BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-361C01.T7 (MSMg01no361_c01.b1) | MSMg01-361C01.TJ (MSMg01no361_c01.g1) |
ACC | AG470136 | AG470137 |
length | 749 | 762 |
length of high quality (start - end) | 548 (50 - 597) | 451 (80 - 530) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no361_c01.b1 PHD_FILE: MSMg01no361_c01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:56:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no361_c01.g1 PHD_FILE: MSMg01no361_c01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:56:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCCTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTGTGATAGCCAAACGCT
GAAAACAACCTAGATGTCCCAGGAAAAAGAATGGATACAGAAAATGTGGT
TCATTTACACAGTGGAATAAGCTATTAAAAGAAAGAGGAGATTGCAACTT
TAGCAGGCAAATGGATGTAACTAGAAAATATCATCCTGAGTGAGGTAACT
CAGACCCAAAAGCACATGCATGTTATGTATTCACTAATATGTGGATATTA
GCCAAAAAGAAAAAGAAAAAAGAAAAAGCCCATACAGAATACACAAGATA
CAGGCCACAGACTTTAGAAGGCTCAACATTCTGACGTGCCCAAGTGAGGG
AGCCTCAGACCCACTTGGGGGAGAGAAGAAAGCAATCACAAGTGGGAAGG
GAGGGAGGAACTTGAGAGGGACAGTGGACAGGGTTGGGAGGGGAGTTGGA
CATAGAGAGGAACCTGATCTGGTATTGGGTATGGGAAAAGAACTGAAGCC
CTGAGGGCCAGCAGAAAGAATGGAAACCCATATCTGTTACCTCCCCCAAG
CCTGAAGCTGGCTGAGTCAGACTCGACTTTGCTGGTCCTAAGGAGCTTAC
CTAGGGTGTAGCCTGCCTTCCTAGATCACTCTATTATTCATCCACTGTTG
CCGTTCCCCTTCTGAAAATGACACCTGTTGGGAGGCCCCCCCAGTCTTN
| TGCGCGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATGGGAAGCAGAGGTGTGTT
GTGGGCAGGGAGTGAGAGATCAAAGCACTCAAACAATATGGAGCTGTTTT
GTTGCTCTGGTCAGGTAGTAAGTCACATATCTTACATTTGTAACCTATGT
TTCCTGGTTATCATTTCTTACACTCTTCTCTCATTTTGTGACTATCTTAC
ATTATGCTCTGCATGCAAGGATAGATCTTTGTGTCACAGCATTTAATGGC
TGGTTCTGCAATTATCAGCCTTGTAGTATTAAGAAGGAGCTGGGCTGGGG
AGTCCCACTAAATCAGAACAGACAATCCATTAATAGCTTGAAAATATACA
TTTCTCTATATAATATGAAGTATATATACATATATATACATATATACATA
TACATATATATATACATACATATGTATATGTATATATTCAAACTAGAGGA
TAAAAGTACTGTATTTATTCCCCTTGTTGCATATCTTGAAGTCTATATAA
AAAGATAAGTTTGCATAACATTTCAATGCTTCTACTATGTATAGGACATT
GTTAATATTATAAAACGGCTATTTACAGGTTGCGGAAAAGATCCTTATCC
ATCTTCATCCCGCGATAGAGGACCAACTATCCCATTTCTTCCCTTTCAAT
CCCCTTATTTCACTATTCCCCATCCCCCTTTTTATTCCATCTTCTTTTCG
CGCTTTTTCATT
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 11 11 13 23 37 29 29 28 22 22 30 24 23 25 28 28 30 44 59 30 30 30 17 16 10 15 14 16 14 12 24 26 37 37 31 31 31 26 26 35
43 57 57 38 38 36 37 50 50 43 43 43 24 29 19 20 15 19 12 29 29 48 42 43 43 47 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 53 50 47 47 48 50 50 59 59 57 57
57 57 57 50 48 48 48 47 48 57 59 57 57 68 57 57 57 57 57 57 47 57 57 57 57 68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 57 52 54 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 50
50 50 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62
62 52 62 62 62 62 62 54 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 57
57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 57 57 52 57 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 57
