BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-113J14
Chromosome6 (Build37)
Map Location 119,838,035 - 119,967,155
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC666887, Rad52, Wnk1, EG406236
Upstream geneCacna1c, Dcp1b, Cacna2d4, Lrtm2, Adipor2, Wnt5b, Fbxl14, Erc1
Downstream geneNinj2, B4galnt3, Ccdc77, Jarid1a, Il17ra, Cecr6, Cecr5, 1700072O05Rik, Cecr2, Slc25a18, Atp6v1e1, Bcl2l13, Bid, Mical3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-113J14.bB6Ng01-113J14.g
ACCDH919352DH919353
length1,056845
definitionDH919352|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J14, 5' end.DH919353|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-113J14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,838,035 - 119,839,076)(119,966,311 - 119,967,155)
sequence
gaattctctccctggcttccctcagtgaggaagtgagtgtgacctgagag
ttgtgcgataacccatcccctccccaagcttgctgtttgtcaaggtgcta
atcacagcaacagaaaacctaacgaagctcccctcacccccaacaactaa
ttggcgcaggacacatgatgatctgtgtctcatagggttacccagagttc
atcaaggttcaagataacaaaaccctgtaagaactatttcacagtctgtg
ccctcagggagctcagagcatcagatgcctttaggggagttcaaaatggc
tagtgctggcataaagggaatctgattggggttagactgatagtttctcc
ttaaggcatcagagccacggggagagtccaacatctactgattagtcaga
ttaccctggtcccagcatctttgcttatttaggaagatgaacaccaaaag
agtgctcactgaaagaactagtcattaacactgttgtatccgattttaat
gttttataccttcccagcacctaaggggaaggccatccacgcattaggat
agaggaacagaagtgataaaatgatctattcacaggggatttattagatt
gccttacatgatccaacagtagctgtctgcatatcagagaggctaagaac
aaggagactgttcagtttatgaggctggagacctcagtagtccctgtatt
ggtgttgaaaggtctggaggattcccagagaactttctcatcttcagtca
tctatggaaggcccaagaagctggatgttgatatcactgaaaggatggta
ccaacagtagcactagcagcagcagcagcagtagcagcagcacagggcaa
tatattcaccagcaagaagtgagggcaggcgcatagaaaaaagccctgat
tttccctctttctatttgggcagacactggaaggttttgtccatttctag
aaggcgatttcccaatttagttactacatccagacagcgccctcacagac
atgcccagaggtggtgctcttattgagtcaagagccaattaggttgacag
tgtctg
gaattcttatcaggtataatgaacactaaaatacaatttggaagtatagc
ctagatctgcctggtaaatgcttaccatacaatcatgaggacctgagttt
gttgatagcctgcactcatgtagaagcctggttcagcagtgttatcttat
tagtgctcaggaaatggaaacaaaatcctgagggctcattgaccaggcag
tctaactgaatttgtgaattctagattttgtaagagattttctgggaaaa
tgaaagtgatacctattgtatttccacatgcatgttcacacagaccctca
tataccaccacatccatgtacacatacaaaaaagacaatttggaattgga
tacccttattgccgtttttcctcatctcccatcttaaatggactacatat
gaactgcttaaccagggtggctgctgttagtttaaaaagacaagatactt
catccttacatacctaagaaataaaataagtagtaatagagcacagaaaa
acagttctctaaatgtagacaataaaacttcatagggtctcacagtaact
ctgagttgattaataaagttaatataaattttcccccctgtggttttaga
gtaatcaagttaccaaaattctagctatttttagtatttcatactaaagt
tggatgagatggaaagtctataaaattataagaggggacttgttggttct
cctaattttctcagctttagactttgtttcttcaactaactaggaataga
aaaattatatatgtgtgtgtgtgtgtatatatatattagagtacttaatg
ttttaatacaatatgcatgtatgtttgtttgtttttccgagacag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_119838035_119839076
seq2: B6Ng01-113J14.b_49_1095

seq1  GAATTCTCTCCCTGGCTTCCCTCAGTGAGGAAGTGAGTGTGACCTGAGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCCCTGGCTTCCCTCAGTGAGGAAGTGAGTGTGACCTGAGAG  50

