MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-020K03
Chromosome	6 (Build37)
Map Location	95,507,512 - 95,508,632
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Suclg2
Upstream gene	Slc25a26, Lrig1, LOC625941, EG665865, LOC100043276, LOC100043680, Kbtbd8, LOC435912
Downstream gene	LOC665886, LOC545867, C630007B19Rik, LOC100043685, 1700123L14Rik
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-020K03.b	B6Ng01-020K03.g
ACC	DH853381	DH853382
length	1,103	1,159
definition	DH853381\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-020K03, 5' end.	DH853382\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-020K03, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcttttctgtcctgtcttcagtgtgcaaatgagccctcggtgctgt tgcctccatttctatacttgtgatatcagatgttcatgcatctgtcacag ggtgaaggagagaagagaggggatatggccttgttttcattctacagatc tctaactcatgatagccacacgcagtggcgacccatgagaggagcagact ccaaacataccctcacaaaggaaaaacgtagcccagattggtctcaagct ctctgtgtggctgaggagggccttgaatttctgaatcttctgcctctacc tcccatttgctgagattataagtgtgcaccaccctaccaatgcatgtagt gtaaggggcttgatctcagggccttgtacatgctagggaagccctctacc agctgagtacatccccagacttgcagagcatactgataactatctttagc attgaaaatcccttaaggtacccggtcctgaccctccatgagggatgtgc ccccaagcctccctctggaattcttgtccgtacagtgatggtcatagggt cccttctcagttttactcaatgaagtgggcttttgctttcacacttgttc tctttctatgtacatgtagtaggatacatataacatgtgtctgacccaag catacaacatatattctatgtccttagacctgcctggtgccacctcagct caccaggcgtgctgagtacgctggttggagtgctgtactgagtcaggaat gctgagtcagacatggtccctctttagccttactcaggcttcatggatca atgtatagactcattaaaattggagacctgtgaattagagtgaacattgg tgacattttattaattagacacagatttttaggagagacagagtggaatt attgaaatgcatgtcgttatccttcctccgtgtgtttggtttatgacatg tggattttaaagtgaaaccatcatcactgtagactgtgagaggagacaat catgtcacaagtcagtacatgtggtggctgtgcactgattgtctccgctt aacgatcggtgattaagctctgactgaagtctctcttttcatgtacaaat ata	gaattcaaccccaaggctcgaaagctaggggtttttatggggtaaaaggc ttaggggtggggaattcagcatagtgacacactattggcttattcaaaca tcagcaaaagaattgcatgtatatgcagatcagggtgtcagagttctgtg agttggatgtttatcaatgctagcagagtatctggtcaatttgactcagt tcagatagccctgttatgtcctcacattcctctttatctttatggtcaag ctgttctcaggaatgctttaactacagggcatgcctgggttggtttatct tttttctcagccccaggcagcctctaggctcacaaataaccagcaatttc ggagtattttatatgacttacaggtcttgaaatttcatctttctttcaat ctcatctccaaatagtgatgccattagactgaattagcggatatgacatt cctggtgaactgtatctcaggaggcagactttgagatttaaaagcgtcct acgatccccagtgtgctctctcttcttgctgtgtttggtttttgagttcc ttccatcagtcctgcctactgccacacttctgagccatgatggtgatgga ctcgtatctctctgcaaacataagtccaaagtaaaccctttgttctataa cagcacttctcaatctgtgggtcaaaacccttttatgggagccaatgacc ctttcacaagggctgcatatcagatatcctgcatatcagatatcctacat atcagatatttacatcactactcataacagtagcaatgttacagttatga agtagcaaaaaaataattttatagtttgggtgccactacaacataagaaa ctataataaagggtcatagtattaggaaggttgagaatcactctttttaa gtggccttggatgtgatgctgtatcatagtacacacacatgcatgcgcgc gcacaccacacacaccacacacttgctgtgctcatagattatgcatctct catctttcgaagactttctattatgtagagggtgataagacggaacccca ggatcaatcctacggaaaaggactcgcacatatcgcctaaatgggggttc ggttcctcccgttctccgccaaggcctagaactttggtgggagatagtgg aaagatagt
