BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021E23
Chromosome6 (Build37)
Map Location 79,973,610 - 79,974,706
singlet/doubletsinglet
Overlap geneLrrtm4
Upstream geneLOC384440, LOC621815, LOC100043392
Downstream geneLOC100043390
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021E23.bB6Ng01-021E23.g
ACCDH853851DH853852
length1,085252
definitionDH853851|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021E23, 5' end.DH853852|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021E23, 3' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctcataaacaaaaccactctgaaatttctgtctggttcttggtga
ttgacttttgtaatggggtgaagatggaagagccagcttaatttaaaatc
caatgagttaaccaaaattatgggaggtagtgatgatttaaaccaaagag
catttgacccaaggtttcacttactttgctgttaagttttagtttgaatt
aaagcatgcaaccaggaagccacagccatgtcacatgtgtcgctcattgt
tataccagcatagagaacatgtaaggccaactgtagagttgtatagaatt
gattcacatgtctaagggtgtcttctctctactgcctttgctttgctttt
gtttataattgctaggacatggatcactttgcaaaagtttcttaagttat
atttatgttatactagaaggaaagtgattttccgtattttgtctgctcct
cttgtaactaacagaaaggcaacttataactgatgacttggcagtaacat
aatgacaggcatgacagagcctgcttgtcatctttgctgtcttcctcaaa
aggaaagacagaaactcttgttaaattgacccaaaactaagtgatgcaaa
tatttatgaataaaaggtgtaactttggctggggtcttttttatttgcat
agaatcctcaaagagatgtctgaatttcatgttggactcttttcatttat
atgagaataagtttggtccagtttctgagtatctaatttaaaagatcact
tacaaaaacacatttacatgaatgggatggtatttatccacttccatttt
ctgatgaactatattggatatatgttgttttttattggtaaataatacta
tgtaacagccaactgtaaggttttgttgccaggatactttagctgataga
aggttgttctggcaattgactcttttagtacctgttattagatggtattt
tcaaagtgagttttaatgagtgtttaagatggtgctctttctatggtact
ataacagtaggaaacataatttgtctttggtacattaaccaagaattcac
agacctaaatcatatgtaatggggagtttttcaga
acttgcatttcttccattttctactggaactgacactggtatcttaatga
agacagacaactaaggacactaccaatagcattcttcctttgtgtatgtt
atgtatatgacatatgtaatttgtatataatatgtgcatgatatatatat
atatatatatgtatatgtgtatgtatgtatgtagctcttgttagagatat
atatcttacacagaatgagtttgtttttggttgtttgtttgtttttggga
gt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_79973610_79974706
seq2: B6Ng01-021E23.b_45_1129

seq1  GAATTCTCATAAACAAAACCACTCTGAAATTTCTGTCTGGTTCTTGGTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATAAACAAAACCACTCTGAAATTTCTGTCTGGTTCTTGGTGA  50

seq1  TTGACTTTTGTAATGGGGTGAAGATGGAAGAGCCAGCTTAATTTAAAATC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACTTTTGTAATGGGGTGAAGATGGAAGAGCCAGCTTAATTTAAAATC  100

seq1  CAATGAGTTAACCAAAATTATGGGAGGTAGTGATGATTTAAACCAAAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGAGTTAACCAAAATTATGGGAGGTAGTGATGATTTAAACCAAAGAG  150

seq1  CATTTGACCCAAGGTTTCACTTACTTTGCTGTTAAGTTTTAGTTTGAATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGACCCAAGGTTTCACTTACTTTGCTGTTAAGTTTTAGTTTGAATT  200

seq1  AAAGCATGCAACCAGGAAGCCACAGCCATGTCACATGTGTCGCTCATTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCATGCAACCAGGAAGCCACAGCCATGTCACATGTGTCGCTCATTGT  250

seq1  TATACCAGCATAGAGAACATGTAAGGCCAACTGTAGAGTTGTATAGAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCAGCATAGAGAACATGTAAGGCCAACTGTAGAGTTGTATAGAATT  300

