BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-054D15
Chromosome6 (Build37)
Map Location 18,586,115 - 18,729,425
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCapza2, St7, Wnt2, Asz1, LOC386426, LOC636450, LOC100040751, Cftr, Cttnbp2
Downstream geneEG545829, Lsm8, Ankrd7, LOC626180, Eif3s6-ps4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-054D15.bB6Ng01-054D15.g
ACCDH877032DH877033
length1,1151,116
definitionDH877032|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054D15, 5' end.DH877033|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-054D15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,728,301 - 18,729,425)(18,586,115 - 18,587,235)
sequence
gaattccttaactgttgtccatgttagatttgactatcaactagagttac
tggggaagaaagccttaattacccagatcagattagcctgtgggcatatc
tgggtgtgtagagaaaatgtcttgattgttatctaatgtaggaggataca
ccatggtgggaccataatggctcaggactatgaaggaaaggtcaagagag
cttcaaccctcagatacctcagatgagacaggagttagctacaccccctc
ccaatctttgactttataaagtcacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacatatcttacagcaccagtgtatgcagatgaagcatcttc
caacacccctatcctggtcaatacacatttagccacacaaaccttgctac
agataccctaggccacttcctctggggcataagtatccctttcccctaag
ccaatgaactgaaacagttttttgtagttgtttcatgatgtgtttattgc
ctaaggactcacatctactgagatcctacacaccattcaccatgtctgtt
taaacaagcttccctccctttaacccatctcagtgcacaatgggcctggc
tatctcatggtagaagctgacaatgttggaaaactctgatattaaaatct
gaacgtgactggacagctgcctgaacccaatacaaaatgtagcactccgt
tttccagtagggcttcttctctctctgacctcatctggggagcctgagtc
ccacatcctctagcattctctaagcaggtgctcttgtcttaaagagaaag
ctagttttaatcacagaaatgggatgaaaccagaacagttatttcaggtc
attttgacttatacataaatttgttcactcccctgtttgacacctaagtt
ggttccacaacttagctattgaaaacagtgctgcagtaaatattgatgtg
caagtatctctgtgatagataaacagacaaacttttatttcaaaatgttt
gatatgaaaaatataaacagaaaagatgtctacagaataaagtgtatagg
aaaatctatgtagtgaacacaaagcttcagcattgtttttaaacatttaa
gaatttaaggtggca
gaattctaagtttactatgttgaactagccatgagatttctagctcctat
ccagtaaaatactgcaagaaagcattcaagaccctccacactattgcagg
gacaaatctggttatggggcaccagagactctccaggagacaagtttcca
tgaaactttttgcctcagaactgcggccaagcttttggacttgccacaca
tacttcactggagtgggtgtggcactcagggagtgtgatcagagaagaag
gaaagaaagagagcagagaggtgctatgcagtgctgtcttctgaagatta
caagacactggcactgtgttatgttagccattcatttccagcaaatgacc
tcacagcaatgtacatggggacagcactaatttgacttacctaaactgat
aagagatgacatgaagttaggagggggaaactggatgagatgggagagtt
taaggatgaaagtgtcagcgcatattatcatatttctttatatatatgca
tatgtattaaatgctcaaagaataaaatgtataataaaatgtttctaaaa
ctgaatttaaacttgattgtttctccatgtgacaaacatagctaaagagg
taaacagttattccctatcgggggataagggaaagagtggccaactctaa
tccatttatatctttaaccaactttaatcttgtaccaatttctttcacac
taatatgatatagtttgaaagtctctcccaaattcatgatgaaatctaat
gcccaatgtaagtgtgatagcaggtaaaatctttgagagacattaggcca
ttaaggcttcctcttcaggagtgggactgctgttattttaaaaggagaat
ctcacctgccaccttgtttactcttgacctcccttctgcttttcacaatg
ggatgacacagtaagatgatccctgccagatgcttttttccaccttccat
aatcatgagccaataaactttatctattataatgacagctagtacttact
tttaccgtaacataaatgatctagacataagtaaattgcaagatgatatt
caactcattctaacttgttgtctatgagactttgaaaagtttcaagctga
attacttgattttttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_18728301_18729425
seq2: B6Ng01-054D15.b_47_1161 (reverse)

seq1  TGCCACCTTAAATTTCTTTAAATGTTTAAAAAACATTGCTGAAGCTTTGT  50
      ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||
seq2  TGCCACCTTAAATT--CTTAAATGTTT-AAAAACAATGCTGAAGCTTTGT  47

seq1  GTTCCACTACATAGATTTTCCTATACACTTTATTCCTGTAGACATCTGTA  100
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | 
seq2  GTT-CACTACATAGATTTTCCTATACACTTTATT-CTGTAGACATCT-TT  94

seq1  TCTGTTTATATTTTTCATATCAAACCTTTTGAAATAAAAGTTTGTCTGTT  150
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTATATTTTTCATATCAAACATTTTGAAATAAAAGTTTGTCTGTT  144

