BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104O24
Chromosome6 (Build37)
Map Location 32,405,852 - 32,569,183
singlet/doubletdoublet
Overlap genePlxna4
Upstream geneMkln1, Podxl, EG619959, LOC620104, 1700012A03Rik
Downstream geneChchd3, LOC100039118, Gm1401, Exoc4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104O24.bB6Ng01-104O24.g
ACCDH913094DH913095
length1,0071,077
definitionDH913094|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104O24, 5' end.DH913095|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104O24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(32,568,401 - 32,569,183)(32,405,852 - 32,406,926)
sequence
gaattcataataaagtccaaaagtgatcattggggacaaccaaggatgct
tcctgacacaaggaatctaggtactatttatcttgctctgctgtcataga
gaagaacgttactccaaatgttactttctggtctatagccactggagctc
tgtccattatatacataccacacaaagcaggacacagaaagggaagaaga
catccctcctgccttcacacttttaagttgacttgccattatcattggta
tatccttgaccaaatgttaattgctttattttgtacattaagccaaaatg
agagacttattagtaaggggacagaaaagaatgcgagaatcagtttttta
aaactatactatctgtaggggttggttctgatgcatggtcctgattccca
attggttcttgttttgtcagtaaagaaagccatggatcaattgcttgaca
gacggtataggtggtacttctgggtccctgttagaaaagaagctgcaagg
acagagaacagagattgccatgctttggagagaagaaaattgggcaacca
tgtgagatctcaaaatggagtggccacacaggccactcttataggtgggt
gatcagggaagattagcaactgaagtttagaacaagtgggtaagacttag
ataagatattaataagggcatgcttttccaggtggtagattgtagcacct
atcaattgtgccaagaaggcaagtgaaattgaacaactgtgtgtctgtgt
cttttatctgctgattcaaagaaaactggaggaggactggtagtgtggtc
tcttcccagagctaaaggttgggtagagtataaaattacatgcaacagct
atcaacaacgaattattagaagtgtctgaagatatatttttgttttgttc
tctgattcaaatatttctagataattcccggaggctccttattaggagca
aaggatatatctatttgtattttaaattggttggtaatatttctaggcat
tacttgg
gaattcatgttgctctggtgggcacaggtcaactgtacaccatgtgaaca
agagcacagcagcttacatggaagaaggtggggcagagaccaagatggtc
gagcatgggccctagcactaacagtcatgctgctgcccaatcttctgggg
ccatgagtggataacagtactgaagacttgcacttgcttaggactatatg
ggtttttgtgtgtatcatgcacagacctgggactgtactatacacccagt
aaaagatacatagcaccaagcattgctataatggcccttgtgtatgtctc
aggcactgttactgtcaagctctatgtggaaatctatatcctggctaata
agcatcttcctaagtctctatggtaggaaaactgaaaaagacatgaaagg
atgaagccatgggttgaatctgagggctgtaaggaggaaaccatgtgaag
ctttagactggcctaggtggcacctggaatcaggtcaaacttctccaact
cttggcattcacattcccccctccacccgagagtgaaggggaaggaaact
aactttaaggaccaaatatagtgatacaatactacaaccactgtttccat
atccccagagtcacctttccagctgccagtgttggctttctataaactct
gtttcactcctgttggttccattttacacagaggaaaatggtaaaggcca
cttgacctgtgttagggagatttgtaatcccagcccaggactccagtgta
agagcactttgggccccttggacactttaccatggacacaagcaaacacc
ttagaattgcctaacaagtgggagtctgggacttcctaccttcacacctc
cccacccactcacatccacgatgcaacattttccattagcttctttgcca
gtgatctgttgcttgttatattagaatttgcaacaattgttctcatccca
gccttctctccccctcccctgctggcatcagaattcagcattgattttcc
tgggccccgctccactggcttgactgacattcctggatggattctccttg
gagacctgacgtgactcaacaaggctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_32568401_32569183
seq2: B6Ng01-104O24.b_44_826 (reverse)

seq1  TCCTCCAGTTTTCTTTGAATCAGCAGATAAAAGACACAGACACACAGTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCAGTTTTCTTTGAATCAGCAGATAAAAGACACAGACACACAGTTG  50

