| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-305L04.T7 (MSMg01no305_l04.b1) | MSMg01-305L04.TJ (MSMg01no305_l04.g1) |
|---|
| ACC | AG430581 | AG430582 |
|---|
| length | 1,312 | 1,229 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 322 (135 - 456) | 578 (127 - 704) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l04.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_l04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l04.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_l04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:45:57 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | NCCGATTNNNNNNGGTATTGGGCCTAAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCG
CGGAATTCATTTTTTTTTAATTTTCTTTAGAAGCATCTCGAGTACCTTTT
CCCTAATAAATGTTCTTAGCTAAAGGGGTCGACATTTAAATTTGCAGAGC
CCTTTCTATTTTTTAAGGTGTTTTCATATCCATTTGCCGAATAAAAGTTG
ACTGGCCTACCCTGGGAAGGTTCTAGTAAAAATGATCTGAGTGATTTTCT
TACTCTGTGTTCATGTCTTACTTGCATCTCCTCAGCCTTCCCTCATGTTT
CCAAAGGAAAATACGGGGGCTGGAATGATGGCTCTATAGTTAAGACCACT
TGATGCTCTTGCAGAGGACCCAAGTTCACGTCTCAGCACCCACACGGAGG
CTCATTTTTATCTTCAATTCCAGTTCCAGGGGACCTGACCATCTCTTCTA
ACTTCCATGTTTTTCACACCCCCACAAAATGCCCAGATATACATACATGA
AAAGACTTGCATACATGGAGTAAAAACAAATCTTAAAATGAAAATCTAAG
GAGAAAATTGTATGGCTATATTTACAATGCCATGTATACCAAGAGAAAAA
AGCTTGTGATCATATGGATAAGAACTTACACTGGGGTGCTATCTGGCTAT
TAGCATATGAAGTTAAAATTTGTGTAGAACAACATCTATAAAAATAGAAA
CCATCTCAATATAATGTCACCAAAGGAAACTAAATAGTCTAGAAAGGGTA
CCACAGCTTGCTTGCTTGCTTTATTTATTTATTTATTTATGAGAGTAGTC
TCCTAATTGGTCTGTAGATTTAGATCTGTCTTTATGGTGCTCTAATGCTG
GGTATTCAAAGAAAAGGAATATACTCTCCACTATGTGTTTGCACGTTGCA
GTTGGACAGCGTGGAATAATACGATCTCTGGAGATGTATCCCATTGCAGG
CTCTGAAAATAAGCTGGGTTTCTCTCCAAAACTAGTTCTTGAGGGAGACC
CCTGCGCCCTGAAATAATTTTTAAAAAAAAATTGGGGGGAATCTAGTTTT
CTCCTAGAATAAATGTAGGAACCGCCCTTTAGAATTTAACAAACCCCTGC
CTTTCTGTATTTCTGAAACCACCCTATTCCGTGGGGTATTCCCATTAAAT
ATTAGCCTGCGTGTGGGGGGTATGGGGTACTTTTTCCTCTCCCATCTCCT
AACTCTCTTTTTAAATCTCTTCGCTTCATATATCGATTTTCCCTCTCTGT
CTTCCCCATCTCTCTTCGCCTTGTCTTTTATCCAACTTTTTTATTCTTTC
ACCCTCTTTGAG
| NCCGTTTCTTTNNNNACTCATGGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTGAGCTTTCCAAACTTTTA
TCATGAATGGGTGTTGGCCCTTGAAAAATGCTTTTTCTGCATCTAACGAG
ATGATCATGTGGTTTTTGTCTTTGAGTTTGTTTATATAATGCATTACATT
GATGGATTTTCGTATATTAAACCATCCCTGCATCCCTGGAATAAAACCTA
CTTGGTCAGGATGGATGATTTCTTTAATGTGTTCTTGGATTCGGTTAGCG
AGAATTTTATTGAGGATTTTTGCATCGATATTCATAAGAGAAATTGGTCT
GAAGTTCTCTATCTTTGTTGGATCTTTCTGTGGTTTAGGTATCAGAGTAA
TAGTGTTTTCATAAAATGAGTTGGGTAGAGTACCTTCTACTTGAGTTGGG
TAGAGTACCTTCTACTTCTATCTTGTGAAATAGTTTGTGCAGAACTGGAA
TTAGATCTTCTTTGAAGGTCTGATAGAACTCTGCACTAAACCCATCTGGT
CCTGGGCTTTTTTTGGTTGGGAGACTATTAATAACTGCTTCTATTTCTTT
AGGGGATATGGGACTGTTTAGAAGGTCAACTTGATCCTGATTCAACTTTG
