BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032B19
Chromosome6 (Build37)
Map Location 118,197,999 - 118,382,864
singlet/doubletdoublet
Overlap gene1700069P05Rik, Bms1, Zfp248
Upstream geneEG640142, LOC100043777, LOC621462, EG640370, EG621705, LOC100043779, Zfp637, Zfp239, 4933440N22Rik, Hnrpf, Fxyd4, LOC232338, Rasgef1a, Galnact2, Ret
Downstream geneZfp9, Ankrd26, Cacna1c, Dcp1b, Cacna2d4, Lrtm2, Adipor2, Wnt5b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032B19.bB6Ng01-032B19.g
ACCDH861542DH861543
length1,053947
definitionDH861542|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032B19, 5' end.DH861543|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032B19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(118,381,809 - 118,382,864)(118,197,999 - 118,198,942)
sequence
gaattcactagcaagggaagtaatctgtgtcactgggtaagataggtcac
tgtcttagcgttctattactataaagagacaccatgaccacagctactct
taattgggtctggcttacagttccgaggtttagtccattatcatcatggt
tggtagcatgctggcacacaggcagacatggtgctggagaggtagctgag
agttctacacctggatcagcagacagcaggagtagaggagctactggctt
gagcttctaaaaccttagagcccacctccagtgacacacttactccaacc
aggccacatctcttcatccctctcaagtactgccactccttggtgatcaa
gcgctcaactctataaggctttaggggccattcctattcaaaccacaaca
gttgcctttggaatatctttcagaaattcctgtttttacatcagactttt
ggaaatacccaagagcagcatcccacagcttatctcagtggcttctccat
ctgtctctaatccagaggcacctttccttttgtcttgacatttggagtaa
tttatttttacctataaatctgaagtcagttggctttgttttagagactt
tttcttggcttgtcttcctttatctttaagaattatgcaccttctctctg
tcttctttgagcaactttcattagctagcatatcctcatgtacttctgta
attccacttaccaggtgtataatggtgaacatctactctgatacacttta
attgttgttctctggaatagtggagtgctatagaatttttttattaagca
tatgattattaacattcttgcatttgagcaccagtagttaagaatagcca
atgttttatgataaagtatattgaaaggctcagtaacagatacagaatat
gacacttagggggcccatacttgaatagaagatacagttacatgttaagc
agaaacctatgtgtaagggaaaaacctagaaataagacagactaaatacc
tagtataggaaaatatgtaccctgaggcctaaggagtgaccaggatagca
aag
gaattccaaaccttaatggatgtaggtgcctagatcctcaggtctgtttg
ccccatgagtctcaacccctgcccctaaacccagcaggtcccaagcccat
aggcatgagggaacaaatatttacccactgctgggtttggcagctcccct
agacccaaggcctgagttgggacctccctgacacaggaaatgaagctgaa
ctttgatgctccaagaagacagacccctgaggtgtgtggggaaggctgtc
cacccactttgttcctttgtctggggtcttcaggagagagcccttatctg
atgtgactttagtatgtttcaatacttggtccccagttagtggaactgtt
caggacgatgtggccttactggagggggtgtatcactgagggtgacccat
gaggtttcaaaggcccacactatcccagttatctctctttgcctcatagt
tgtggatgtaagttctcagctactgtttcagtgccacacctgcctgccta
ttgtcaggctccctgccttggggggcgtgaactaaccccctgggactgta
agccctaataaactcttctataagttgccttggtcatggtgttttgtcac
aatggaaaagtagctaagacagctccttagagaccaggaacagacacagc
atgtctaggctgtgggggacatctccttccttcctgcggcttctatgtct
ctggttcagtcatcgtgaccttaaaatgctccctttttgaaaaggttctg
ttgcctgctttttagtctgatttttttccccaagtcacctccaggattgt
atgcaggctgtttaagctccataaaaacttgctatttgtttagactggct
gacatttccacaatttttttattaaagaaaatttcttggggagacggcag
gagtttgcgcaaagcttatgccctctgcctctgggccctggtgccct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_118381809_118382864
seq2: B6Ng01-032B19.b_47_1099 (reverse)

seq1  CTTTGCTATCCTGGTCACTCCTAAGCCCTCAGGGTACATATTTTCCTATA  50
      |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGCTATCCTGGTCACTCCTTAGGCCTCAGGGTACATATTTTCCTATA  50

seq1  CTAGGTATTTAAGTCTGTCTTTATTTCTAGGTTTTTTCCTTTACACATAG  100
      |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  CTAGGTATTT-AGTCTGTC-TTATTTCTAGG-TTTTTCCCTTACACATAG  97