seq1  TTCAATTTCACTTGCCTTCTTGGCACAATTGATAGGTGCTACAATCTACC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAATTTCACTTGCCTTCTTGGCACAATTGATAGGTGCTACAATCTACC  100

seq1  ACCTGGAAAAGCATGCCCTTATTAATATCTTATCTAAGTCTTACCCACTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGGAAAAGCATGCCCTTATTAATATCTTATCTAAGTCTTACCCACTT  150

seq1  GTTCTAAACTTCAGTTGCTAATCTTCCCTGATCACCCACCTATAAGAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTAAACTTCAGTTGCTAATCTTCCCTGATCACCCACCTATAAGAGTG  200

seq1  GCCTGTGTGGCCACTCCATTTTGAGATCTCACATGGTTGCCCAATTTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTGTGGCCACTCCATTTTGAGATCTCACATGGTTGCCCAATTTTCT  250

seq1  TCTCTCCAAAGCATGGCAATCTCTGTTCTCTGTCCTTGCAGCTTCTTTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCCAAAGCATGGCAATCTCTGTTCTCTGTCCTTGCAGCTTCTTTTC  300

seq1  TAACAGGGACCCAGAAGTACCACCTATACCGTCTGTCAAGCAATTGATCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGGGACCCAGAAGTACCACCTATACCGTCTGTCAAGCAATTGATCC  350

seq1  ATGGCTTTCTTTACTGACAAAACAAGAACCAATTGGGAATCAGGACCATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCTTTCTTTACTGACAAAACAAGAACCAATTGGGAATCAGGACCATG  400

seq1  CATCAGAACCAACCCCTACAGATAGTATAGTTTTAAAAAACTGATTCTCG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGAACCAACCCCTACAGATAGTATAGTTTTAAAAAACTGATTCTCG  450

seq1  CATTCTTTTCTGTCCCCTTACTAATAAGTCTCTCATTTTGGCTTAATGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTTTTCTGTCCCCTTACTAATAAGTCTCTCATTTTGGCTTAATGTA  500

seq1  CAAAATAAAGCAATTAACATTTGGTCAAGGATATACCAATGATAATGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATAAAGCAATTAACATTTGGTCAAGGATATACCAATGATAATGGCA  550

seq1  AGTCAACTTAAAAGTGTGAAGGCAGGAGGGATGTCTTCTTCCCTTTCTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAACTTAAAAGTGTGAAGGCAGGAGGGATGTCTTCTTCCCTTTCTGT  600

seq1  GTCCTGCTTTGTGTGGTATGTATATAATGGACAGAGCTCCAGTGGCTATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCTTTGTGTGGTATGTATATAATGGACAGAGCTCCAGTGGCTATA  650

seq1  GACCAGAAAGTAACATTTGGAGTAACGTTCTTCTCTATGACAGCAGAGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGAAAGTAACATTTGGAGTAACGTTCTTCTCTATGACAGCAGAGCA  700

seq1  AGATAAATAGTACCTAGATTCCTTGTGTCAGGAAGCATCCTTGGTTGTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAATAGTACCTAGATTCCTTGTGTCAGGAAGCATCCTTGGTTGTCC  750

seq1  CCAATGATCACTTTTGGACTTTATTATGAATTC  783
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAATGATCACTTTTGGACTTTATTATGAATTC  783

seq1: chr6_32405852_32406926
seq2: B6Ng01-104O24.g_67_1143

seq1  GAATTCATGTTGCTCTGGTGGGCACAGGTCAACTGTACACCATGTGAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATGTTGCTCTGGTGGGCACAGGTCAACTGTACACCATGTGAACA  50

seq1  AGAGCACAGCAGCTTACATGGAAGAAGGTGGGGCAGAGACCAAGATGGTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACAGCAGCTTACATGGAAGAAGGTGGGGCAGAGACCAAGATGGTC  100

seq1  GAGCATGGGCCCTAGCACTAACAGTCATGCTGCTGCCCAATCTTCTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCATGGGCCCTAGCACTAACAGTCATGCTGCTGCCCAATCTTCTGGGG  150

seq1  CCATGAGTGGATAACAGTACTGAAGACTTGCACTTGCTTAGGACTATATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGTGGATAACAGTACTGAAGACTTGCACTTGCTTAGGACTATATG  200

