BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-121O02
Chromosome6 (Build37)
Map Location 27,922,551 - 28,080,240
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGrm8
Upstream geneLOC100041247
Downstream gene6530409C15Rik, AA407452, LOC100041304, LOC384360, Gcc1, Arf5, Fscn3, Pax4, LOC100041350, Snd1, Lrrc4, LOC100041367, Lep, Rbm28
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-121O02.bB6Ng01-121O02.g
ACCDH925450DH925451
length9361,187
definitionDH925450|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121O02, 5' end.DH925451|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-121O02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(28,079,304 - 28,080,240)(27,922,551 - 27,923,746)
sequence
gaattcttttgttatgcaaataaccacagtctaatttatctgtttagtgg
ttgagcatcttttggatctgatattcttaatatcttccctactagtataa
atgagctttcagaactgtctctcactgatgggggatgggtgttacttgct
tgcaaacaaaaccagttattgtgctcagttgagaaagccttgggctcctt
tttgagtataatcccatagccccttattattgagtacccatgtctcagcg
gggagccggaagacagtgtagagctggtagggtcagcccaccatttcaca
gactagcaagtagaagcacacagagatgcggtgacctgttcactgtctcc
agcttgtgacaaaatgtcagaaaaagatccaattccaggcctccgttgct
ggttggggacctcactctgttctcactagggaaccatacaggtagcagtc
tgggacatagacaaaatcgcagccttaggagctgctggcagtgctttccc
agatactgttatgtgcaaagtttttactttgacatagggaacatacacat
aaaataaaacatggcccttttgccacaggcctgtaactcagacagggtat
ttgcttgtaaagactccaggtgtataggacacacagtcagtgtgggtggt
acagcacttagaagggacaaagaaggctgaggtggacgagaccatgacct
cagaatttccgcagaacaggactcacactttctgtaagtctgtcagaagc
ctgactttagttccagcacttgggaggcagaggcaggccgatctctgtga
gtttgaaaccagcctgatctacagagtgaattccaggacagccaaggtta
catacggaaaccttgtctcaaaaactaaaagctgaaggagaggaggaaga
ggaagagaaggaaaaggaggagaatgatggggcata
gaattctcttacactgtagaactcatgtgtgttcattcatggtgtcctaa
ctaagaagatgctgctaacaggatgctaagttaggcaggatcagaaccct
tgagtagaggtcaggagcaggctctgcctgatggcatcctgtcattagac
ctcatccactgggtgagcgtacagacagaggagcagatgctgccacccag
gcaaaagctggcaaagaataattgttacattgtcatccaagcctgggaaa
tcagagtgtaagagcagatccatcagtcaagtcaagggtaggacactgga
tgtttgcagtgacagaagggcccagcactcactcctgagggaaggttgca
aaactgacaaccattgtccctggcttcctctcaaagactgaacaaggctg
gaagtgctgccaagggcatgggtgatgctagggtagacaactgtgactgt
gacgttcacataagaacaagtcaaacacggatggcccaagagacgatacc
tctaatagatagacacacagatgctattgtctggcactgttcatatttca
ggcctattaaacactccacatgtatgtgctacaacaccaagttggcatgg
tctacattccattttgcgatgaagcattatctcaaaaaagttctttcttc
cgaagttatctaaagtcactcccatgatacactgcatgcaccctttgagc
ataggacctaccaaccattgccccaaagcctccttccaggtctttttgtc
atgtggactgaaagatgccttctagcagcctgttgttcttggatgtggct
tctaagtgatgcctcgaccctccaccctttaccctccatcctccaccctt
aatccttcaccatccataccctccaccaatgcaaagtcataatctacatt
tttgtttgttgtttgcttgcttgctgtatgtctgtgtctctgactcaaca
acaacagtgacctgctagaaaacagtataattcatctctctgccctcaca
actgacaaaaaaataaagcctatataatggtgggcttactagaaaatact
ggcagacactaatatttagaagggttaaaaagagtgagcatgcaatttag
tgtgtccattaatgtctaatatattcatgtttttcaaacatgtgctagct
ctacctaggcaatgtattattcaatgcttagggaaac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_28079304_28080240
seq2: B6Ng01-121O02.b_49_984 (reverse)

seq1  TATGCCCCCTCCTTCTCCTCCTTTTCCTTCTCTTCCTCTTCCTCCTCCTC  50
      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TATGCCCCATCATTCTCCTCCTTTTCCTTCTCTTCCTCTTCCTCCT-CTC  49

seq1  CTTCAGCTTTTAGTTTTTGAGACAAGGTTTCCGTATGTAACCTTGGCTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGCTTTTAGTTTTTGAGACAAGGTTTCCGTATGTAACCTTGGCTGT  99

