BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-508O04.T7 (MSMg01no508_o04.b1) | MSMg01-508O04.TJ (MSMg01no508_o04.g1) |
ACC | AG582693 | AG582694 |
length | 757 | 781 |
length of high quality (start - end) | 509 (75 - 583) | 369 (78 - 446) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no508_o04.b1 PHD_FILE: MSMg01no508_o04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:37:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no508_o04.g1 PHD_FILE: MSMg01no508_o04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:37:57 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | AAACCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCTCATACGTCNCACAATAGTACTCTGTAACACACGTCCATTCA
TGACTCTGTAGCCAAATATTGAGTTATATTTATAACTCAATTTATTTATT
TATAAAATGAATCAGGAAGGCAAGAGTCACGTGCCTCAGTTTTGCTTGCA
ATATAGCATCAGTGATAACCACACACCAGATATGCTAACCTTCAAAGTCA
CTCTGGGAAATAGCTTTGATAGATGCGGTTGTCCTTGACCATACACTTGC
TGTGTTTTGTTGTTGCTAATTAGGAAGGACATTTGAAGCTCCCCTTATGC
CATAGCAGATATAAGAGTATATTGTGGAAGTACTTGTTGGGTGAGTTTTA
CTGAATGGAACTGACTCTGCCTGGGGATCAATCAGAGAGTTAATGTGTGA
ATGAATTAATCCTGTGCTTCCACAAAGAGTTGCTGGAAAGGCAGGATTTT
TAAAAGTTCAGCACCTACACAAGCAGGGTAGAGGTTTGATTATACACTGG
CACATGTCCTCTGGGTTTTATGAACTGATTCAGCCAGAGAAAGGGTCATC
CGCAACACAGTGGAAAGTGGGTGAAACTTGATTTAGCCCACACTGCCAAG
ATACTACTATAGTGGGTGGTTCTCCTTCTCCATCTTAGAACTGTAAGGGG
CCTGGGTTTTGCAAAGCCTACTCAAGTATGGGTCCTCACAACATTGTGTG
GTTTGTT
| ACGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAACAGCAAGGATACAGTATGG
TGGTGAATACATCTTAGTGTGTACATGGGGTAAGCCACATGATTCACATA
CAAGAGACCATCGCCTCGTGTATCCATAGGTGGCTATGACTTCACACATA
TACAGAAAAGGATAGCTGGGTCTGGGTTTAGTCAGAGAAGATGCAACTGA
CCCTAAAGAGACCGAGGTCTCTGGAAGTTCAGAGGTCTGGTGGGGTGGGT
TTGGGGATCCCCGTATACAGAGGAGGGGCAGGGGAGAGGTATGGGATGTG
GAAGAGACAGAGGGCAGATCTGGAGTTTAAAAAAACATAAATAAAACAAA
AGTATAAAAGTGTTATTTTTCCCGCGTTTCAGCCTTGCTTTTCTCTCTAA
GCAGAGTAAGTTTGTCACCTTTCTGGATAGATAGAATTAATAGGAGCTAG
AAAGTTGAAAGCAAAGATGGCTATTATACCATCATGGGTTCAGAACGTCA
CCAAATCATGGACAGGTTGAGGCAGTGGGTTGTGGGAGTCAGCTTAAAGC
CACTATCTCCCTATTTGTATGCTTTGACATGTCAGGATTCCCTGGGAATT
ACTTAGTTCCTCTCTCATCTTACAACATTTAAGACTTGTTTTTTGTTTGG
GCATAGGCCATTATTTATTTTATGTGGTCTTCTTCGACGGTCCCGCCGAT
GTATTGTTTCTGGCACCTATTCTTTGTTTGG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 7 10 9 9 10 17 21 18 18 16 11 11 8 8 8 9 10 10 10 10 13 13 25 25 37 28 25 29 21 17 6 6 6 7 7 9 9 10 23 19 20 15 15 14 13 15 24
33 41 36 36 33 33 33 33 41 41 27 19 9 9 9 7 3 0 3 8 8 8 8 19 19 28 28 28 37 37 39 47 57 53 53 50 50 53 50 50 50 53 47 42 42 42 47 51 68 68
68 68 57 68 68 57 57 57 59 59 54 54 54 54 54 54 57 54 54 57 57 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 36 36 14 20 20 38 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 59 57 57 57 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 68 68 68 57 57 57 52 45 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 57 57 52 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 43 43 35 43 43 52 52 62 62 62 62 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 43 44 44 52 52 52 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 43 44 50 50 54 59 57 57 57 57 54 48 59 37 41 28 41 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57