seq1  TTGTGCGATAACCCATCCCCTCCCCAAGCTTGCTGTTTGTCAAGGTGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGCGATAACCCATCCCCTCCCCAAGCTTGCTGTTTGTCAAGGTGCTA  100

seq1  ATCACAGCAACAGAAAACCTAACGAAGCTCCCCTCACCCCCAACAACTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACAGCAACAGAAAACCTAACGAAGCTCCCCTCACCCCCAACAACTAA  150

seq1  TTGGCGCAGGACACATGATGATCTGTGTCTCATAGGGTTACCCAGAGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCGCAGGACACATGATGATCTGTGTCTCATAGGGTTACCCAGAGTTC  200

seq1  ATCAAGGTTCAAGATAACAAAACCCTGTAAGAACTATTTCACAGTCTGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAGGTTCAAGATAACAAAACCCTGTAAGAACTATTTCACAGTCTGTG  250

seq1  CCCTCAGGGAGCTCAGAGCATCAGATGCCTTTAGGGGAGTTCAAAATGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGGGAGCTCAGAGCATCAGATGCCTTTAGGGGAGTTCAAAATGGC  300

seq1  TAGTGCTGGCATAAAGGGAATCTGATTGGGGTTAGACTGATAGTTTCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGCTGGCATAAAGGGAATCTGATTGGGGTTAGACTGATAGTTTCTCC  350

seq1  TTAAGGCATCAGAGCCACGGGGAGAGTCCAACATCTACTGATTAGTCAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGGCATCAGAGCCACGGGGAGAGTCCAACATCTACTGATTAGTCAGA  400

seq1  TTACCCTGGTCCCAGCATCTTTGCTTATTTAGGAAGATGAACACCAAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCCTGGTCCCAGCATCTTTGCTTATTTAGGAAGATGAACACCAAAAG  450

seq1  AGTGCTCACTGAAAGAACTAGTCATTAACACTGTTGTATCCGATTTTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCACTGAAAGAACTAGTCATTAACACTGTTGTATCCGATTTTAAT  500

seq1  GTTTTATACCTTCCCAGCACCTAAGGGGAAGGCCATCCACGCATTAGGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTATACCTTCCCAGCACCTAAGGGGAAGGCCATCCACGCATTAGGAT  550

seq1  AGAGGAACAGAAGTGATAAAATGATCTATTCACAGGGGATTTATTAGATT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAACAGAAGTGATAAAATGATCTATTCACAGGGGATTTATTAGATT  600

seq1  GCCTTACATGATCCAACAGTAGCTGTCTGCATATCAGAGAGGCTAAGAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTACATGATCCAACAGTAGCTGTCTGCATATCAGAGAGGCTAAGAAC  650

seq1  AAGGAGACTGTTCAGTTTATGAGGCTGGAGACCTCAGTAGTCCCTGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGACTGTTCAGTTTATGAGGCTGGAGACCTCAGTAGTCCCTGTATT  700

seq1  GGTGTTG-AAGGTCTGGAGGATTCCCAGAGAAC-TTCTCATCTTCAGTCA  748
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  GGTGTTGAAAGGTCTGGAGGATTCCCAGAGAACTTTCTCATCTTCAGTCA  750

seq1  TCTATGGAAGGCCCAAGAAGCTGGATGTTGATATCACTG-AAGGATGGTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TCTATGGAAGGCCCAAGAAGCTGGATGTTGATATCACTGAAAGGATGGTA  800

seq1  CCAACAGTAGCACTAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCACA-GGCAA  846
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CCAACAGTAGCACTAGCAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCAGCACAGGGCAA  850

seq1  TATATTCACCAGCAAGAAGTGAGGGCAGGCGCATAG-AAGAAGCCCTGAT  895
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||
seq2  TATATTCACCAGCAAGAAGTGAGGGCAGGCGCATAGAAAAAAGCCCTGAT  900

seq1  TTTCCCTCTTTCTATTTGGGCAGACACTGGAAGGTTTTGTCCA-TTCTAG  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TTTCCCTCTTTCTATTTGGGCAGACACTGGAAGGTTTTGTCCATTTCTAG  950

