BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051N18
Chromosome6 (Build37)
Map Location 95,554,316 - 95,678,035
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSuclg2
Upstream geneSlc25a26, Lrig1, LOC625941, EG665865, LOC100043276, LOC100043680, Kbtbd8, LOC435912
Downstream geneLOC665886, LOC545867, C630007B19Rik, LOC100043685, 1700123L14Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051N18.bB6Ng01-051N18.g
ACCDH875380DH875381
length9591,062
definitionDH875380|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N18, 5' end.DH875381|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051N18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,554,316 - 95,555,275)(95,676,973 - 95,678,035)
sequence
gaattctcctgagcacactcacaatgttcagaaaagctggggcaatgcct
gcagcggtggcctgatgcatatgtgatagagtgatgtaaatgactgtaca
aatgttttcctgtgccattgaagtcactgtcacctgcctgaagcctattt
agaactacagaccttttctaaccctacagggtttatgaaagaaaatcacc
agacagtatttacaagataaaagccaaagaaatatttgcatcacaaacta
gactgcattactgtcccaaaaactttagaaaacactgctgtagatactct
aaaaagctcaaagacaggaagcatagagctgcagtatttaccagggctca
agtcatttttacttcttctttagagttttgatatgacctacatactaatg
actatttaaaaccagggggaaaaaaacttttcagatttaaatgaaagatg
gaaagaaaaaaagagaaggcttgttatggtctcagacacagaccattaag
caccagtacctatgtgtatacatgtatactgaagatgagtgctagctcaa
cctagtggcagaaggtcgctgttaaacacagccccacacgccataatacc
accacaggcagtgaaaatttgccacaaatcactcaaataaggaagaaata
ccattttaaaaactgtctgccagatcaactcagattcctgagctgcagag
actccgtgcaaccatccctggcttagcaccacctcttcctatctcagacg
ggtgtagaggaaaagacaaagacaggaataaaacgctgttgctttaaact
tgtggtggtttgaataggtatggaccccatagactcatgtggggcatggc
aatattaggaggcatgcccctgttggagtagatgtggatttgttggagaa
gtgcttcactgtgggggtgggctaggaagtctagtactggtcaagctccc
ccagtgtgg
gaattcagggaggcatagcatcagagctcaggacaggcatactcttaact
atggaataagtttgctccaaactgtgctatgtaggaagattcaaatagag
agtggggtttgaagacatggtctccaaatacatatagatatatactacta
ataattttatattgactatatgatatgatcatcctcaaggtatgatcagt
tattacaatagccaacttcctgcttatcttagtcttttagtatgtctctc
tctctctctctttttttattttttattttttttttggtttttggagacag
ggtttctctgtgtagccctggttgtcctggcactcattctgtagaccagg
ctggcctcaaactcggaaacccacctgcctctgcctcccgagtgctggga
ttaaaggcgtgtgccaccaacacccagcttttagtatgtcttgagtaaat
aatttgttaaaaatcacagccaatttgcaacatcctgggttcaaccccag
caccaaaaccttccagctgtgtggcatcaagagaggccacctcgtggtac
agtcagtactttgcatcagctctcagaataacagcatcaaataaaatcaa
cactgcatctgtccactgaagtgtggcattgtattggaatgcttctttaa
ttcttagtttagcaattttaagatgtcggctttaatcaacagtgaagatg
ttgagtgtagagagctccaactacaatctgaacgcaggacttgtttttga
caggagcttctttcccacgttcggccaggtgctactttctgctttctgtc
cctgtcccccaaacagccctttgtggaaacattcaacaccagattccacc
tccctcttcaccgctctccacggtcctttgaaaggagacaactaccccat
tctaacctgttctccacttgcagctttttgctatccctgtcctcagctat
agctcatgtaggtagagatgctcaatgtttttttccttactctgtactgg
gtccctgagtcctctccaggaacacagtatgaagttctcttggactctac
acaatttggaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_95554316_95555275
seq2: B6Ng01-051N18.b_42_1000

seq1  GAATTCTCCTGAGCACACTCACAATGTTCAGAAAAGCTGGGGCAATGCCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCTGAGCACACTCACAATGTTCAGAAAAGCTGGGGCAATGCCT  50

seq1  GCAGCGGTGGCCTGATGCATATGTGATAGAGTGATGTAAATGACTGTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCGGTGGCCTGATGCATATGTGATAGAGTGATGTAAATGACTGTACA  100