GTACCTGGTATCTGTCCAGAAATTTGTCCATTTCGTCCAGGTTTTCCAGT
TTCGTTGAGTATAAGCTTTTGTAGAAGGATCTGATGGTGTTTTGGATTTC
TTCAGGATCTGTTGTTAAGNCCCCCTTTTCATTTCTGATTTTGATGATTA
AGATTTTGCCCCTTTTGCCTCTTAATGAGTCTAACCTAACGGTCTATATA
TCTTGGTGATTTTTTCATAAAAAACAATCCCTCCTTGTGTAATACTTTAA
AAAGATCTTCTTTTTCTTCCTTGAATAATTATCCCCCAAAAATAAATAAT
TTGCTCATCACATTTTTTTCTATAGAATTTTTTTAACTTTTTTTTAATTT
ATTATTAAGATTTCTTATCTTCTTCAAATTTTATCTACTTTTTTCCTACT
TATATTAACCCATTATTCATTTTTCTCTTACTTTCTATAATATTTCACTC
TATAACATCAAATCCTATTATTTTTTATATTTAAAATATATCTTCTATTT
ATTATTTTATTATACTTATTCCTATAAACATATTCTATATTTTATTATTC
CTTTTACTATTTATTATTTTACTTAATTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 10 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 19 19 8 8 8 12 14 18 26 26 42 33 29 33 33 33 36 42 48 53 53 53
57 57 57 57 43 43 47 30 30 16 19 20 34 34 28 23 12 11 11 23 23 21 21 11 11 11 10 11 12 16 20 21 24 37 33 33 33 33 33 33 33 34 30 30 21 24 30 33 33 39
34 28 30 35 35 30 30 21 21 22 23 18 11 10 10 10 11 11 9 9 9 12 19 19 28 21 10 8 6 6 6 8 6 6 14 22 37 34 34 28 28 32 41 41 48 57 43 43 39 39
35 39 25 37 30 30 30 34 37 42 43 26 28 29 29 40 37 32 30 15 19 19 36 36 39 38 32 32 20 20 22 32 30 37 23 19 9 9 9 9 11 25 27 30 30 30 37 37 40 43
43 43 37 28 23 14 14 26 28 37 43 40 42 37 35 35 35 39 39 39 35 36 43 44 42 37 28 24 22 17 20 22 37 40 54 54 59 59 57 48 48 36 36 30 30 35 42 42 47 47
47 57 48 54 57 57 42 37 32 32 42 37 37 37 37 42 35 37 42 44 42 37 43 43 37 37 43 50 50 57 57 57 57 50 50 37 37 50 50 52 52 52 52 43 37 43 35 35 35 35
38 33 43 43 52 52 52 52 52 44 44 38 38 14 14 14 34 34 32 20 20 28 41 44 43 43 43 44 44 44 26 27 27 44 41 42 36 28 27 27 28 32 28 20 20 28 32 42 44 42
44 39 35 35 39 44 47 48 37 37 28 36 28 35 32 39 43 43 32 30 32 32 32 39 40 40 43 35 35 37 39 35 32 32 28 23 25 30 33 37 39 35 35 35 39 33 33 33 33 28
29 16 18 12 14 12 12 21 28 31 28 36 30 47 43 43 34 34 32 32 28 34 34 46 59 48 48 48 43 43 36 36 39 43 42 48 48 57 57 43 59 39 43 43 59 59 57 48 48 59
59 48 32 32 24 15 15 9 12 12 24 21 29 24 11 11 9 12 12 21 23 27 11 11 11 22 23 35 35 37 37 37 41 43 43 48 48 43 41 41 41 41 23 23 11 11 9 8 8 8
8 10 10 12 11 12 16 24 18 24 28 59 41 41 28 28 33 37 39 36 36 43 44 57 43 43 30 30 30 33 39 47 40 47 43 43 43 48 59 59 59 54 48 48 48 47 42 39 23 23
14 15 15 32 32 57 59 59 59 43 43 43 47 47 42 44 33 42 42 48 48 57 47 43 37 37 37 59 42 43 39 43 43 47 39 39 39 39 39 37 44 39 39 32 30 30 32 32 39 43
47 43 43 39 42 39 39 43 41 32 20 20 20 32 32 43 46 57 43 39 39 33 33 33 37 37 37 39 35 35 37 39 31 31 43 59 59 39 39 39 40 43 48 37 37 37 37 39 39 34
30 22 22 28 34 34 41 41 47 47 37 30 30 30 39 39 43 43 43 43 59 43 46 37 27 21 11 11 19 24 33 39 39 47 35 39 39 47 39 43 47 43 48 40 40 40 39 37 37 34
