BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015G18
Chromosome6 (Build37)
Map Location 30,886,864 - 31,105,000
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKlf14, LOC100038973
Upstream geneD330017J20Rik, 1700023L04Rik, 1700080G18Rik, Nrf1, Ube2h, Zc3hc1, 2410127E18Rik, 2700094F01Rik, 1700025E21Rik, Cpa2, Cpa4, Cpa5, Cpa1, Tsga14, Mest, Copg2, Copg2, Tsga13
Downstream geneAB041803, Mkln1, Podxl, EG619959, LOC620104, 1700012A03Rik, Plxna4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015G18.bB6Ng01-015G18.g
ACCDH849684DH849685
length1,089894
definitionDH849684|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015G18, 5' end.DH849685|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,886,864 - 30,887,951)(31,104,108 - 31,105,000)
sequence
gaattcaagggtgaagctgcggaggatacttaggagtaaaccagcactga
aagccaatgtcaagggtcactgtggtcttcatattggactttgtttattt
aaagttctttttacaaccctgatgttgcttttgtttttgtttttgagaca
gtatttgtatgtagcccaggctaaccttgaactcaacattcccctaccct
gcttctgagtgctgggtttacaatatatacaaccacaactaatttatacc
cagcttgttattaatatcaaaagaaggaatgctttcatggtggggatgga
gtcagggatttcattaaactggaagttaagactgcctcctgccaggcagt
ggtgtcgcatgcctttaatcccagcaattgggaggcagaggcaggcagat
ttctaagttcgaggccagtctggtctacaaagtgagttccaggacagcca
gggctacacagagaaaccctgtctagaaaaacaaacaaacaaacaaccct
gcctcctatccaggatgtattctgtatactcctaagagatgaccgtatcc
ttgccagtcaggttgtattccacatacttctgagacatcaggcttaaaga
aggtggctctgatgctggctggtattcatttgatccttgttgctcataca
ctaagaaggacaagatgaagggcatgggtatgcatgcaatcttgcaactc
tttgtaagagaaatggtaacattttacatgtctaaagtagttgtcttaga
gaagaatctcaactgttgttacaaaatgaaaacatttcccccaaagacta
ctataattctattttcttataaaattccccttcctctcaattcaacccat
ttctagcaactttcacctattagaaggccattcccagttcttacactctc
cgttgttagctccacaacttttttgtgtgtacattttgtatgtgtatgtg
ccccattttctgtgtttattcatgtgttatattggtatttgcacagagcc
agaggaaaaccttcggattgccccttcagcttccaccttgatttttgaaa
catgtgtgccttactggctagaactacccaacatgttag
gaattccagccctgctattggctagattttggccacacatagacctctca
tttttgtacaatctgggaaataggaatgataatgagtattaaaaaacaaa
caaactttgcccactgcatgtgtgttttcagtaaattgtggtatgtttgt
acacatacacactcacacagaagcacacacacagcatatggctgagtttc
tagtcattagaagaaactgcatgagtacctagttcaagaagaaatggagt
cacttttaaagatttttttccccagaaaccacataactttttgcattcag
tgacttcgtggtattgggtgcttgacatctgccaatctgctgtgcttttt
gagagccttgtcactagtgtagattcttaggtggccccttccctttggcc
taagtgtagtagctgcccaggggatgtttgaaatgaaaagtaacttggca
gtagctttatcaagtgctctgcttcagtagtctgccgccctgggatggga
tattcccaggtgtgtggagatggggaaattatcttggtaaccctccctaa
agataaggtgataagaagaagccttcaagtttcagggatgagacagtgta
gctttgtaacagagcatccttagtgaatagaggaggaataagggcagcac
atgctgtgctttggatttcatgggcattctgtcattcatactcaagtgtg
gatcttcatctccagtctataaagttagctttagttgatcagttgaccca
gaagtctgctgcccacgtgcatgaatggaactgtctagatgctgcactcg
aaattggaagtcttcacagatgggctgggtgtgttgatgcatacccttca
atccccatactttggtggtagaggcaggtggtggatctatgagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_30886864_30887951
seq2: B6Ng01-015G18.b_48_1136

seq1  GAATTCAAGGGTGAAGCTGCGGAGGATA-GGAGGAGTAAACCAGCACTGA  49
      ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGGTGAAGCTGCGGAGGATACTTAGGAGTAAACCAGCACTGA  50

