BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304L24.T7 (MSMg01no304_l24.b1) | MSMg01-304L24.TJ (MSMg01no304_l24.g1) |
ACC | AG429936 | AG429937 |
length | 1,230 | 1,254 |
length of high quality (start - end) | 707 (91 - 797) | 761 (89 - 849) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_l24.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_l24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_l24.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_l24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:43:48 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNCCGGTTANNNNNNAATCATTGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTTTGTTCAGTTCTGACCCTTAATTTTTAATGGGGTTAT
TTGATTTTCTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATT
AGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAATATCCTTTCCCAATCTGTTGG
TGGCCTTTTTGTTTTATTTACGGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCTTTGCA
GTTTCATGAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACAGTGCAAGCCATT
GCTGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTAG
CCAAATGGATGGACCTGGAGGGCGTCATCCTGAGCGAGGTAACACAATCA
CAAAGAAACTCACACAATATTTACTCACTGATAAGTGGATATTAACCCAA
AACTTAGGATACACAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACACATGAAACT
CAAGAAGAATGAAGACCAAAGTGTGGACACTGTGCCCCTTCTTAGAATTG
GGAACAAAATACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTCTG
ATGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCATATCCAGGGATCCACCCCAT
AATCAGCTTCCAAACGCTGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCT
GAAAGGACCCTGATATAGCTGTCTCTTGTGAGATGATGCCAGGGCCTAGC
AAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCT
CCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTACCCAAAGAGCTAAAGGGATCTGCAA
CCCTATAGGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGAGCTTGA
GTCTCTAGCTGCATATGTATCAGAACATAACCTAGTCGGCCATCACTGGA
AAGAGAGGCCCATTGGACACACAAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGA
ATGCCCAGGCCCAAAAATGGAATTGGTTGTGAAGGAAAATGGGAAATAAA
GTATTGGGGCTCTTTTTCTAATAACCTTCAACCCCTTCTTGTTCATCATC
TTTCCCTTCACTTATCCTGATTTTAATAAACTCTTATCCCTATTTCTCTT
CTTTTTATAAACTTCTTTCCTTAAACTATCTTTTCCCCACCTTTTCTCCA
TCTCACAATTATTCTTCTCTTTCTTTCCTT
| NCCCGTGTTTNNNNNNACTGAAGCGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTATACCCTGCCCTTGCCAGT
TCCCAGATGTTAAAGCCCTTTACTTATACATATATTTTGGTAAGCTTATT
GACAAGTGATTAAACTGTATTATTGGAGAAGGTGTAAATACTGGGAGTGA
TTCTGATGACAACCCACAGGCACTCCCATTTAATTATCTTCTTAGTCATT
TCAGAATATAAAGGCCAATCTCTTGTATATTGTTAGTCATCATAGATTGA
AGATACACTTAGGCTTTGAACCACAAAATGATATACGTTTCACTTTATCT
TTTCTGAAGTACAAAACAACCCCCCAGGTTAAACATGTTGATGGATGTTA
TTTAAGTCACCAAAGTTGTTTTTTAGTTTGTTTTATTTTTTCTTTATTGG
ATATTTTCTTTATTTACATCTCAAATGGAAAGGAAGCCCTTTCCAGGTCT
CCCCTTCAGAAAACCCCTATCCCATCCCCGTTCTCCCTGCCTCTATAAGG
GTTCTTCCCTCCCACCCACCCATTCCCATCTTCCTGCATTGGCATTTCCC
TACATTGGGGACACTGAACACCTTCAGGCCCAAGCGCCTGTCCTTCCATT
GATGTCCAACAAGGCCATCCTCTGCTAAATATGCAGCCAGTGCCATGGGT
ACCTCCATGTGGATTCTTTGGTTGGTGGTCCAGTCCCCAGGAGCTCTGGG
GGTGGGGTGGGGGTCTGGNCTGTTGACACTGTTGTTCCCTCCATGGAGCT
GCAAACCCCCTCAGATCTTTTTTTTTTAATTAGGTATTTTCTTTATATAC
ATTTCAAATTTCAAATGCTATCCCAAAAGTACTCTATATCCTCCCCTGCC
CTGTTCCCCAACCCACCACTCCTGCTTCTTGNCCCTGNCATTCCCCTGTA
CTGGGGCATAATAAGTTTGCAATACCAAGGGGCCTCTCCTTCCCCGGAAG
