BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-497G03.T7 (MSMg01no497_g03.b1) | MSMg01-497G03.TJ (MSMg01no497_g03.g1) |
ACC | AG573965 | AG573966 |
length | 753 | 758 |
length of high quality (start - end) | 370 (325 - 694) | 618 (76 - 693) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_g03.b1 PHD_FILE: MSMg01no497_g03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:23:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no497_g03.g1 PHD_FILE: MSMg01no497_g03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:23:03 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTTGTTTTCCTCTGAGCCCCATTTTTAATGGGGTTATTTGACTTT
CTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGACCCCT
ATCTGATTTGTGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTT
TTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCTTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATG
AGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTACTGCACAAGCCATTGCTGTTCT
ATTCAGGAACTATTCCCCTGTACCCATATCTTCAAGGCTTTTGCCTACTT
ACTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTGTTTTTATGTGGAGTTCCTTAATC
CACTTAGATTTGGCCTTAGTACAAGGAGATAGAAATGGATCAATTCGCAT
TCTTCTACATGATAACCACCAGTTGTTCCAGCACCATTTGTTGAAAATGC
TGTCTTTTTTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCAAAGATCAAATG
ACCATAGGTGTGTGGGTTCATCTCTGGGTCTTCAATTCTGCTCCATTGGT
CTGGTCTACTTATCTGTCACTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAA
TTGCTCTGTAGTACAGCTTTAGGTCCGGCATGGTGGTGATTCCACCAGAG
GTTCTTTTATCCTTGAGAAGAGTTTTTGCTATCCTAGGTTTTTTGTTATT
CCA
| CCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTTTCTCCGAAATCACATCTTATTTCCATAAAACATATA
TGCTGTAGCATACATACATACATACATACATACATACATACATACATATA
CACATACACACATACACACATACACACACACACACATACACACATACACA
CATACACACATACAATTGGTTTGTCTGTTTAGTTTTGGATGGGTTTGAGG
TGTCGTTGTTGTTGGTTTGTTTTTGAAACAGAGTCTGTCTATGTAGCCTT
GGCTGTCATGGAATTTGTTTTGTAAACCAGGCTGGCCTCAAATTTAGAGA
TTCACCTTCTTCTGTCTTCTAAGACCTAGTAGTCAAGTCTCCACGCCCAG
CAGTTTGAATTGTTGGATTAAAGATTTTGGACATTTGTCTACTTTATCTT
TTCTATTAAGATAGAAAGAAGATAGCCTATTATTCAAAATTACTCGGAAA
ATTATTTTATAGTCAGTCATGGCTGGAATGCAGATATAAAAAAATCAGAT
TGTTTGGAACTGAAAAAAAAAGATAAAAAGTTTAAGAAACTCTTTANAAA
TTTCCCTTTTCAAAACTGGCTGGCCATTCATACAGCTCATGAATCTTAAG
GTTTAACAATATAAGTGAGTAGCCTCAGCTTATTTCAGTTTGTCTTAAAT
TTAATTTAGGTTTAATCATGTGTCTATAGACCTGTACTTTTATCATCATG
TTATTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 13 16 34 34 47 37 37 37 31 31 37 23 19 9 9 9 21 21 41 27 24 20 20 15 12 7 6 6 6 6 6 9 15 15 16 16 21 16 18 22 32 41 47 36
31 31 33 33 33 47 44 41 27 27 9 9 8 8 8 8 11 18 18 23 28 28 37 37 37 39 39 47 57 57 57 53 48 48 48 48 57 59 57 57 57 53 53 68 68 68 68 54 54 54
54 54 48 48 48 48 41 41 41 41 41 36 42 42 47 47 43 44 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 68 57 44 42 40 43 48 48 48
57 50 54 46 48 46 46 46 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 52 59 54 52 52 52 52 57 52 52 52 57 59 57 68 68 68 57 59 52 52 52 59 59
68 57 59 52 52 57 57 57 68 57 57 57 52 52 57 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57
43 43 57 59 48 57 54 54 59 59 68 68 68 68 68 57 57 48 54 54 54 54 59 59 59 59 59 57 57 59 57 59 48 48 48 59 59 43 43 43 57 59 57 57 57 57 59 48 48 48
59 57 43 43 41 43 43 53 50 50 50 41 59 34 26 19 12 12 11 16 11 11 11 12 12 21 30 37 59 59 44 44 47 47 39 47 48 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 59 59 59 54 54 46 57 46 57 57 57 59 57 48 46 43 48 48 59 48 48 59 59 59 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 57 59 59 59 41 42
