BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-529D01.T7 (MSMg01no529_d01.b1) | MSMg01-529D01.TJ (MSMg01no529_d01.g1) |
ACC | AG598128 | AG598129 |
length | 837 | 745 |
length of high quality (start - end) | 109 (78 - 186) | 663 (80 - 742) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no529_d01.b1 PHD_FILE: MSMg01no529_d01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:05:03 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no529_d01.g1 PHD_FILE: MSMg01no529_d01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:05:03 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCCTCCCTTATNTGCGGCCGCTATACGACTCCTATTCTCTGAGGATCCGC
GGAATTCTGGAGTTTTTTCCGGAGGAATACCTCTTTGTGGGCTTGAGGTA
CAATTGAGTTCCTGAGACTCGAGAGAGGAGGAGAGGGCAGGGAGAGGAAG
AGGAGAAGGAGGAAGGGGAAGGTAGGGGATGAGGGAGCGAACCGCCCCCC
GCGGTTCTCCCCCCCCCCCCCCCTGCCTTCCCGCCCTTTCCCCTTCCCGC
TCTTCCCCCCTCCTCCCCCCTCCCCTTCCCCTGCCCTCCCCCTTCTCCCT
TTCCCCGTCCCTCCCTTTTCTCCCTCCTCTTTTTCCTCCCCCCCCCCCGC
ACCCCGCCTTCCCCCCTCCCCTCTCTCCCCCCCCTCACCCCCCCCCCCCC
TTCCCTCCCCTCCCCTTCCCTCCCCCTCTCTTGTTTTTCTCACCCCTCCC
CTTCTCCCCCCTCTCCCCCCCCCCCCCCCTCTTTTCCCCCGCCCCCTCCC
CTTCTTTCCCCCCCTTTTCCCTTACTCTTCTTCTCCCTCCCTCCCTTCCC
CCCTCTTCTTTTCTCTTTTCTTCTCCTCCTCCCTCCCCCCTTCCTTTCAC
CCCCCCCCCCCCCCCCTCCTCCTCTTCCCCCCCTCCTCTTTCCCCCCTCC
CGCCCCCCTCTCCTCCCTCCCCCGCCCCCCTCCCCTCCTTCCATCCCTCC
CCCCCTCCTTTTCCCCACCCCCCCTCCCGTTCCCCTCTCTTTTCTCCCCC
TCCCCCCTCTCCCTCCCTCTCCCCTATTCCTCCACCCTCCTTCTCTCTTC
TTCCTCCCTTTCTCCTCCCTCTCCCCTCTCTCCCTCC
| NCCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTGTAACAGCTGGATGTGGCA
GGGTGAGTTTCCCAACACTCCGACAGTAAGTAGTCAGATGGGAGGCAGAA
ACAAGAGAATCCCTGGGAACCAAAAGGCTAGCCTGTGCTACACAGTGCAC
CTGGACAAATGAGAAACCCTGCCCACCTGGAAGAAGTTGAAAAAGAATTC
CCGAGAGCTGTCTTCTGGACTCTGACAGGCAAGTACTTACTCTCCCCAGC
ATAATAATATATAAATAAAATTTTAGAAGGTAGACAAGAGGGCTCAGCAG
GTAAAGGTGCTTGCCACCAAGCCTGATGACCTGAGTTTGATACCCACGGA
GTGGAAGGAGGGCAATGTCTCCCACAAGCTGTCCTCTGACCTCCCCATGG
GCACCATACGCACACACACATAAATTAAAAAAGAAAAACATGTAAAAAAT
GTTTTAAAATAAAAAGTCGGAACTGGGGAGACAGCTGGGAGTTAAAGGTG
CTTGCGGCTCTTGCACAGGACCCGGGTTCTGTTCCCAGCACCCATGCCAA
AAGGCTCACAAATGCCTGTAAGTCCAGCTCCACGGACCTGATGACCTCTC
CAGTTTCCAGAGACATCCGTGCATTTGTGGCACACACGCAGACACATAGA
TAAAAATCAATCTTGTGTGTTTTGACACAGGTTCATACTTGGTGG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 15 12 12 15 12 12 12 11 3 0 3 9 13 23 27 27 22 15 10 9 9 15 19 37 43 28 26 23 19 20 24 19 12 9 9 9 10 11 13 17 12 17 19 25 28 31 47 43
37 35 35 28 28 29 29 48 37 37 37 39 21 19 10 10 9 8 8 8 8 8 14 27 15 11 11 11 19 24 47 47 57 57 57 48 39 39 35 35 35 39 40 42 39 32 25 16 10 10
8 19 23 32 41 28 25 25 36 44 44 47 32 29 24 24 28 44 44 32 35 35 35 39 42 44 57 57 39 39 39 36 32 19 19 18 18 13 13 15 21 21 32 32 32 42 42 42 28 28
28 32 32 28 20 20 20 28 20 28 28 36 40 25 25 25 30 28 37 42 39 43 37 39 32 32 25 30 30 31 31 25 30 28 21 19 15 14 14 10 10 12 12 12 12 22 22 12 12 12
11 8 8 8 10 11 13 10 10 10 10 19 25 27 10 9 9 10 12 10 9 9 9 9 14 13 10 8 8 8 12 8 8 8 8 8 10 15 15 15 27 25 37 28 28 22 30 13 10 8
12 8 8 10 18 19 24 22 16 10 8 8 8 8 9 15 11 11 13 8 8 8 10 8 11 10 10 10 15 8 8 7 8 8 8 10 9 9 13 13 15 9 8 8 8 8 8 17 19 16
