BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-362O08.T7 (MSMg01no362_o08.b1) | MSMg01-362O08.TJ (MSMg01no362_o08.g1) |
ACC | AG471471 | AG471472 |
length | 1,345 | 768 |
length of high quality (start - end) | --- | 450 (73 - 522) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no362_o08.b1 PHD_FILE: MSMg01no362_o08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:58:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no362_o08.g1 PHD_FILE: MSMg01no362_o08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:58:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCTGCGGGTGTCGTGCGCGGTGGGGTGGGTTTATATGTATTTAACGGCGC
CGGCACCGGGTATTCTTTTTTTGATATTGTTATTAATCCCCTCTCCGTCA
TTGTGCTGTTCTCAGTATCCCATGGCTCTCGCCGTGCTCGCGCACTCCCT
GCCCGCGTGTTTGTATTTAGTCTGCTCTCTGCCGTCGCGCGGCGCGCGAG
ACAACTGGGACGCGGGCTGGCTTGGCGCGCNGTGCGTGGCGCTCTTTCGC
GCCCGCGGCGCCGCGTCGGGATCCGCTGGCCGTGTGGGGGGGAGCTNTTG
TTACGAGGTAGGTGATGTGTATCGCAGCTCTCGTTGTNTCACCGTCTCAG
TTAATCGGCGCGTACGTCCGCGCCGTATTCACCGTGTCGTATCTCAGAGG
ACGCCGGGCGAGGTGGCGAGCGTATATCGTCGTGGCGTCGCCCCTTGATC
GTGGGTGCTGTGGGCGCGGCGCGCGTCGGGCGGGGAGCGGGTTAGTGTGG
GTGGTGTTGTGTGCGGAGGTCGGCGCGTGATGGGTGCCGTCGAGGCGGCG
TGATCCGGCGGTCGGCTGGTCGCGGCTGGGTGGGGGTGTGCGGGCGGCGC
GCGCCGCGGCGCTCCCGCTTCGACATGTAATCACCGCCGCCGCGCGGTGT
GGTGTCTCGGCCGGTCGGCTGTATAATCCTGTCACCATATAACAGCACGC
TGTCTGTGTGCCTCGGGAGTATTATACTCCCTCGCGAGCGCGGCTGAGCG
TCGCGTGACGTCGGCGTCGGTGGGCTGTTTGAGTGTGACATGCGTCACAT
TAATAGAGTATGACGGTGCTGACTCAGTACTGTTGGCTGCCAGTCGGTCT
GCTGTAATGTCCTGCTCACCTCGGCGCCGACACNAGACTGACTACGCCAT
AGCGCGGCGGCGCGCTGGAAAGATGACGCCGTTGTGTCATCTCTTATCAC
GCGCGCCCCACCGCACGCCGCCGTGTTTGTTATGACGCGCGTGTGCGGCC
CACCCCGTCTCTGTTGTCTCCGCGCCGCTCATTGACCTCGTCCGCGCGAC
GTGTCTTCGGTAGTGTGTGCCAGTGGATTCAACTTTTCTCTCTCGCTTGC
GCGCCCTATTTATATCGCGTCGCCGCGCTGATACACTCCNTCTATTCGTC
TTCTCGGCCNCAGCTCTATATCTCTTCGTATTCATTCGNTTGTAGTGAGA
GGCGCGCTGTTCGGGTCGAGGTACCGCAACGACGCCGTCTTCATCGCTTC
GTCTCCTGCTCCTGCTGCCTATTCGTCATTGTTCCTATCCGCCTACGACC
TGATTCTCTACTACGTGTATGCGCGTATCCTCGCTATCTGATATT
| GACTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGAACTGATCTTCAGATCCTATCAAAAG
TGACATTTGAAATTGAGAAACGTGCTCTGTGTATAAAATATATGCCCAAC
TGAGCTTGAAACAGTGATGTATTGTAGCGGCAGTTATAGTAGCTATTATA
TTACAAAGTGATATGTCCCTTCCCCCAGGCAGTTGCAAAGCTCAAATCTT
ATTTTTCATTTATTTACGTTCAATTAAAGGATACAGAAATGGAATGAGAT
TGATGAAAATTTCTCTGGAGATTTTATAAAGAAAATCCTAAGTGATCATT
TAGGGCTTTTTTTCTAGCACTGGTATTTTCATGAGACTTCCCTTCTTTTG
AGTGTTGTAAGTGGGTCCCTTCTCTCATTTTCTCACATGCTCCTCACCAG
CACATCATCACTCCATAGAATCTAATTTAAGGTAAGAGATGAAATCTGAA
GAATTTAGGTGAAATTGTGTTGTACAGAAGGAAGCAGTGGAAAAGTATCA
ATCATTAGTGAAGTTATAATTCCGTTATTCCTGCCTTGAGGCAAAATTCC
CAGGAGCCTTTATTACTGCCTATGTGTGAAGACTGGTTACCCCCTGACAA
TCCTGGAGTACCACCATATATGCGGCCTTTACATCTCACAATCCTAATCT
GCATCCTTTGACCACCCTTGCACTACTACTGGTTACTTCCGTTATACCTA
TATTCCCTTCTCCTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 13 11 6 6 6 6 7 6 6 6 6 9 9 11 10 10 8 8 8 10 12 8 7 7 10 10 12 8 8
6 6 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11
11 16 13 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 6 6 6 6 8 6 6 8 8 7 6 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 12 13 9
8 8 8 8 8 10 6 6 6 12 12 14 10 10 10 10 12 13 8 8 8 8 10 8 10 9 6 8 6 6 8 8 11 10 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8
6 6 6 8 10 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 7 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 8 10 8
8 8 10 8 8 8 8 10 12 9 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 6 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 10 7 7 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8
8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 8 10 10 10 10 11 6 6 3 0 3 9 10 9 9 9 10 9 8 8 8 8
8 8 10 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 6 6 8 8 11 11 10 10 6 6 6 7 8 8 9 8 6 7 7 10 10 10 12 10 10 11 10 9 9 9 10 8 8 6 6
6 6 8 8 6 6 8 8 10 9 9 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 8 10 10 6 8 6 6 8 8 14 8 6 6 6 6 8 6