seq1  GTTTTCTGCTTTAACATGTAACTGTATCTTCTATTCAAGTATGGGCCCCC  150
      | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TTTCTGC-TTAACATGTAACTGTATCTTCTATTCAAGTATGGGCCCCC  145

seq1  TAAGTGTCATATTCTGTATCTGTTACTGAGCCTTTCAATATACTTTATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGTCATATTCTGTATCTGTTACTGAGCCTTTCAATATACTTTATCA  195

seq1  TAAAACATTGGCTATTCTTAACTACTGGTGCTC-AATGCAAGAATGTTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TAAAACATTGGCTATTCTTAACTACTGGTGCTCAAATGCAAGAATGTTAA  245

seq1  TAATCATATGCTTAAT-TAAAAATTCTATAGCACTCCACTATTCCAGAGA  298
      ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCATATGCTTAATAAAAAAATTCTATAGCACTCCACTATTCCAGAGA  295

seq1  ACAACAATTAAAGTGTATCAGAGTAGATGTTCACCATTATACACCTGGTA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACAATTAAAGTGTATCAGAGTAGATGTTCACCATTATACACCTGGTA  345

seq1  AGTGGAATTACAGAAGTACATGAGGATATGCTAGCTAATGAAAGTTGCTC  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAATTACAGAAGTACATGAGGATATGCTAGCTAATGAAAGTTGCTC  395

seq1  AAAGAAGACAGAGAGAAGGTGCATAATTCTTAAAGATAAAGGAAGACAAG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAGACAGAGAGAAGGTGCATAATTCTTAAAGATAAAGGAAGACAAG  445

seq1  CCAAGAAAAAGTCTCTAAAACAAAGCCAACTGACTTCAGATTTATAGGTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAAAAAGTCTCTAAAACAAAGCCAACTGACTTCAGATTTATAGGTA  495

seq1  AAAATAAATTACTCCAAATGTCAAGACAAAAGGAAAGGTGCCTCTGGATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATAAATTACTCCAAATGTCAAGACAAAAGGAAAGGTGCCTCTGGATT  545

seq1  AGAGACAGATGGAGAAGCCACTGAGATAAGCTGTGGGATGCTGCTCTTGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGATGGAGAAGCCACTGAGATAAGCTGTGGGATGCTGCTCTTGG  595

seq1  GTATTTCCAAAAGTCTGATGTAAAAACAGGAATTTCTGAAAGATATTCCA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTCCAAAAGTCTGATGTAAAAACAGGAATTTCTGAAAGATATTCCA  645

seq1  AAGGCAACTGTTGTGGTTTGAATAGGAATGGCCCCTAAAGCCTTATAGAG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAACTGTTGTGGTTTGAATAGGAATGGCCCCTAAAGCCTTATAGAG  695

seq1  TTGAGCGCTTGATCACCAAGGAGTGGCAGTACTTGAGAGGGATGAAGAGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCGCTTGATCACCAAGGAGTGGCAGTACTTGAGAGGGATGAAGAGA  745

seq1  TGTGGCCTGGTTGGAGTAAGTGTGTCACTGGAGGTGGGCTCTAAGGTTTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCCTGGTTGGAGTAAGTGTGTCACTGGAGGTGGGCTCTAAGGTTTT  795

seq1  AGAAGCTCAAGCCAGTAGCTCCTCTACTCCTGCTGTCTGCTGATCCAGGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGCTCAAGCCAGTAGCTCCTCTACTCCTGCTGTCTGCTGATCCAGGT  845

seq1  GTAGAACTCTCAGCTACCTCTCCAGCACCATGTCTGCCTGTGTGCCAGCA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAACTCTCAGCTACCTCTCCAGCACCATGTCTGCCTGTGTGCCAGCA  895

seq1  TGCTACCAACCATGATGATAATGGACTAAACCTCGGAACTGTAAGCCAGA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACCAACCATGATGATAATGGACTAAACCTCGGAACTGTAAGCCAGA  945

seq1  CCCAATTAAGAGTAGCTGTGGTCATGGTGTCTCTTTATAGTAATAGAACG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAATTAAGAGTAGCTGTGGTCATGGTGTCTCTTTATAGTAATAGAACG  995

seq1  CTAAGACAGTGACCTATCTTACCCAGTGACACAGATTACTTCCCTTGCTA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGACAGTGACCTATCTTACCCAGTGACACAGATTACTTCCCTTGCTA  1045

