BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-381P01.T7 (MSMg01no381_p01.b1) | MSMg01-381P01.TJ (MSMg01no381_p01.g1) |
ACC | AG485961 | AG485962 |
length | 693 | 741 |
length of high quality (start - end) | 444 (62 - 505) | 570 (75 - 644) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no381_p01.b1 PHD_FILE: MSMg01no381_p01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:23:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no381_p01.g1 PHD_FILE: MSMg01no381_p01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:23:30 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCT
CCATTTCTGTTGGAATTTTGATTGCTATGTTGCACCTTGTTCAGGTATGA
TGCAAATGAGCACAGCTATTGTGAATTGATTGTTATGAGAGTCATGAAAT
ATATATATGAGTTTCACAACTTCATTTCCCATTTACTAAAACCTACATCT
TTTTTTCTTTCCTCTCACAAAGTTCTCTGAGTAGGAGGTGTAACCTACCC
ATAGCAGAGCTCAGTTAATTCTACCCACAACGTCATCCCTTTATGAACCT
CCATATTGACCAATGCACAGTATAAAAGTCAGTTACTATGACCAAAGTGA
AGAGAAGTACAGGCATAAATAAAAAGATTTGGAGTATAGTTTAACATTAT
GATCAATTAGCAAATCAACAGTAGGTTCCCTCTAAAGATGTTGACCACCT
TGTTCATAGGCTATTGATCAGTTTAACAGTTTCACACATGATATCTTTTT
TTTTTAAGCATTTTTATATCTAATCACAAAGTATTTGGTTATCCTGATAA
CCTTATTGCCACTATTGCACCACAGCACATATTAGAACTACCGATTAGTG
CCGTGGTTTCCGACGTCATGTTCTGTTCAATATTATTGACGATAATACCT
TCCCTCTACCCATCAGTGCCTTCTGAACCGCTTATGTTTCTAT
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATATCTATGCCATGATGGAGTCTTT
CAAAATTAAAACTACAACTAGGTTTAATTTCGAAGGTTCCCTGTGGTTTA
GTAGCTTTCATATTTAATTATCACTTCAGTAAAATTTCAGGAGGGAGTGG
GGATAAACAAGAACGTTCTCTCTGTTTAATAAAAGCTTCATTAATTTATG
TCCTACATACTGTGCTCTTATGTTTGATGAGAGCTAATTAATTATCCTTA
TCTAAATATGTTTTATAACTTTTCCAAGTCATAAATCAGAAACCTTGTTG
ATCAGTTTAATTTACATAAGGTTATACCTGCATGGTAAGCTCTAGAAGGC
CTCGTGAGGTAAGGCAATAAAATATTGGCCAAATAAGGAGATTTAGGCCA
GGCTGGGTTACATGAAACTCTGTTTCAAAGGAGCAAAACATACAAGCAAA
AATAAAAAATGAGGGAAAGTTATAGAAATAAACAAGGAAGAAATAATAAT
TAGTAAGTTTACAAGCCAGAAGGTCAAAGAAGTTTTCAGGAAGGACTCGA
CATGTGTAAATATGCATAAAGAACATTCAAATCCTAATTTACTGTATTAA
CTGCAATTGTCCTGTTGTTTTTTAAATGTTTTTTATATGTATTAATAAAT
GGAATGTCATTCCATTTATTCTCCCATAAATTCTATTTTAT
|
quality values | Open.Hide.36 36 36 39 39 34 34 30 24 26 18 19 13 8 8 10 19 19 41 30 24 29 15 13 9 9 9 9 9 9 9 10 10 15 23 20 29 24 28 28 48 48 53 31 31 31 31 33 33 27
23 13 11 9 14 14 11 11 11 15 20 25 22 25 30 33 31 36 36 38 38 42 50 53 53 53 57 53 50 57 50 53 53 53 53 53 68 68 68 42 42 42 37 37 48 59 59 68 68 68
68 68 68 68 48 48 46 46 39 39 37 42 37 41 41 42 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 54 57 57 57 57 47 57 50 54 50 50 57 57 57 48 48 47 50
50 57 57 57 57 50 50 50 57 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 45 52 43 52 52 52 59 59 68 68 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 39 39 39 43 44 62 43 52 62 62 62 62 62
62 62 62 59 59 35 35 35 47 47 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 35 35 35 39 35 35 39 38 44 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 44 44
52 52 52 44 44 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 52 43 43 52 59 57 57 57 57 59 59 57 57
57 54 57 57 57 52 32 32 14 14 14 30 32 43 59 50 37 37 37 50 44 44 43 43 44 44 48 57 57 57 57 57 57 42 42 37 37 32 32 17 17 17 29 32 44 43 43 43 57 48
57 47 44 44 40 37 37 37 37 43 48 59 59 48 48 43 46 39 31 18 14 14 14 22 24 37 24 24 12 12 12 25 21 30 30 40 32 24 24 23 14 17 17 26 30 43 48 48 48 59
47 34 28 20 18 15 12 10 10 8 8 8 12 22 20 27 30 28 19 18 18 18 18 20 23 23 22 28 22 16 16 10 10 10 10 15 16 14 14 14 21 21 28 37 34 37 37 28 28 23
22 22 28 26 30 22 22 11 11 11 16 16 20 23 21 13 13 11 11 10 10 10 9 10 9 10 10 10 11 12 13 8 8 8 10 9 14 18 23 29 19 18 13 13 19 10 10 10 10 15
15 15 15 15 11 11 11 18 18 13 12 10 10 10 11 11 11 10 8 10 8 9 8 9 10 10 10 10 9 9 9 10 9 10 8 8 8 8 10 10 10 10 14 19 16 13 13 9 9 11
15 14 11 14 11 10 10 10 8 10 11 16 14 15 16 16 17 11 12 10 9 9 8 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 10 8 8 8 | Open.Hide. 7 10 7 6 6 6 8 15 17 28 27 28 32 29 29 41 39 39 47 47 39 39 37 32 31 37 34 23 19 10 8 7 7 7 8 8 19 15 19 19 24 29 48 50 53 57 53 50 50 42
43 50 50 53 53 53 43 34 25 10 10 12 12 23 23 43 43 46 42 42 42 42 50 50 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 51 50 68 68 68 68 68 68 51 51
50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 54 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 44 43 43 57 59 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 48 57 57 48 48 57
57 57 57 57 57 59 46 43 43 43 57 48 59 59 59 59 43 43 43 43 47 43 48 59 59 57 57 57 43 43 39 39 37 36 36 37 41 39 39 41 41 41 44 44 47 47 59 50 50 50
47 50 47 59 59 59 43 41 37 40 39 36 36 39 59 59 41 41 41 37 31 31 31 39 36 32 28 31 43 39 44 47 47 41 47 37 36 32 31 31 36 31 29 29 32 37 37 37 27 25
15 15 15 21 21 23 23 23 28 34 34 47 41 30 17 12 11 11 11 11 20 19 31 39 39 39 39 30 30 30 39 39 31 36 41 37 37 28 28 17 17 11 16 10 10 10 16 17 14 14
14 23 18 12 12 13 18 12 15 15 24 27 32 27 20 19 18 15 15 21 29 28 18 19 17 17 19 18 19 12 14 9 9 9 12 12 9 12 10 11 11 19 16 25 21 29 28 32 18 20
15 14 14 11 15 11 12 11 9 8 14 14 9 10 11 27 15 15 18 22 19 32 21 21 12 12 11 16 14 13 11 12 11 10 10 10 13 18 13 13 12 |