GGCCGAATAAAACCTCTTTTTGTTAAATTATGGGCTTTAAACAAAACTAA
AAACACCCCAAAAAACATTTTTCCAAAACCCAAAAAATTCCCCAAAAAGG
AAGGCCCCGGTGAGGGACCCCTCTTTCCTCCCTTTAAAAAAAAAAAAAAT
ACCCCCCCCCCCCTTTCCCGAAAAAAAAATCTTTGNTTTTTTTATGAAGG
GGGATTATTTATCCTAAGAAACACCCCCCGCGGGGAGCCTCTTCTACAAG
ACCT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 9 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 7 15 9 9 9 10 12 10 8 8 8 8 8 12 15 9 8 8 8 8 8 19 21 28 28 28 28 30 33 33
37 37 37 37 37 37 32 32 28 31 37 37 37 31 31 31 31 31 31 31 31 31 37 34 25 32 20 13 13 12 9 9 9 9 9 18 17 19 15 10 12 19 32 47 53 38 38 42 42 53
53 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 50 42 42 28 23 12 10 11 18 24 32 22 41 33 42 33 32 32 32 37 39 41 48 57 68 68 68 51 51 51 51 51 68 68 68 68 57 57 57
47 47 57 59 57 50 50 50 50 50 47 57 57 59 51 50 50 50 50 50 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 52 57 59 57 59 59 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 52 57 57 57 57 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 57 54 52 52 54 54 54 57 57 57 57 57 57
52 52 52 52 52 57 57 68 68 68 68 59 57 57 50 48 57 57 57 68 68 68 57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 47 47 59 47 57
48 48 48 48 57 57 54 54 54 59 59 59 48 48 43 46 36 46 46 46 42 41 47 47 48 43 43 43 47 43 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 48 46 43 43 40 40
47 47 37 30 26 15 15 12 13 13 13 13 22 25 33 36 39 44 59 59 59 59 59 59 57 48 48 48 48 57 57 44 48 57 43 43 43 43 43 48 48 57 57 57 57 48 43 43 43 46
43 48 48 59 59 57 46 46 32 32 37 30 30 41 39 44 47 48 57 57 68 68 68 68 59 59 59 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 44 47 42
35 33 42 44 57 57 54 54 57 57 44 44 28 28 28 44 44 48 57 48 48 48 59 59 59 54 54 54 54 54 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 42 43 42 43 57 57 53 53 53
59 43 43 43 43 43 47 59 59 59 48 46 46 46 46 46 46 41 50 42 41 37 29 22 19 19 28 37 41 41 46 43 40 40 40 40 59 59 59 59 59 59 59 59 47 43 43 46 43 48
48 48 53 53 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 48 40 42 42 43 57 43 43 48 43 43 40 40 40 43 59 47 46 43 43 43 37 37 37 37 37 41 41 31 34 39 41 41 47
59 59 46 48 48 48 48 57 39 39 36 36 36 44 47 48 48 57 43 57 43 43 43 43 43 42 48 48 47 47 47 57 59 59 43 39 30 34 32 36 29 37 43 43 40 41 59 59 59 59
44 32 32 37 37 37 32 31 31 32 37 39 39 40 39 39 39 46 46 47 37 39 39 39 43 37 37 37 34 43 36 36 36 39 39 41 41 37 31 31 35 36 39 39 28 19 32 20 21 13
12 12 19 18 37 36 36 32 31 31 37 32 29 31 35 39 37 29 29 19 19 13 23 24 30 22 24 25 36 34 39 39 39 29 29 32 37 31 36 34 32 23 23 23 32 16 26 25 25 22
20 30 24 22 10 9 9 9 9 9 12 28 28 28 27 25 28 22 22 22 22 26 39 39 32 19 19 13 13 13 28 28 35 30 30 35 31 31 36 43 36 26 31 28 26 28 28 18 12 9
9 9 12 15 34 32 34 32 26 35 31 35 30 27 30 20 20 23 20 24 31 34 32 25 25 15 12 12 10 12 12 16 19 22 24 23 9 9 10 9 9 10 11 14 14 15 19 25 32 22
22 12 15 15 24 22 17 17 22 24 24 24 28 23 30 30 24 24 17 17 16 11 11 11 16 17 17 13 7 7 6 6 6 7 9 9 10 10 12 16 11 11 11 11 11 11 11 11 12 21
21 11 12 11 11 10 10 10 11 13 9 12 10 13 10 8 8 8 8 8 8 9 11 11 17 10 10 10 13 10 10 10 10 10 17 11 11 10 9 9 9 10 9 9 9 11 10 9 8 11
