BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-081L18
Chromosome6 (Build37)
Map Location 74,589,821 - 74,699,644
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneEG668132, LOC668136, LOC621306, LOC100042942, LOC668143
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-081L18.bB6Ng01-081L18.g
ACCDH896495DH896496
length6381,132
definitionDH896495|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-081L18, 5' end.DH896496|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-081L18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,589,821 - 74,590,458)(74,698,508 - 74,699,644)
sequence
gaattctcttgtttttaaaataagcatttgtacaataatggtcccttaac
agtactcaaacaaaaccatcctgaattaacactacgttgagctgtttatg
cattaaaccaactgtttatttcagtaaaccaatatgaaaactgtgaactc
attgtatatgaattaaaatatcatcccaaatgaggtaaatcagattcaaa
aggacatgtactcactaataagtggatattaggggggaaaggtgctgaat
acacaagatacaacccacagaaccccaaaaaaatgtcatcaagctgaagg
gccccagtaaggatgcctcagtcccaatagggagggagaagaaagcaacc
acagcgagggaggggggacctgggagggaaaaagggtggggagggcagag
ggaggaacatgatcaggtattgggtgaagaaaaagtagtgaaatctcttt
gggtcaacagaaagaatggaaacatgcactcttgggaggtaagaggttga
ggggaccctctagaatgtaacagagacctgagcagtgagagactctcagg
actaaaagggagggaacttagatgaaatgctctacattggggagaggaaa
tatgtagaggccacctctagcagaaagacagggcatcc
gaattcaaactatgcaacttccttagatacagcaaccaaatcacaaaaca
ggtgaagcaatttcttatacttgagttaccattatcataattagtgctgt
atataatcaggaaaattaagctaatggaaaaaattcagctaacatcttat
ggatattagaaatgaaaggcttccttatctttgttagtaactgtgatata
cctcagattaagtgaaagcagactcagggtccaatttcctccctatctca
cctaagtgggagtatatatctatatttaatccccagaatctactcatttt
ttcacaattttcctacattaattgatgaaagggaattttttgataaatat
gtatattacaggtataaactctgagtagtgaagaaacatataatagtttg
tgttatatattagagttatatatatatgtacatatacatattaatataat
atgcaatataagatgtatatatatatatatgccacaatcataaaaattga
aatgtccattgcctcatgtgaatacttttttcacatgtaatgaaatcata
gaagatttacatgcctagacatgtaaaacaaacaatacaatagtgttaaa
tacattctgaagtttttaccttcataactgatctatttttcataaatgta
aggttttgacttctggataacttatattacagtcccttattctaggcctt
gctcatcagcatccacttcatttctatgaggctgatatttttagtaagta
taatataaagtgttcatctatccaacactgactgattcttcctagcatac
tgacctctggagctctacataaaatatgttatctacagacaggaagctag
gtactttctgtagccttatagccttatttgttttctaataaagttgaaag
aacacaagagaacatttaatctgctggggataattatttcatttactttg
ttgatgcctatcatatgggatttaagtagtctctgatggttgataaagtt
tcatactttctatatacttgttgacattcaaatatcctgtttgagaacat
gcttaataatcatttttccttttacatagttttctgttgagtggcattag
gtggcataacctagatgtccaatagttatcag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_74589821_74590458
seq2: B6Ng01-081L18.b_42_679

seq1  GAATTCTCTTGTTTTTAAAATAAGCATTTGAACAATAATGGTCCCTTAAC  50
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTGTTTTTAAAATAAGCATTTGTACAATAATGGTCCCTTAAC  50

seq1  AGTACTCAAACAAAACCATCCTGAATTAACACTACGTTGAGCTGTTTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCAAACAAAACCATCCTGAATTAACACTACGTTGAGCTGTTTATG  100

seq1  CATTAAACCAACTGTTTATTTCAGTAAACCAATATGAAAACTGTGAACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAAACCAACTGTTTATTTCAGTAAACCAATATGAAAACTGTGAACTC  150

seq1  ATTGTATATGAATTAAAATATCATCCCAAATGAGGTAAATCAGATTCAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATATGAATTAAAATATCATCCCAAATGAGGTAAATCAGATTCAAA  200

seq1  AGGACATGTACTCACTAATAAGTGGATATTAGGGGGGAAAGGTGCTGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACATGTACTCACTAATAAGTGGATATTAGGGGGGAAAGGTGCTGAAT  250

seq1  ACACAAGATACAACCCACAGAACCCCAAAAAAATGTCATCAAGCTGAAGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAGATACAACCCACAGAACCCCAAAAAAATGTCATCAAGCTGAAGG  300

seq1  GCCCCAGTAAGGATGCCTCAGTCCCAATAGGGAGGGAGAAGAAAGCAACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCAGTAAGGATGCCTCAGTCCCAATAGGGAGGGAGAAGAAAGCAACC  350

seq1  ACAGCGAGGGAGGGGGGACCTGGGAGGGAAAAAGGGTGGGGAGGGCAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCGAGGGAGGGGGGACCTGGGAGGGAAAAAGGGTGGGGAGGGCAGAG  400

seq1  GGAGGAACATGATCAGGTATTGGGTGAAGAAAAAGTAGTGAAATCTCTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAACATGATCAGGTATTGGGTGAAGAAAAAGTAGTGAAATCTCTTT  450

seq1  GGGTCAACAGAAAGAATGGAAACATGCACTCTTGGGAGGTAAGAGGTTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCAACAGAAAGAATGGAAACATGCACTCTTGGGAGGTAAGAGGTTGA  500

seq1  GGGGACCCTCTAGAATGTAACAGAGACCTGAGCAGTGAGAGACTCTCAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGACCCTCTAGAATGTAACAGAGACCTGAGCAGTGAGAGACTCTCAGG  550

