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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-092E03
Chromosome	6 (Build37)
Map Location	109,056,884 - 109,058,050
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Sumf1, LOC100043718, Itpr1, LOC677205, Bhlhb2, Arl8b, Edem1, EG627371
Downstream gene	LOC639110, LOC100043720
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-092E03.b	B6Ng01-092E03.g
ACC	DH904068	DH904069
length	1,189	1,145
definition	DH904068\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092E03, 5' end.	DH904069\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092E03, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctttgttcagttctgagccccattttttaatggggttatttgatt ttctgaagtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtccc ctatctgatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtct ttttgtcttattgacggtgtcttttgccttgcagaaactttggagtttca ttaggtcccatttgtcaattcttgatcttacagcacaagccattgctgtt ctgttcaggaatttttcttctgtgcccatatcttcaaggcttttcccgac tttctcctctataagattcagtgtctctggttttaagtgaagttccttga tccacttaactttgaccttagtacaaggagataagtatggatcaatttgc attcttctacatgataacaaccagttgtgccagcaccaattgttgaagat gctgtctttcttccactggatggttttagctcccttgtcgaagatcaagt gaccataggtgtgtgggttcatttctgggtcttcaattctattccattgg tctacttgtctgtctctataccagtaccatgcagtttttatcacaattcc tctgtagtaaagctttaggtcaggcatggtgattccaccagaggttcttt tatccttgagaagagtttttgctatcctaggttttttgttattccagatg aatttgcaaattgctccttctaattcgttgaagaattgagttggaatttt gatggggattgcattgaatctgtaaattgcttttggcaagatagccattt ttacaatgttgatcctgccaatccatgagcatgggagatccttccatctt ctgagatcttctttaatttctttcttcagagatttgaagtttttatcata cagatctttcacttccttagttagagtcacacgagatattttatattatt tgtgactattgagaaggtgttgtttccctaatttcttctcagcctgatta ttctttgttagagaaggccattgacttggttgagtttatttaaatcagct actcactcgagctggtttatcaaggtctaggaggttcctgggtgaatttt agggaactttattatattcctaatcatctgcaaaaggatatttgattccc ctcttttccattgtatccctctatactctcttgagtgag	gaattcaaatcccagcaacaacatgatggctcacaaccatctgtaatgag atctaatgccctcttctaaggagtctgaagacatctacagtgagcgagta gggccggggtgagaaggaaaagggtctgaagacagctacagtgtacttac acataataaataaataaatctttttaaaaataaaagaaaatatctaataa aacaaaaaataaaaataaaagaaagatgattagaatattccatattatcc ataataaacttaattcaatggctttcagaaaaaaaaagacacatttgcac acatgtacacatacacacaccagtttgttttgatatgccttgactacctt aatgaatggctgggcacttctaatccttctcgtggctagcaaacactccc ctctggtattctggagttaacatcttttaaatctatatttcatcttttct accccagacccaattggggaagtggccactagaaccatttacccaaattt ttccatggctagtccattctatacccctctcactgcaattctcttcttct tctcctctccccaagcctaaatatcctaaaagtcctgcccatccattggc cgctggcatctttatttacctatcagagccaactggggaaagggtccctt agtgtcttaggttcaaacactcttgttagcagtttggctgactgaaatta acattataacacaagcagtattagaccaaacccacttcaacttggttatg aagccatcctctactatacctatggaaacagaagatgtctgacacccaat tgtattttattagtactctgtaattttatgcaccttgattccttcttccc caaaaaagtacaaattcctggaagatgaagatctaagatcttgtgaatcc ttaatactgtttaaatgctatgtacattaattaattaagaacttaaatat ctaatatagaaatgatgtaacacaggtctgaacagatgaaactgtggtta aaacactgttattcttctagaagacctggagttgttccaccatccatctg cagcaataatcgatcaatgttccttctgatttcccgacatctgcggattt cttgtataaaccccaccacccttattaatgaatcttaaaataata
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ATAGTAGAGGATGGCTTCATAACCAAGTTGAAGTGGGTTTGGTCTAATAC 428 seq1 TGCTTGTGTTATAATGTTAATTTCAGTCAGCCAAACTGCTAACAAGAGTG 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCTTGTGTTATAATGTTAATTTCAGTCAGCCAAACTGCTAACAAGAGTG 478 seq1 TTTGAACCTAAGACACTAAGGGACCCTTTCCCCAGTTGGCTCTGATAGGT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTTGAACCTAAGACACTAAGGGACCCTTTCCCCAGTTGGCTCTGATAGGT 528 seq1 AAATAAAGATGCCAGCGGCCAATGGATGGGCAGGACTTTTAGGATATTTA 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAATAAAGATGCCAGCGGCCAATGGATGGGCAGGACTTTTAGGATATTTA 578 seq1 GGCTTGGGGAGAGGAGAAGAAGAAGAGAATTGCAGTGAGAGGGGTATAGA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GGCTTGGGGAGAGGAGAAGAAGAAGAGAATTGCAGTGAGAGGGGTATAGA 628 seq1 ATGGACTAGCCATGGAAAAATTTGGGTAAATGGTTCTAGTGGCCACTTCC 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGGACTAGCCATGGAAAAATTTGGGTAAATGGTTCTAGTGGCCACTTCC 678 seq1 CCAATTGGGTCTGGGGTAGAAAAGATGAAATATAGATTTAAAAGATGTTA 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCAATTGGGTCTGGGGTAGAAAAGATGAAATATAGATTTAAAAGATGTTA 728 seq1 ACTCCAGAATACCAGAGGGGAGTGTTTGCTAGCCACGAGAAGGATTAGAA 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACTCCAGAATACCAGAGGGGAGTGTTTGCTAGCCACGAGAAGGATTAGAA 778 seq1 GTGCCCAGCCATTCATTAAGGTAGTCAAGGCATATCAAAACAAACTGGTG 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGCCCAGCCATTCATTAAGGTAGTCAAGGCATATCAAAACAAACTGGTG 828 seq1 TGTGTATGTGTACATGTGTGCAAATGTGTCTTTTTTTTTCTGAAAGCCAT 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGTATGTGTACATGTGTGCAAATGTGTCTTTTTTTTTCTGAAAGCCAT 878 seq1 TGAATTAAGTTTATTATGGATAATATGGAATATTCTAATCATCTTTCTTT 950 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAATTAAGTTTATTATGGATAATATGGAATATTCTAATCATCTTTCTTT 928 seq1 TATTTTTATTTTTTGTTTTATTAGATATTTTCTTTTATTTTTAAAAAGAT 1000 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TATTTTTATTTTTTGTTTTATTAGATATTTTCTTTTATTTTTAAAAAGAT 978 seq1 TTATTTATTTATTATGTGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACCCTTTT 1050 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTATTTATTTATTATGTGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACCCTTTT 1028 seq1 CCTTCTCACCCCGGCCCTACTCGCTCACTGTAGATGTCTTCAGACTCCTT 1100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CCTTCTCACCCCGGCCCTACTCGCTCACTGTAGATGTCTTCAGACTCCTT 1078 seq1 AGAAGAGGGCATTAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCATGTTGT 1150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAAGAGGGCATTAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCATGTTGT 1128 seq1 TGCTGGGATTTGAATTC 1167 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCTGGGATTTGAATTC 1145

