BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015E08
Chromosome6 (Build37)
Map Location 91,994,657 - 92,165,987
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFgd5, Nr2c2, Mrps25, Zfyve20
Upstream geneNup210, Hdac11, Fbln2, LOC665716, Wnt7a, LOC100043659, LOC625420, Chchd4, Tmem43, Xpc, Lsm3, Slc6a6, Grip2, C130022K22Rik, 4930590J08Rik
Downstream geneTrh, LOC665805, Prickle2, LOC545866, A730049H05Rik, LOC384461
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015E08.bB6Ng01-015E08.g
ACCDH849577DH849578
length1,040738
definitionDH849577|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015E08, 5' end.DH849578|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015E08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,164,942 - 92,165,987)(91,994,657 - 91,995,394)
sequence
gaattccagaagattaagacaggaagatctccaagtcaaggttatctggg
attaaaggtgtggtggcagacacctttaatctgggccacaccttttgctg
gagacctatataaggacattggaagaaggaagattgacactctcttcttc
aactgcttgccttgtgggactgagtgactgctagatccttggacttccat
tcacagctgctgctgaccattgttgggaattggactacagactgtaagtc
atccaccaattcccttactatatagactatagagttctgtgactctagag
aaccctgactcatacataaatgccacttattttgcagagatctagctacc
ctcatacttttttatgcttttttgagatggagtttcatgtatcccagtat
ggccttgaacttgctatgtaattgaaaattaacttaaatttttggtcctc
ctgcctccatccttagagtattggtgttacaggcatgggtgtgtggtgga
aattgagtcccaaccaggatcaattgagccaacttccaatccctgacacg
actcctcaacgtctctactttctttggctcaatttccacgtctttctgtc
tcctcaatgtgctgaacataacttagtctctcgcactcagaaactttttt
ttaacaacaacaacaaaaaagtaaaaaaacaaaattttgtatgtgtgttt
tgcctgcatgtctgtgcaccacatgtgcagtgcccatggactccagaaga
gagcatataggtagcagacaagcagtttttcaaacctgggtcctttggaa
gaacaaccgctgtataaaggcttttatgcaaaaatctcagaaacttttta
acggtctctaaataatgttagcgctgcaagcacattattttaagagccaa
agtctcagttttccccacctataggggtgagtgtagggcgagtgtagggt
ttcacatcgatgtgttgctaggacctgagagactcgcagttacctctcta
ctgggcccgcccgttgcgcagcgcctgccagcatctcttc
gaattcttcctagcgtgacccctccttcagagcacagcactctttggctt
cctcacgtttgtggttccccagactcctgctgctgctggtttcctggttc
tgttgtgggaagatgcatttctttggttttcttagatggattgagacttc
tgttatagcctagcacaaggccaccatgggctggggactgcgccatttgt
cgtttgtgttttggctcaggtgtgacctctgttcccatctctctttgggg
gctgtgttgcttgagccctctgaagttggtgcattttttagtggacctct
ctggctgggcatctgtcccatgctctccctcatagagtgggtgtcctctt
tggaagtaatgcctataaggacagccatgaacacagggcaggacacttct
gaagtatccagcccagctttccaggtgtaggggaaggagtctcagaggaa
ggtatatctagtagccagggaaggaaagctcgccactgcagtgatcaaga
tgtgcacaggccttatagccagctggggtgagcatgttgggacttgagag
atgttcccagccaggtggaggatgttatgagaggggaaactgagaaagct
gaggccagcaggaaaaggaaagatagagagccttcatgccatatgtagct
tcatcccaagggagtgtctgggaagctgttggtgactccaggaagaaatg
ctgtggcatgctggaaaggccaccgactgtgtgccctt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_92164942_92165987
seq2: B6Ng01-015E08.b_46_1085 (reverse)

seq1  GAAGAGGATGCTGCGCAGGCGCTGCCGCAACGGGGCGGGCCCAGTAGGAG  50
      ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||   
seq2  GAAGA-GATGCTG-GCAGGCGCTG-CGCAAC-GGGCGGGCCCAGTAG--A  44