10 10 10 12 13 9 9 9 10 14 11 12 14 16 16 9 9 9 9 10 18 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 13 10 11 7 7 6 6 6 6 6
8 6 8 8 8 11 11 15 10 9 9 10 12 11 11 8 8 12 8 8 8 8 8 10 11 6 7 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 10 10 16 13 11 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 7 8 8 8 8 9 9 12 11 8 8 8 10 19 10 8 8 10 12 10 10 10 9 9 10 13 13 15 13 10
10 10 12 11 11 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 10 10 10 9 15 10 10 8 8 8 8 18 18 15 12 11 11 8 8 6 6 8 8 8 10 10 9 9 7
7 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 8 13 10 8 8 8 6 6 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 7 7 7 3 0 0 0 0 0 0 3 9 7 6 8 8 6 6 6 6 6 8 13 6 6 6 8 8 10 11 8 8 9 8 11 10 13 15 19 8 9 8 11 11
9 13 19 33 36 36 36 36 37 37 37 37 37 36 38 42 38 53 53 53 50 50 50 34 23 16 10 15 15 11 8 8 8 8 8 8 8 8 15 20 30 30 31 36 36 36 35 38 38 38
42 42 53 42 50 38 36 36 30 31 31 31 33 33 31 25 13 11 10 10 12 22 26 30 28 19 15 10 10 10 24 28 43 48 53 53 57 57 50 53 53 50 47 47 43 43 43 47 68 68
54 57 54 48 48 48 57 68 50 68 68 53 50 48 54 50 50 50 48 48 50 50 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 42 42 44 44 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44
39 39 39 39 41 39 23 23 23 23 23 23 39 41 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 59 59 59 57 57 57 59
59 59 59 68 59 59 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 47 54 57 57 57 57 57 59 48 48 46 46 46 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 50 50
50 50 50 50 48 48 48 42 42 47 47 44 41 43 37 32 41 37 47 47 47 47 47 59 59 59 48 57 57 57 57 48 48 48 37 32 30 24 24 28 34 34 37 36 41 41 35 39 41 40
37 37 39 40 47 43 43 46 43 43 48 48 39 34 34 41 41 34 34 30 37 34 34 34 32 35 36 37 41 41 41 39 46 46 46 46 47 47 31 26 27 18 16 19 26 32 32 32 41 37
59 59 44 37 37 37 37 37 31 31 37 37 34 30 32 23 13 3 0 3 23 18 31 31 27 29 19 19 19 29 32 32 32 37 32 31 25 26 25 28 24 24 15 9 9 9 9 14 16 37
39 37 28 24 29 24 25 30 34 31 27 28 18 18 13 22 28 31 36 43 44 39 33 29 28 22 22 22 22 29 24 32 18 16 13 12 9 9 9 17 16 25 28 32 28 23 23 15 15 13
23 20 13 9 8 8 8 11 11 14 27 24 19 18 19 23 32 31 31 31 31 27 34 25 30 19 16 10 13 9 9 15 20 21 30 23 28 14 17 17 11 13 9 8 8 8 12 11 10 9
9 12 13 19 13 8 8 8 11 10 22 11 20 11 11 11 14 22 22 22 18 18 21 18 15 15 12 10 8 8 3 0 3 10 9 10 3 0 3 9 10 11 10 10 8 8 8 8 9 10
10 8 8 8 8 12 8 8 8 6 6 6 8 8 10 16 18 22 22 15 13 9 9 9 9 9 15 20 18 16 11 15 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 10
11 12 11 10 10 10 10 10 10 13 14 14 13 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 8 8 8 9 10 19 12 14 9 8 8 8 8 8 9 16 10 10 10 10 10
13 17 15 14 14 12 15 10 9 9 9 12 12 15 12 12 9 11 11 12 9 8 8 8 10 12 10 10 10 8 8 8 8 12 12 9 9 9 11 13 14 10 11 11 21 17 13 12 12 18
18 10 9 9 10 16 15 8 6 6 6 6 8 9 9 9 14 12 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 14 16 16 12 10 8 8 8 10 8 8 10 10 10 10 10 12 12 11 11
12 21 24 37 39 25 23 19 18 13 12 12 9 11 11 12 12 10 9 9 9 12 15 16 14 14 14 13 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 13 13 10 10 10 8 8 8 11 11 11
8 6 6 7 8 8 6 6 8 6 11 11 13 10 8 13 6 6 6 8 8 9 8 10 8 9 8 8 6 6 8 10 10 19 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6
6 8 8 6 |