seq1  AATGTTTTCCTGTGCCATTGAAGTCACTGTCACCTGCCTGAAGCCTATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTTTCCTGTGCCATTGAAGTCACTGTCACCTGCCTGAAGCCTATTT  150

seq1  AGAACTACAGACCTTTTCTAACCCTACAGGGTTTATGAAAGAAAATCACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACTACAGACCTTTTCTAACCCTACAGGGTTTATGAAAGAAAATCACC  200

seq1  AGACAGTATTTACAAGATAAAAGCCAAAGAAATATTTGCATCACAAACTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAGTATTTACAAGATAAAAGCCAAAGAAATATTTGCATCACAAACTA  250

seq1  GACTGCATTACTGTCCCAAAAACTTTAGAAAACACTGCTGTAGATACTCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCATTACTGTCCCAAAAACTTTAGAAAACACTGCTGTAGATACTCT  300

seq1  AAAAAGCTCAAAGACAGGAAGCATAGAGCTGCAGTATTTACCAGGGCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCTCAAAGACAGGAAGCATAGAGCTGCAGTATTTACCAGGGCTCA  350

seq1  AGTCATTTTTACTTCTTCTTTAGAGTTTTGATATGACCTACATACTAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTTTTACTTCTTCTTTAGAGTTTTGATATGACCTACATACTAATG  400

seq1  ACTATTTAAAACCAGGGGGAAAAAAACTTTTCAGATTTAAATGAAAGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTAAAACCAGGGGGAAAAAAACTTTTCAGATTTAAATGAAAGATG  450

seq1  GAAAGAAAAAAAGAGAAGGCTTGTTATGGTCTCAGACACAGACCATTAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAAAAAGAGAAGGCTTGTTATGGTCTCAGACACAGACCATTAAG  500

seq1  CACCAGTACCTATGTGTATACATGTATACTGAAGATGAGTGCTAGCTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGTACCTATGTGTATACATGTATACTGAAGATGAGTGCTAGCTCAA  550

seq1  CCTAGTGGCAGAAGGTCGCTGTTAAACACAGCCCCACACGCCATAATACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTGGCAGAAGGTCGCTGTTAAACACAGCCCCACACGCCATAATACC  600

seq1  ACCACAGGCAGTGAAAATTTGCCACAAATCACTCAAATAAGGAAGAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAGGCAGTGAAAATTTGCCACAAATCACTCAAATAAGGAAGAAATA  650

seq1  CCATTTTAAAAACTGTCTGCCAGATCAACTCAGATTCCTGAGCTGCAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTTTAAAAACTGTCTGCCAGATCAACTCAGATTCCTGAGCTGCAGAG  700

seq1  ACTCCGTGCAACCATCCCTGGCTTAGCACCACCTCTTCCTATCTCAGACG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCGTGCAACCATCCCTGGCTTAGCACCACCTCTTCCTATCTCAGACG  750

seq1  GGTGTAGAGGAAAAGACAAAGACAGGAATAAAACGCTGTTGCTTTAAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTAGAGGAAAAGACAAAGACAGGAATAAAACGCTGTTGCTTTAAACT  800

seq1  TGTGGTGGTTTGAATAGGTATGGACCCCATAGACTCATGTGGGGCATGGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTGGTTTGAATAGGTATGGACCCCATAGACTCATGTGGGGCATGGC  850

seq1  AATATTAGGAGGCATGCCCCTGTTGGAGTAGATGTGGATTTGTTGGAGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AATATTAGGAGGCATGCCCCTGTTGGAGTAGATGTGGATTTGTTGGA-GA  899

seq1  AGTGCTTCACTGTGGGGGTGGGCTAGGAGGTCTAGTACTGCTCAAGCTCC  950
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||
seq2  AGTGCTTCACTGTGGGGGTGGGCTAGGAAGTCTAGTACTGGTCAAGCTCC  949

seq1  CCCAGTGTGG  960
      ||||||||||
seq2  CCCAGTGTGG  959

seq1: chr6_95676973_95678035
seq2: B6Ng01-051N18.g_68_1129 (reverse)

seq1  TTTCCTAATTGTGGTGAGCTCAAGAGAAACTCATACTGTG-TCCTGGAGA  49
      ||||| |||||||  |||  ||||||||  |||||||||| |||||||||
seq2  TTTCCAAATTGTGTAGAGTCCAAGAGAACTTCATACTGTGTTCCTGGAGA  50

