BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-037H14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 32,589,298 - 32,698,252
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC620104, 1700012A03Rik, Plxna4
Downstream geneChchd3, LOC100039118, Gm1401, Exoc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-037H14.bB6Ng01-037H14.g
ACCDH865325DH865326
length411866
definitionDH865325|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037H14, 5' end.DH865326|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-037H14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,589,298 - 32,589,714)(32,697,385 - 32,698,252)
sequence
attaaacaacccagggtgtcaacctgggagactgagctaaatgccaatag
caccaaagacaggggctggcctagtatttcaaaaatggtgacaactgtgt
gaaggtggctgacaggttagcaggagggggtgaccggtacagagatacac
aggtggctgtggtgagaatagagcctccagatgaggtgtgatgcagtgga
aagagcccttctccaggcctggtggtacaggtctgtggtctcaactgagg
tgagaaagtgatgagttttaggacctgtgtaagctacagagtgagttcaa
ggccagcctgggcaactcagtgagactttatctaaaatagatagatagat
agatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag
gtaggtaggta
gaattccataatcacaaatcacatgtgaagtgaggtaactgggctggcga
gctggcttagcagctaaagggtgcttgttgctcttgcagagaaccaagtt
cagttcctagcattcgtgtctggtggctcacaaccacctgtaactccagc
tccagctctgactctgtcttctggccttagcaggcatccaccaacacaca
ggcacataaatacaaataaatctttaaaaagaaaggaagaaaatgcacag
cgctggctttgtagtgatttttttgttagcgtgggagctccgcttgctct
cacagactactggctcaaggccattgtctgaactccacatcagagaggta
tatattctgggggggggacctccacaactgatctggggggcaatagcctt
gggttctgacagccattctgtcctagctgtgaggcggctgcccaggtcac
ttcctgaccatctccatgcctttgacttcagtgtgagaagagggtagagg
gggtctccaaaagaggggatggacaggatctccaaaggcctgaaagaatg
caggattttcattttttttcttgaatagtaccacgtactatgccaggcag
gggtacgtggagggcacaggatctctgtctgctgcaccattgtccttttt
cccttagctttccatttgactgttcctgagttatgtcctcaataaaaccc
agggcagattctgttagtctttctagtgaggaatcttccagctggagact
gggagcttgttataaataacaagacactccaattagggaaacacaaagaa
ttttaggagttcagctagaaaggagaacaagctgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_32589298_32589714
seq2: B6Ng01-037H14.b_47_463

seq1  GAATTCATTAAACAACCCAGGGTGTCAACCTGGGAGACTGAGCTAAATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAAACAACCCAGGGTGTCAACCTGGGAGACTGAGCTAAATGC  50

seq1  CAATAGCACCAAAGACAGGGGCTGGCCTAGTATTTCAAAAATGGTGACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCACCAAAGACAGGGGCTGGCCTAGTATTTCAAAAATGGTGACAA  100

seq1  CTGTGTGAAGGTGGCTGACAGGTTAGCAGGAGGGGGTGACCGGTACAGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTGAAGGTGGCTGACAGGTTAGCAGGAGGGGGTGACCGGTACAGAG  150

seq1  ATACACAGGTGGCTGTGGTGAGAATAGAGCCTCCAGATGAGGTGTGATGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACAGGTGGCTGTGGTGAGAATAGAGCCTCCAGATGAGGTGTGATGC  200

seq1  AGTGGAAAGAGCCCTTCTCCAGGCCTGGTGGTACAGGTCTGTGGTCTCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAAGAGCCCTTCTCCAGGCCTGGTGGTACAGGTCTGTGGTCTCAA  250

seq1  CTGAGGTGAGAAAGTGATGAGTTTTAGGACCTGTGTAAGCTACAGAGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTGAGAAAGTGATGAGTTTTAGGACCTGTGTAAGCTACAGAGTGA  300

seq1  GTTCAAGGCCAGCCTGGGCAACTCAGTGAGACTTTATCTAAAATAGATAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAAGGCCAGCCTGGGCAACTCAGTGAGACTTTATCTAAAATAGATAG  350

seq1  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGAT  400

seq1  AGATAGGTAGGTAGGTA  417
      |||||||||||||||||
seq2  AGATAGGTAGGTAGGTA  417

seq1: chr6_32697385_32698252
seq2: B6Ng01-037H14.g_68_933 (reverse)