seq1  GAGGTAAACTGCGAAGTTCTCTCAGGTCCTAGCAACACATCGATGTGAAA  100
      ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGT-AACTGCGA--GTCTCTCAGGTCCTAGCAACACATCGATGTGAAA  91

seq1  CCCTACACTCGCCCTTCACTCA-CCCTATAGGTGGGG-AAACTGAGACTT  148
      ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CCCTACACTCGCCCTACACTCACCCCTATAGGTGGGGAAAACTGAGACTT  141

seq1  TGGCTCTT-AAATAATGTGCCTGCAGCGCTAACATTATTTAGAGACCGTT  197
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCTTAAAATAATGTGCTTGCAGCGCTAACATTATTTAGAGACCGTT  191

seq1  AAAAAGTTTCTGAGATTTTTGCATAAATGCCTTAATACAGCGGTTGTTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTTTCTGAGATTTTTGCATAAAAGCCTTTATACAGCGGTTGTTCT  241

seq1  TCCAAAGGACCCAGGTTTGAAAAACTGCTTGTCTGCTACCTATATGCTCT  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAGGACCCAGGTTTGAAAAACTGCTTGTCTGCTACCTATATGCTCT  291

seq1  CTTCTGGAGTCCATGGGCACTGCACATGTGGTGCACAGACATGCAGGCAA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGAGTCCATGGGCACTGCACATGTGGTGCACAGACATGCAGGCAA  341

seq1  AACACACATACAAAATTTTGTTTTTTTACTTTTTTGTTGTTGTTGTTAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACACATACAAAATTTTGTTTTTTTACTTTTTTGTTGTTGTTGTTAAA  391

seq1  AAAAAGTTTCTGAGTGCGAGAGACTAAGTTATGTTCAGCACATTGAGGAG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTTTCTGAGTGCGAGAGACTAAGTTATGTTCAGCACATTGAGGAG  441

seq1  ACAGAAAGACGTGGAAATTGAGCCAAAGAAAGTAGAGACGTTGAGGAGTC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGAAAGACGTGGAAATTGAGCCAAAGAAAGTAGAGACGTTGAGGAGTC  491

seq1  GTGTCAGGGATTGGAAGTTGGCTCAATTGATCCTGGTTGGGACTCAATTT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCAGGGATTGGAAGTTGGCTCAATTGATCCTGGTTGGGACTCAATTT  541

seq1  CCACCACACACCCATGCCTGTAACACCAATACTCTAAGGATGGAGGCAGG  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCACACACCCATGCCTGTAACACCAATACTCTAAGGATGGAGGCAGG  591

seq1  AGGACCAAAAATTTAAGTTAATTTTCAATTACATAGCAAGTTCAAGGCCA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACCAAAAATTTAAGTTAATTTTCAATTACATAGCAAGTTCAAGGCCA  641

seq1  TACTGGGATACATGAAACTCCATCTCAAAAAAGCATAAAAAAGTATGAGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGGATACATGAAACTCCATCTCAAAAAAGCATAAAAAAGTATGAGG  691

seq1  GTAGCTAGATCTCTGCAAAATAAGTGGCATTTATGTATGAGTCAGGGTTC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCTAGATCTCTGCAAAATAAGTGGCATTTATGTATGAGTCAGGGTTC  741

seq1  TCTAGAGTCACAGAACTCTATAGTCTATATAGTAAGGGAATTGGTGGATG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGAGTCACAGAACTCTATAGTCTATATAGTAAGGGAATTGGTGGATG  791

seq1  ACTTACAGTCTGTAGTCCAATTCCCAACAATGGTCAGCAGCAGCTGTGAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTACAGTCTGTAGTCCAATTCCCAACAATGGTCAGCAGCAGCTGTGAA  841

seq1  TGGAAGTCCAAGGATCTAGCAGTCACTCAGTCCCACAAGGCAAGCAGTTG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTCCAAGGATCTAGCAGTCACTCAGTCCCACAAGGCAAGCAGTTG  891

seq1  AAGAAGAGAGTGTCAATCTTCCTTCTTCCAATGTCCTTATATAGGTCTCC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAGAGTGTCAATCTTCCTTCTTCCAATGTCCTTATATAGGTCTCC  941

