BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-082M07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 32,422,559 - 32,582,853
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlxna4
Upstream geneMkln1, Podxl, EG619959, LOC620104, 1700012A03Rik
Downstream geneChchd3, LOC100039118, Gm1401, Exoc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-082M07.bB6Ng01-082M07.g
ACCDH897228DH897229
length1,033846
definitionDH897228|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082M07, 5' end.DH897229|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-082M07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,422,559 - 32,423,605)(32,582,021 - 32,582,853)
sequence
gaattccttatctgcgaggtgaatgagacccatggccctcaatcacacag
cacggctcagccagctagagcctgccactcaaatgtatgagtatgtccct
ggagatctgatgaaaaaagtgatgcacttgccaactccacctttttctca
acgactcaaatgataatggccatgaatgagacctcattttctgcagggtg
catggaattccactaatacaggcttaccatggtcaaggtcagcagacatt
gtttgtggtccctatgagaaaacatgtttgtcaatcatatctgccttaca
tggggatctttagggagtttctcaggtaaaaatggatctgcttatggaca
aaggtcatcacaagatctcttttctcataaatggagattttgctggggga
aagagtggctggcttgactttagttggaatcaccaatagctgaaccggct
ccagccatctcatccacttcctatgaggatgtaatgtgaagcattaaaga
agtcttcctccgccttttcctccttcttctcatcattatcttctctctat
gtgtccccccacttccaggtcatacctaataacacagactacaacaacag
cccttatatatctatggccttgcttgggtcaagtatcctgacaaatagat
tcctcatctacaacatgaaactcattgcccctacttactatgatatatgc
cacttacgtacatatcatgaatgaatctaggccacttacaaggcatgtag
gtatgtaatggtgcggactgtgctgcttgggtcctccaagctctatgagg
aactcaaggacaaagagaaagttctgaatacatcttccgccttccatctg
acccctccatttgaaattacactcatggctaccgtgcctagcatacagat
ctcatggtacatgaatggaatggatctctctccaaaagtgtatctctgta
ctaatgctatcgatgtcatgacactgatgtctatagaaagagcacttagt
actactagagcaagcgtccagaccttctcaacc
gaattcctgggtagtctgggttacctgatactctgtctccaaaaggtacc
agtttataagcataggaatgtgtcatgatgctgaggtatttccatagcgg
agtggtcaccatgcttaccaacaaatgtgtcccgatgaggtttttgagtg
ttataccttatgcttcattcctcacgtaagaattatggttctcagctcat
aaagttttgcctgatgactatgaggagctttctatgttgcattatagaaa
aactgaatgtaactggggggagggggcccctgagcctcattctaatcagc
tgggagagtcaaatagttctcattatagagagaagggatcttactgaatg
caaatgatggctgatctgaccacacacaaggcgatttctcaccaaacatg
aattacttacaaaaaacacttctaaaagctgcctcctactttaaagaaca
gaaacctgacaatatttcaaataggcatattgggctgatacacagaccac
gttctctctgtatggcatgtcctgagatacattggctgtgttcaaggaca
cacaaagggaaggactggtatgtactcagtctttaatatagaatatgtgg
gcttcaagccttgctttatttggcatccatgccccactgctcctgtacct
ccatgtacctcctgagtcttaccatgtagaagatgcttatctgacacatg
agagacataacagactccctgcttccctgagggatcagagattctgatac
agggagctagacagtaaacgagcacatcaacgtgctctctgtcaacagga
ttactgctctatagaaacacgatgctagaaagaagtcatttgcaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_32422559_32423605
seq2: B6Ng01-082M07.b_43_1075

seq1  GAATTCCTTATCTGCAAGGTGAATGAGACCCGTGGCCCTCAATCACACAG  50
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTATCTGCGAGGTGAATGAGACCCATGGCCCTCAATCACACAG  50

seq1  CACGGCTCAGCCAGCTAGAGCCTGCCACTCAAATGTATGAGTATGTCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGGCTCAGCCAGCTAGAGCCTGCCACTCAAATGTATGAGTATGTCCCT  100

seq1  GGAGATCTGATGAAAAAAGTGATGCACTTGCCAACTCGACCTTTTTCTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GGAGATCTGATGAAAAAAGTGATGCACTTGCCAACTCCACCTTTTTCTCA  150