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr6_95507512_95508632 seq2: B6Ng01-020K03.b_43_1145 (reverse) seq1 TATATGTGTACAATGAAAAGAGAGACTTCAGTTCAGAGCCTTTAAATCAC 50 \|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\| seq2 TATATTTGTAC-ATGAAAAGAGAGACTTCAG-TCAGAGC---TTAATCAC 45 seq1 ACGATCTGCTAAGCCGGAGACAATTCAGTGCACAGCCCACCACATGTACT 100 \|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 -CGATC-GTTAAG-CGGAGACAA-TCAGTGCACAG-CCACCACATGTACT 90 seq1 GACTTGTGACATGAATTTGTCTCCTCTCACAGTCTACAGTGATGATTGGT 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| seq2 GACTTGTGACATGA--TTGTCTCCTCTCACAGTCTACAGTGATGAT--GG 136 seq1 TTTCACTTTAAAATCCACCATGTCATAAAACCAAAACACACGGAGGAAGG 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTCACTTTAAAATCCA-CATGTCATAAA--CCAAACACACGGAGGAAGG 183 seq1 ATAACGACATGCATTTCAATAATTCCACCTCTGTCTCTCCTAAAAATCTG 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAACGACATGCATTTCAATAATTCCA-CTCTGTCTCTCCTAAAAATCTG 232 seq1 TGTCTAATTAATAAAATGTCACCAATGTTCACTCTAATTCACAGGTCTCC 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTCTAATTAATAAAATGTCACCAATGTTCACTCTAATTCACAGGTCTCC 282 seq1 AATTTTAATGAGTCTATACATTGATCCATGAAGCCTGAGTAAGGCTAAAG 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATTTTAATGAGTCTATACATTGATCCATGAAGCCTGAGTAAGGCTAAAG 332 seq1 AGGGACCATGTCTGACTCAGCATTCCTGACTCAGTACAGCACTCCAACCA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGGACCATGTCTGACTCAGCATTCCTGACTCAGTACAGCACTCCAACCA 382 seq1 GCGTACTCAGCACGCCTGGTGAGCTGAGGTGGCACCAGGCAGGTCTAAGG 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCGTACTCAGCACGCCTGGTGAGCTGAGGTGGCACCAGGCAGGTCTAAGG 432 seq1 ACATAGAATATATGTTGTATGCTTGGGTCAGACACATGTTATATGTATCC 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACATAGAATATATGTTGTATGCTTGGGTCAGACACATGTTATATGTATCC 482 seq1 TACTACATGTACATAGAAAGAGAACAAGTGTGAAAGCAAAAGCCCACTTC 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TACTACATGTACATAGAAAGAGAACAAGTGTGAAAGCAAAAGCCCACTTC 532 seq1 ATTGAGTAAAACTGAGAAGGGACCCTATGACCATCACTGTACGGACAAGA 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTGAGTAAAACTGAGAAGGGACCCTATGACCATCACTGTACGGACAAGA 582 seq1 ATTCCAGAGGGAGGCTTGGGGGCACATCCCTCATGGAGGGTCAGGACCGG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATTCCAGAGGGAGGCTTGGGGGCACATCCCTCATGGAGGGTCAGGACCGG 632 seq1 GTACCTTAAGGGATTTTCAATGCTAAAGATAGTTATCAGTATGCTCTGCA 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTACCTTAAGGGATTTTCAATGCTAAAGATAGTTATCAGTATGCTCTGCA 682 seq1 AGTCTGGGGATGTACTCAGCTGGTAGAGGGCTTCCCTAGCATGTACAAGG 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTCTGGGGATGTACTCAGCTGGTAGAGGGCTTCCCTAGCATGTACAAGG 732 seq1 CCCTGAGATCAAGCCCCTTACACTACATGCATTGGTAGGGTGGTGCACAC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTGAGATCAAGCCCCTTACACTACATGCATTGGTAGGGTGGTGCACAC 782 seq1 TTATAATCTCAGCAAATGGGAGGTAGAGGCAGAAGATTCAGAAATTCAAG 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTATAATCTCAGCAAATGGGAGGTAGAGGCAGAAGATTCAGAAATTCAAG 832 seq1 GCCCTCCTCAGCCACACAGAGAGCTTGAGACCAATCTGGGCTACGTTTTT 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCCCTCCTCAGCCACACAGAGAGCTTGAGACCAATCTGGGCTACGTTTTT 882 seq1 CCTTTGTGAGGGTATGTTTGGAGTCTGCTCCTCTCATGGGTCGCCACTGC 950 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTTTGTGAGGGTATGTTTGGAGTCTGCTCCTCTCATGGGTCGCCACTGC 932 seq1 GTGTGGCTATCATGAGTTAGAGATCTGTAGAATGAAAACAAGGCCATATC 1000 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGTGGCTATCATGAGTTAGAGATCTGTAGAATGAAAACAAGGCCATATC 982 seq1 CCCTCTCTTCTCTCCTTCACCCTGTGACAGATGCATGAACATCTGATATC 1050 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCCTCTCTTCTCTCCTTCACCCTGTGACAGATGCATGAACATCTGATATC 1032 seq1 ACAAGTATAGAAATGGAGGCAACAGCACCGAGGGCTCATTTGCACACTGA 1100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAAGTATAGAAATGGAGGCAACAGCACCGAGGGCTCATTTGCACACTGA 1082 seq1 AGACAGGACAGAAAAGAATTC 1121 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGACAGGACAGAAAAGAATTC 1103

