BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-008O04
Chromosome6 (Build37)
Map Location 60,945,842 - 61,090,501
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041756, LOC100041764
Upstream geneEG434019, LOC671300, EG627178, LOC100041706, LOC100041717, A530053G22Rik, LOC667066, LOC100041726, Snca, ENSMUSG00000064018, Mmrn1
Downstream geneC130092O11Rik, LOC100042694
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-008O04.bB6Ng01-008O04.g
ACCDH844989DH844990
length882964
definitionDH844989|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008O04, 5' end.DH844990|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-008O04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,089,623 - 61,090,501)(60,945,842 - 60,946,805)
sequence
gaattctcttggtgatggagagtccagactgtttgagtgcttgcttcaga
aatgcattgttttgcaagcacaaagattgcattacccgtggaagacaggt
ttggggacatcatcctgtttcaaataaggataaataaactttcaaggttt
atttccaccgttggtttaagaacaaaatacactgattttataagcacaca
ctatgtctctggggtggtggttttccgtctttgtacctgcagaattccac
tcttagaagatcccagatagtggtgcctatgtcctcacagtacatgtaaa
caccaataaggctgtagatcagtgctgacatttgtcttcaaattaatgga
tctttttcttcatatgaatttagatcaatagcaacttgatagatattttt
aattatctatttcatttattacattccaaatgttgttcccttctctgttc
ctcctcccaaagtccttcaccccattcccctatccactgcacctctgaga
gggaatcactctaagggggacatcctccttctcaaatctctatagaatta
ggcccattctctcccactgtagcagacaagacagacagtcctttgctaca
tatgtgtcagggggcctggaaccagccatgattttggttggtggctccca
ggggtctgtgttagttgaccccacactgttggtcttgcaatggggtcaca
gtctccttcagctccttcagctcttcccctaactctttccatagaagtct
cagacctcagtccaaatgatgtgctgtaagtatctgcatctgtctcagtc
aactgctgttagaggtgagggcaagccattgcaggtcatgaaaacccctt
tgaatctgtcttgggctctgcagtcattgtga
gaattctccacaaaacctgctacgatccaacatggtgaatttgcattcgt
ttctctaggttagcacgccaattgaatacaaaactctggaaaaagtccaa
atttaagaggttttatgatttacatatgaatcccttcataggttgtgaaa
gcccaggaatttgcctgggggatgttttgtgggtggtagctgtgatagtt
ttgttttgttttaattttttgcttcgtatttgattttctgagaccaggct
acaatctatctgagactttcctccagcttgttacctcttgccacaccctc
ctaagtacaggaattagaggtatgtgccactaaaccagaccataaaagcc
caggtttgaataaaacattttccatgtcttagtttcagctgccctgagga
aatactaatgtctttgaggcataaacagcatatatttctccaattctgga
gggttagaaggtatctgcagacttggtgcctggtaagggctgttccttgg
ctttcaggctgtcttttcatagaagcaatgtagattaaagaacttttgct
tagaaggtctcagcccagcaaggtatgatgatatacacaagtaataacag
cacttgggaggctgagacagaggacctcaagctcaaggcccacctgggtt
acatactgagttccaggtcagccacacggactttatgagacccttgacac
tctctcacactgaggctattctctctcataatggaggccccatatgtatg
gtctcctgcaatctaattttatcctgaagactttaccttcaatcacattc
ttttagagtgaagtttaatacacaaagtttctgagggggggtgggcatgt
catttcccaggaccatgttttccaatgcatcagtgttaaggatggtgcta
ttaaaaacaacacaacaacctgtctcctcagttattgaatagtttgcata
tactatactctggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_61089623_61090501
seq2: B6Ng01-008O04.b_45_926 (reverse)

seq1  TCACAATGACTGCAGAGCACAAGACAGATTCAAAGGGGTTTTCATGACCT  50
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAATGACTGCAGAGCCCAAGACAGATTCAAAGGGGTTTTCATGACCT  50

seq1  GCAATGGCTTGCCCTCACCTCTAACAGCAGTTGACTGAGACAGATGCAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATGGCTTGCCCTCACCTCTAACAGCAGTTGACTGAGACAGATGCAGA  100