37 39 43 34 59 59 68 68 68 68 68 50 50 43 43 38 41 41 59 59 43 43 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 59 43 35 35 43 47 59
50 48 48 47 47 43 50 50 57 57 57 68 57 57 57 47 43 43 39 37 35 44 44 54 44 44 37 43 43 37 44 44 47 43 43 43 57 48 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 48
48 48 43 43 48 59 59 68 48 48 37 37 28 30 40 42 48 48 57 48 48 48 48 48 53 48 50 39 37 37 37 43 41 34 41 36 41 41 41 32 37 34 34 34 31 30 41 41 59 59
37 37 30 24 29 27 34 36 43 43 47 47 59 59 50 43 43 35 37 35 39 39 41 41 37 43 36 37 41 32 32 28 20 18 28 32 32 35 36 47 43 34 29 25 30 28 22 24 25 27
28 39 27 32 30 30 37 37 41 41 59 59 59 59 59 43 43 36 36 36 37 37 37 37 29 29 35 39 39 39 37 37 39 39 39 39 39 41 37 37 44 59 59 47 37 35 35 35 47 59
59 59 47 47 39 30 30 26 26 30 28 28 28 32 32 33 30 29 23 15 10 12 16 22 20 23 23 26 32 32 37 30 31 35 29 29 30 33 23 21 19 24 15 16 17 16 13 13 9 9
9 12 9 14 22 37 39 28 28 19 16 16 18 17 21 20 18 14 12 9 9 8 7 8 8 21 21 37 28 28 23 23 20 20 24 16 13 11 9 9 16 16 22 22 21 17 13 18 19 22
23 22 22 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 9 9 10 12 27 28 37 29 34 28 24 24 25 24 30 30 39 39 40 41 41 41 44 31 17 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 7 10 10 12 12 12 25 23 37
39 44 44 39 37 42 41 34 25 17 9 9 9 8 8 6 8 8 8 13 11 17 10 10 11 12 24 29 36 38 57 57 57 57 59 50 50 50 50 50 50 59 50 50 50 50 68 48 57 54
57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 54 68 68 48 48 47 41 41 57 57 48 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 59 57
57 54 54 57 57 57 57 54 54 54 54 54 57 54 54 54 54 54 54 54 59 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 54 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 54
54 54 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 57 57 57 54 52 57 59 59 57 57 50 48 48 57 50 54 57 59 68 68 68 57 57 59 57 57 47 47 44 57 57 59 54 48 48 54 48 47
42 42 28 28 23 44 44 59 54 54 54 54 54 57 57 57 54 57 54 59 59 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 59 43 43 47 46 48 48 48 48 48 48 59 59 47 39 43 43 43
47 59 47 47 43 40 40 47 43 48 41 41 42 35 30 26 14 14 12 33 12 12 11 12 12 21 23 30 35 59 59 48 48 59 59 39 37 43 43 43 57 57 59 59 59 59 59 68 68 43
57 48 48 48 48 46 48 43 43 43 43 39 39 59 39 43 43 43 47 44 57 57 57 57 48 47 46 59 59 59 59 48 37 37 43 44 57 42 42 42 42 43 43 47 47 48 44 44 43 47
44 59 59 59 59 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 57 59 59 59 59 59 57 57 54 54 59
59 52 43 43 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 52 57 52 59 59 57 57 54 57 57 57 52 52 52 59 59 59 59 59 52 52 43 57 57 57 59 59 50 50 48 48 48 57 57 57 57
54 54 54 57 57 57 57 57 57 44 44 28 28 28 41 40 35 35 42 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 48 47 48 47 59 59 59 59 68 68 68 68 48 48 37 37 28 37 32 43
43 43 43 48 57 57 57 47 47 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 37 37 30 30 30 37 33 33 32 30 25 25 28 28 28 28 22 24 34 39 32 32 32 21 21 3 0 3 18 22
37 37 32 32 36 39 39 39 37 32 30 25 29 34 41 41 34 32 24 28 23 32 20 18 18 31 32 28 28 28 34 37 39 39 39 59 36 39 37 37 35 30 27 28 28 31 34 34 32 28
18 18 18 28 25 29 30 30 30 37 33 36 33 37 24 24 19 31 15 15 11 11 11 15 19 28 23 26 32 31 31 35 31 31 37 30 24 17 17 20 23 21 28 28 10 9 9 9 9 9
20 22 22 20 22 11 14 8 8 8 8 10 12 12 23 23 23 19 19 12 12 11 19 15 24 16 22 22 22 18 23 19 18 11 11 10 14 11 15 19 14 19 15 18 15 15 12 12 12 11
11 11 10 9 9 9 9 9 |