seq1  GGTTTTTGTGTGTATCATGCACAGACCTGGGACTGTACTATACACCCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTTGTGTGTATCATGCACAGACCTGGGACTGTACTATACACCCAGT  250

seq1  AAAAGATACATAGCACCAAGCATTGCTATAATGGCCCTTGTGTATGTCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGATACATAGCACCAAGCATTGCTATAATGGCCCTTGTGTATGTCTC  300

seq1  AGGCACTGTTACTGTCAAGCTCTATGTGGAAATCTATATCCTGGCTAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCACTGTTACTGTCAAGCTCTATGTGGAAATCTATATCCTGGCTAATA  350

seq1  AGCATCTTCCTAAGTCTCTATGGTAGGAAAACTGAAAAAGACATGAAAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATCTTCCTAAGTCTCTATGGTAGGAAAACTGAAAAAGACATGAAAGG  400

seq1  ATGAAGCCATGGGTTGAATCTGAGGGCTGTAAGGAGGAAACCATGTGAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGCCATGGGTTGAATCTGAGGGCTGTAAGGAGGAAACCATGTGAAG  450

seq1  CTTTAGACTGGCCTAGGTGGCACCTGGAATCAGGTCAAACTTCTCCAACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTAGACTGGCCTAGGTGGCACCTGGAATCAGGTCAAACTTCTCCAACT  500

seq1  CTTGGCATTCACATTCCCCCCTCCACCCGAGAGTGAAGGGGAAGGAAACT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCATTCACATTCCCCCCTCCACCCGAGAGTGAAGGGGAAGGAAACT  550

seq1  AACTTTAAGGACCAAATATAGTGATACAATACTACAACCACTGTTTCCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTAAGGACCAAATATAGTGATACAATACTACAACCACTGTTTCCAT  600

seq1  ATCCCCAGAGTCACCTTTCCAGCTGCCAGTGTTGGCTTTCTATAAACTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCCCAGAGTCACCTTTCCAGCTGCCAGTGTTGGCTTTCTATAAACTCT  650

seq1  GTTTCACTCCTGTTGGTTCCATTTTACACAGAGGAAAATGGTAAAGGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCACTCCTGTTGGTTCCATTTTACACAGAGGAAAATGGTAAAGGCCA  700

seq1  CTTGACCTGTGTTAGGGAGATTTGTAATCCCAGCCCAGGACTCCAGTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACCTGTGTTAGGGAGATTTGTAATCCCAGCCCAGGACTCCAGTGTA  750

seq1  AGAGCACTTTGGGCCCCTTGGACACTTTACCATGGACACAAGCAAACACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGCACTTTGGGCCCCTTGGACACTTTACCATGGACACAAGCAAACACC  800

seq1  TTAGAATTGCCTAACAAGTGGGAGTCT-GGACTTCCTACCTCCACACCTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||
seq2  TTAGAATTGCCTAACAAGTGGGAGTCTGGGACTTCCTACCTTCACACCTC  850

seq1  CCCACCCACTCACATCCACGATGC-ACA-TTTCCATTAGCTTCTTTGCCC  897
      |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||
seq2  CCCACCCACTCACATCCACGATGCAACATTTTCCATTAGCTTCTTTG-CC  899

seq1  AGTGATCTGTTGCTTTGTTATATTAGAATTGCAAACAAATGTTCTCATCC  947
      ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||
seq2  AGTGATCTGTTGC-TTGTTATATTAGAATTTGCAACAATTGTTCTCATCC  948

seq1  CAGCCTTCTCTCCCCCTCCCCTGCTGGCATCTAGAATTCAGCATTGATTT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTTCTCTCCCCCTCCCCTGCTGGCATC-AGAATTCAGCATTGATTT  997

seq1  TCCT-GGCCCCGCTCCACT-GCTTGACTGACATTCCTGGATGATTCCCCC  1045
      |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | | ||
seq2  TCCTGGGCCCCGCTCCACTGGCTTGACTGACATTCCTGGATGGATTCTCC  1047

seq1  TTGGAGACCTTGAGCTGACTCAAC-AGGCTC  1075
      ||||||||| |||  ||||||||| ||||||
seq2  TTGGAGACC-TGACGTGACTCAACAAGGCTC  1077