seq1  GCGACTCAAATGATAATGGCCATGAATGAGACCTCATTTTCTGCAGGGTG  200
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGACTCAAATGATAATGGCCATGAATGAGACCTCATTTTCTGCAGGGTG  200

seq1  CATGGAATTCCACTAATACAGGCTTACCATGGTCAAGGTCAGCAGACATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGAATTCCACTAATACAGGCTTACCATGGTCAAGGTCAGCAGACATT  250

seq1  GTTTGTGGTCCCTATGAGAAAACATGTTTGTCAATCATATCTGCCTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTGGTCCCTATGAGAAAACATGTTTGTCAATCATATCTGCCTTACA  300

seq1  TGGGGATCTTTAGGGAGTTTCTCAGGTAGAAATGGATCTGCTTATGGACA  350
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGATCTTTAGGGAGTTTCTCAGGTAAAAATGGATCTGCTTATGGACA  350

seq1  AAGGTCATCAGAAGATCTCTTTTCTCATAGATGGAGATTTTGCTGGGGGA  400
      |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCATCACAAGATCTCTTTTCTCATAAATGGAGATTTTGCTGGGGGA  400

seq1  AAGAGTGGCTGGCTTGACTTTAGTTGGAATCACCAAGAGCTGAACCAGCT  450
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||
seq2  AAGAGTGGCTGGCTTGACTTTAGTTGGAATCACCAATAGCTGAACCGGCT  450

seq1  CCAGCAATCTCATCCACTTCCTATGAGGATGTAATGTGAAGCATTAGAGA  500
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  CCAGCCATCTCATCCACTTCCTATGAGGATGTAATGTGAAGCATTAAAGA  500

seq1  AGTCTTCCTCCGCCTTTTCCTCCTTCTTCTCATCATTATCTTCTCTCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTTCCTCCGCCTTTTCCTCCTTCTTCTCATCATTATCTTCTCTCTAT  550

seq1  GTGTCCCCCCACTTCCAGGTCATACCTAATAGCACAGACTACAACAACAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCCCCACTTCCAGGTCATACCTAATAACACAGACTACAACAACAG  600

seq1  CCCTTATATATCTATGGCCTTGCTTGGGTCAAGTATCCTGACAAATAGAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTATATATCTATGGCCTTGCTTGGGTCAAGTATCCTGACAAATAGAT  650

seq1  TCCTCATCTACAACATGAAACTCAAGGCCCCTAGTTACTATGATATATGC  700
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCCTCATCTACAACATGAAACTCATTGCCCCTACTTACTATGATATATGC  700

seq1  CACTTAGGTACATATCATGAATGAATCTAGGCCACTTACAAGGCAGGTAG  750
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CACTTACGTACATATCATGAATGAATCTAGGCCACTTACAAGGCATGTAG  750

seq1  GTATGTAATGGTAGGGACTGTGCTGCTTGGGGTCCTCCAAGCTCTATGAG  800
      ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTAATGGTGCGGACTGTGCTGCTT-GGGTCCTCCAAGCTCTATGAG  799

seq1  GAACTCAAGGACAAAAGAGAAAGTTCTGAAAACATCTTCCACCTTCCATC  850
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||
seq2  GAACTCAAGGAC-AAAGAGAAAGTTCTGAATACATCTTCCGCCTTCCATC  848

seq1  TGACCCCTCCATTTGAAATTACACTCATTGGTTCCGTGCCTAGCTTACAG  900
      |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||
seq2  TGACCCCTCCATTTGAAATTACACTCATGGCTACCGTGCCTAGCATACAG  898

seq1  ATCAGATGGTACATGAA-GGAAGGATTCTCTCTCTAAAAGGTATAATCTT  949
      |||  |||||||||||| |||| |  |||||||| |||| || | |||| 
seq2  ATCTCATGGTACATGAATGGAATGGATCTCTCTCCAAAA-GTGT-ATCTC  946

seq1  TGTCCTTAAGGCTTGTCAGTGTCATGACCAAAGGATGTCTATAGAAAGAG  999
      ||| | ||| || | ||  |||||||||  |  |||||||||||||||||
seq2  TGTAC-TAATGC-TATCGATGTCATGAC--ACTGATGTCTATAGAAAGAG  992