seq1  GGACTCAAGGGACACAAGTTACAGAGTAAGGAGAAAAAACATAGAGCATC  99
      |||||| |||||| ||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2  GGACTC-AGGGACCCA--GTACAGAGTAAGGA-AAAAAACATTGAGCATC  96

seq1  TCTTACCTACATGAGCTATAGCTGAGGACAGGGATAGCAAAAAGCTGCAA  149
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TC-TACCTACATGAGCTATAGCTGAGGACAGGGATAGCAAAAAGCTGCAA  145

seq1  GTGGAGAACAGGGTAGAATGGGGTAGTGGTCTCCTCTC-AAGGACCGTGG  198
      |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||
seq2  GTGGAGAACAGGTTAGAATGGGGTAGTTGTCTCCTTTCAAAGGACCGTGG  195

seq1  AGAGCGGTGAAGAGGGAGGTGGAATCTGGTGTTGAATGTTTCCACAAAGG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCGGTGAAGAGGGAGGTGGAATCTGGTGTTGAATGTTTCCACAAAGG  245

seq1  GCTG-TTGGGGGACAGGGACAGAAAGCAGAAAGTAGCACCTGGCCGAACG  297
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTTGGGGGACAGGGACAGAAAGCAGAAAGTAGCACCTGGCCGAACG  295

seq1  TGGGAAAGAAGCTCCTGTCAAAAACAAGTCCTGCGTTCAGATTGTAGTTG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAAGAAGCTCCTGTCAAAAACAAGTCCTGCGTTCAGATTGTAGTTG  345

seq1  GAGCTCTCTACACTCAACATCTTCACTGTTGATTAAAGCCGACATCTT-A  396
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GAGCTCTCTACACTCAACATCTTCACTGTTGATTAAAGCCGACATCTTAA  395

seq1  AATTGCTAAACTAAGAATTAAAGAAGCATTCCAATACAATGCCACACTTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCTAAACTAAGAATTAAAGAAGCATTCCAATACAATGCCACACTTC  445

seq1  AGTGGACAGATGCAGTGTTGATTTTATTTGATGCTGTTATTCTGAGAGCT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGACAGATGCAGTGTTGATTTTATTTGATGCTGTTATTCTGAGAGCT  495

seq1  GATGCAAAGTACTGACTGTACCACGAGGTGGCCTCTCTTGATGCCACACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCAAAGTACTGACTGTACCACGAGGTGGCCTCTCTTGATGCCACACA  545

seq1  GCTGGAAGGTTTTGGTGCTGGGGTTGAACCCAGGATGTTGCAAATTGGCT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAGGTTTTGGTGCTGGGGTTGAACCCAGGATGTTGCAAATTGGCT  595

seq1  GTGATTTTTAACAAATTATTTACTCAAGACATACTAAAAGCTGGGTGTTG  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATTTTTAACAAATTATTTACTCAAGACATACTAAAAGCTGGGTGTTG  645

seq1  GTGGCACACGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGGTT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCACACGCCTTTAATCCCAGCACTCGGGAGGCAGAGGCAGGTGGGTT  695

seq1  TCCGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAATGAGTGCCAGGACAACCAG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGAGTTTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGAATGAGTGCCAGGACAACCAG  745

seq1  GGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCCAAAAACCAAAAAAAAAATAAAAAAT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTACACAGAGAAACCCTGTCTCCAAAAACCAAAAAAAAAATAAAAAAT  795

seq1  AAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGACATACTAAAAGACTAAGATAAGCAGGA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGACATACTAAAAGACTAAGATAAGCAGGA  845

seq1  AGTTGGCTATTGTAATAACTGATCATACCTTGAGGATGATCATATCATAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGGCTATTGTAATAACTGATCATACCTTGAGGATGATCATATCATAT  895

seq1  AGTCAATATAAAATTATTAGTAGTATATATCTATATGTATTTGGAGACCA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAATATAAAATTATTAGTAGTATATATCTATATGTATTTGGAGACCA  945

seq1  TGTCTTCAAACCCCACTCTCTATTTGAATCTTCCTACATAGCACAGTTTG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTCAAACCCCACTCTCTATTTGAATCTTCCTACATAGCACAGTTTG  995

seq1  GAGCAAACTTATTCCATAGTTAAGAGTATGCCTGTCCTGAGCTCTGATGC  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAAACTTATTCCATAGTTAAGAGTATGCCTGTCCTGAGCTCTGATGC  1045

seq1  TATGCCTCCCTGAATTC  1063
      |||||||||||||||||
seq2  TATGCCTCCCTGAATTC  1062