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr6_109056884_109058050
seq2: B6Ng01-092E03.g_70_1214 (reverse)

seq1  TATTAATTTTTTAAGATTCATTTTTATTTATGTGTGTGTGTGTGTTTATA  50
      |||||   ||||||||||||||      || | ||| ||| | |||||||
seq2  TATTA---TTTTAAGATTCATT----AATAAGGGTG-GTG-GGGTTTATA  41

seq1  CTAGATATCTGCAGATGTCTGTGAAATCCAGAAGAGAACATTGGATCGAT  100
      | ||| ||| ||||||||| | ||||| |||||| ||||||| |||||||
seq2  CAAGAAATCCGCAGATGTC-GGGAAAT-CAGAAG-GAACATT-GATCGAT  87

seq1  TATGTGCTGCAGATGTGATGGTGGGAACAAAACTCAGGTCTTCTAGAAGA  150
      ||| ||||||||||| |||||| |||||||  | ||||||||||||||||
seq2  TAT-TGCTGCAGATG-GATGGT-GGAACAACTC-CAGGTCTTCTAGAAGA  133

seq1  ATAACAAGTGTTTTAACCACAGTTTCATCTGTTCAGACCTGTGTTTAACA  200
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  ATAAC-AGTGTTTTAACCACAGTTTCATCTGTTCAGACCTGTGTT--ACA  180

