BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121H05
Chromosome6 (Build37)
Map Location 119,480,251 - 119,604,791
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErc1
Upstream geneAnkrd26, Cacna1c, Dcp1b, Cacna2d4, Lrtm2, Adipor2, Wnt5b, Fbxl14
Downstream geneLOC666887, Rad52, Wnk1, EG406236, Ninj2, B4galnt3, Ccdc77, Jarid1a, Il17ra, Cecr6, Cecr5, 1700072O05Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121H05.bB6Ng01-121H05.g
ACCDH925132DH925133
length9241,095
definitionDH925132|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121H05, 5' end.DH925133|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121H05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,603,871 - 119,604,791)(119,480,251 - 119,481,354)
sequence
gaattcatgaaaatcttaggcaaatggatggaactagaaaatatcatcct
gagtgaggtaacccagtcacaaaagaacagacatggtataaactcactga
taagtggatattagtccagaagcttggaatgcccaagatacaattcacag
accacatgaagctcaagaagaaggaagaccaaagtgtggatacttaggtc
cttcttagaagggggaacaaaatacccatgggaggagatacagagacaaa
gtgtggaacagaaactgaaggaaaggccatccagagactgtgccaactgt
atattttaattgcatttatttatttgggtggtgtgcatctttatgcacac
accttagtgcacatatggagctcagagaacaacttgtggaagtcagttct
ctccatccaccataagttccaggaatcaaccccaggtcatcagggttaaa
gacatggacctttaccttctgagccatattgtttgccccttggtatgttt
gtttagtcagcaaagaatttgacattttgagatctagctgtcataatttg
cattcattctgttcacagttctttgtgaatcactttgaatagttaccaaa
ttttaaacttccaaaaaatatacatgtgaattttgtatattttgtgaaca
attttatctattacttccttgtttggggaattcatagatgagaagtgtta
acagtaagctggttaggggttctcttagccaggtagtcaagaaggagctc
ttcagcggccagcctttgggaacttttgtttctatggattctgacagctt
ccattggaagccacatgcaatagaacagcagctctttgggaccatcttgt
attacaatttttattcaggttttgggcctcaggaccttacctctacaggt
attacagttagaaagtcagggttg
gaattccagatacaattaacttacaaagtgaaaaggttaatttagctcat
ggttctaaaggtaccagaccaagaccagcagcccactgctatgatccttt
agtaatggcttcacataatggcaggagagcagggcagagcaaactattca
tcttacaagctacaagcatagctagagacaagacaggcccagacccttaa
ctgcttccaggacacaccactaatgaccactcacaaggtcccatgtccca
gaggaccaaggcatgtccacagcagaagagtctgggagacaagtctttaa
cacagggactttttgggaacactgttttgacactgtatcaaagcaccccc
ccccccaccccaggtggctataattcacaagtggtaacaagggtgtggct
aaattagaatctgcacattattcatgggaaaatgctgcagccatttggaa
atacagtctactatttctctgaaaggtcaggcacagagcagcatgtgccc
cggtgactgtactccgtggtacctccccaacacagaaacttatatacaca
tgttgccagtaacatcactcacaatagccaaaagcagaaacaaccgtgaa
tgtccatcagttggtgaaaagatgactactgggcgaacattctggaacaa
tctggaagattatttggacacaaagagaggaaacagccaaaccaagccct
gatgcgatctgtaagggagaagggcattgtgtcctgttgagttgattgat
gcttgtgctctttacagatcaacagtggcaaagggtcagagaagaccaca
ctgacacaaagtgatgagccagcagttagctgtcagccaaaaaaaaaaaa
aagccacccaaaagaaaaaccacccaaaaaagagctaataaagccagagg
tttgctttgtctctgctctctcattactgcagaagcaaggtcccttaatc
ctgttgagcaagccctctcccaccaggctacacagccttggctgtttaga
ttattctttaaaagagctttactaaattgctcgggctggcttgaacttgc
catcttctgctcagctcttgagcagcacaccactaggcttaccca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_119603871_119604791
seq2: B6Ng01-121H05.b_49_972 (reverse)

seq1  CAACCCTGACTTCCTAACTGTAATACCTGTAGAGGTACGGTCCTGAGGCC  50
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAACCCTGACTTTCTAACTGTAATACCTGTAGAGGTAAGGTCCTGAGGCC  50

seq1  CAAAACCTGAATAAAAATTGTAATACAAGATGGTCCCAAAGAGCTGCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACCTGAATAAAAATTGTAATACAAGATGGTCCCAAAGAGCTGCTGT  100

