| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-305C17.T7 (MSMg01no305_c17.b1) | MSMg01-305C17.TJ (MSMg01no305_c17.g1) |
|---|
| ACC | AG430228 | AG430229 |
|---|
| length | 1,249 | 1,276 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 421 (32 - 452) | 383 (72 - 454) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_c17.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_c17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:45 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_c17.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_c17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:46 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | NGGGGCACATTCGCGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
AGAACAAAACACCCATGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTGGAGCTGCA
ACAAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCTTATCTAGGGATCCACCCCAT
AATCAGCTTCCAAACGCTGACACCACTGCATACACTAGCAAGATTTTGCT
GAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTAGGCAGGGGCCTAGC
AAACACATAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGTATCACAGGGCC
CCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAA
CCCTGTAGGTGCAACAACATTATGAAGTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTG
ATTCTAGCTGCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTCAGCCATCACTGGAA
ATATTTTTTTCATCCCCCCCCCAAANTTTATATGCCCCAAAAAAAAGAAG
GGGGGGGGCCNNNNNNNNNNTGAGANTGGGTGGGTAGGGAAGTGGGGGGG
GTTTGNNNNNTNNCCTCNNTTNTTTTCCCTTCTTTTTTCCCTTCCCCCTT
CTCCCCTTCTTCCCTTCTTTNTCTTTCCTCTCCCTCCCTTTCTTTCTTTT
CCTCTCTCTCTTCCCCCTTTTTTCTTCTCTCCCTTTCCCCTCCTCTCTCT
TCTTCTTTTCCTTCTTCCTTCTCTTCTCCTTTCCTCCTCTTCCTTTCTCT
TCTTCTCCCCTTTTCTCCTTCCTTTTTTTTTTTTTTTCTCCTCTCCTCTC
TTCCCTTTCTTCCTCTTTCTCCTTCCTCCTTTTTCCTTCTTTCTCCCCTC
TCCCTCTCCCTTTCTCTTCTTTCCCTTTCCCCCTCCCTCTCCCTCCCCTT
TTTCTTTTTCTCTCTCCCCCCTTCTTCTCCTCTCCTTTCCTTCCTTTCTT
CTCCCCTTCTCTTTTCCCTCCCCCTCCTCCTCTCTTCCCTTTCTCTCCCC
CTCTCTTCCCTTTTTTTCTCTCCCTCCTTCCTCCCCTCCTTCCCTTCTCT
CCTCCCCCCCTTCTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCCNCNCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCCNNCCCNCCCCCCCCCCC
CCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCNCCCCCNCCCCNCCCCCCCCCCCCCCCC
| NNTTCCTTGATGTGTAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGAGTATAATCTGTTGATAATAATCTC
CTCATTTCTATCAAAAGCTAATTTAGAATATGTTAAATTTGATTTAGGTA
GAGCTTAAGATAAAAATGAAGAAAGCAGAATTTGAATATAGAATACAAAT
CTTATTAGAGATCCATTTCAGTTTATATTTTTACTGTAAATTAATTACTG
CAACTTCCATTCCTTCTTATTTTGTGGTTTCATACTGTTTAATATCATAT
GGTATTCTTATTGTAAGAACAGAACTTCTAAAGAAGATATAATCAGAGCA
AATTCAATACTTCAATTCCATTAAAGATTCACTTTAATCAAATCATGGAG
ATTTAGGAACACAACTTTACAATTCAAACTTCAGTCAAAACTTTAACACA
GTTTTTTTTTTGCCCCCCTCTTTGTAAATATCTACCCGCTGAAAAAGAAG
GGGCGGTTCCAGAAATCAAGCAAGTAGACATAACTTTTATATGCTATAAC
TGTTGTAGTATATACAGGAACTGCACTAGAATTTCCTACCATTTTCCTGT
AAATTTGAGGATACATTTGATTTTCCTTTGACTGAATGTAATAATTTGAC
AACACAGTACAGCTGAAAGTGGAAATTAAGAATTATCACTTTTATACATA
TACACCTAAAATCTTCCTCATTTGTCTAGATGTAAATATGTTTTTTAGAA
TGTGGGAGAATAATATTCACTTTACTTATGTTAACTTCTAAAACTAATTA
CTACAGGATTAATATAAGTAAGTAGTCTGTAAAAATATATGCTAAATGAG
ATTATAAGTGTTATCAAATATTTTTGTTCTGCTGAAATGTTTAGTTTTTA
TATTTCTATAGCATTGAGTTCACATTACTGCTAAAGATAACTCTGGTAAT
GGCACAGTACACTGACCTTTTGGCATGCAGAAATAAACCCATTCTCTAAT
