BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-504M05.T7 (MSMg01no504_m05.b1) | MSMg01-504M05.TJ (MSMg01no504_m05.g1) |
ACC | AG579564 | AG579565 |
length | 748 | 1,367 |
length of high quality (start - end) | 488 (52 - 539) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no504_m05.b1 PHD_FILE: MSMg01no504_m05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no504_m05.g1 PHD_FILE: MSMg01no504_m05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:32:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NGGGGATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCTTTGTCTCGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATT
TGATTTTCTGATGTCCACCTTCTTAAGTTCTTTATATATGTTGGATAATG
ACTTTGTTGTTTGATTATTAGAATATAAAATCTGTTTCCTAGTGTTTGTT
GTTTTGGTTTTGGTTTTGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTTTTG
AGATTCTAAGCATTTAATTAATTAATGCTACACTTTATTTAGTTTCTTTG
TTTTCAGACATCAAAAAAAAATTTATCCCCTGGGAAAGTGTCTTTTATAG
TCAAGCTCTTGTGACCTATAGCAGAGTGTGGATCAAAACTTGGTCCTCCT
ATCCAGGTGCTGGCTATAAAATCTTGTCAAGGCTAAACATGTACTCAGCT
GTTAGGTGACACCTCAGCTCCCATTTTTTAAAAAAATTAGGTATTTATTT
CATTTACATTTCTAATGCTATCCCAAAAGTTTCCCCCCTCCCGCTACCCC
CTCTCCTGTTCCCCCATTCACCCACTTCCAATTCTTGGACCTGGGATTCC
CCCTGCCTGATTCTTTTTAAATCCGCCTGACCCATGGGCGTTTTCTCTCC
CATGTTTGTTAGTTATTGCCTCACCCGAAAGACTGGTTTGTATGCATTAT
TTATTTTTGGCTATCCCCGCGCCGCGTGATTTTAATTTTCCTTTTATG
| CTTGCTTGAGGCACTCGATCGAGACGTGGTTGGGTCCCGCGGGCCGCCTC
GGCGCTCTTCTCCATTACGTATCTTTCTGCCACGCTGCCTTTTCTTGCGT
TCTCCTCTCGCCTCGTAGGTGCTCACTGCCCCGCGTGATACTACACGTCA
CATTACATACCCTCGCAGGCTACAGAAGACGCGCGAGATGAACGATAATT
AAAAGAATCGGCCAACCGCGCGCAATAATGCGCAGGCNCGCGCGCGTAGC
TCCCGCAACGAACGTATGATATGTACCGACGAAGTAGACACCAAGAATTA
TTTTCGGTTGCATTATCGTCGCGATGCAGATGAGAGCGTCCGCGGTTCGC
GTGCGCGTCGGAGCAGACGGGCTAGAGGCAGTGCGCGGCCCGTGTTTGCG
CGGACGATGTTACACGAACTCGTGTCTATTGCCACCATGTACCGCACCGA
ACCATCGCATCACACGCTCTATCCACTCTCCGCTCCGATTAACGTGATAT
ATATCCATACAGCGCATACATAGTAGCGCAAGTATATNAGTCGTCGCTGG
GCGCATACCGCGCGATACCGATTTTGTAGAGCACCGGTGTGAGGAGAAGT
CATGCGCCGGTAGTACCGGAGTCGCGTGTTNGGTGCGTGTTGGCGGCGCG
CGCGTATCGGGAACGGGTGCAGAGCGCCGGCCATTATATAACGTTCCCGT
ACATCCGACATCAGCTCTCCTGATAATCTACTACGTAACTCATTGATGTA
TAGGCGTTGTTATCTGTNCTATCCCGACGCGTAGACCAGCACGCGCTTAG
CGGATGTGGTGCGCCGCCGCGCGATATTCTATATACTATCGAGAGTATGA
GGAGATAATGCGAGTGCATTCGTGAAACTATTACTGTGTGTCGCGACGCG
CAGATCTTATCTATACTCCGCGCGACTTGACATCTACGTGAACAGCCGAG
AGCCCTCTCGATCACGACTATATGATTCGTCCATACCGACACATACTCAT
ATGCAATCGCTCGTAGACGCAAATACTATGAGCGAACGTTCGCGTANGAT
AGTATGATGGTGATCGCGCCGGTGGTATGTATTATGCGAAATAGACGTAT
ATGCCGGATAACCTTACCCATATATACCGCACGCGNTCGATGGAGCAGAG
CGGTCGAGTGCATTACGACTATAGCCNTGGAGGCATGAGACGACGTATAC
ACCGCACGCGCGCGCCGGTGTATTTACTACGTAATAGTATATTCTATATC
ACGAGTCCCGGCCGCGCGCCGCTTCGTGTATCGAATTATCGATACGCCTC
CGCTATCTACCCATAATCACGATTACAGCTCGCGCTCCACGCCACAGATC
GCGACATATATATAATN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 6 6 6 10 14 22 8 8 8 17 22 37 37 29 28 24 19 19 28 25 23 10 10 10 21 21 59 30 21 19 9 3 0 3 7 7 7 8 8 9 28 28 29 28 28 22
25 29 34 59 59 41 41 37 37 37 37 29 23 10 10 7 7 7 9 9 9 23 34 37 39 39 39 40 48 37 47 47 53 53 59 53 53 53 53 50 50 50 53 57 59 57 57 57 53 68
68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 48 47 47 47 47 47 48 57 57 57 57 59 68 59 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 50 50
50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 47 47 57 48 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 57 48 57 48 48 48 57 57 57 57 68 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 48 48 48 48 48 43 47 48 48 48 47 59 59 30 26 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 26 30 34 46 41 48 48 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 57 57 57 57 57
57 48 48 48 59 59 48 47 47 43 43 39 39 39 41 41 47 37 36 36 30 42 39 39 30 37 41 44 44 48 59 48 47 47 57 57 59 59 48 54 57 59 47 59 35 42 42 48 48 48
57 44 44 37 39 39 46 50 43 44 43 43 37 44 44 57 46 48 48 48 57 57 57 59 59 43 43 43 44 46 57 47 54 54 44 44 40 43 39 42 30 30 30 40 29 22 17 19 30 41
37 39 39 35 35 35 42 37 42 26 26 14 21 19 21 12 12 19 19 24 28 32 32 43 43 57 57 57 48 48 48 48 47 59 59 36 35 33 31 22 18 22 17 30 30 41 40 40 37 37