seq1  TACTTACAGCACATCA-TTGGACTGAGGTCTGAGACTTCTATGG-AAGAG  148
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TACTTACAGCACATCATTTGGACTGAGGTCTGAGACTTCTATGGAAAGAG  150

seq1  TTAGGGGAAGAGCTGAAGGAGCTGAAGGAGACTGTGACCCCATTGCAAGA  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGGGGAAGAGCTGAAGGAGCTGAAGGAGACTGTGACCCCATTGCAAGA  200

seq1  CCAACAGTGTGGGGTCAACTAACACAGACCCCTGGGAGCCACCAACCAAA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACAGTGTGGGGTCAACTAACACAGACCCCTGGGAGCCACCAACCAAA  250

seq1  ATCATGGCTGGTTCCAGG-CCCCTGACACATATGTAGCAAAGGACTGTCT  297
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATGGCTGGTTCCAGGCCCCCTGACACATATGTAGCAAAGGACTGTCT  300

seq1  GTCTTGTCTGCTACAGTGGGAGAGAATGGGCCTAATTCTATAGAGATTTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTGTCTGCTACAGTGGGAGAGAATGGGCCTAATTCTATAGAGATTTG  350

seq1  AGAAGGAGGATGTCCCCCTTAGAGTGATTCCCTCTCAGAGGTGCAGTGGA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGAGGATGTCCCCCTTAGAGTGATTCCCTCTCAGAGGTGCAGTGGA  400

seq1  TAGGGGAATGGGGTGAAGGACTTTGGGAGGAGGAACAGAGAAGGGAACAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGGAATGGGGTGAAGGACTTTGGGAGGAGGAACAGAGAAGGGAACAA  450

seq1  CATTTGGAATGTAATAAATGAAATAGATAATTAAAAATATCTATCAAGTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGGAATGTAATAAATGAAATAGATAATTAAAAATATCTATCAAGTT  500

seq1  GCTATTGATCTAAATTCATATGAAGAAAAAGATCCATTAATTTGAAGACA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATTGATCTAAATTCATATGAAGAAAAAGATCCATTAATTTGAAGACA  550

seq1  AATGTCAGCACTGATCTACAGCCTTATTGGTGTTTACATGTACTGTGAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCAGCACTGATCTACAGCCTTATTGGTGTTTACATGTACTGTGAGG  600

seq1  ACATAGGCACCACTATCTGGGATCTTCTAAGAGTGGAATTCTGCAGGTAC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGCACCACTATCTGGGATCTTCTAAGAGTGGAATTCTGCAGGTAC  650

seq1  AAAGACGGAAAACCACCACCCCAGAGACATAGTGTGTGCTTATAAAATCA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACGGAAAACCACCACCCCAGAGACATAGTGTGTGCTTATAAAATCA  700

seq1  GTGTATTTTGTTCTTAAACCAACGGTGGAAATAAACCTTGAAAGTTTATT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATTTTGTTCTTAAACCAACGGTGGAAATAAACCTTGAAAGTTTATT  750

seq1  TATCCTTATTTGAAACAGGATGATGTCCCCAAACCTGTCTTCCACGGGTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCTTATTTGAAACAGGATGATGTCCCCAAACCTGTCTTCCACGGGTA  800

seq1  ATGCAATCTTTGTGCTTGCAAAACAATGCATTTCTGAAGCAAGCACTCAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATCTTTGTGCTTGCAAAACAATGCATTTCTGAAGCAAGCACTCAA  850

seq1  ACAGTCTGGACTCTCCATCACCAAGAGAATTC  879
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCTGGACTCTCCATCACCAAGAGAATTC  882

seq1: chr6_60945842_60946805
seq2: B6Ng01-008O04.g_66_1029

seq1  GAATTCTCCACAAAACCTGCTACGATCCAACATGGTGAATTTGCATTCGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCACAAAACCTGCTACGATCCAACATGGTGAATTTGCATTCGT  50

