BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-099K22
Chromosome6 (Build37)
Map Location 24,583,286 - 24,704,936
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWasl, 4932701A20Rik, Hyal4
Upstream geneCadps2, Rnf133, Rnf148, Tas2r118, LOC100041082, Slc13a1, LOC100041094, Iqub, Ndufa5, Asb15, EG626715, Lmod2
Downstream geneSpam1, Hyal5, 6332401O19Rik, LOC384358, Gpr37, Pot1a
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-099K22.bB6Ng01-099K22.g
ACCDH909410DH909411
length1,167941
definitionDH909410|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099K22, 5' end.DH909411|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-099K22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(24,703,777 - 24,704,936)(24,583,286 - 24,584,163)
sequence
gaattctgttccacatgttttggtgaaatgtggagtgaagtaactattgt
ttagtggtttgatagcttacttagagctttttttcactttagtatgctag
acctgaaaaatgctatgagttttggttggtgacctctggtggttaaaatg
ataaatacctacaatgactgaaattgtcctaagtcaggattcataggaag
agcctctctcacagtttctggttggaaataaaacctaccatatgtgaaca
taaaagttctgtaccccaggaacaatgttggcacaaaacagcagaatcat
ggacattggatggccaccaaacccagtcgcttctgcttctggacaaagaa
aaatgtgtgctgtgtgtatgtgtatgcaagtgcacttgcctactcatgaa
tgtgtgaagaccaaaggtcactgtccaatgtcttactttatcactcactc
tctatcttagtttttaagacagtaaggacctctttctgaaccttaaactc
attaattcatctacaatgctggctagtgcctgtaaggattccacccatct
acattccctcagtgctggggttacaggtgagttccatggcacccctttta
tgtaggttttgggcaatccaaactcgggttctcacacttctgcaacaagc
gtttttctcactggaccatcttcccacaaggtgggaatttgatcaccatt
atcaacaccaccccttagactctttgaatcccaagatctcaattcaaaag
ctagagtaggatgtatctaagtggttttattgaggtccaaatcagcatta
aagctcctcatgaaagatgggaaagcatttgaactttgggacttatttag
tgaaacaatattttaaaagtcctaaagtaaactgatacattcaaatgtca
tttttttaattaagtatttttaaaaggttttatttattatcatatggaag
tacactgtagctctctttagacacaccagaaggagggcatcagatctcat
tagggatggttgtgagccatcattgtggttgctgggatttgaactcaagg
accttcagaagaagcagtcggtgctctaaccggatgagccatcctcaccc
agccctaaataagatttttatccattgcttaaaccaatgccagcctgaag
aggaatatgctactctg
gaattctaaatacataagtttgaaaatatgtaatttttcaactatgcaag
aaataaaattacaatatgaattatgagaggcttcatgaatcaaaagaaac
aaaggctatgtatgctatgagccagcttgtcagaaacgtacaaaggtaca
aatgcaggcagattcctaagtttgaggtcagtctgggataatgttaagct
cagtcatgttggaaatggtaatttcaggacagggtctatctctgaattcc
tctgcaatgttaagaaaaatatgtatgcttgctgtctcctaagaatcaaa
gggctagagaggtcatgggatactgattcataggataatcaaaaggaaac
ttggactaaataactgaattgatacgtaagtaaaaaactgggcttttgga
ctgcatgagatgagctaacagaaagcaatagaagccatctctgcacaacc
taggccgccagcttgggcccaggacttgactttgaatctttctttgcacc
actctcaagacaccccttctttctctcaggaagccctcttcaagccgagg
ctggtcctgagcagtctgggccatgttatgtatagaatgaaaaaggaaaa
gcaaggaggtatttaccagatttcctttgtcgtcggcccaacaggtctgt
aactgcttttcggaacttttttgcttcttcttcattggcaaaattaagag
ctacttgacaagtctgaagtatttccatcaaaaagaacaaacaacaaagt
gcatggacttagctttagataacaaaaataatgacagttcacagaagtcc
acttctaaaggaggaaagttacattttaagtaacttttagggaaaacgct
cagaaagactatcagaaaaggttccttacttggcagaacttaacaactaa
tactttgttttcagggggggggggggaaatcaagtatgatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_24703777_24704936
seq2: B6Ng01-099K22.b_46_1212 (reverse)

seq1  CAGAGTAGGGTTATTCCTCTTCAGGCT-GCATTGGTTTAGCCAATGGATA  49
      ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||
seq2  CAGAGTA-GCATATTCCTCTTCAGGCTGGCATTGGTTTAAGCAATGGATA  49

seq1  AAAATACTTAATTAGGGCT-GGTGA-GATGGCTCATCGGGTAAGAGCACC  97
      ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||
seq2  AAAAT-CTTATTTAGGGCTGGGTGAGGATGGCTCATCCGGTTAGAGCACC  98