seq1  AAGGCGATTTCCCAATTTAGTTACTACATCCAGACAGCGCCCTCACAGAC  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCGATTTCCCAATTTAGTTACTACATCCAGACAGCGCCCTCACAGAC  1000

seq1  ATGCCCAGAGGTGTGCCTCTTAGTTGAGTCAAGAGCCAATTAGGTTGA  1042
      |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCCAGAGGTGGTGCTCTTA-TTGAGTCAAGAGCCAATTAGGTTGA  1047

seq1: chr6_119966311_119967155
seq2: B6Ng01-113J14.g_68_912 (reverse)

seq1  CTGTCTCGGAAAAACAAACAAACATACATGCATAATGTATTAAAACATTA  50
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CTGTCTCGGAAAAACAAACAAACATACATGCATATTGTATTAAAACATTA  50

seq1  AGTACTCTAATATATATATACACACACACACACATATATAATTTTTCTAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCTAATATATATATACACACACACACACATATATAATTTTTCTAT  100

seq1  TCCTAGTTAGTTGAAGAAACAAAGTCTAAAGCTGAGAAAATTAGGAGAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGTTAGTTGAAGAAACAAAGTCTAAAGCTGAGAAAATTAGGAGAAC  150

seq1  CAACAAGTCCCCTCTTATAATTTTATAGACTTTCCATCTCATCCAACTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAGTCCCCTCTTATAATTTTATAGACTTTCCATCTCATCCAACTTT  200

seq1  AGTATGAAATACTAAAAATAGCTAGAATTTTGGTAACTTGATTACTCTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATGAAATACTAAAAATAGCTAGAATTTTGGTAACTTGATTACTCTAA  250

seq1  AACCACAGGGGGGAAAATTTATATTAACTTTATTAATCAACTCAGAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCACAGGGGGGAAAATTTATATTAACTTTATTAATCAACTCAGAGTTA  300

seq1  CTGTGAGACCCTATGAAGTTTTATTGTCTACATTTAGAGAACTGTTTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGAGACCCTATGAAGTTTTATTGTCTACATTTAGAGAACTGTTTTTC  350

seq1  TGTGCTCTATTACTACTTATTTTATTTCTTAGGTATGTAAGGATGAAGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTCTATTACTACTTATTTTATTTCTTAGGTATGTAAGGATGAAGTA  400

seq1  TCTTGTCTTTTTAAACTAACAGCAGCCACCCTGGTTAAGCAGTTCATATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTCTTTTTAAACTAACAGCAGCCACCCTGGTTAAGCAGTTCATATG  450

seq1  TAGTCCATTTAAGATGGGAGATGAGGAAAAACGGCAATAAGGGTATCCAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCATTTAAGATGGGAGATGAGGAAAAACGGCAATAAGGGTATCCAA  500

seq1  TTCCAAATTGTCTTTTTTGTATGTGTACATGGATGTGGTGGTATATGAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAATTGTCTTTTTTGTATGTGTACATGGATGTGGTGGTATATGAGG  550

seq1  GTCTGTGTGAACATGCATGTGGAAATACAATAGGTATCACTTTCATTTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTGAACATGCATGTGGAAATACAATAGGTATCACTTTCATTTTC  600

seq1  CCAGAAAATCTCTTACAAAATCTAGAATTCACAAATTCAGTTAGACTGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAAAATCTCTTACAAAATCTAGAATTCACAAATTCAGTTAGACTGCC  650

seq1  TGGTCAATGAGCCCTCAGGATTTTGTTTCCATTTCCTGAGCACTAATAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCAATGAGCCCTCAGGATTTTGTTTCCATTTCCTGAGCACTAATAAG  700

seq1  ATAACACTGCTGAACCAGGCTTCTACATGAGTGCAGGCTATCAACAAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACACTGCTGAACCAGGCTTCTACATGAGTGCAGGCTATCAACAAACT  750

seq1  CAGGTCCTCATGATTGTATGGTAAGCATTTACCAGGCAGATCTAGGCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTCCTCATGATTGTATGGTAAGCATTTACCAGGCAGATCTAGGCTAT  800

seq1  ACTTCCAAATTGTATTTTAGTGTTCATTATACCTGATAAGAATTC  845
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCCAAATTGTATTTTAGTGTTCATTATACCTGATAAGAATTC  845