seq1  AAGCCAATGTCAAGGGTCACTGTGGTCTTCATATTGGACTTTGTTTATTT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAATGTCAAGGGTCACTGTGGTCTTCATATTGGACTTTGTTTATTT  100

seq1  AAAGTTCTTTTTACAACCCTGATGTTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGAGACA  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTCTTTTTACAACCCTGATGTTGCTTTTGTTTTTGTTTTTGAGACA  150

seq1  GTATTTGTATGTAGCCCAGGCTAACCTTGAACTCAACATTCCCCTACCCT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTGTATGTAGCCCAGGCTAACCTTGAACTCAACATTCCCCTACCCT  200

seq1  GCTTCTGAGTGCTGGGTTTACAATATATACAACCACAACTAATTTATACC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCTGAGTGCTGGGTTTACAATATATACAACCACAACTAATTTATACC  250

seq1  CAGCTTGTTATTAATATCAAAAGAAGGAATGCTTTCATGGTGGGGATGGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTGTTATTAATATCAAAAGAAGGAATGCTTTCATGGTGGGGATGGA  300

seq1  GTCAGGGATTTCATTAAACTGGAAGTTAAGACTGCCTCCTGCCAGGCAGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGGATTTCATTAAACTGGAAGTTAAGACTGCCTCCTGCCAGGCAGT  350

seq1  GGTGTCGCATGCCTTTAATCCCAGCAATTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCGCATGCCTTTAATCCCAGCAATTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGAT  400

seq1  TTCTAAGTTCGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGTTCGAGGCCAGTCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCA  450

seq1  GGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTAGAAAAACAAACAAACAAACAACCCT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCTACACAGAGAAACCCTGTCTAGAAAAACAAACAAACAAACAACCCT  500

seq1  GCCTCCTATCCAGGATGTATTCTGTATACTCCTAAGAGATGACCGTATCC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCTATCCAGGATGTATTCTGTATACTCCTAAGAGATGACCGTATCC  550

seq1  TTGCCAGTCAGGTTGTATTCCACATACTTCTGAGACATCAGGCTT-AAGA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTGCCAGTCAGGTTGTATTCCACATACTTCTGAGACATCAGGCTTAAAGA  600

seq1  AGGTGGCTCTGATGCTGGCTGGTATTCATTTGATCCTTGTTGCTCATACA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGCTCTGATGCTGGCTGGTATTCATTTGATCCTTGTTGCTCATACA  650

seq1  CTAAGAA-GACAAGAATGAAGGGCAT-GGTATGCATGCAATC-TGCAACT  695
      ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  CTAAGAAGGACAAG-ATGAAGGGCATGGGTATGCATGCAATCTTGCAACT  699

seq1  CTTTGTAAGAGAAATGGTAACA-TTTACATGTCTAAAGTAGTTGTCTTAG  744
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAAGAGAAATGGTAACATTTTACATGTCTAAAGTAGTTGTCTTAG  749

seq1  AGAAGAATCTCAACTGTTGTTACAAAATGAAAACATTTCCCCCAAAGACT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATCTCAACTGTTGTTACAAAATGAAAACATTTCCCCCAAAGACT  799

seq1  ACTATAA-TCTATTTTCTTATAAAATTCCCCTTCCTCTCAATTCAACCCA  843
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATAATTCTATTTTCTTATAAAATTCCCCTTCCTCTCAATTCAACCCA  849

seq1  TTTC-AGCAACTTTCACCTATTAGGAAGGCCATTCCCAGTTCTTACAACT  892
      |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTCTAGCAACTTTCACCTATTA-GAAGGCCATTCCCAGTTCTTAC-ACT  897

seq1  CTCCGTTGTTAGCTCCACAACTTTTTTGTGTGTACA-TATGTATGTGTAT  941
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||
seq2  CTCCGTTGTTAGCTCCACAACTTTTTTGTGTGTACATTTTGTATGTGTAT  947

seq1  GTGCCCCCATGTCTGTGTATATTCATGTGGTTATATGGGTATGTGCACAG  991
      |||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||
seq2  GTGCCCCATTTTCTGTGTTTATTCATGT-GTTATATTGGTATTTGCACAG  996

seq1  AAGCCAGAGGACAACCTCAGGGATTGCCCCTCCAGCTGCCCACCTTGATT  1041
       |||||||||| |||||   ||||||||||| |||||  |||||||||||
seq2  -AGCCAGAGGAAAACCT-TCGGATTGCCCCTTCAGCT-TCCACCTTGATT  1043