seq1  TTCTCTAGGTTAGCACGCCAATTGAATACAAAACTCTGGAAAAAGTCCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTAGGTTAGCACGCCAATTGAATACAAAACTCTGGAAAAAGTCCAA  100

seq1  ATTTAAGAGGTTTTATGATTTACATATGAATCCCTTCATAGGTTGTGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGAGGTTTTATGATTTACATATGAATCCCTTCATAGGTTGTGAAA  150

seq1  GCCCAGGAATTTGCCTGGGGGATGTTTTGTGGGTGGTAGCTGTGATAGTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGGAATTTGCCTGGGGGATGTTTTGTGGGTGGTAGCTGTGATAGTT  200

seq1  TTGTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTCGTATTTGATTTTCTGAGACCAGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTCGTATTTGATTTTCTGAGACCAGGCT  250

seq1  ACAATCTATCTGAGACTTTCCTCCAGCTTGTTACCTCTTGCCACACCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATCTATCTGAGACTTTCCTCCAGCTTGTTACCTCTTGCCACACCCTC  300

seq1  CTAAGTACAGGAATTAGAGGTATGTGCCACTAAACCAGACCATAAAAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTACAGGAATTAGAGGTATGTGCCACTAAACCAGACCATAAAAGCC  350

seq1  CAGGTTTGAATAAAACATTTTCCATGTCTTAGTTTCAGCTGCCCTGAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTTGAATAAAACATTTTCCATGTCTTAGTTTCAGCTGCCCTGAGGA  400

seq1  AATACTAATGTCTTTGAGGCATAAACAGCATATATTTCTCCAATTCTGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACTAATGTCTTTGAGGCATAAACAGCATATATTTCTCCAATTCTGGA  450

seq1  GGGTTAGAAGGTATCTGCAGACTTGGTGCCTGGTAAGGGCTGTTCCTTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAGAAGGTATCTGCAGACTTGGTGCCTGGTAAGGGCTGTTCCTTGG  500

seq1  CTTTCAGGCTGTCTTTTCATAGAAGCAATGTAGATTAAAGAACTTTTGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAGGCTGTCTTTTCATAGAAGCAATGTAGATTAAAGAACTTTTGCT  550

seq1  TAGAAGGTCTCAGCCCAGCAAGGTATGATGATATACACAAGTAATAACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGTCTCAGCCCAGCAAGGTATGATGATATACACAAGTAATAACAG  600

seq1  CACTTGGGAGGCTGAGACAGAGGACCTCAAGCTCAAGGCCCACCTGGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGGAGGCTGAGACAGAGGACCTCAAGCTCAAGGCCCACCTGGGTT  650

seq1  ACATACTGAGTTCCAGGTCAGCCACACGGACTTTATGAGACCCTTGACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACTGAGTTCCAGGTCAGCCACACGGACTTTATGAGACCCTTGACAC  700

seq1  TCTCTCACACTGAGGCTATTCTCTCTCATAATGGAGGCCCCATATGTATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCACACTGAGGCTATTCTCTCTCATAATGGAGGCCCCATATGTATG  750

seq1  GTCTCCTGCAAATCTAATTTTATCCTGAAGACTTTACCTTCAATCACATT  800
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCCTGC-AATCTAATTTTATCCTGAAGACTTTACCTTCAATCACATT  799

seq1  CTTTTAGAGTGAAGTTTTAATACACAAAG-TTCTGAGGGGGGGTGGGCAT  849
      |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAGAGTGAAG-TTTAATACACAAAGTTTCTGAGGGGGGGTGGGCAT  848

seq1  GTCA-TTCCCAGGACCA-GATTTCCAATGCAGCAGTGTTAAGGATGGTGC  897
      |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTCATTTCCCAGGACCATGTTTTCCAATGCATCAGTGTTAAGGATGGTGC  898

seq1  TATTAAAAACAACAACAACAACCTGTTCTCCTCAGTTA-TGAACAGTTTG  946
      ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||
seq2  TATTAAAAACAAC-ACAACAACCTG-TCTCCTCAGTTATTGAATAGTTTG  946

seq1  CATATACTACACTCTGGG  964
      ||||||||| ||||||||
seq2  CATATACTATACTCTGGG  964