BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007I13
Chromosome6 (Build37)
Map Location 35,739,573 - 35,874,306
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAgbl3, Tmem140, 3110062M04Rik, 9530020G05Rik, Stra8, 2010107G12Rik, Cnot4, Nup205, 1810058I24Rik, Slc13a4, BC064033, 1700065J11Rik, Mtpn, LOC100039312
Downstream geneLOC100039327, 9330158H04Rik, Chrm2, EG620863, LOC100039370, Ptn, LOC100039514, Dgki
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007I13.bB6Ng01-007I13.g
ACCDH844073DH844074
length7131,016
definitionDH844073|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007I13, 5' end.DH844074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007I13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(35,873,594 - 35,874,306)(35,739,573 - 35,740,597)
sequence
gaattccttgtctcttgtcctaacaaaaattgctggcactgccttctact
gctacaagaggctctggcatgcatgctgagatccctctcagtggtgaaac
ccactgtatttagttcattttatattgctctccttcctatccgtgcattc
attgtgcagatctggctaggtgagggctggggatagagaacatgctttac
aggcaccccactcaatcactgcatccgtctgtatgcttccactgggtaag
ggtttgtccagcctatgtaagcaagggcgtgagattctgacacaggtcaa
gggaaggataattaaggttttgtggaataccaattcgggaggtagaggtt
ccacacatggatacatggatgcttggcattgagtctgtttcctccttcta
gtgagatggtaaactagcttatagaaaaccattcctttgaaaattgtggg
ggaaatattagtataaaacttactgtgtggaaacagacttgaatgaaaaa
atgtgtagaagaatgtgtttcctttctgaactctgttggacagaaagtat
cataagcacattcatgggagacaatggacaaggaaattccagttacaaat
ctgcctgaactcctctcaccagcattgctgatatggtaaatcaagaatat
acaacatgttagtgtgtggtctcaatgtgacatgtggtagctctgttagg
ggaaaggagggct
gaattcccttaatgtctcaggaggtagagacagggtgatcagaagctcac
agtcatctttggagctacacaagtgagcttgaggctggacttcgatattt
gagacccatttttacataaataaaattatgtagcccatgacaatgtcctt
aattcattcaatgaatacttattgaataccttgtacaggtgatcattaat
ttgatgctcgggtgtagtcttccttgtctgggctattttaagttgaacag
atcaattcctgggcagcataactgagtttgaacatgtgatttctctcaat
attaagatactacttttatgcaaatataatatggcttaaatagttttata
ttgaaacacacctgtataaatcaatactaatgtactattttctgttacta
ttcacatagtctctgtcccatccttagctctgttcttgtatttaaatgtc
actgttattctgcccatgtggggcttattctcagctctaaagcctctgga
caccccttcgaggggctaaagctctgacacttttcctctaactgagtctt
ttgaagctgttgaacagtgtcaccttctattcagtatgccctgttcttgt
ttatttgaatcgaggtagattgctttatgctccatttctctgctcaaagg
ccagaacgggcaggtgcacatcacagtgtgcatgggggggtcagtgtccc
agatccagccttattatgcttttccaattatcagggaagcctcccccatt
ctgccaggtatttagttttactgattaattactatcatctgtttaagact
aatttccttagaactcctcttgctgactctaattatgttatcgttaaacc
tgtctcctgtcagagacttacttggccttagagaaattatacttctttct
caacagatatttaattctttccagccacctttaatagactttaaagcaaa
gtgatagttggggcacagaagcaagtgaagggtagtatggaggacaggta
taggtgggaaggggag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_35873594_35874306
seq2: B6Ng01-007I13.b_44_756 (reverse)

seq1  AGCCCTCCTTTCCCCTAACAGAGCTACCACATGTCACATTGAGACCACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTCCTTTCCCCTAACAGAGCTACCACATGTCACATTGAGACCACAC  50