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACACAGCCTTGTTCTCCTTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACACAG-CTTGTTCTCCTTTC  49

seq1  TTAGCTGAACTCCTAAAATTCTTTGTGTTT-CCTAATTGGAGTGTCTTGT  99
       ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  -TAGCTGAACTCCTAAAATTCTTTGTGTTTCCCTAATTGGAGTGTCTTGT  98

seq1  TATTTATAACAAGCTCCCAGTCTCCAGCTGGAAGATTCCTCACTAGAAAG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTATAACAAGCTCCCAGTCTCCAGCTGGAAGATTCCTCACTAGAAAG  148

seq1  ACTCACAGAACTCTGCCCTGGGTTTTATTGAGGACATAACTCAGGAACAG  199
      ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAACAGAA-TCTGCCCTGGGTTTTATTGAGGACATAACTCAGGAACAG  197

seq1  TCAAATGGAAAGCTAAGGGAAAAAGGACAATGGTGCAGCAGACAGAGATC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATGGAAAGCTAAGGGAAAAAGGACAATGGTGCAGCAGACAGAGATC  247

seq1  CTGTGCCCTCCACGTACCCCTGCCTGGCATAGTACGTGGTACTATTCAAG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGCCCTCCACGTACCCCTGCCTGGCATAGTACGTGGTACTATTCAAG  297

seq1  AAAAAAAATGAAAATCCTGCATTCTTTCAGGCCTTTGGAGATCCTGTCCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAATGAAAATCCTGCATTCTTTCAGGCCTTTGGAGATCCTGTCCA  347

seq1  TCCCCTCTTTTGGAGACCCCCTCTACCCTCTTCTCACACTGAAGTCAAAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTCTTTTGGAGACCCCCTCTACCCTCTTCTCACACTGAAGTCAAAG  397

seq1  GCATGGAGATGGTCAGGAAGTGACCTGGGCAGCCGCCTCACAGCTAGGAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGAGATGGTCAGGAAGTGACCTGGGCAGCCGCCTCACAGCTAGGAC  447

seq1  AGAATGGCTGTCAGAACCCAAGGCTATTGCCCCCCAGATCAGTTGTGGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGCTGTCAGAACCCAAGGCTATTGCCCCCCAGATCAGTTGTGGAG  497

seq1  GTCCCCCCCCCAGAATATATACCTCTCTGATGTGGAGTTCAGACAATGGC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCCCCCCAGAATATATACCTCTCTGATGTGGAGTTCAGACAATGGC  547

seq1  CTTGAGCCAGTAGTCTGTGAGAGCAAGCGGAGCTCCCACGCTAACAAAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGCCAGTAGTCTGTGAGAGCAAGCGGAGCTCCCACGCTAACAAAAA  597

seq1  AATCACTACAAAGCCAGCGCTGTGCATTTTCTTCCTTTCTTTTTAAAGAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTACAAAGCCAGCGCTGTGCATTTTCTTCCTTTCTTTTTAAAGAT  647

seq1  TTATTTGTATTTATGTGCCTGTGTGTTGGTGGATGCCTGCTAAGGCCAGA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGTATTTATGTGCCTGTGTGTTGGTGGATGCCTGCTAAGGCCAGA  697

seq1  AGACAGAGTCAGAGCTGGAGCTGGAGTTACAGGTGGTTGTGAGCCACCAG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGAGTCAGAGCTGGAGCTGGAGTTACAGGTGGTTGTGAGCCACCAG  747

seq1  ACACGAATGCTAGGAACTGAACTTGGTTCTCTGCAAGAGCAACAAGCACC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACGAATGCTAGGAACTGAACTTGGTTCTCTGCAAGAGCAACAAGCACC  797

seq1  CTTTAGCTGCTAAGCCAGCTCGCCAGCCCAGTTACCTCACTTCACATGTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGCTGCTAAGCCAGCTCGCCAGCCCAGTTACCTCACTTCACATGTG  847

seq1  ATTTGTGATTATGGAATTC  868
      |||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTGATTATGGAATTC  866