57 57 47 47 47 47 47 50 54 54 54 48 48 48 48 57 50 48 48 46 41 43 43 43 43 43 59 46 46 43 48 48 48 50 50 50 50 50 57 57 48 48 43 43 43 43 43 48 48 59
59 59 47 44 44 43 36 29 34 30 33 31 32 28 35 37 37 32 37 37 37 37 37 41 41 37 34 32 35 33 33 30 37 32 32 32 37 37 37 41 47 41 37 37 35 35 36 36 32 37
34 34 34 34 34 32 25 25 34 34 37 41 34 34 39 27 20 28 23 25 25 32 36 31 35 32 37 32 33 26 24 15 15 16 14 13 15 11 11 11 19 19 31 29 27 32 24 26 22 33
22 22 22 22 22 30 24 24 19 19 30 22 28 28 26 29 25 22 20 22 33 33 35 30 31 16 15 10 10 10 16 20 32 39 30 30 24 26 26 35 36 28 28 19 13 13 13 13 11 15
10 10 10 15 18 37 34 31 28 18 22 8 8 6 9 7 11 9 8 11 15 18 15 11 10 10 10 12 15 13 11 12 14 26 23 23 11 11 10 13 17 21 14 21 21 20 12 10 10 10
15 13 17 16 16 14 17 22 30 30 17 13 10 6 8 6 6 6 11 15 21 29 15 15 13 15 16 14 13 13 15 10 12 12 12 10 8 8 10 8 9 12 21 15 15 12 12 12 12 10
14 19 16 18 19 17 17 | Open.Hide. 6 6 6 8 17 15 8 8 8 8 19 25 23 20 24 27 25 25 32 37 37 41 42 42 42 41 41 40 41 27 27 12 9 9 9 9 12 12 11 10 10 10 9 13 9 9 9 9 25 26
44 44 53 41 41 39 41 41 33 25 15 11 7 6 6 8 8 8 9 16 16 13 18 25 22 33 28 28 28 33 39 47 53 53 53 53 50 42 42 40 40 40 47 48 50 53 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 68 68 68 68 48 48 44 57 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 50 51 50 50 47 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 54 46 52 50 43 39 59 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 50 50 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 48 48 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 68 68 59 68 68 59 59 57 59 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 53 53 50 50 50 39 41 26 15 12 11 12 12 12 12 12 21 25 37 37 37 37 48 48 48 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 48 48 48 39 39 39 37 30 30 23 23 23 23 28 37 44 48 57 59 48 48 48 48 48 48 32 32 18 18 17 26 24 30 24 27 15 15 14 18 15 28 28 23 23 23 28
28 39 39 39 36 28 28 25 25 28 32 37 37 40 40 40 39 39 36 22 13 9 9 9 9 9 10 19 20 30 33 36 37 34 30 26 18 18 18 30 30 40 36 21 19 15 19 15 17 14
14 12 12 14 14 17 24 28 36 43 30 32 21 13 13 24 24 33 39 42 40 40 25 25 25 36 33 30 28 25 23 23 23 23 23 28 28 23 23 23 28 28 23 20 20 20 17 20 16 15
10 10 11 11 11 8 13 10 9 8 8 10 10 10 10 11 11 16 19 10 10 10 10 10 10 15 12 21 23 14 10 10 10 10 10 20 19 21 23 10 10 10 10 10 10 10 10 15 10 10
8 8 8 8 10 8 12 15 16 19 10 10 10 10 10 10 16 19 18 15 15 10 10 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 13 15 11 10 10 9 9 9 15 15 15 11 10 10
6 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 11 11 13 18 28 28 25 22 14 14 10 10 12 12 12 10 8
8 8 8 10 10 10 12 12 16 19 17 15 9 9 8 8 8 9 16 9 9 9 9 15 9 9 9 9 9 9 9 9 10 13 9 12 10 16 16 16 14 15 13 12 11 11 11 11 11 11
10 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 11 15 21 22 12 14 12 14 11 10 10 10 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 8 8 6 6 6 6
6 6 7 10 12 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 9 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 6 |