seq1  AGCAAAAGGTGTGGCCCAGATTAAAGGTGTCTGCCACCACACCTTTAATC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAAGGTGTGGCCCAGATTAAAGGTGTCTGCCACCACACCTTTAATC  991

seq1  CCAGATAACCTTGACTTGGAGATCTTCCTGTCTTAATCTTCTGGAATTC  1046
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATAACCTTGACTTGGAGATCTTCCTGTCTTAATCTTCTGGAATTC  1040

seq1: chr6_91994657_91995394
seq2: B6Ng01-015E08.g_71_808

seq1  GAATTCTTCCTAGCGTGACCCCTCCTTCAGAGCACAGCACTCTTTGGCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCCTAGCGTGACCCCTCCTTCAGAGCACAGCACTCTTTGGCTT  50

seq1  CCTCACGTTTGTGGTTCCCCAGACTCCTGCTGCTGCTGGTTTCCTGGTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCACGTTTGTGGTTCCCCAGACTCCTGCTGCTGCTGGTTTCCTGGTTC  100

seq1  TGTTGTGGGAAGATGCATTTCTTTGGTTTTCTTAGATGGATTGAGACTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTGGGAAGATGCATTTCTTTGGTTTTCTTAGATGGATTGAGACTTC  150

seq1  TGTTATAGCCTAGCACAAGGCCACCATGGGCTGGGGACTGCGCCATTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATAGCCTAGCACAAGGCCACCATGGGCTGGGGACTGCGCCATTTGT  200

seq1  CGTTTGTGTTTTGGCTCAGGTGTGACCTCTGTTCCCATCTCTCTTTGGGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTGTGTTTTGGCTCAGGTGTGACCTCTGTTCCCATCTCTCTTTGGGG  250

seq1  GCTGTGTTGCTTGAGCCCTCTGAAGTTGGTGCATTTTTTAGTGGACCTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTGTTGCTTGAGCCCTCTGAAGTTGGTGCATTTTTTAGTGGACCTCT  300

seq1  CTGGCTGGGCATCTGTCCCATGCTCTCCCTCATAGAGTGGGTGTCCTCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTGGGCATCTGTCCCATGCTCTCCCTCATAGAGTGGGTGTCCTCTT  350

seq1  TGGAAGTAATGCCTATAAGGACAGCCATGAACACAGGGCAGGACACTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGTAATGCCTATAAGGACAGCCATGAACACAGGGCAGGACACTTCT  400

seq1  GAAGTATCCAGCCCAGCTTTCCAGGTGTAGGGGAAGGAGTCTCAGAGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTATCCAGCCCAGCTTTCCAGGTGTAGGGGAAGGAGTCTCAGAGGAA  450

seq1  GGTATATCTAGTAGCCAGGGAAGGAAAGCTCGCCACTGCAGTGATCAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATATCTAGTAGCCAGGGAAGGAAAGCTCGCCACTGCAGTGATCAAGA  500

seq1  TGTGCACAGGCCTTATAGCCAGCTGGGGTGAGCATGTTGGGACTTGAGAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACAGGCCTTATAGCCAGCTGGGGTGAGCATGTTGGGACTTGAGAG  550

seq1  ATGTTCCCAGCCAGGTGGAGGATGTTATGAGAGGGGAAACTGAGAAAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCCCAGCCAGGTGGAGGATGTTATGAGAGGGGAAACTGAGAAAGCT  600

seq1  GAGGCCAGCAGGAAAAGGAAAGATAGAGAGCCTTCATGCCATATGTAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCAGCAGGAAAAGGAAAGATAGAGAGCCTTCATGCCATATGTAGCT  650

seq1  TCATCCCAAGGGAGTGTCTGGGAAGCTGTTGGTGACTCCAGGAAGAAATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCCCAAGGGAGTGTCTGGGAAGCTGTTGGTGACTCCAGGAAGAAATG  700

seq1  CTGTGGCATGCTGGAAAGGCCACCGACTGTGTGCCCTT  738
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGCATGCTGGAAAGGCCACCGACTGTGTGCCCTT  738