seq1  TATCTATCACAGAGATACTTGCACATCAATATTTACTGCAGCACTGTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCACAGAGATACTTGCACATCAATATTTACTGCAGCACTGTTTT  194

seq1  CAATAGCTAAGTTGTGGAACCAACTTAGGTGTCAAACAGGGGAGTGAACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGCTAAGTTGTGGAACCAACTTAGGTGTCAAACAGGGGAGTGAACA  244

seq1  AATTTATGTATAAGTCAAAATGACCTGAAATAACTGTTCTGGTTTCATCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATGTATAAGTCAAAATGACCTGAAATAACTGTTCTGGTTTCATCC  294

seq1  CATTTCTGTGATTAAAACTAGCTTTCTCTTTAAGACAAGAGCACCTGCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTGTGATTAAAACTAGCTTTCTCTTTAAGACAAGAGCACCTGCTT  344

seq1  AGAGAATGCTAGAGGATGTGGGACTCAGGCTCCCCAGATGAGGTCAGAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAATGCTAGAGGATGTGGGACTCAGGCTCCCCAGATGAGGTCAGAGA  394

seq1  GAGAAGAAGCCCTACTGGAAAACGGAGTGCTACATTTTGTATTGGGTTCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAGAAGCCCTACTGGAAAACGGAGTGCTACATTTTGTATTGGGTTCA  444

seq1  GGCAGCTGTCCAGTCACGTTCAGATTTTAATATCAGAGTTTTCCAACATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTGTCCAGTCACGTTCAGATTTTAATATCAGAGTTTTCCAACATT  494

seq1  GTCAGCTTCTACCATGAGATAGCCAGGCCCATTGTGCACTGAGATGGGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGCTTCTACCATGAGATAGCCAGGCCCATTGTGCACTGAGATGGGTT  544

seq1  AAAGGGAGGGAAGCTTGTTTAAACAGACATGGTGAATGGTGTGTAGGATC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGAGGGAAGCTTGTTTAAACAGACATGGTGAATGGTGTGTAGGATC  594

seq1  TCAGTAGATGTGAGTCCTTAGGCAATAAACACATCATGAAACAACTACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGATGTGAGTCCTTAGGCAATAAACACATCATGAAACAACTACAA  644

seq1  AAAACTGTTTCAGTTCATTGGCTTAGGGGAAAGGGATACTTATGCCCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTGTTTCAGTTCATTGGCTTAGGGGAAAGGGATACTTATGCCCCAG  694

seq1  AGGAAGTGGCCTAGGGTATCTGTAGCAAGGTTTGTGTGGCTAAATGTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTGGCCTAGGGTATCTGTAGCAAGGTTTGTGTGGCTAAATGTGTA  744

seq1  TTGACCAGGATAGGGGTGTTGGAAGATGCTTCATCTGCATACACTGGTGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACCAGGATAGGGGTGTTGGAAGATGCTTCATCTGCATACACTGGTGC  794

seq1  TGTAAGATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  850
      |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAGATA----TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  840

seq1  GTGACTTTATAAAGTCAAAGATTGGGAGGGGGTGTAGCTAACTCCTGTCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACTTTATAAAGTCAAAGATTGGGAGGGGGTGTAGCTAACTCCTGTCT  890

seq1  CATCTGAGGTATCTGAGGGTTGAAGCTCTCTTGACCTTTCCTTCATAGTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTGAGGTATCTGAGGGTTGAAGCTCTCTTGACCTTTCCTTCATAGTC  940

seq1  CTGAGCCATTATGGTCCCACCATGGTGTATCCTCCTACATTAGATAACAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCCATTATGGTCCCACCATGGTGTATCCTCCTACATTAGATAACAA  990

seq1  TCAAGACATTTTCTCTACACACCCAGATATGCCCACAGGCTAATCTGATC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGACATTTTCTCTACACACCCAGATATGCCCACAGGCTAATCTGATC  1040

seq1  TGGGTAATTAAGGCTTTCTTCCCCAGTAACTCTAGTTGATAGTCAAATCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAATTAAGGCTTTCTTCCCCAGTAACTCTAGTTGATAGTCAAATCT  1090

seq1  AACATGGACAACAGTTAAGGAATTC  1125
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGGACAACAGTTAAGGAATTC  1115

seq1: chr6_18586115_18587235
seq2: B6Ng01-054D15.g_67_1182

seq1  GAATTCTAAGTTTACTATGTTGAACTAGCCATGAGATTTCTAGCTCCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGTTTACTATGTTGAACTAGCCATGAGATTTCTAGCTCCTAT  50

seq1  CCAGTAAAATACTGCAAGAAAGCATTCAAGACCCTCCACACTATTGCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTAAAATACTGCAAGAAAGCATTCAAGACCCTCCACACTATTGCAGG  100