seq1  TTTGAGACATG-GTGTCTTACTGGCCTAGAACTCACCCAACAGGTTAG  1088
      ||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||
seq2  TTTGAAACATGTGTGCCTTACTGG-CTAGAACT-ACCCAACATGTTAG  1089

seq1: chr6_31104108_31105000
seq2: B6Ng01-015G18.g_72_965 (reverse)

seq1  ACTCATAGATCCACCACCTGCCTCTACCACCCAAGTATGGGGATTGAA-G  49
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
seq2  ACTCATAGATCCACCACCTGCCTCTACCACCAAAGTATGGGGATTGAAGG  50

seq1  GTATGCATCAACACACCCAGCCCATCTGTGAAGACTTCCAATTTCGAGTG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGCATCAACACACCCAGCCCATCTGTGAAGACTTCCAATTTCGAGTG  100

seq1  CAGCATCTAGACAGTTCCATTCATGCACGTGGGCAGCAGACTTCTGGGTC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCATCTAGACAGTTCCATTCATGCACGTGGGCAGCAGACTTCTGGGTC  150

seq1  AACTGATCAACTAAAGCTAACTTTATAGACTGGAGATGAAGATCCACACT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGATCAACTAAAGCTAACTTTATAGACTGGAGATGAAGATCCACACT  200

seq1  TGAGTATGAATGACAGAATGCCCATGAAATCCAAAGCACAGCATGTGCTG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTATGAATGACAGAATGCCCATGAAATCCAAAGCACAGCATGTGCTG  250

seq1  CCCTTATTCCTCCTCTATTCACTAAGGATGCTCTGTTACAAAGCTACACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTATTCCTCCTCTATTCACTAAGGATGCTCTGTTACAAAGCTACACT  300

seq1  GTCTCATCCCTGAAACTTGAAGGCTTCTTCTTATCACCTTATCTTTAGGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCATCCCTGAAACTTGAAGGCTTCTTCTTATCACCTTATCTTTAGGG  350

seq1  AGGGTTACCAAGATAATTTCCCCATCTCCACACACCTGGGAATATCCCAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTACCAAGATAATTTCCCCATCTCCACACACCTGGGAATATCCCAT  400

seq1  CCCAGGGCGGCAGACTACTGAAGCAGAGCACTTGATAAAGCTACTGCCAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGGCGGCAGACTACTGAAGCAGAGCACTTGATAAAGCTACTGCCAA  450

seq1  GTTACTTTTCATTTCAAACATCCCCTGGGCAGCTACTACACTTAGGCCAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACTTTTCATTTCAAACATCCCCTGGGCAGCTACTACACTTAGGCCAA  500

seq1  AGGGAAGGGGCCACCTAAGAATCTACACTAGTGACAAGGCTCTCAAAAAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGGGGCCACCTAAGAATCTACACTAGTGACAAGGCTCTCAAAAAG  550

seq1  CACAGCAGATTGGCAGATGTCAAGCACCCAATACCACGAAGTCACTGAAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCAGATTGGCAGATGTCAAGCACCCAATACCACGAAGTCACTGAAT  600

seq1  GCAAAAAGTTATGTGGTTTCTGGGGAAAAAAATCTTTAAAAGTGACTCCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAAGTTATGTGGTTTCTGGGGAAAAAAATCTTTAAAAGTGACTCCA  650

seq1  TTTCTTCTTGAACTAGGTACTCATGCAGTTTCTTCTAATGACTAGAAACT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCTTGAACTAGGTACTCATGCAGTTTCTTCTAATGACTAGAAACT  700

seq1  CAGCCATATGCTGTGTGTGTGCTTCTGTGTGAGTGTGTATGTGTACAAAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCATATGCTGTGTGTGTGCTTCTGTGTGAGTGTGTATGTGTACAAAC  750

seq1  ATACCACAATTTACTGAAAACACACATGCAGTGGGCAAAGTTTGTTTGTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCACAATTTACTGAAAACACACATGCAGTGGGCAAAGTTTGTTTGTT  800

seq1  TTTTAATACTCATTATCATTCCTATTTCCCAGATTGTACAAAAATGAGAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAATACTCATTATCATTCCTATTTCCCAGATTGTACAAAAATGAGAG  850

seq1  GTCTATGTGTGGCCAAAATCTAGCCAATAGCAGGGCTGGAATTC  893
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGTGTGGCCAAAATCTAGCCAATAGCAGGGCTGGAATTC  894