seq1  GACTGC-TCTTCTGAAGGTCC-TGAGTTCAAATCCCAGCAACCAC-ATGA  144
      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GACTGCTTCTTCTGAAGGTCCTTGAGTTCAAATCCCAGCAACCACAATGA  148

seq1  TGGCTCACAACCATCCCTAATGAGATCTGATGCCCT-CTTCTGGTGTGTC  193
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGGCTCACAACCATCCCTAATGAGATCTGATGCCCTCCTTCTGGTGTGTC  198

seq1  TAAAGAGAGCTACAGTGTACTTCCATATGATAATAAAT-AAACCTTTTAA  242
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TAAAGAGAGCTACAGTGTACTTCCATATGATAATAAATAAAACCTTTTAA  248

seq1  AAATACTTAATT-AAAAAATGACATTTGAATGTATCAGTTTACTTTAGGA  291
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACTTAATTAAAAAAATGACATTTGAATGTATCAGTTTACTTTAGGA  298

seq1  CTTTTAAAATATTGTTTCACTAAATAAGTCCCAAAGTTCAAATGCTTTCC  341
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTAAAATATTGTTTCACTAAATAAGTCCCAAAGTTCAAATGCTTTCC  348

seq1  CATCTTTCATGAGGAGCTTTAATGCTGATTTGGACCTCAATAAAACCACT  391
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTCATGAGGAGCTTTAATGCTGATTTGGACCTCAATAAAACCACT  398

seq1  TAGATACATCCTACTCTAGCTTTTGAATTGAGATCTTGGGATTCAAAGAG  441
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATACATCCTACTCTAGCTTTTGAATTGAGATCTTGGGATTCAAAGAG  448

seq1  TCTAAGGGGTGGTGTTGATAATGGTGATCAAATTCCCACCTTGTGGGAAG  491
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGGGGTGGTGTTGATAATGGTGATCAAATTCCCACCTTGTGGGAAG  498

seq1  ATGGTCCAGTGAGAAAAACGCTTGTTGCAGAAGTGTGAGAACCCGAGTTT  541
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTCCAGTGAGAAAAACGCTTGTTGCAGAAGTGTGAGAACCCGAGTTT  548

seq1  GGATTGCCCAAAACCTACATAAAAGGGGTGCCATGGAACTCACCTGTAAC  591
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTGCCCAAAACCTACATAAAAGGGGTGCCATGGAACTCACCTGTAAC  598

seq1  CCCAGCACTGAGGGAATGTAGATGGGTGGAATCCTTACAGGCACTAGCCA  641
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCACTGAGGGAATGTAGATGGGTGGAATCCTTACAGGCACTAGCCA  648

seq1  GCATTGTAGATGAATTAATGAGTTTAAGGTTCAGAAAGAGGTCCTTACTG  691
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGTAGATGAATTAATGAGTTTAAGGTTCAGAAAGAGGTCCTTACTG  698

seq1  TCTTAAAAACTAAGATAGAGAGTGAGTGATAAAGTAAGACATTGGACAGT  741
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAAACTAAGATAGAGAGTGAGTGATAAAGTAAGACATTGGACAGT  748

seq1  GACCTTTGGTCTTCACACATTCATGAGTAGGCAAGTGCACTTGCATACAC  791
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTTTGGTCTTCACACATTCATGAGTAGGCAAGTGCACTTGCATACAC  798

seq1  ATACACACAGCACACATTTTTCTTTGTCCAGAAGCAGAAGCGACTGGGTT  841
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACACACAGCACACATTTTTCTTTGTCCAGAAGCAGAAGCGACTGGGTT  848

seq1  TGGTGGCCATCCAATGTCCATGATTCTGCTGTTTTGTGCCAACATTGTTC  891
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGCCATCCAATGTCCATGATTCTGCTGTTTTGTGCCAACATTGTTC  898

seq1  CTGGGGTACAGAACTTTTATGTTCACATATGGTAGGTTTTATTTCCAACC  941
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGTACAGAACTTTTATGTTCACATATGGTAGGTTTTATTTCCAACC  948

seq1  AGAAACTGTGAGAGAGGCTCTTCCTATGAATCCTGACTTAGGACAATTTC  991
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACTGTGAGAGAGGCTCTTCCTATGAATCCTGACTTAGGACAATTTC  998

seq1  AGTCATTGTAGGTATTTATCATTTTAACCACCAGAGGTCACCAACCAAAA  1041
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTGTAGGTATTTATCATTTTAACCACCAGAGGTCACCAACCAAAA  1048