AGAGAATCTAAAACCTACTTAAAGGAAAGAACGAAAAAATGCCCCCCCTG
GGATTTTGCCAAAAAAAAAGTACCCCAAAGGGGGGAAAAAAAAAAAAAGG
GACCCGTTGGTTTGGGTGTTTAAACCTTTTTAAAAACCCCAGGGGGAAAC
ACCTTTTAGTTTTTTTTTTACAACAGGCTTTTCTTAAGAGGGAACTCTGA
TCCCCCCTCCTTTTAAAAAACAAGGGAGCCCGGCGGGGTGTGTTTTTTTT
TTTTGGGCGGGAAATGGTCTTTTTCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 6 6 8 7 6 8 10 13 13 10 10 8 8 8 8 10 13 15 19 13 15 8 8 8 19 21 28 24 28 24 26 33 33 37 37 37 37 37 32 30 17 19 10 9
9 15 19 33 33 37 37 47 48 57 57 50 42 42 43 37 42 47 47 50 43 43 42 28 28 28 33 42 42 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 43 43 37 37 31 39 39 44 43
44 44 43 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 47 43 43 47 47 47 57 47 50 50 50 57 50 50 35 35 35 43 44 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 57 43 52 52 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 39 39 31 44 44 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 43 57 45 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 52 57 52 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 59 57 57 68 68 57 57 59 68 68 68 68 44 44 33 31 31 42 44 59 59 44 44 23 23 23 44 44 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 48 29 29 19 14
14 14 15 17 16 29 29 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 43 39 39 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 43 34 22 12 11
9 9 9 9 12 12 26 21 12 11 9 9 9 9 18 17 29 25 27 19 21 12 27 25 3 0 3 29 25 28 18 14 14 21 24 30 25 14 14 11 14 13 16 17 12 9 9 9 12 12
11 13 14 14 13 21 29 21 21 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 27 27 29 3 0 3 27 27 59 59 59 59 59 59 59 59 48 30 28 15 12 12 27 28 59 59 59 59 23
18 11 8 13 3 0 0 0 0 0 3 0 0 3 7 7 3 0 0 3 3 0 3 9 9 9 10 13 10 10 10 10 11 11 11 11 12 11 13 12 12 12 11 10 10 8 8 6 6 8
12 11 13 10 8 6 6 10 8 9 8 10 10 6 6 8 8 8 8 3 0 3 6 8 8 8 9 9 9 9 10 10 8 8 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9
10 8 8 6 7 10 12 10 8 6 6 8 8 9 9 10 10 10 9 9 10 10 10 13 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 6 9 7 8 8 13 11 8 8 8 8
8 10 14 10 10 10 8 8 12 8 8 10 10 12 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 6 6 8 11 11 9 9 9 9 8 8 10 10 10 8
8 8 10 10 10 11 11 12 12 12 12 10 8 8 10 10 13 12 10 9 9 8 10 11 11 8 8 10 13 16 13 19 14 12 10 8 8 6 6 8 8 9 11 12 11 9 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 6 8 8 11 15 13 10 10 10 12 11 12 11 18 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 15 16 10 10 10 9
14 11 18 11 11 11 15 14 13 13 12 19 19 12 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 10 10 15 11 11 8 8 8 8 10 8 8 8 12 12 16 11 11 10
10 11 13 14 9 9 9 10 10 10 9 8 8 7 7 10 8 11 10 10 10 10 10 15 14 14 14 12 12 10 15 10 10 9 13 11 26 19 19 15 11 10 13 10 9 8 8 8 8 11
8 10 8 8 8 6 6 8 10 10 8 8 9 12 9 8 8 10 10 12 10 11 10 10 10 10 10 11 12 8 7 6 10 8 10 10 8 10 12 12 8 8 8 8 13 10 8 8 10 10
10 17 10 11 11 12 12 11 12 11 8 8 8 6 6 7 6 6 9 12 12 12 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 9 9 11 10 11 11 18 19 18 13 10 8
8 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 9 12 11 11 8 6 6 6 6 8 8 9 8 8 8 10 12 13 25 23 17 3 0 3 8 8 12 12 12 9 9 3 0 3 0 3 8 8 7
6 6 6 7 7 10 8 6 6 6 6 11 7 7 6 6 6 6 6 6 8 9 8 6 7 6 6 8 7 10 8 7 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 0 3 7 6