seq1  GACAAATCTGGTTATGGGGCACCAGAGACTCTCCAGGAGACAAGTTTCCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAATCTGGTTATGGGGCACCAGAGACTCTCCAGGAGACAAGTTTCCA  150

seq1  TGAAACTTTTTGCCTCAGAACTGCGGCCAAGCTTTTGGACTTGCCACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTTTTTGCCTCAGAACTGCGGCCAAGCTTTTGGACTTGCCACACA  200

seq1  TACTTCACTGGAGTGGGTGTGGCACTCAGGGAGTGTGATCAGAGAAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCACTGGAGTGGGTGTGGCACTCAGGGAGTGTGATCAGAGAAGAAG  250

seq1  GAAAGAAAGAGAGCAGAGAGGTGCTATGCAGTGCTGTCTTCTGAAGATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAAGAGAGCAGAGAGGTGCTATGCAGTGCTGTCTTCTGAAGATTA  300

seq1  CAAGACACTGGCACTGTGTTATGTTAGCCATTCATTTCCAGCAAATGACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACACTGGCACTGTGTTATGTTAGCCATTCATTTCCAGCAAATGACC  350

seq1  TCACAGCAATGTACATGGGGACAGCACTAATTTGACTTACCTAAACTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGCAATGTACATGGGGACAGCACTAATTTGACTTACCTAAACTGAT  400

seq1  AAGAGATGACATGAAGTTAGGAGGGGGAAACTGGATGAGATGGGAGAGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATGACATGAAGTTAGGAGGGGGAAACTGGATGAGATGGGAGAGTT  450

seq1  TAAGGATGAAAGTGTCAGCGCATATTATCATATTTCTTTATATATATGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGATGAAAGTGTCAGCGCATATTATCATATTTCTTTATATATATGCA  500

seq1  TATGTATTAAATGCTCAAAGAATAAAATGTATAATAAAATGTTTCTAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATTAAATGCTCAAAGAATAAAATGTATAATAAAATGTTTCTAAAA  550

seq1  CTGAATTTAAACTTGATTGTTTCTCCATGTGACAAACATAGCTAAAGAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAATTTAAACTTGATTGTTTCTCCATGTGACAAACATAGCTAAAGAGG  600

seq1  TAAACAGTTATTCCCTATCGGGGGATAAGGGAAAGAGTGGCCAACTCTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGTTATTCCCTATCGGGGGATAAGGGAAAGAGTGGCCAACTCTAA  650

seq1  TCCATTTATATCTTTAACCAACTTTAATCTTGTACCAATTTCTTTCACAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTATATCTTTAACCAACTTTAATCTTGTACCAATTTCTTTCACAC  700

seq1  TAATATGATATAGTTTGAAAGTCTCTCCCAAATTCATGATGAAATCTAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATGATATAGTTTGAAAGTCTCTCCCAAATTCATGATGAAATCTAAT  750

seq1  GCCCAATGTAAGTGTGATAGCAGGTAAAATCTTTGAGAGACATTAGGCCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAATGTAAGTGTGATAGCAGGTAAAATCTTTGAGAGACATTAGGCCA  800

seq1  TTAAGGCTTCCTCTTCAGGAGTGGGACTGCTGTTATTTTAAAAGGAGAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCTTCCTCTTCAGGAGTGGGACTGCTGTTATTTTAAAAGGAGAAT  850

seq1  CTCACCTGCCACCTTGTTTACTCTTGACCTCCCTTCTGCTTTTCACAATG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCTGCCACCTTGTTTACTCTTGACCTCCCTTCTGCTTTTCACAATG  900

seq1  GGATGACACAGTAAGATGATCCCTGCCAGATGC-TCTTTCCAACCTCCAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||
seq2  GGATGACACAGTAAGATGATCCCTGCCAGATGCTTTTTTCCACCTTCCAT  950

seq1  AATCATGAGCCAATAAACTTTATCTATTATAAATGACAGCTAGTTACATA  999
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||
seq2  AATCATGAGCCAATAAACTTTATCTATTAT-AATGACAGCTAG-TACTTA  998

seq1  CTTTTACCGTAACATAAATGATCTAAGACATAAGTAAAATGCAAGATGAT  1049
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTTTTACCGTAACATAAATGATCT-AGACATAAGTAAATTGCAAGATGAT  1047

seq1  ATTCAACTCATGTCTAAC-TGTTGTCTA-GAGACTTTGAGAAAGTTTCAA  1097
      ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  ATTCAACTCAT-TCTAACTTGTTGTCTATGAGACTTTGA-AAAGTTTCAA  1095

seq1  GCATGACATTACTTGGATTTTTTT  1121
      || ||| ||||||| |||||||||
seq2  GC-TGA-ATTACTT-GATTTTTTT  1116