seq1  CTCATAGCATTTTTCAGGTCTAGCATACTAAAGTGAAAAAAAGCTCTAAG  1091
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATAGCATTTTTCAGGTCTAGCATACTAAAGTGAAAAAAAGCTCTAAG  1098

seq1  TAAGCTATCAAACCACTAAACAATAGTTACTTCACTCCACATTTCACCAA  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTATCAAACCACTAAACAATAGTTACTTCACTCCACATTTCACCAA  1148

seq1  AACATGTGGAACAGAATTC  1160
      |||||||||||||||||||
seq2  AACATGTGGAACAGAATTC  1167

seq1: chr6_24583286_24584163
seq2: B6Ng01-099K22.g_130_1005

seq1  ATGAATTATGAGAGGCTTCATGAATCAAAAGAAACAAAGGCTATGTATGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTATGAGAGGCTTCATGAATCAAAAGAAACAAAGGCTATGTATGC  50

seq1  TATGAGCCAGCTTGTCAGAAACGTACAAAGGTACAAATGCAGGCAGATTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAGCCAGCTTGTCAGAAACGTACAAAGGTACAAATGCAGGCAGATTC  100

seq1  CTAAGTTTGAGGTCAGTCTGGGATAATGTTAAGCTCAGTCATGTTGGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGTTTGAGGTCAGTCTGGGATAATGTTAAGCTCAGTCATGTTGGAAA  150

seq1  TGGTAATTTCAGGACAGGGTCTATCTCTGAATTCCTCTGCAATGTTAAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAATTTCAGGACAGGGTCTATCTCTGAATTCCTCTGCAATGTTAAGA  200

seq1  AAAATATGTATGCTTGCTGTCTCCTAAGAATCAAAGGGCTAGAGAGGTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATGTATGCTTGCTGTCTCCTAAGAATCAAAGGGCTAGAGAGGTCA  250

seq1  TGGGATACTGATTCATAGGATAATCAAAAGGAAACTTGGACTAAATAACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGATACTGATTCATAGGATAATCAAAAGGAAACTTGGACTAAATAACT  300

seq1  GAATTGATACGTAAGTAAAAAACTGGGCTTTTGGACTGCATGAGATGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTGATACGTAAGTAAAAAACTGGGCTTTTGGACTGCATGAGATGAGC  350

seq1  TAACAGAAAGCAATAGAAGCCATCTCTGCACAACCTAGGCCGCCAGCTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGAAAGCAATAGAAGCCATCTCTGCACAACCTAGGCCGCCAGCTTG  400

seq1  GGCCCAGGACTTGACTTTGAATCTTTCTTTGCACCACTCTCAAGACACCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCAGGACTTGACTTTGAATCTTTCTTTGCACCACTCTCAAGACACCC  450

seq1  CTTCTTTCTCTCAGGAAGCCCTCTTCAAGCCGAGGCTGGTCCTGAGCAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTTCTCTCAGGAAGCCCTCTTCAAGCCGAGGCTGGTCCTGAGCAGT  500

seq1  CTGGGCCATGTTATGTATAGAATGAAAAAGGAAAAGCAAGGAGGTATTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGCCATGTTATGTATAGAATGAAAAAGGAAAAGCAAGGAGGTATTTA  550

seq1  CCAGATTTCCTTTGTCGTCGGCCCAACAGGTCTGTAACTGCTTTTCGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATTTCCTTTGTCGTCGGCCCAACAGGTCTGTAACTGCTTTTCGGAA  600

seq1  CTTTTTTGCTTCTTCTTCATTGGCAAAATTAAGAGCTACTTGACAAGTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTTTGCTTCTTCTTCATTGGCAAAATTAAGAGCTACTTGACAAGTCT  650

seq1  GAAGTATTTCCATCAAAAAGAACAAACAACAAAGTGCATGGACTTAGCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTATTTCCATCAAAAAGAACAAACAACAAAGTGCATGGACTTAGCTT  700

seq1  TAGATAACAAAAATAATGACAGTTCACAGAAGTCCACTTCTAAAGGAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAACAAAAATAATGACAGTTCACAGAAGTCCACTTCTAAAGGAGGA  750

seq1  AAGTTACATTTTAAGTAACTTTTAGGGAAAACGCTCAGAAAAGACTATCA  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  AAGTTACATTTTAAGTAACTTTTAGGGAAAACGCTCAG-AAAGACTATCA  799

seq1  GAAAAGGTTCCTTACTTGGCAGAAACTTAACAACTAAATACTTTGTTTTC  850
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GAAAAGGTTCCTTACTTGGCAG-AACTTAACAACT-AATACTTTGTTTTC  847

seq1  A-GGGGGGGGGGGGAAATCAAGTATGATT  878
      | |||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGGGGGGGGGAAATCAAGTATGATT  876