57 57 52 52 50 50 35 59 43 57 52 54 54 57 57 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 44 43 43 50 43 57 59 59 59 48 48 48 59 59 57
57 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59 57 57 43 43 43 46 47 54 54 54 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 48 48 48 48
48 37 37 23 23 23 34 34 59 48 50 41 41 37 37 41 41 41 37 37 31 31 41 41 41 41 41 41 37 28 28 37 37 30 35 35 43 59 47 47 47 47 44 41 39 31 31 30 30 32
39 30 37 33 30 26 21 15 15 14 21 15 14 14 24 28 39 34 34 32 34 34 42 28 36 30 28 28 30 37 36 43 39 46 46 41 37 34 31 24 25 31 37 34 30 21 19 15 15 19
20 24 28 18 12 11 11 11 13 12 14 25 23 25 11 11 11 12 18 18 28 28 28 13 13 13 22 17 25 37 30 16 12 7 6 6 6 10 13 8 8 8 8 11 19 17 17 10 10 10
17 17 20 15 10 8 8 8 8 8 8 8 11 13 19 17 22 25 19 25 18 18 11 15 15 22 17 17 17 30 32 34 34 23 19 19 18 13 8 8 8 6 6 6 6 8 8 20 18 19
10 10 10 12 9 9 9 9 10 13 13 8 8 8 8 8 9 9 10 15 10 11 9 10 11 14 9 9 13 10 11 11 10 11 11 13 8 8 10 9 10 8 8 8 10 12 12 3 0 | Open.Hide. 6 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 12 15 18 20 18 27 31 29 39 30 25 25 28 30 37 39 39 32 28 25 15 14 14 15 26 20 30 28 25 28 28 33 36 48 57 57
57 47 38 43 43 42 42 43 44 44 48 48 34 34 18 28 36 36 40 40 48 48 57 41 41 42 42 48 50 57 57 57 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 68 68 68
68 57 57 54 54 54 57 57 47 47 47 50 47 54 57 59 46 46 46 46 46 46 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62
62 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 68 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 43 43 43 43 62 62 59 59 35 35 35 44 44 62 62 52 52 43 43 43 52 52 62 62 59 43 35 35 39 43 43 35 31 31
35 43 43 57 47 44 45 42 42 43 43 43 35 36 26 26 44 44 44 43 43 33 29 29 29 44 44 52 52 43 57 39 39 43 43 35 35 38 44 57 57 52 57 57 57 44 44 35 31 31
43 44 57 59 54 54 57 57 57 57 54 54 52 57 52 52 43 43 43 43 35 35 43 43 50 48 43 47 42 59 59 59 59 59 59 57 46 44 42 32 32 42 42 46 42 42 37 35 24 32
19 19 13 19 19 44 36 43 43 43 43 47 44 46 37 37 32 40 30 30 30 42 42 37 39 39 42 42 42 35 35 36 42 42 48 43 40 33 28 28 37 37 27 27 12 12 11 18 18 23
23 28 25 34 28 28 13 18 18 25 19 20 20 32 32 37 32 23 20 28 24 24 32 32 28 28 22 20 11 9 9 16 17 14 14 23 20 22 23 11 11 11 15 15 22 11 11 11 10 10
10 12 12 12 21 20 23 20 20 20 19 28 12 10 8 8 8 15 15 16 16 15 12 11 12 12 18 28 22 19 13 10 10 10 10 10 10 10 10 8 6 6 8 8 12 17 11 10 10 10
9 9 9 9 9 13 13 9 8 8 8 8 8 10 12 11 11 10 10 10 10 12 9 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 15 13 13 12 15 18 9 9 7 8 8 8 8 7
6 8 6 6 6 6 6 6 11 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 18 8 8 8 12 12 19 21 10 8 8 8 8 8 6
8 8 10 13 8 10 6 7 8 8 9 8 8 8 8 8 10 10 14 13 10 11 12 11 10 10 10 12 13 13 12 12 8 6 8 8 7 6 6 6 8 8 8 12 12 8 8 8 8 8
8 8 8 8 11 12 11 9 11 11 11 11 |