seq1  CCTGGAATTCACTCTGTAGATCAGGCTGGTTTCAAACTCACAGAGATCGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAATTCACTCTGTAGATCAGGCTGGTTTCAAACTCACAGAGATCGG  149

seq1  CCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGAACTAAAGTCAGGCTTCTGACAGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGAACTAAAGTCAGGCTTCTGACAGAC  199

seq1  TTACAGAAAGTGTGAGTCCTGTTCTGCGGAAATTCTGAGGTCATGGTCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGAAAGTGTGAGTCCTGTTCTGCGGAAATTCTGAGGTCATGGTCTC  249

seq1  GTCCACCTCAGCCTTCTTTGTCCCTTCTAAGTGCTGTACCACCCACACTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCACCTCAGCCTTCTTTGTCCCTTCTAAGTGCTGTACCACCCACACTG  299

seq1  ACTGTGTGTCCTATACACCTGGAGTCTTTACAAGCAAATACCCTGTCTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGTGTCCTATACACCTGGAGTCTTTACAAGCAAATACCCTGTCTGA  349

seq1  GTTACAGGCCTGTGGCAAAAGGGCCATGTTTTATTTTATGTGTATGTTCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGGCCTGTGGCAAAAGGGCCATGTTTTATTTTATGTGTATGTTCC  399

seq1  CTATGTCAAAGTAAAAACTTTGCACATAACAGTATCTGGGAAAGCACTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGTCAAAGTAAAAACTTTGCACATAACAGTATCTGGGAAAGCACTGC  449

seq1  CAGCAGCTCCTAAGGCTGCGATTTTGTCTATGTCCCAGACTGCTACCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAGCTCCTAAGGCTGCGATTTTGTCTATGTCCCAGACTGCTACCTGT  499

seq1  ATGGTTCCCTAGTGAGAACAGAGTGAGGTCCCCAACCAGCAACGGAGGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTTCCCTAGTGAGAACAGAGTGAGGTCCCCAACCAGCAACGGAGGCC  549

seq1  TGGAATTGGATCTTTTTCTGACATTTTGTCACAAGCTGGAGACAGTGAAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTGGATCTTTTTCTGACATTTTGTCACAAGCTGGAGACAGTGAAC  599

seq1  AGGTCACCGCATCTCTGTGTGCTTCTACTTGCTAGTCTGTGAAATGGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCACCGCATCTCTGTGTGCTTCTACTTGCTAGTCTGTGAAATGGTGG  649

seq1  GCTGACCCTACCAGCTCTACACTGTCTTCCGGCTCCCCGCTGAGACATGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACCCTACCAGCTCTACACTGTCTTCCGGCTCCCCGCTGAGACATGG  699

seq1  GTACTCAATAATAAGGGGCTATGGGATTATACTCAAAAAGGAGCCCAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTCAATAATAAGGGGCTATGGGATTATACTCAAAAAGGAGCCCAAGG  749

seq1  CTTTCTCAACTGAGCACAATAACTGGTTTTGTTTGCAAGCAAGTAACACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCAACTGAGCACAATAACTGGTTTTGTTTGCAAGCAAGTAACACC  799

seq1  CATCCCCCATCAGTGAGAGACAGTTCTGAAAGCTCATTTATACTAGTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCCCATCAGTGAGAGACAGTTCTGAAAGCTCATTTATACTAGTAGG  849

seq1  GAAGATATTAAGAATATCAGATCCAAAAGATGCTCAACCACTAAACAGAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATATTAAGAATATCAGATCCAAAAGATGCTCAACCACTAAACAGAT  899

seq1  AAATTAGACTGTGGTTATTTGCATAACAAAAGAATTC  937
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATTAGACTGTGGTTATTTGCATAACAAAAGAATTC  936

seq1: chr6_27922551_27923746
seq2: B6Ng01-121O02.g_67_1253

seq1  GAATTCTCTTACACTGTAGAACTCATGTGTGTTCATTCATGGTGTCCTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTACACTGTAGAACTCATGTGTGTTCATTCATGGTGTCCTAA  50

seq1  CTAAGAAGATGCTGCTAACAGGATGCTAAGTTAGGCAGGATCAGAACCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAAGATGCTGCTAACAGGATGCTAAGTTAGGCAGGATCAGAACCCT  100

seq1  TGAGTAGAGGTCAGGAGCAGGCTCTGCCTGATGGCATCCTGTCATTAGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTAGAGGTCAGGAGCAGGCTCTGCCTGATGGCATCCTGTCATTAGAC  150

seq1  CTCATCCACTGGGTGAGCGTACAGACAGAGGAGCAGATGCTGCCACCCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCCACTGGGTGAGCGTACAGACAGAGGAGCAGATGCTGCCACCCAG  200

seq1  GCAAAAGCTGGCAAAGAATAATTGTTACATTGTCATCCAAGCCTGGGAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAAGCTGGCAAAGAATAATTGTTACATTGTCATCCAAGCCTGGGAAA  250