seq1  TCATTTCTATATTAGATATTTAAGTTCTTAATTAATTAATGTACATAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTTCTATATTAGATATTTAAGTTCTTAATTAATTAATGTACATAGCA  230

seq1  TTTTAAACAGTATTAAGGATTCACAAGATCTTAGATCTTCATCTTCCAGG  300
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TTTAAACAGTATTAAGGATTCACAAGATCTTAGATCTTCATCTTCCAGG  279

seq1  AATTTGTACTTTTTTTGGGGAAGAAGGAATCAAGGTGCATAAAATTACAG  350
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTAC-TTTTTTGGGGAAGAAGGAATCAAGGTGCATAAAATTACAG  328

seq1  AGTACTAATAAAATACAATTGGGTGTCAGACATCTTCTGTTTCCATAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTAATAAAATACAATTGGGTGTCAGACATCTTCTGTTTCCATAGGT  378

seq1  ATAGTAGAGGATGGCTTCATAACCAAGTTGAAGTGGGTTTGGTCTAATAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTAGAGGATGGCTTCATAACCAAGTTGAAGTGGGTTTGGTCTAATAC  428

seq1  TGCTTGTGTTATAATGTTAATTTCAGTCAGCCAAACTGCTAACAAGAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTGTTATAATGTTAATTTCAGTCAGCCAAACTGCTAACAAGAGTG  478

seq1  TTTGAACCTAAGACACTAAGGGACCCTTTCCCCAGTTGGCTCTGATAGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAACCTAAGACACTAAGGGACCCTTTCCCCAGTTGGCTCTGATAGGT  528

seq1  AAATAAAGATGCCAGCGGCCAATGGATGGGCAGGACTTTTAGGATATTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAAGATGCCAGCGGCCAATGGATGGGCAGGACTTTTAGGATATTTA  578

seq1  GGCTTGGGGAGAGGAGAAGAAGAAGAGAATTGCAGTGAGAGGGGTATAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGGGGAGAGGAGAAGAAGAAGAGAATTGCAGTGAGAGGGGTATAGA  628

seq1  ATGGACTAGCCATGGAAAAATTTGGGTAAATGGTTCTAGTGGCCACTTCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTAGCCATGGAAAAATTTGGGTAAATGGTTCTAGTGGCCACTTCC  678

seq1  CCAATTGGGTCTGGGGTAGAAAAGATGAAATATAGATTTAAAAGATGTTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATTGGGTCTGGGGTAGAAAAGATGAAATATAGATTTAAAAGATGTTA  728

seq1  ACTCCAGAATACCAGAGGGGAGTGTTTGCTAGCCACGAGAAGGATTAGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCAGAATACCAGAGGGGAGTGTTTGCTAGCCACGAGAAGGATTAGAA  778

seq1  GTGCCCAGCCATTCATTAAGGTAGTCAAGGCATATCAAAACAAACTGGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCCAGCCATTCATTAAGGTAGTCAAGGCATATCAAAACAAACTGGTG  828

seq1  TGTGTATGTGTACATGTGTGCAAATGTGTCTTTTTTTTTCTGAAAGCCAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTATGTGTACATGTGTGCAAATGTGTCTTTTTTTTTCTGAAAGCCAT  878

seq1  TGAATTAAGTTTATTATGGATAATATGGAATATTCTAATCATCTTTCTTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTAAGTTTATTATGGATAATATGGAATATTCTAATCATCTTTCTTT  928

seq1  TATTTTTATTTTTTGTTTTATTAGATATTTTCTTTTATTTTTAAAAAGAT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTATTTTTTGTTTTATTAGATATTTTCTTTTATTTTTAAAAAGAT  978

seq1  TTATTTATTTATTATGTGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACCCTTTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTATTTATTATGTGTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGACCCTTTT  1028

seq1  CCTTCTCACCCCGGCCCTACTCGCTCACTGTAGATGTCTTCAGACTCCTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTCACCCCGGCCCTACTCGCTCACTGTAGATGTCTTCAGACTCCTT  1078

seq1  AGAAGAGGGCATTAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCATGTTGT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAGGGCATTAGATCTCATTACAGATGGTTGTGAGCCATCATGTTGT  1128

seq1  TGCTGGGATTTGAATTC  1167
      |||||||||||||||||
seq2  TGCTGGGATTTGAATTC  1145

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