BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-032O05
Chromosome6 (Build37)
Map Location 107,176,168 - 107,361,997
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCntn4, Il5ra, Trnt1, Crbn, Ppia-ps6_1128.1
Downstream geneLrrn1, Setmar, Sumf1, LOC100043718, Itpr1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-032O05.bB6Ng01-032O05.g
ACCDH862094DH862095
length843483
definitionDH862094|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032O05, 5' end.DH862095|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-032O05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(107,176,168 - 107,177,011)(107,361,509 - 107,361,997)
sequence
gaattcatctcaaaagcaaacccactctgaagaggcttttaaggcagtct
gacatacataatcaatattcatgaatattttagtaaaattaatgcccaac
caaactaatttcatgttttaaccttaaattttaatggaaacaatggacat
ctgtgggggaaaaaaatcccacttaggtatcttctttattcaagatttat
gtgggagcatgggggatggctggaaggatgactcagtggttaagagaact
tcctgttcttccagaacgcctgggctcagtttcccagcattaacttcagg
aagtttgtagccacttgcaactccacttctactggatcaaatgctcttct
ttggcctctggggtcactacatacttgtgcatatacaaccactattacat
ccatgcaaataaattaatacatttctaaaaattaggcatgggtgtttgaa
gggaaatatgtagtgatgccagaaacactagaggtcctaaaggagtcaga
ggtaattcccaaattgacaaatcaaccagatttttggtggtcaaatgtcc
atctctatacataccataatgcccagagagtggcaatatgtatttgttgg
attaatgaaaatgctgtcaccagtgaaattgatgctattatttatcacgt
ccttcacacacatagatttgagaacattacagtccatcacgtgtgtgtct
gtgtatatgtatgcatgcacacaggtacacaagtatatttttcataagcc
tagtgcaccagggtgctgaagcgagagctaagtaaggactggctataaag
gggatatgagacagagatttgagtgctcaaaatacattgttgg
ttcccgtcatagaaagcttcatccagggaaaggttcttgacctcatcatt
attgaaatttagggatatgaaaaatctctgctatggacaccatcctttac
cttgtagggtgaaagaaaaatcttcctttttaatggatgactactgacaa
ctttcaaatcccatcaccccaccccatttttcttttctcaagaagacaaa
aacaaaaataaacaaaaccctcaaagctttgaaatatttgagagcccttt
attgtatccagtggtaagttcaagtcagggaaaccctaggaccatggtgg
gagtcttcatcttatcaaatcttgtaaacacaatgaaattccatatcagt
tataggctgtcttgggtaccgtccatttgtaccgtccatttgttctctag
acagactcattctgggaaccactagatttttccttaagttattggaaagt
gtggtgagagagagagaggaagagggaggggga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_107176168_107177011
seq2: B6Ng01-032O05.b_44_886

seq1  GAATTCATCTCAAAAGCAAACCCACTCTGAAGAGGCTTTTAAGGCAGTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTCAAAAGCAAACCCACTCTGAAGAGGCTTTTAAGGCAGTCT  50

seq1  GACATACATAATCAATATTCATGAATATTTTAGTAAAATTAATGCCCAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACATACATAATCAATATTCATGAATATTTTAGTAAAATTAATGCCCAAC  100

seq1  CAAACTAATTTCATGTTTTAACCTTAAATTTTAATGGAAACAATGGACAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTAATTTCATGTTTTAACCTTAAATTTTAATGGAAACAATGGACAT  150

seq1  CTGTGGGGGAAAAAAATCCCACTTAGGTATCTTCTTTATTCAAGATTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGGGGGAAAAAAATCCCACTTAGGTATCTTCTTTATTCAAGATTTAT  200

seq1  GTGGGAGCATGGGGGATGGCTGGAAGGATGACTCAGTGGTTAAGAGAACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGGAGCATGGGGGATGGCTGGAAGGATGACTCAGTGGTTAAGAGAACT  250

seq1  TCCTGTTCTTCCAGAACGCCTGGGCTCAGTTTCCCAGCATTAACTTCAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGTTCTTCCAGAACGCCTGGGCTCAGTTTCCCAGCATTAACTTCAGG  300

seq1  AAGTTTGTAGCCACTTGCAACTCCACTTCTACTGGATCAAATGCTCTTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTGTAGCCACTTGCAACTCCACTTCTACTGGATCAAATGCTCTTCT  350