37 36 36 36 39 39 35 28 28 25 26 22 18 28 27 23 15 13 13 13 13 19 28 32 35 35 30 29 23 23 23 34 28 32 37 28 22 19 15 26 18 20 19 19 15 19 19 28 22 18
11 10 10 17 19 15 10 8 8 8 8 8 10 18 13 13 12 12 14 19 18 14 14 12 12 10 10 10 10 10 10 12 15 25 28 24 19 10 10 10 13 10 10 9 10 10 17 21 29 30
33 26 18 14 11 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 9 8 10 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 14 14 15 28 13 11 8 11 8 8 8 13 12 19 12 12 10 10 8 8
8 8 8 8 8 7 7 7 6 8 6 6 8 7 6 6 6 6 10 8 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8
10 8 8 8 13 15 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 17 10 10 8 8 8 7 7 8 8 10 11 10 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 12 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 13 13
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 8 7 7 6 7 6 8 9 8 8 6 6 7 6 8 6 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 7
6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 10 7 6 8 8 8 8 11 11 13 13 9
9 9 8 8 8 8 8 7 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8 10 10 3 0 3 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8
6 9 7 8 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 9 9 10 8 8 8 6 6 8 8 10 6 6 6 6
11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 10 8 10 9 9 9 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 13 10 10 13 10 10 8 7 7 7 7 8 10 10 8 8 8
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 9 10 9 9 8 8 9 9 9 9 10 9 6 6 6 6 6 8 10 9 9 6 8 7 6 8 8 6 6 8 10 8 10 10 6 6
6 7 8 8 6 6 8 8 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 10 10 10 13 13 13 6 6 6 6 6 6 8 6 6
8 8 9 9 9 11 8 8 6 6 8 6 6 13 8 6 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 8 6 11 10 12 9 9 9 9 9 9 12 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
11 9 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 7 6 6 6 6 8 11 10 11 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 8 6 10 10 8 8 10 8 6 6 10 8 8 8 10 3 0 3 8 8 8 8 6 8 6 8 8 10 10 8 8 10 10 10 10 10
11 13 9 9 8 8 8 12 12 15 8 8 6 6 6 10 6 11 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 6 6 14 10 10 10 10 10 10 10 8 10 8 8
9 8 10 8 6 6 7 8 8 9 9 10 12 10 9 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 7 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 12 12 12 15 12 12 12 8
8 6 6 6 6 8 8 12 12 12 13 12 8 8 8 8 3 0 3 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 7 7 10 8 10 10 10 10 11 8 8
8 8 8 9 11 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 8 8 11 11 8 8 9 9 10 10 11 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 8 7
7 12 10 10 10 10 10 10 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 10 9 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 10 10 9 7 8 6 6
6 6 6 10 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 11 8 10 10 10 11 11 12 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8
10 10 10 10 9 9 7 8 8 8 8 8 11 11 11 13 10 10 10 10 8 8 6 7 6 10 10 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 10 8 10 7 7 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 7 3 0 3 8 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 7 10 8 10 8 8 8 8 8 10 10 11 11 11 11 10 9 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8
6 6 6 6 8 8 9 9 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 13 10 12 12 10 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 13
13 11 11 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 7 7 6 8 8 8 8 6 6 8 3 0 3 6 6 8 8 8 10 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6
7 10 8 8 6 7 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 11 13 9 9 10 11 8 8 8 10 8 10 10 11 11 11 16 10 10
10 10 8 8 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 7 8 6 6 8 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8
6 6 6 6 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 11 11 11 11 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 8 7 3 0 |