8 8 8 11 8 9 6 6 6 6 8 8 14 13 13 20 12 12 12 9 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 13 9 8 8
8 8 8 13 9 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 9 10 10 11 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 10 10 9 8 6 6 6 6 8 8 8 8
8 6 6 8 9 10 17 18 8 8 6 6 6 6 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 6 6 8 8 10 9 10 10 12 12 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 11 9 9 10 10 8 6 6 8 8 8 6 7 6 10 8 8 8 6 6 6 9 10 10 10 10 10 16 14 12 8 8 6 6 6 6 9 9 12 9
12 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 7 7 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 6 9 13 10
16 13 10 10 10 10 10 13 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 14 11 14 8 10 6 6 6 8 8 11 9 9 10 8 8 8 8 8 11 10 9 8 8 8 8 8 6 6 6
6 6 6 8 8 11 9 10 10 10 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 13 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10
11 8 8 8 8 8 8 10 13 10 8 8 8 7 9 9 9 9 9 7 8 8 8 10 8 8 8 6 7 6 9 9 3 0 3 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10
10 10 10 10 10 8 8 9 6 8 8 8 8 13 10 6 6 6 6 9 9 10 8 6 6 6 6 7 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 6 6 10 8 8 10 10 11
10 8 6 6 7 7 7 10 8 6 6 10 10 10 8 10 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 11 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 11
8 9 8 6 6 6 6 8 10 10 8 10 10 10 10 8 10 10 13 10 15 10 15 19 11 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 15 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6
8 8 10 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 10 8 8
10 12 9 9 13 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 11 8 9 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 3 0 3 11 10 10 10 8 6 6 6 6
6 8 8 8 8 8 6 6 3 0 3 8 8 8 13 10 8 8 8 8 12 10 10 10 8 8 6 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 3 0 3 11 10 8 8 8 11 8 8 8 8
6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 7 7 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6
8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8
10 9 7 7 8 8 6 6 6 7 10 10 10 8 8 8 8 8 8 12 8 9 11 13 12 10 11 9 9 10 10 10 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 8 8 19 30 32 25 29 36 32 37 39 39 33 32 37 32 32 37 59 27 27 9 9 9 9 9 9 7 3 0 3 8 15 19 30 30 41 47 33 33 33 33 33 33
39 47 47 47 25 21 9 7 8 8 8 13 11 21 21 37 22 22 25 28 28 28 37 37 47 47 47 50 50 50 53 50 50 47 47 47 47 50 57 57 57 57 50 53 50 48 48 57 54 54
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 57 57 57 57 57 50 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 46 46 46 48 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 57 59 59
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 52 52 62 52 52 52 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 59 57 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57
57 57 57 54 54 54 57 57 50 50 37 32 32 44 44 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 32 32 32 42 42 48 48 43 43 43 57 57 57 59 59 44 44 43 44
44 47 34 34 32 30 30 30 25 28 36 40 48 43 36 36 23 23 23 34 35 54 54 54 48 57 43 42 39 42 32 28 31 24 22 22 28 32 32 37 37 35 35 35 32 39 39 28 21 24
15 14 23 23 23 23 20 18 17 26 30 28 30 30 28 29 28 30 30 30 30 13 11 8 8 8 10 15 20 18 17 22 17 13 13 13 13 17 17 16 16 17 15 17 18 14 14 12 12 11
12 11 12 12 12 22 9 12 11 12 18 15 10 10 10 10 16 18 32 36 32 40 23 23 22 28 28 43 43 23 23 15 13 13 16 15 15 15 11 10 10 10 10 10 15 18 23 26 32 21
15 12 12 10 8 8 8 8 10 11 13 10 10 13 15 15 18 14 12 12 12 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 6 7 7 7 9 14 21 17 16 10 10 12 10 8 8 6 6 6 8
10 10 10 10 9 9 8 9 9 12 11 10 9 8 10 10 13 13 11 12 10 10 8 8 8 8 8 19 15 11 9 9 9 9 11 6 6 6 6 6 7 9 10 10 9 10 12 15 10 10
11 10 10 18 15 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 13 10 8 10 9 9 6 8 6 6 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 10 12 12 14 24 24 28 30 28 23 20 |