seq1  TCTA-TGCATGTGGCTTCCAATGGAAGCTGTCAGAATCCATAGAAACAAA  149
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTGCATGTGGCTTCCAATGGAAGCTGTCAGAATCCATAGAAACAAA  150

seq1  AGTTCCCAAAGGCTGGCCGCTGAAGAGCTCCTTCTTGACTACCTGGCTAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCCAAAGGCTGGCCGCTGAAGAGCTCCTTCTTGACTACCTGGCTAA  200

seq1  GAGAA-CCCTAACCAGCTTACTGTTAACACTTCTCATCTATGAATTCCCC  248
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACCCCTAACCAGCTTACTGTTAACACTTCTCATCTATGAATTCCCC  250

seq1  AAACAAGGAAGTAATAGATAAAATTGTTCAC-AAATATACAAAATTCACA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAACAAGGAAGTAATAGATAAAATTGTTCACAAAATATACAAAATTCACA  300

seq1  TGTATATTTTTTGGAAGTTTAAAATTTGGTAACTATTCAAAGTGATTCAC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATATTTTTTGGAAGTTTAAAATTTGGTAACTATTCAAAGTGATTCAC  350

seq1  AAAGAACTGTGAACAGAATGAATGCAAATTATGACAGCTAGATCTCAAAA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACTGTGAACAGAATGAATGCAAATTATGACAGCTAGATCTCAAAA  400

seq1  TGTCAAATTCTTTGCTGACTAAACAAACATACCAAGGGGCAAACAATATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAATTCTTTGCTGACTAAACAAACATACCAAGGGGCAAACAATATG  450

seq1  GCTCAGAAGGTAAAGGTCCATGTCTTTAACCCTGATGACCTGGGGTTGAT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAGAAGGTAAAGGTCCATGTCTTTAACCCTGATGACCTGGGGTTGAT  500

seq1  TCCTGGAACTTATGGTGGATGGAGAGAACTGACTTCCACAAGTTGTTCTC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGAACTTATGGTGGATGGAGAGAACTGACTTCCACAAGTTGTTCTC  550

seq1  TGAGCTCCATATGTGCACTAAGGTGTGTGCATAAAGATGCACACCACCCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTCCATATGTGCACTAAGGTGTGTGCATAAAGATGCACACCACCCA  600

seq1  AATAAATAAATGCAATTAAAATATACAGTTGGCACAGTCTCTGGATGGCC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAATAAATGCAATTAAAATATACAGTTGGCACAGTCTCTGGATGGCC  650

seq1  TTTCCTTCAGTTTCTGTTCCACACTTTGTCTCTGTATCTCCTCCCATGGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTTCAGTTTCTGTTCCACACTTTGTCTCTGTATCTCCTCCCATGGG  700

seq1  TATTTTGTTCCCCCTTCTAAGAAGGACCTAAGTATCCACACTTTGGTCTT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTGTTCCCCCTTCTAAGAAGGACCTAAGTATCCACACTTTGGTCTT  750

seq1  CCTTCTTCTTGAGCTTCATGTGGTCTGTGAATTGTATCTTGGGCATTCCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCTTCTTGAGCTTCATGTGGTCTGTGAATTGTATCTTGGGCATTCCA  800

seq1  AGCTTCTGGACTAATATCCACTTATCAGTGAGTTTATACCATGTCTGTTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTGGACTAATATCCACTTATCAGTGAGTTTATACCATGTCTGTTC  850

seq1  TTTTGTGACTGGGTTACCTCACTCAGGATGATATTTTCTAGTTCCATCCA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTGACTGGGTTACCTCACTCAGGATGATATTTTCTAGTTCCATCCA  900

seq1  TTTGCCTAAGATTTTCATGAATTC  921
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCCTAAGATTTTCATGAATTC  924

seq1: chr6_119480251_119481354
seq2: B6Ng01-121H05.g_66_1160

seq1  GAATTCCAGATACAATTAACTTACAAAGTGAAAAGGTTAATTTAGCTCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGATACAATTAACTTACAAAGTGAAAAGGTTAATTTAGCTCAT  50

seq1  GGTTCTAAAGGTACCAGACCAAGACCAGCAGCCCACTGCTATGATCCTTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTAAAGGTACCAGACCAAGACCAGCAGCCCACTGCTATGATCCTTT  100

seq1  AGTAATGGCTTCACATAATGGCAGGAGAGCAGGGCAGAGCAAACTATTCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAATGGCTTCACATAATGGCAGGAGAGCAGGGCAGAGCAAACTATTCA  150