seq1  GATTCACATGTCTAAGGGTGTCTTCTCTCTACTGCCTTTGCTTTGCTTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCACATGTCTAAGGGTGTCTTCTCTCTACTGCCTTTGCTTTGCTTTT  350

seq1  GTTTATAATTGCTAGGACATGGATCACTTTGCAAAAGTTTCTTAAGTTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATAATTGCTAGGACATGGATCACTTTGCAAAAGTTTCTTAAGTTAT  400

seq1  ATTTATGTTATACTAGAAGGAAAGTGATTTTCCGTATTTTGTCTGCTCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGTTATACTAGAAGGAAAGTGATTTTCCGTATTTTGTCTGCTCCT  450

seq1  CTTGTAACTAACAGAAAGGCAACTTATAACTGATGACTTGGCAGTAACAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAACTAACAGAAAGGCAACTTATAACTGATGACTTGGCAGTAACAT  500

seq1  AATGACAGGCATGACAGAGCCTGCTTGTCATCTTTGCTGTCTTCCTCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGACAGGCATGACAGAGCCTGCTTGTCATCTTTGCTGTCTTCCTCAAA  550

seq1  AGGAAAGACAGAAACTCTTGTTAAATTGACCCAAAACTAAGTGATGCAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAAGACAGAAACTCTTGTTAAATTGACCCAAAACTAAGTGATGCAAA  600

seq1  TATTTATGAATAAAAGGTGTAACTTTGGCTGGGGTCTTTTTTATTTGCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATGAATAAAAGGTGTAACTTTGGCTGGGGTCTTTTTTATTTGCAT  650

seq1  AGAATCCTCAAAGAGATGTCTGAATTTCATGTTGGACTCTTTTCATTTAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCCTCAAAGAGATGTCTGAATTTCATGTTGGACTCTTTTCATTTAT  700

seq1  ATGAGAATAAGTTTGGTCCAGTTTCTGAGTATCTAATTTAAAAGATCACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAATAAGTTTGGTCCAGTTTCTGAGTATCTAATTTAAAAGATCACT  750

seq1  TACAAAAACACA-TTACATGAATGGGATGGTATTTATCCACTTCCATTTT  799
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAAAACACATTTACATGAATGGGATGGTATTTATCCACTTCCATTTT  800

seq1  CTGATTGAACTATATTGGATATATGTTGTTTTTTCATTGGTAAAATAATA  849
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||
seq2  CTGA-TGAACTATATTGGATATATGTTGTTTTTT-ATTGGT-AAATAATA  847

seq1  CTATGTAACAGCCAACTGTAAGGTTTTGTTGCCAGGATACTTTAGCTGAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTAACAGCCAACTGTAAGGTTTTGTTGCCAGGATACTTTAGCTGAT  897

seq1  AGAAGGTTGTTCTGGCAATTGACTCTTTTAGTACCTGTTATTAGATGGTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGGTTGTTCTGGCAATTGACTCTTTTAGTACCTGTTATTAGATGGTA  947

seq1  TTTTCAAAAGTGAGTTTTAATGAGTGTTTAAAGATGGTGCTCTTTCTAAT  999
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||
seq2  TTTTC-AAAGTGAGTTTTAATGAGTGTTT-AAGATGGTGCTCTTTCT-AT  994

seq1  GTTACTTATAACAGTTAGGAAACATAATTTGTTCTTTGGTAACATATACC  1049
      | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||
seq2  GGTAC-TATAACAG-TAGGAAACATAATTTG-TCTTTGGT-ACATTAACC  1040

seq1  AAGATTTCCACAGACCTAAATACATATGTTAATGGGAGTGTTTTCAGA  1097
      |||| || ||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||
seq2  AAGAATT-CACAGACCTAAAT-CATATGTAATGGGGAGT-TTTTCAGA  1085