seq1  CACTTTGGTTCCTAACTAGAGAAAAGTCATCCAAGGACCTTCTCAACC  1047
      ||||| |  | || ||||||| ||   | ||||  |||||||||||||
seq2  CACTTAG--TACT-ACTAGAGCAA--GCGTCCA--GACCTTCTCAACC  1033

seq1: chr6_32582021_32582853
seq2: B6Ng01-082M07.g_68_900 (reverse)

seq1  TCTTTCTAGCATCGTGTTTCTCTAGAGCAGTAATCCTGTTGACAGAAAGC  50
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TCTTTCTAGCATCGTGTTTCTATAGAGCAGTAATCCTGTTGACAGAGAGC  50

seq1  ACGTTGATCTGCTTGTTTACTGTCTAGCTCCCTGTATCAGAATCTCTGAT  100
      |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTGATGTGCTCGTTTACTGTCTAGCTCCCTGTATCAGAATCTCTGAT  100

seq1  CCCTCAGGGAAGCAGGGAGTCTGTGATGTCTCCCAAGTGTCAGATAAGCA  150
      |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||
seq2  CCCTCAGGGAAGCAGGGAGTCTGTTATGTCTCTCATGTGTCAGATAAGCA  150

seq1  TCTTCTACATGGTAAGACTCAGGAGGTACATGGAGGTACAGGAGCAGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTACATGGTAAGACTCAGGAGGTACATGGAGGTACAGGAGCAGTGG  200

seq1  GGCATGGATGCCAAATAAAGCAAGGCTTGAAGCCCACATATTCTATATTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCATGGATGCCAAATAAAGCAAGGCTTGAAGCCCACATATTCTATATTA  250

seq1  AAGACTGAGTACATACCAGTCCTTCCCTTTGTGTGTCCTTGAACACAGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGACTGAGTACATACCAGTCCTTCCCTTTGTGTGTCCTTGAACACAGCC  300

seq1  AATGTATCCCAGGACATGCCATACAGAGAGAACGTGGTCTGTGTATCAGC  350
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTATCTCAGGACATGCCATACAGAGAGAACGTGGTCTGTGTATCAGC  350

seq1  CCAATATGCCTATTTGAAATATTGTCAGGTTTCTGTTCTTTAAAGTAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATATGCCTATTTGAAATATTGTCAGGTTTCTGTTCTTTAAAGTAGGA  400

seq1  GGCAGCTTTTAGAAGTGTTCTTTGTAAGTAATTCATGTTTGGTGAGAAAT  450
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGCTTTTAGAAGTGTTTTTTGTAAGTAATTCATGTTTGGTGAGAAAT  450

seq1  CGCCTTGTCTGTGGTCAGATCAGCCATCATTTGCATTCAGTAAGATCCCT  500
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCCTTGTGTGTGGTCAGATCAGCCATCATTTGCATTCAGTAAGATCCCT  500

seq1  TCTCTCTATAATGAGAACTATTTGACTCTCCCAGCTGATTAGAATGAGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTATAATGAGAACTATTTGACTCTCCCAGCTGATTAGAATGAGGC  550

seq1  TCAGGGGCCCCCTCCCCCCAGTTACATTCAGTTTTTCTATAATGCAACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGGGCCCCCTCCCCCCAGTTACATTCAGTTTTTCTATAATGCAACAT  600

seq1  AGAAAGCTCCTCATAGTCATCAGGCAAAACTTTATGAGCTGAGAACCATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCTCCTCATAGTCATCAGGCAAAACTTTATGAGCTGAGAACCATA  650

seq1  ATTCTTACGTGAGGAATGAAGCATAAGGTATAACACTCAAAAACCTCATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTTACGTGAGGAATGAAGCATAAGGTATAACACTCAAAAACCTCATC  700

seq1  GGGACACATTTGTTGGTAAGCATGGTGACCACTCCGCTATGGAAATACCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACACATTTGTTGGTAAGCATGGTGACCACTCCGCTATGGAAATACCT  750

seq1  CAGCATCATGACACATTCCTATGCTTATAAACTGGTACCTTTTTGAGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAGCATCATGACACATTCCTATGCTTATAAACTGGTACCTTTTGGAGACA  800

seq1  GAGTATCACGTAACCCAGACTACCCTTGAATTC  833
      |||||||| ||||||||||||||||  ||||||
seq2  GAGTATCAGGTAACCCAGACTACCCAGGAATTC  833