seq1  TCTTACAAGCTACAAGCATAGCTAGAGACAAGACAGGCCCAGACCCTTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTACAAGCTACAAGCATAGCTAGAGACAAGACAGGCCCAGACCCTTAA  200

seq1  CTGCTTCCAGGACACACCACTAATGACCACTCACAAGGTCCCATGTCCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCCAGGACACACCACTAATGACCACTCACAAGGTCCCATGTCCCA  250

seq1  GAGGACCAAGGCATGTCCACAGCAGAAGAGTCTGGGAGACAAGTCTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCAAGGCATGTCCACAGCAGAAGAGTCTGGGAGACAAGTCTTTAA  300

seq1  CACAGGGACTTTTTGGGAACACTGTTTTGACACTGTATCAAAGCACCCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGGACTTTTTGGGAACACTGTTTTGACACTGTATCAAAGCACCCCC  350

seq1  CCCCCCACCCCAGGTGGCTATAATTCACAAGTGGTAACAAGGGTGTGGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCACCCCAGGTGGCTATAATTCACAAGTGGTAACAAGGGTGTGGCT  400

seq1  AAATTAGAATCTGCACATTATTCATGGGAAAATGCTGCAGCCATTTGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAGAATCTGCACATTATTCATGGGAAAATGCTGCAGCCATTTGGAA  450

seq1  ATACAGTCTACTATTTCTCTGAAAGGTCAGGCACAGAGCAGCATGTGCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAGTCTACTATTTCTCTGAAAGGTCAGGCACAGAGCAGCATGTGCCC  500

seq1  CGGTGACTGTACTCCGTGGTACCTCCCCAACACAGAAACTTATATACACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGTGACTGTACTCCGTGGTACCTCCCCAACACAGAAACTTATATACACA  550

seq1  TGTTGCCAGTAACATCACTCACAATAGCCAAAAGCAGAAACAACCGTGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCAGTAACATCACTCACAATAGCCAAAAGCAGAAACAACCGTGAA  600

seq1  TGTCCATCAGTTGGTGAAAAGATGACTACTGGGCGAACATTCTGGAACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCATCAGTTGGTGAAAAGATGACTACTGGGCGAACATTCTGGAACAA  650

seq1  TCTGGAAGATTATTTGGACACAAAGAGAGGAAACAGCCAAACCAAGCCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAAGATTATTTGGACACAAAGAGAGGAAACAGCCAAACCAAGCCCT  700

seq1  GATGCGATCTGTAAGGGAGAAGGGCATTGTGTCCTGTTGAGTTGATTGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCGATCTGTAAGGGAGAAGGGCATTGTGTCCTGTTGAGTTGATTGAT  750

seq1  GCTTGTGCTCTTTACAGATCAACAGTGGCAAAGGGTCAGAGAAGACCACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTGCTCTTTACAGATCAACAGTGGCAAAGGGTCAGAGAAGACCACA  800

seq1  CTGACACAAAGTGATGAGCCAGCAGTTAAGCTGTCAGCCAAAAAAAAAAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||
seq2  CTGACACAAAGTGATGAGCCAGCAGTT-AGCTGTCAGCC--AAAAAAAAA  847

seq1  AAAAAGCCACCCAAAAAGAAAAACCACCC-AAAAAGAGCTAATAAAGCCA  899
      |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCCACCC-AAAAGAAAAACCACCCAAAAAAGAGCTAATAAAGCCA  896

seq1  GAGGTTTGCTTTGTCTCTGCTCTCTCATTACTGCAG-AGCAAGGT-CCTT  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||
seq2  GAGGTTTGCTTTGTCTCTGCTCTCTCATTACTGCAGAAGCAAGGTCCCTT  946

seq1  AATCCTGTGAGGCAAGCCCTCTCCCACCAGGCTACACAGCCTTGGCTGTT  997
      ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTGTTGAGCAAGCCCTCTCCCACCAGGCTACACAGCCTTGGCTGTT  996

seq1  TAGAATTTATTCTATAACAGAGCCTCACTAAATTGCTCGGGCTGGCTTGA  1047
      ||||  ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| 
seq2  TAGA--TTATTCTTTAAAAGAGCTTTACTAAATTGCTCGGGCTGGCTTG-  1043

seq1  AACTTGCCATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCAACACCACTAGGCT  1097
      |||||||||| || ||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||
seq2  AACTTGCCAT-CTTCTG-CTCAG-CTCTTGAGCAGC-ACACCACTAGGCT  1089

seq1  TAACCCA  1104
      | |||||
seq2  T-ACCCA  1095