seq1  ACTAACATGTTGTATATTCTTGATTTACCATATCAGCAATGCTGGTGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACATGTTGTATATTCTTGATTTACCATATCAGCAATGCTGGTGAGA  100

seq1  GGAGTTCAGGCAGATTTGTAACTGGAATTTCCTTGTCCATTGTCTCCCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTTCAGGCAGATTTGTAACTGGAATTTCCTTGTCCATTGTCTCCCAT  150

seq1  GAATGTGCTTATGATACTTTCTGTCCAACAGAGTTCAGAAAGGAAACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGCTTATGATACTTTCTGTCCAACAGAGTTCAGAAAGGAAACACA  200

seq1  TTCTTCTACACATTTTTTCATTCAAGTCTGTTTCCACACAGTAAGTTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCTACACATTTTTTCATTCAAGTCTGTTTCCACACAGTAAGTTTTA  250

seq1  TACTAATATTTCCCCCACAATTTTCAAAGGAATGGTTTTCTATAAGCTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAATATTTCCCCCACAATTTTCAAAGGAATGGTTTTCTATAAGCTAG  300

seq1  TTTACCATCTCACTAGAAGGAGGAAACAGACTCAATGCCAAGCATCCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCATCTCACTAGAAGGAGGAAACAGACTCAATGCCAAGCATCCATG  350

seq1  TATCCATGTGTGGAACCTCTACCTCCCGAATTGGTATTCCACAAAACCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCATGTGTGGAACCTCTACCTCCCGAATTGGTATTCCACAAAACCTT  400

seq1  AATTATCCTTCCCTTGACCTGTGTCAGAATCTCACGCCCTTGCTTACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATCCTTCCCTTGACCTGTGTCAGAATCTCACGCCCTTGCTTACATA  450

seq1  GGCTGGACAAACCCTTACCCAGTGGAAGCATACAGACGGATGCAGTGATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGACAAACCCTTACCCAGTGGAAGCATACAGACGGATGCAGTGATT  500

seq1  GAGTGGGGTGCCTGTAAAGCATGTTCTCTATCCCCAGCCCTCACCTAGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGGGGTGCCTGTAAAGCATGTTCTCTATCCCCAGCCCTCACCTAGCC  550

seq1  AGATCTGCACAATGAATGCACGGATAGGAAGGAGAGCAATATAAAATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTGCACAATGAATGCACGGATAGGAAGGAGAGCAATATAAAATGAA  600

seq1  CTAAATACAGTGGGTTTCACCACTGAGAGGGATCTCAGCATGCATGCCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAATACAGTGGGTTTCACCACTGAGAGGGATCTCAGCATGCATGCCAG  650

seq1  AGCCTCTTGTAGCAGTAGAAGGCAGTGCCAGCAATTTTTGTTAGGACAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTTGTAGCAGTAGAAGGCAGTGCCAGCAATTTTTGTTAGGACAAG  700

seq1  AGACAAGGAATTC  713
      |||||||||||||
seq2  AGACAAGGAATTC  713

seq1: chr6_35739573_35740597
seq2: B6Ng01-007I13.g_66_1081

seq1  GAATTCCCTTAATGTCTCAGGAGGTAGAGACAGGGTGATCAGAAGCTCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTTAATGTCTCAGGAGGTAGAGACAGGGTGATCAGAAGCTCAC  50

seq1  AGTCATCTTTGGAGCTACACAAGTGAGCTTGAGGCTGGACTTCGATATTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATCTTTGGAGCTACACAAGTGAGCTTGAGGCTGGACTTCGATATTT  100

seq1  GAGACCCATTTTTACATAAATAAAATTATGTAGCCCATGACAATGTCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACCCATTTTTACATAAATAAAATTATGTAGCCCATGACAATGTCCTT  150

seq1  AATTCATTCAATGAATACTTATTGAATACCTTGTACAGGTGATCATTAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATTCAATGAATACTTATTGAATACCTTGTACAGGTGATCATTAAT  200