seq1  TTGGCCTCTGGGGTCACTACATACTTGTGCATATACAACCACTATTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCCTCTGGGGTCACTACATACTTGTGCATATACAACCACTATTACAT  400

seq1  CCATGCAAATAAATTAATACATTTCTAAAAATTAGGCATGGGTGTTTGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGCAAATAAATTAATACATTTCTAAAAATTAGGCATGGGTGTTTGAA  450

seq1  GGGAAATATGTAGTGATGCCAGAAACACTAGAGGTCCTAAAGGAGTCAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAATATGTAGTGATGCCAGAAACACTAGAGGTCCTAAAGGAGTCAGA  500

seq1  GGTAATTCCCAAATTGACAAATCAACCAGATTTTTGGTGGTCAAATGTCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAATTCCCAAATTGACAAATCAACCAGATTTTTGGTGGTCAAATGTCC  550

seq1  ATCTCTATACATACCATAATGCCCAGAGAGTGGCAATATGTATTTGTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCTATACATACCATAATGCCCAGAGAGTGGCAATATGTATTTGTTGG  600

seq1  ATTAATGAAAATGCTGTCACCAGTGAAATTGATGCTATTATTTATCACGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAATGAAAATGCTGTCACCAGTGAAATTGATGCTATTATTTATCACGT  650

seq1  CCTTCACACACATAGATTTGAGAACATTACAGTCCATCACGTGTGTGTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACACACATAGATTTGAGAACATTACAGTCCATCACGTGTGTGTCT  700

seq1  GTGTATATGTATGCATGCACACAGGTACACAAGTATATTGTTCATAAGCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTGTATATGTATGCATGCACACAGGTACACAAGTATATTTTTCATAAGCC  750

seq1  TAGTGCACCAGGGTGCTGAAGCGAGAGCTAAGTAAGGACTGGCTATAAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCACCAGGGTGCTGAAGCGAGAGCTAAGTAAGGACTGGCTATAAAG  800

seq1  GGGATATGAGACAGAGATTTGAGTGCTCAGAGATACATTGTTGG  844
      ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
seq2  GGGATATGAGACAGAGATTTGAGTGCTCA-AAATACATTGTTGG  843

seq1: chr6_107361509_107361997
seq2: B6Ng01-032O05.g_70_558 (reverse)

seq1  TCCCCCTCCCTCTTCCTCTCTCTCTCTCACCACACTTTCCAATAACTTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCTCCCTCTTCCTCTCTCTCTCTCACCACACTTTCCAATAACTTAA  50

seq1  GGAAAAATCTAGTGGTTCCCAGAATGAGTCTGTCTAGAGAACAAATGGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAAATCTAGTGGTTCCCAGAATGAGTCTGTCTAGAGAACAAATGGAC  100

seq1  GGTACAAATGGACGGTACCCAAGACAGCCTATAACTGATATGGAATTTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTACAAATGGACGGTACCCAAGACAGCCTATAACTGATATGGAATTTCA  150

seq1  TTGTGTTTACAAGATTTGATAAGATGAAGACTCCCACCATGGTCCTAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGTTTACAAGATTTGATAAGATGAAGACTCCCACCATGGTCCTAGGG  200

seq1  TTTCCCTGACTTGAACTTACCACTGGATACAATAAAGGGCTCTCAAATAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCCTGACTTGAACTTACCACTGGATACAATAAAGGGCTCTCAAATAT  250

seq1  TTCAAAGCTTTGAGGGTTTTGTTTATTTTTGTTTTTGTCTTCTTGAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAGCTTTGAGGGTTTTGTTTATTTTTGTTTTTGTCTTCTTGAGAAA  300

seq1  AGAAAAATGGGGTGGGGTGATGGGATTTGAAAGTTGTCAGTAGTCATCCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATGGGGTGGGGTGATGGGATTTGAAAGTTGTCAGTAGTCATCCA  350

seq1  TTAAAAAGGAAGATTTTTCTTTCACCCTACAAGGTAAAGGATGGTGTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAAGGAAGATTTTTCTTTCACCCTACAAGGTAAAGGATGGTGTCCA  400

seq1  TAGCAGAGATTTTTCATATCCCTAAATTTCAATAATGATGAGGTCAAGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAGAGATTTTTCATATCCCTAAATTTCAATAATGATGAGGTCAAGAA  450

seq1  CCTTTCCCTGGATGAAGCTTTCTATGACGGGAAGAATTC  489
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTCCCTGGATGAAGCTTTCTATGACGGGAAGAATTC  489