37 37 43 47 48 43 43 32 34 23 26 26
32 40 47 48 40 43 28 28 28 34 34 43 43 39 24 24 15 15 18 30 30 37 32 26 23 22 23 12 12 11 11 11 15 15 14 12 20 32 28 34 28 30 28 28 28 28 25 25 25 32
36 43 48 59 59 43 43 36 43 43 48 48 57 57 47 40 30 30 28 28 33 34 43 43 43 36 39 39 36 35 30 32 32 19 19 16 24 24 37 39 37 39 37 39 34 28 21 14 14 22
22 31 22 19 19 16 18 15 18 23 17 28 25 28 23 28 15 20 20 24 32 37 41 34 34 20 20 19 26 15 15 13 13 13 13 19 18 32 32 36 31 37 31 39 35 35 35 39 37 47
39 23 23 14 14 16 23 28 37 30 30 37 19 19 14 19 19 19 17 16 12 21 12 13 11 12 11 12 12 12 11 16 16 25 25 24 21 13 15 15 16 10 11 13 19 22 22 14 12 10
9 10 13 13 10 9 11 11 12 8 8 10 8 8 8 12 11 20 20 20 10 8 8 8 8 8 8 15 19 19 19 11 8 10 19 15 15 12 12 12 10 10 13 16 16 20 20 18 8 8
9 9 9 7 9 9 10 16 11 10 10 12 12 10 10 11 15 12 11 11 11 10 10 10 11 11 9 9 9 7 6 6 6 8 7 13 16 28 32 19 14 9 9 9 13 15 14 12 9 9
10 10 10 8 8 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 12 12 15 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 12 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8
8 8 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 10 13 19 10 10 10 17 15 24 14 22 21 27 27 39 30 28 20 32 32 37 32 28 34 28 25 34 23 19 11 11 13 21 21 39 48 53 25 25 12 12 12 27 23 37 43 40 47
47 57 48 50 50 48 48 43 43 43 43 42 42 42 42 48 48 54 48 48 48 48 41 50 57 54 54 57 57 57 57 59 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 44 57 46 47 57 57 57
57 57 59 57 57 57 57 57 54 57 54 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59
59 68 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 54 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 44 34 24 12 12 21 21 30 37 39 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 48 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 36 59 25 28 15 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 21 25 24 35 35 36 32 28 24 18 20 20 32 32 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 68 68 68 50 50 50
50 50 50 59 57 57 48 48 48 59 59 39 37 35 35 35 43 39 39 28 24 21 12 12 12 12 14 14 19 25 17 17 17 30 30 41 46 59 59 48 48 48 43 43 39 39 39 32 32 26
33 33 43 43 57 57 44 59 39 39 39 37 37 48 48 48 48 57 59 57 57 57 57 57 59 59 57 50 48 48 48 41 59 59 47 44 44 44 37 37 39 44 44 47 47 59 47 48 48 48
48 57 57 43 43 43 47 47 35 35 32 43 37 48 48 59 57 57 46 46 46 48 39 47 39 39 37 43 39 37 37 34 36 31 37 37 59 37 41 41 41 37 34 32 41 37 37 43 43 37
37 37 31 34 41 39 41 41 31 25 22 17 20 16 16 18 23 34 39 37 39 40 40 37 39 34 34 28 30 30 37 39 37 29 20 19 22 22 25 37 39 31 29 33 28 28 24 16 13 12
12 16 19 41 32 30 27 24 29 22 22 22 15 11 8 8 8 11 11 25 24 18 20 16 17 11 11 11 15 18 23 19 15 14 14 14 27 21 30 25 24 24 24 28 28 37 39 35 32 32
27 27 19 25 18 19 14 14 22 18 17 22 28 28 16 19 13 10 9 11 9 10 10 10 10 12 13 25 24 24 25 18 18 21 15 11 10 13 11 10 14 19 16 19 24 17 19 12 15 13
10 10 10 10 8 6 6 10 11 13 12 12 11 15 15 19 19 22 22 17 13 11 10 14 9 13 9 12 12 16 12 8 8 8 6 6 7 8 8 8 10 9 9 10 9 11 11 21 18 18
9 8 8 8 8 |