6 6 6 6 8 9 9 7 7 9 9 10 8 10 15 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 3 0 0 3 8 3 0 3 12 12 15 15 19 18 12 11 8 6
6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 7 7 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 3 0 3 6 6 3 0 3 6 6 8 8 9 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 6 8 6 6 7 7 6 6 6 10 8 6 6 6 10 10 12 13 9 8 9 3 0 3 17 19 19 8 9 11 22 21 31 35 35 28 32 34 36 36 37 37 37
40 40 47 47 48 48 48 48 48 54 54 57 57 54 54 54 48 48 46 48 48 48 54 48 46 36 36 42 43 48 51 50 50 57 57 46 50 50 50 57 57 57 57 57 57 43 43 44 46 48
57 57 54 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 54 57 50 50 50 50 50 51 50 50 50 50 50 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57
57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 48 42 30 21 12 12
12 21 34 32 48 48 48 57 57 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 34 18
18 12 16 17 13 12 13 12 9 8 8 9 9 12 12 12 17 9 9 9 20 20 27 28 59 41 30 28 32 21 28 19 15 14 10 8 7 6 6 8 9 12 17 9 9 6 6 6 6 6
6 6 10 10 10 10 25 27 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 48
57 48 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 59
59 68 59 59 59 59 59 59 57 57 48 43 43 43 43 54 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 48 48 57 48 50 53 53 50 57 59 59 48
43 43 35 35 32 39 37 59 47 47 47 47 59 59 44 41 37 43 41 41 36 39 41 44 44 47 41 41 43 37 31 31 37 37 37 59 40 40 40 47 47 59 59 59 47 47 35 35 35 59
32 34 20 20 20 32 32 48 59 59 47 39 37 43 43 59 43 43 39 43 43 40 43 43 43 30 40 33 39 31 31 20 28 28 41 37 48 43 43 39 39 39 59 59 37 37 30 30 25 25
28 20 20 18 27 32 25 24 20 24 28 35 37 39 41 34 34 28 28 28 34 32 37 43 41 37 37 37 37 35 28 28 39 43 41 39 39 36 36 39 59 59 59 43 43 41 43 39 37 41
43 37 37 32 30 28 36 39 44 41 37 37 41 43 37 43 43 43 43 37 37 41 59 59 36 25 25 35 32 29 26 27 31 27 31 36 37 36 36 36 47 47 32 30 27 23 25 30 30 30
30 31 30 41 35 30 32 23 23 23 20 20 34 30 37 37 37 36 36 32 36 29 37 25 25 28 22 24 32 33 36 37 18 11 11 11 10 13 15 20 15 17 18 28 18 19 21 16 15 17
18 18 17 17 17 27 32 32 31 21 28 12 15 14 21 24 24 25 13 15 12 12 13 19 15 32 34 37 37 32 30 22 19 19 14 12 9 8 8 8 11 19 25 18 12 11 13 11 11 11
11 13 12 15 12 21 12 12 10 10 10 10 14 12 18 15 15 25 28 22 18 18 14 19 24 21 21 15 11 11 10 13 10 12 14 17 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8
8 8 8 9 9 9 10 14 8 6 6 8 7 7 8 10 9 7 8 8 8 8 8 9 9 9 12 9 9 9 12 15 11 10 12 8 11 9 11 10 10 10 10 16 17 17 11 11 11 16
12 17 16 11 11 11 10 8 6 8 6 6 8 9 14 19 11 10 8 6 6 6 8 8 9 9 9 10 13 8 8 8 8 22 16 20 20 30 23 20 20 22 22 30 39 31 24 22 18 15
17 12 11 10 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 9 10 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 13 18 18 18 18 28 18 17 17 15 18 18 19 12 11 13 10 8 10 9 9 9 9
8 8 8 6 7 9 17 8 8 8 8 8 12 21 27 25 11 12 13 13 10 10 14 14 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 7
7 9 10 11 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8 8 9 19 21 13 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 17 11 8 8 7 6 6 8 14 17 10 11 12 22
18 15 10 9 9 10 6 14 8 8 8 8 8 10 8 8 8 7 7 9 12 8 8 8 8 8 |
|---|