seq1  TTGATGCTCGGGTGTAGTCTTCCTTGTCTGGGCTATTTTAAGTTGAACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATGCTCGGGTGTAGTCTTCCTTGTCTGGGCTATTTTAAGTTGAACAG  250

seq1  ATCAATTCCTGGGCAGCATAACTGAGTTTGAACATGTGATTTCTCTCAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATTCCTGGGCAGCATAACTGAGTTTGAACATGTGATTTCTCTCAAT  300

seq1  ATTAAGATACTACTTTTATGCAAATATAATATGGCTTAAATAGTTTTATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGATACTACTTTTATGCAAATATAATATGGCTTAAATAGTTTTATA  350

seq1  TTGAAACACACCTGTATAAATCAATACTAATGTACTATTTTCTGTTACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAACACACCTGTATAAATCAATACTAATGTACTATTTTCTGTTACTA  400

seq1  TTCACATAGTCTCTGTCCCATCCTTAGCTCTGTTCTTGTATTTAAATGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACATAGTCTCTGTCCCATCCTTAGCTCTGTTCTTGTATTTAAATGTC  450

seq1  ACTGTTATTCTGCCCATGTGGGGCTTATTCTCAGCTCTAAAGCCTCTGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTATTCTGCCCATGTGGGGCTTATTCTCAGCTCTAAAGCCTCTGGA  500

seq1  CACCCCTTCGAGGGGCTAAAGCTCTGACACTTTTCCTCTAACTGAGTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCTTCGAGGGGCTAAAGCTCTGACACTTTTCCTCTAACTGAGTCTT  550

seq1  TTGAAGCTGTTGAACAGTGTCACCTTCTATTCAGTATGCCCTGTTCTTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGCTGTTGAACAGTGTCACCTTCTATTCAGTATGCCCTGTTCTTGT  600

seq1  TTATTTGAATCGAGGTAGATTGCTTTATGCTCCATTTCTCTGCTCAAAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGAATCGAGGTAGATTGCTTTATGCTCCATTTCTCTGCTCAAAGG  650

seq1  CCAGAACGGGCAGGTGCACATCACAGTGTGCATGGGGGGGTCAGTGTCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAACGGGCAGGTGCACATCACAGTGTGCATGGGGGGGTCAGTGTCCC  700

seq1  AGATCCAGCCTTAATTATGCTTTTCCAATTATCAGGGAAGCCTCCCCCAT  750
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCCAGCCTT-ATTATGCTTTTCCAATTATCAGGGAAGCCTCCCCCAT  749

seq1  TCTGCCAGGTATTTAGTTTTACTGATTAATTACTATCATCTGTTTAAGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCAGGTATTTAGTTTTACTGATTAATTACTATCATCTGTTTAAGAC  799

seq1  TAATTTCCTTAGAAACTCCTCTTGCTGACTCTTAATTATGTTATCGTTAA  850
      |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCCTTAG-AACTCCTCTTGCTGACTC-TAATTATGTTATCGTTAA  847

seq1  ACCTGTCTCCTGTCAGAGAACTTACTTGGCCTTAGAGAAATTATACTTCT  900
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCTCCTGTCAGAG-ACTTACTTGGCCTTAGAGAAATTATACTTCT  896

seq1  TTCTCAACAGATATTTAATTCTTTCAAGCCAACCTTAATAGACTTTAAAG  950
      ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||
seq2  TTCTCAACAGATATTTAATTCTTTCCAGCCACCTTTAATAGACTTTAAAG  946

seq1  CAAAGGTGATAAGTTGGGGCACAGAAAGCAAAGTGAAGGGTAGTATGGAA  1000
      |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| 
seq2  CAAA-GTGAT-AGTTGGGGCACAG-AAGC-AAGTGAAGGGTAGTATGGAG  992

seq1  GACAGGGTAAAGGTGGGATGGGGAG  1025
      |||| |||| |||||||| ||||||
seq2  GACA-GGTATAGGTGGGAAGGGGAG  1016