seq1  GTGAATTC  1056
      ||||||||
seq2  GTGAATTC  1053

seq1: chr6_118197999_118198942
seq2: B6Ng01-032B19.g_69_1015

seq1  GAATTCCAAACCTTAATGGATGTAGGTGCCTAGATCCTCAGGTCTGTTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAACCTTAATGGATGTAGGTGCCTAGATCCTCAGGTCTGTTTG  50

seq1  CCCCATGAGTCTCAACCCCTGCCCCTAAACCCAGCAGGTCCCAAGCCCAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGAGTCTCAACCCCTGCCCCTAAACCCAGCAGGTCCCAAGCCCAT  100

seq1  AGGCATGAGGGAACAAATATTTACCCACTGCTGGGTTTGGCAGCTCCCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCATGAGGGAACAAATATTTACCCACTGCTGGGTTTGGCAGCTCCCCT  150

seq1  AGACCCAAGGCCTGAGTTGGGACCTCCCTGACACAGGAAATGAAGCTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCCAAGGCCTGAGTTGGGACCTCCCTGACACAGGAAATGAAGCTGAA  200

seq1  CTTTGATGCTCCAAGAAGACAGACCCCTGAGGTGTGTGGGGAAGGCTGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGATGCTCCAAGAAGACAGACCCCTGAGGTGTGTGGGGAAGGCTGTC  250

seq1  CACCCACTTTGTTCCTTTGTCTGGGGTCTTCAGGAGAGAGCCCTTATCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCACTTTGTTCCTTTGTCTGGGGTCTTCAGGAGAGAGCCCTTATCTG  300

seq1  ATGTGACTTTAGTATGTTTCAATACTTGGTCCCCAGTTAGTGGAACTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGACTTTAGTATGTTTCAATACTTGGTCCCCAGTTAGTGGAACTGTT  350

seq1  CAGGACGATGTGGCCTTACTGGAGGGGGTGTATCACTGAGGGTGACCCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACGATGTGGCCTTACTGGAGGGGGTGTATCACTGAGGGTGACCCAT  400

seq1  GAGGTTTCAAAGGCCCACACTATCCCAGTTATCTCTCTTTGCCTCATAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTTCAAAGGCCCACACTATCCCAGTTATCTCTCTTTGCCTCATAGT  450

seq1  TGTGGATGTAAGTTCTCAGCTACTGTTTCAGTGCCACACCTGCCTGCCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATGTAAGTTCTCAGCTACTGTTTCAGTGCCACACCTGCCTGCCTA  500

seq1  TTGTCAGGCTCCCTGCCTTGGGGGGCGTGAACTAACCCCCTGGGACTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCAGGCTCCCTGCCTTGGGGGGCGTGAACTAACCCCCTGGGACTGTA  550

seq1  AGCCCTAATAAACTCTTCTATAAGTTGCCTTGGTCATGGTGTTTTGTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTAATAAACTCTTCTATAAGTTGCCTTGGTCATGGTGTTTTGTCAC  600

seq1  AATGGAAAAGTAGCTAAGACAGCTCCTTAGAGACCAGGAACAGACACAGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAAAAGTAGCTAAGACAGCTCCTTAGAGACCAGGAACAGACACAGC  650

seq1  ATGTCTAGGCTGTGGGGGACATCTCCTTCCTTCCTGCGGCTTCTATGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTAGGCTGTGGGGGACATCTCCTTCCTTCCTGCGGCTTCTATGTCT  700

seq1  CTGGTTCAGTCATCGTGACCTT-AAATGCTCCCATATTG-AAAGGTTCTG  748
      |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||
seq2  CTGGTTCAGTCATCGTGACCTTAAAATGCTCCCTTTTTGAAAAGGTTCTG  750

seq1  -TGCCTGCTTTTTAGTCTGATTTTTTTCCCCAAAGTCACCTCCAGGATTG  797
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTGCCTGCTTTTTAGTCTGATTTTTTTCCCC-AAGTCACCTCCAGGATTG  799

seq1  TATGCAGGCTGTTCAAGCTCCAT-AAAACTTGCTATTTGTTTAGACTGGC  846
      ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGGCTGTTTAAGCTCCATAAAAACTTGCTATTTGTTTAGACTGGC  849

seq1  TGACATTTCCAC-AGTCTTTTATTAAAGAAAATCTCCTTGGGAGACGGCA  895
      |||||||||||| | | |||||||||||||||| || | |||||||||||
seq2  TGACATTTCCACAATTTTTTTATTAAAGAAAATTTCTTGGGGAGACGGCA  899

seq1  GGATGTTTGCGCAGAGCTTATGCCCTCTGCCTCTGGCCCCTGGTGCCCT  944
      ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGA-GTTTGCGCAAAGCTTATGCCCTCTGCCTCTGGGCCCTGGTGCCCT  947