seq1  TCAGAGTGTAAGAGCAGATCCATCAGTCAAGTCAAGGGTAGGACACTGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAGTGTAAGAGCAGATCCATCAGTCAAGTCAAGGGTAGGACACTGGA  300

seq1  TGTTTGCAGTGACAGAAGGGCCCAGCACTCACTCCTGAGGGAAGGTTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGCAGTGACAGAAGGGCCCAGCACTCACTCCTGAGGGAAGGTTGCA  350

seq1  AAACTGACAACCATTGTCCCTGGCTTCCTCTCAAAGACTGAACAAGGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTGACAACCATTGTCCCTGGCTTCCTCTCAAAGACTGAACAAGGCTG  400

seq1  GAAGTGCTGCCAAGGGCATGGGTGATGCTAGGGTAGACAACTGTGACTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTGCTGCCAAGGGCATGGGTGATGCTAGGGTAGACAACTGTGACTGT  450

seq1  GACGTTCACATAAGAACAAGTCAAACACGGATGGCCCAAGAGACGATACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACGTTCACATAAGAACAAGTCAAACACGGATGGCCCAAGAGACGATACC  500

seq1  TCTAATAGATAGACACACAGATGCTATTGTCTGGCACTGTTCATATTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATAGATAGACACACAGATGCTATTGTCTGGCACTGTTCATATTTCA  550

seq1  GGCCTATTAAACACTCCACATGTATGTGCTACAACACCAAGTTGGCATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTATTAAACACTCCACATGTATGTGCTACAACACCAAGTTGGCATGG  600

seq1  TCTACATTCCATTTTGCGATGAAGCATTATCTCAAAAAAGTTCTTTCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACATTCCATTTTGCGATGAAGCATTATCTCAAAAAAGTTCTTTCTTC  650

seq1  CGAAGTTATCTAAAGTCACTCCCATGATACACTGCATGCACCCTTTGAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAGTTATCTAAAGTCACTCCCATGATACACTGCATGCACCCTTTGAGC  700

seq1  ATAGGACCTACCAACCATTGCCCCAAAGCCTCCTTCCAGGTCTTTTTGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGACCTACCAACCATTGCCCCAAAGCCTCCTTCCAGGTCTTTTTGTC  750

seq1  ATGTGGACTGAAAGATGCCTTCTAGCAGGCCTGTTGTTCTTGGATGTGGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGACTGAAAGATGCCTTCTAGCA-GCCTGTTGTTCTTGGATGTGGC  799

seq1  TTCTAAGTGATGCCTCGACCCTCCACCCTTTACCCTCCATCCTCCACCCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAAGTGATGCCTCGACCCTCCACCCTTTACCCTCCATCCTCCACCCT  849

seq1  TAATCCTTCACCATCCATACCCTCCACCAATGCAAAGTTCATAATCTACA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TAATCCTTCACCATCCATACCCTCCACCAATGCAAAG-TCATAATCTACA  898

seq1  TTTTTGTTTGTTTGTTTGCTTGCTTGCTTGTATGTCTGTGTTCTCTGACT  950
      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||
seq2  TTTTTGTTTG-TTGTTTGCTTGCTTGC-TGTATGTCTGTG-TCTCTGACT  945

seq1  C-ACAACAACAGTGACCTGCTAGAAAACAGTATAATTCATCTCTCTGCCC  999
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAACAACAGTGACCTGCTAGAAAACAGTATAATTCATCTCTCTGCCC  995

seq1  TCACAACTGACAAAAAAATATAGCCTAATAT-ATGGTGGGCTTACTAG-A  1047
      |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |
seq2  TCACAACTGACAAAAAAATAAAGCCT-ATATAATGGTGGGCTTACTAGAA  1044

seq1  GATACTGGCAGACACTTAATATTCAGAAGGGTTAAAAAAAGGAAGATGAG  1097
       |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||     ||||
seq2  AATACTGGCAGACAC-TAATATTTAGAAGGGTTAAAAAGAG-----TGAG  1088

seq1  CATGCAGATTTAGTGTGCCAATGATGGCCTAATTAATTCATG-TGTTCAA  1146
      |||||| |||||||||| | || |  | |||||  ||||||| | |||||
seq2  CATGCA-ATTTAGTGTGTCCATTAATGTCTAATATATTCATGTTTTTCAA  1137

seq1  CTATGTGCTAGCTCTATCTTAGGCAATGTATTTATC-ATGCTAAGGGAAA  1195
        |||||||||||||| | |||||||||||||  || ||||| |||||||
seq2  ACATGTGCTAGCTCTA-CCTAGGCAATGTATTATTCAATGCTTAGGGAAA  1186

seq1  C  1196
      |
seq2  C  1187