seq1  ACTAAAAGGGAGGGAACTTAGATGAAATGCTCTACATTGGGGAGAGGAAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAAGGGAGGGAACTTAGATGAAATGCTCTACATTGGGGAGAGGAAA  600

seq1  TATGTAGAGGCCACCTCTAGCAGAAAGACAGGGCATCC  638
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTAGAGGCCACCTCTAGCAGAAAGACAGGGCATCC  638

seq1: chr6_74698508_74699644
seq2: B6Ng01-081L18.g_69_1200 (reverse)

seq1  CTGATAAATTATTGACATCTAAAGTGTATG-CAACTAATGCCACTCAACA  49
      ||||||| |  | |||||||  ||  |||| || ||||||||||||||||
seq2  CTGATAACTATTGGACATCT--AGGTTATGCCACCTAATGCCACTCAACA  48

seq1  GAAAACTATGTTAAAAAGGAAAATGATTTATTAAGCATG-TCTCAAACAG  98
      |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAAACTATG-TAAAAGGAAAAATGA-TTATTAAGCATGTTCTCAAACAG  96

seq1  GATATTTGAATGGTCAACAAGTATATAGGAAGTATGAAACTTTATCAACC  148
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTGAAT-GTCAACAAGTATATAGAAAGTATGAAACTTTATCAACC  145

seq1  ATCAGAGAACTACTTAAATTCCATATTGATAGGCATCAACAAAGTAAATG  198
      ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAG-ACTACTTAAATCCCATA-TGATAGGCATCAACAAAGTAAATG  193

seq1  AAATAATTATCCCCAGCAGATTAAATGTTCTCTTGTGTTTCTTTCAACTT  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATAATTATCCCCAGCAGATTAAATGTTCTCTTGTG-TTCTTTCAACTT  242

seq1  TATTAGAAAAC-AATAAGGCTATAAGGCTACAGAAAGTACCTAGCTTCCT  297
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAGAAAACAAATAAGGCTATAAGGCTACAGAAAGTACCTAGCTTCCT  292

seq1  GTCTGTAGATAACATATTTTATGTAGAGCTCCAGAGGTCAGTATGCTAGG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTAGATAACATATTTTATGTAGAGCTCCAGAGGTCAGTATGCTAGG  342

seq1  AAGAATCAGTCAGTGTTGGATAGATGAACACTTTATATTATACTTACTAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATCAGTCAGTGTTGGATAGATGAACACTTTATATTATACTTACTAA  392

seq1  AAATATCAGCCTCATAGAAATGAAGTGGATGCTGATGAGCAAGGCCTAGA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCAGCCTCATAGAAATGAAGTGGATGCTGATGAGCAAGGCCTAGA  442

seq1  ATAAGGGACTGTAATATAAGTTATCCAGAAGTCAAAACCTTACATTTATG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGGACTGTAATATAAGTTATCCAGAAGTCAAAACCTTACATTTATG  492

seq1  AAAAATAGATCAGTTATGAAGGTAAAAACTTCAGAATGTATTTAACACTA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGATCAGTTATGAAGGTAAAAACTTCAGAATGTATTTAACACTA  542

seq1  TTGTATTGTTTGTTTTACATGTCTAGGCATGTAAATCTTCTATGATTTCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTGTTTGTTTTACATGTCTAGGCATGTAAATCTTCTATGATTTCA  592

seq1  TTACATGTGAAAAAAGTATTCACATGAGGCAATGGACATTTCAATTTTTA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATGTGAAAAAAGTATTCACATGAGGCAATGGACATTTCAATTTTTA  642

seq1  TGATTGTGGCATATATATATATATACATCTTATATTGCATATTATATTAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTGTGGCATATATATATATATACATCTTATATTGCATATTATATTAA  692

seq1  TATGTATATGTACATATATATATAACTCTAATATATAACACAAACTATTA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATATGTACATATATATATAACTCTAATATATAACACAAACTATTA  742

seq1  TATGTTTCTTCACTACTCAGAGTTTATACCTGTAATATACATATTTATCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTTTCTTCACTACTCAGAGTTTATACCTGTAATATACATATTTATCA  792

seq1  AAAAATTCCCTTTCATCAATTAATGTAGGAAAATTGTGAAAAAATGAGTA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATTCCCTTTCATCAATTAATGTAGGAAAATTGTGAAAAAATGAGTA  842

seq1  GATTCTGGGGATTAAATATAGATATATACTCCCACTTAGGTGAGATAGGG  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTGGGGATTAAATATAGATATATACTCCCACTTAGGTGAGATAGGG  892

seq1  AGGAAATTGGACCCTGAGTCTGCTTTCACTTAATCTGAGGTATATCACAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAATTGGACCCTGAGTCTGCTTTCACTTAATCTGAGGTATATCACAG  942

seq1  TTACTAACAAAGATAAGGAAGCCTTTCATTTCTAATATCCATAAGATGTT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTAACAAAGATAAGGAAGCCTTTCATTTCTAATATCCATAAGATGTT  992

seq1  AGCTGAATTTTTTCCATTAGCTTAATTTTCCTGATTATATACAGCACTAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAATTTTTTCCATTAGCTTAATTTTCCTGATTATATACAGCACTAA  1042

seq1  TTATGATAATGGTAACTCAAGTATAAGAAATTGCTTCACCTGTTTTGTGA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGATAATGGTAACTCAAGTATAAGAAATTGCTTCACCTGTTTTGTGA  1092

seq1  TTTGGTTGCTGTATCTAAGGAAGTTGCATAGTTTGAATTC  1137
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTTGCTGTATCTAAGGAAGTTGCATAGTTTGAATTC  1132