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr6_95507512_95508632
seq2: B6Ng01-020K03.b_43_1145 (reverse)

seq1  TATATGTGTACAATGAAAAGAGAGACTTCAGTTCAGAGCCTTTAAATCAC  50
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||
seq2  TATATTTGTAC-ATGAAAAGAGAGACTTCAG-TCAGAGC---TTAATCAC  45

seq1  ACGATCTGCTAAGCCGGAGACAATTCAGTGCACAGCCCACCACATGTACT  100
       ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||
seq2  -CGATC-GTTAAG-CGGAGACAA-TCAGTGCACAG-CCACCACATGTACT  90

seq1  GACTTGTGACATGAATTTGTCTCCTCTCACAGTCTACAGTGATGATTGGT  150
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  | 
seq2  GACTTGTGACATGA--TTGTCTCCTCTCACAGTCTACAGTGATGAT--GG  136

seq1  TTTCACTTTAAAATCCACCATGTCATAAAACCAAAACACACGGAGGAAGG  200
      ||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||
seq2  TTTCACTTTAAAATCCA-CATGTCATAAA--CCAAACACACGGAGGAAGG  183

seq1  ATAACGACATGCATTTCAATAATTCCACCTCTGTCTCTCCTAAAAATCTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACGACATGCATTTCAATAATTCCA-CTCTGTCTCTCCTAAAAATCTG  232

seq1  TGTCTAATTAATAAAATGTCACCAATGTTCACTCTAATTCACAGGTCTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTAATTAATAAAATGTCACCAATGTTCACTCTAATTCACAGGTCTCC  282

seq1  AATTTTAATGAGTCTATACATTGATCCATGAAGCCTGAGTAAGGCTAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTAATGAGTCTATACATTGATCCATGAAGCCTGAGTAAGGCTAAAG  332

seq1  AGGGACCATGTCTGACTCAGCATTCCTGACTCAGTACAGCACTCCAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACCATGTCTGACTCAGCATTCCTGACTCAGTACAGCACTCCAACCA  382

seq1  GCGTACTCAGCACGCCTGGTGAGCTGAGGTGGCACCAGGCAGGTCTAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTACTCAGCACGCCTGGTGAGCTGAGGTGGCACCAGGCAGGTCTAAGG  432

seq1  ACATAGAATATATGTTGTATGCTTGGGTCAGACACATGTTATATGTATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGAATATATGTTGTATGCTTGGGTCAGACACATGTTATATGTATCC  482

seq1  TACTACATGTACATAGAAAGAGAACAAGTGTGAAAGCAAAAGCCCACTTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTACATGTACATAGAAAGAGAACAAGTGTGAAAGCAAAAGCCCACTTC  532

seq1  ATTGAGTAAAACTGAGAAGGGACCCTATGACCATCACTGTACGGACAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAGTAAAACTGAGAAGGGACCCTATGACCATCACTGTACGGACAAGA  582

seq1  ATTCCAGAGGGAGGCTTGGGGGCACATCCCTCATGGAGGGTCAGGACCGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCAGAGGGAGGCTTGGGGGCACATCCCTCATGGAGGGTCAGGACCGG  632

seq1  GTACCTTAAGGGATTTTCAATGCTAAAGATAGTTATCAGTATGCTCTGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTTAAGGGATTTTCAATGCTAAAGATAGTTATCAGTATGCTCTGCA  682

seq1  AGTCTGGGGATGTACTCAGCTGGTAGAGGGCTTCCCTAGCATGTACAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGGGGATGTACTCAGCTGGTAGAGGGCTTCCCTAGCATGTACAAGG  732

seq1  CCCTGAGATCAAGCCCCTTACACTACATGCATTGGTAGGGTGGTGCACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGAGATCAAGCCCCTTACACTACATGCATTGGTAGGGTGGTGCACAC  782

seq1  TTATAATCTCAGCAAATGGGAGGTAGAGGCAGAAGATTCAGAAATTCAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAATCTCAGCAAATGGGAGGTAGAGGCAGAAGATTCAGAAATTCAAG  832

seq1  GCCCTCCTCAGCCACACAGAGAGCTTGAGACCAATCTGGGCTACGTTTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCTCCTCAGCCACACAGAGAGCTTGAGACCAATCTGGGCTACGTTTTT  882

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq2  AGACAGGACAGAAAAGAATTC  1103

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