31 29 34 32 34 31 31 28 39 43 43 43 43 43 39 33 32 30 30 32 33 40 40 47 47 47 47 57 48 48 48 57 48 43 43 43 43 39 37 47 35 30 30 37 37 30 27 25 27 28
33 41 47 46 46 46 37 39 39 39 37 37 47 47 47 47 37 31 31 32 31 41 44 47 47 41 41 31 31 41 41 41 41 41 41 40 40 39 39 32 25 16 17 15 12 12 18 25 25 28
30 30 32 37 37 37 34 31 31 31 34 31 34 15 10 7 7 7 11 11 21 20 20 20 26 22 26 18 24 24 30 30 37 37 28 19 13 13 12 22 19 30 28 27 25 32 30 14 9 9
9 9 8 8 19 19 15 14 14 16 16 9 9 9 9 9 9 18 15 20 20 21 18 22 8 11 8 8 8 10 10 10 13 20 18 21 22 30 30 37 37 32 31 21 12 8 8 8 8 8
16 16 28 17 20 12 13 13 23 15 8 8 8 9 9 8 8 11 10 10 10 9 9 9 11 16 15 15 15 17 16 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 15 8 10 8 11 10
10 10 12 12 12 9 8 9 8 8 8 9 12 9 9 10 9 13 13 13 13 6 6 6 6 6 8 13 23 12 12 9 9 9 9 6 6 8 8 13 8 16 11 22 11 11 11 12 8 8
9 9 10 9 10 10 8 8 6 6 8 10 12 12 11 11 10 12 19 14 14 14 19 19 20 16 10 9 10 10 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10 9 9
9 11 18 10 9 9 8 8 10 10 10 10 8 10 8 8 8 11 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 7 11 13 6 6 6 10 9 9 8 10 8 9 9 9
12 15 10 9 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 11 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 11 11 11 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 14 9 9 9 9 9 15 13 9
8 10 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 15 15 15 10 6 6 6 6 6 8 8 12 8 8 6 7 8 8 12 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 13 13 10 13 8 8
8 8 8 8 8 10 11 13 13 8 6 6 6 8 13 8 10 10 10 9 8 8 8 10 8 8 12 9 11 10 8 8 8 8 7 7 10 9 10 12 9 9 15 11 8 8 8 8 6 6
7 7 9 13 10 8 8 8 11 6 6 8 6 7 12 9 9 10 9 8 8 7 6 8 8 8 8 10 17 15 9 9 9 9 9 9 9 10 15 9 10 10 10 9 12 11 11 10 10 12
11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 | Open.Hide. 0 3 7 7 7 8 8 6 6 8 3 0 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 7 8 8 8 8 13 8 7 9 8 15 9 15 16 12 8 9 9 21 19 24 12
12 19 26 35 35 35 37 37 37 35 35 35 38 38 36 36 41 41 50 50 47 47 23 23 9 9 9 9 14 14 16 11 8 7 8 8 10 15 15 14 12 10 26 26 47 40 33 33 36 36
36 36 48 43 43 43 37 30 21 12 11 11 13 19 13 9 9 9 13 12 8 13 10 8 8 8 23 23 33 33 33 26 30 15 20 20 19 23 23 28 37 37 50 47 47 42 43 43 43 43
35 37 37 39 39 32 32 32 32 32 20 20 22 23 34 36 42 30 30 30 40 37 37 37 37 36 36 39 43 40 43 43 37 33 33 33 27 22 13 11 11 11 14 14 27 27 37 37 37 37
37 32 32 23 28 32 41 39 43 39 36 36 36 36 43 43 42 42 35 35 35 42 43 44 43 43 43 57 42 46 39 44 30 39 39 34 34 37 30 30 37 44 39 39 35 37 37 43 46 48
48 43 44 43 57 48 48 48 42 46 44 44 43 47 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59