18 9 11 18 15 10 8 8 15 13 11 9 11 8 8 8 8 8 10 11 8 14 14 13 13 8 12 8 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 15 8 9 9 9 9 12 14 11 9 8 8
6 6 10 10 8 8 8 8 8 10 11 22 15 8 8 6 6 10 15 19 13 14 10 12 9 8 10 8 8 8 13 13 9 9 9 9 9 9 15 15 23 23 23 22 25 22 20 19 9 11
10 9 9 10 10 21 24 21 15 10 10 10 15 10 12 12 13 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 11 15 10 10 8 8 9 8 8 8 8 10 13 7
8 8 8 10 10 14 14 9 8 11 8 6 8 8 8 8 10 9 8 10 8 10 8 9 12 13 25 15 25 18 20 16 9 9 9 9 9 18 17 8 8 8 8 8 8 13 11 9 11 11
11 10 10 11 13 13 20 19 31 36 38 35 28 26 22 18 13 13 10 12 8 8 6 6 6 8 10 11 11 11 11 11 10 8 8 9 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 17 19 13
10 10 9 11 8 8 8 8 10 10 15 17 12 10 13 9 9 9 10 8 8 8 8 8 12 22 12 17 24 19 19 10 10 10 19 22 16 13 11 8 6 8 8 10 8 11 11 9 11 12
19 11 21 17 16 16 16 32 29 32 29 23 16 12 10 8 6 6 11 11 8 8 8 11 8 8 12 9 14 9 10 10 9 9 12 12 13 6 6 8 8 10 10 12 9 9 10 10 10 7
6 6 6 13 13 10 10 11 8 15 15 15 13 8 8 8 13 13 13 14 9 9 9 9 9 9 9 14 21 10 6 6 8 8 10 10 8 8 11 8 10 8 6 6 6 10 13 10 8 10
13 30 21 30 14 14 14 16 12 17 21 13 13 14 17 8 8 8 17 19 12 8 8 8 8 8 8 9 11 9 9 9 10 10 8 11 6 6 8 8 8 9 13 11 12 10 11 15 19 10
9 8 8 15 19 21 9 9 9 10 8 8 8 8 10 11 9 10 8 9 8 10 10 10 6 6 6 10 10 8 8 8 8 6 7 8 10 14 14 12 11 11 11 11 9 11 12 11 10 10
8 8 8 8 6 6 9 9 19 17 12 8 8 8 6 6 6 7 6 6 8 10 10 12 10 8 10 6 7 6 6 9 15 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 19 26 32 23 28 30 25 22 28 28 31 32 33 42 50 50 30 34 28 28 28 23 23 9 7 6 6 7 6 6 6 10 10 14 19 18 19
30 27 33 36 36 36 36 36 59 50 50 50 28 27 13 9 10 10 11 11 14 11 10 10 18 17 22 33 30 37 37 43 37 37 57 57 57 57 50 57 43 43 47 47 47 53 53 53 53 53
53 68 68 68 68 68 68 57 59 57 54 47 47 47 48 47 47 48 48 48 47 47 47 47 47 57 57 59 57 59 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
48 48 47 57 57 57 42 42 42 38 41 46 57 59 57 57 50 50 50 50 52 52 57 57 68 68 68 68 59 59 52 52 52 57 59 59 68 57 57 57 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 43 43 52 52 57 57 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 43
52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 44 39 29 29 23 29 29 43 43 62 62 62 62 62 43 43 23 43 43 62 62
62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 62 43 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 43 43 44 44 52 52 62 62 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 68
68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57
57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 50 43 35 35 50 50 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 59 57 59 54
57 57 59 57 54 54 54 54 57 57 68 68 59 59 59 59 57 48 48 42 42 42 48 59 57 48 48 48 48 57 59 59 43 43 43 39 43 43 57 48 48 48 48 59 48 31 31 31 30 29
32 41 32 32 41 41 41 41 41 41 41 48 39 39 36 36 37 37 39 39 37 41 43 47 43 59 41 41 18 24 13 13 13 28 30 48 43 43 43 43 43 39 39 39 32 36 28 30 23 30
28 39 39 43 43 39 39 36 39 39 37 43 37 37 37 25 19 13 13 13 17 28 28 42 48 48 48 48 48 48 48 48 43 37 33 30 23 22 24 30 32 23 23 20 22 28 23 23 14 11
11 11 12 18 28 31 24 22 22 22 21 27 25 29 32 37 31 35 35 39 39 44 39 32 31 17 18 14 21 14 10 10 10 21 22 28 32 24 26 18 19 10 10 10 10 |