59 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 41 32 20 28 32 44 57 68 68 57 57 57 57 47 47 47
47 39 48 47 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 48 59 59 59 57 57 57 48 48 48 57 48 59 43 43 43 48 48 48 59 59
59 36 30 19 15 11 11 12 9 9 9 9 12 11 18 25 31 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 43 57 54 57 57 59 59 59 59
41 32 18 13 12 12 14 26 28 43 48 43 44 44 44 48 59 47 41 35 37 35 24 24 13 13 24 34 44 59 68 59 59 41 42 47 59 48 47 47 42 35 35 43 44 57 43 43 43 50
43 43 23 23 23 44 44 57 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59
52 43 43 35 44 44 57 59 59 68 68 68 59 59 59 68 68 59 57 44 44 32 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 44 44 35 35 42 59 57 57 57 44 44
54 54 48 57 48 48 48 48 57 57 57 59 68 59 59 68 59 41 41 20 20 20 32 32 54 54 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 43 43 43 46 47 48 48 48 41
37 24 29 29 31 31 28 28 37 37 47 59 46 47 42 39 39 39 41 29 35 32 37 31 30 25 25 25 28 28 37 30 39 39 39 43 43 37 37 28 28 28 37 34 39 41 37 37 32 17
17 12 12 11 27 25 32 18 18 20 28 25 20 18 21 18 30 34 41 39 28 28 12 12 9 9 9 23 23 39 41 41 41 27 27 19 26 27 32 41 39 34 34 20 20 20 28 28 37 28
28 21 21 13 26 19 24 30 29 30 24 18 18 16 10 8 8 8 3 0 3 23 18 15 15 9 9 9 18 10 11 11 23 12 12 10 15 10 10 10 15 19 10 11 9 15 10 8 8 8
11 21 15 11 11 13 13 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 17 18 20 14 12 11 8 8 8 13 8 10 11 16 15 14 13 9 9 9 9 9 6 6 8 6 8 8 12
10 10 10 13 22 19 15 15 10 13 10 13 10 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 9 9 10 10 8 8 8 7 6 7 6 10 8 8 8 8 8 8 13 12 13 13 19 21 11 18 10
10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 13 18 19 24 12 12 9 9 9 12 10 8 10 9 9 10 10 9 9 10 15 10 9 8 9 10 9 8 8 8 8 9 8 10 6 6 8 8 10
8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 10 8 8 13 13 12 15 17 11 11 11 12 8 8 8 8 8 8 9 12 12 13 15 8 8 6 7 8 10 11 11 9 15 9 8 8 8 8 12 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 13 10 10 14 10 19 17 10 8 10 13 13 13 8 8 10 9 9 10 8 7 7 10 11 10 12 9 10 10 14 14 24 24 16 10 10 10 10 12
12 12 21 15 10 9 9 9 9 12 10 8 8 8 12 15 10 10 9 11 11 17 15 12 9 9 10 10 8 8 10 10 10 13 10 8 8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 11 10 10 8
8 8 8 8 8 7 6 8 10 10 11 7 6 8 8 9 10 10 10 12 12 12 12 11 8 8 8 8 7 7 10 8 11 8 8 8 10 10 10 24 20 23 20 11 11 9 9 8 10 9
9 7 9 10 10 9 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 10 10 9 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 15 11
11 11 18 12 8 8 8 8 10 11 15 12 7 6 6 6 8 19 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 |
|---|
