BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-126O12
Chromosome6 (Build37)
Map Location 92,256,241 - 92,389,715
singlet/doubletdoublet
Overlap genePrickle2
Upstream geneLOC665716, Wnt7a, LOC100043659, LOC625420, Chchd4, Tmem43, Xpc, Lsm3, Slc6a6, Grip2, C130022K22Rik, 4930590J08Rik, Fgd5, Nr2c2, Mrps25, Zfyve20, Trh, LOC665805
Downstream geneLOC545866, A730049H05Rik, LOC384461, LOC100043253
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-126O12.bB6Ng01-126O12.g
ACCDH929158DH929159
length1,213615
definitionDH929158|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126O12, 5' end.DH929159|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-126O12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(92,256,241 - 92,257,463)(92,389,102 - 92,389,715)
sequence
gaattctgctctctctctgtgttgttctgcatgagtcaagctagactctt
gataagacaggtctgatgtggtcgatgcatgtgtgttagttatgaacttg
aggtaggaagagtaagggaagctgcagtaagatgcattattacccaaggc
aggcttcaggttctaaagactcatagaaacactgagtgaatagggactga
gtctaatcctgttctttagtcagatacaacaaagcacctttgccttacct
acctgtctcttatggttataatttgtggcagagtgttaccaccataggtt
tggggggcaggctatgttttaatcttaagctttgtgtggtcttgggaaca
tcagctcttctgtgtctctgattttctacctacaaaatgggtactttacc
cactctatagggctattgtgctaagaccaagtaatatatgaaatgcttac
aacaaggctaaataaatactaactctccagtaaatgctatcatttctaat
attgtcaccaaagatggaaaattctactggcatggtgtgatatggtgctg
ggatcaaactcaaggtcttgtgcatactaagcaagcactctagcacagag
ctacatttccagtcaaatctctcccttaaaacttcagaacctgccatgta
agaatgaagatctgagtttaggtccccaacactcatgggaatatcaagac
acaatggcctgcatcagtgcttggaaggagtgacagggggggtctcagga
acttgttgacctggcagtctagataaaccagtcagctcaatgttcagtga
gagtcattacctcaagagaataagatggagaacaattgaagaagatactg
gatattgagttctgacctccctacatacattcacatgtgtgcatatgcac
atatatacatatgaacatgtacaaatactactaaaaattaaattcagagt
aactaaatagctagaaaaaaaacgattttagctttaatagatagcaacag
aatcttcaccagttagctgagtgcatgacttgaaaagcctaacccattta
attaacagtagaaagtgccagccacaaaggcctgttctttaataataagc
acaattccggtaccaacgcatgtttccccgtaactttgctcacatttaat
tcctacaaccctcaattctctgctccctgaagccgtgaaatgaaggtaag
gggaaagttctca
gaattcaaagtgatctacaagattttcccaattagaactctagctgccct
gtttcctattcgtggttttagcaagacttgcaagctcaaagaatgaaagg
tgactacatttgcttataatccatcaaatacacagggcagagtataatcc
tgatgtattcttggagatgataagaatgagctttgacatcagctataaat
ttaaatcctggatccacctttactctagggcatggcagatagcttataat
ttagttgatgcccattgtttgtgatcccatagtcacaaatttacctcctc
attaacatttctttgcaatccccaaatcagcatgcatagtgttttcatgg
tcattaacaggacaaagccaaggccaaatattcggcctttatacttgaga
tcatatcaaatggtctaattggtactatgttttcacatttggtaggttat
tttgtttgtttgttgggttggttacttggggttttttgcaggtgctttat
tgttcaaagtgctgtggagaattgtgatgtattctaattttcccaagggc
aagaaggctgctgtttgttttttggagaaaatatgtatgttagatactct
ttaatcaggtgtggc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_92256241_92257463
seq2: B6Ng01-126O12.b_50_1262

seq1  GAATTCTGCTCTCTCTCTGTGTTGTTCTGCATGAGTCAAGCTAGACTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTCTCTCTCTGTGTTGTTCTGCATGAGTCAAGCTAGACTCTT  50

seq1  GATAAGACAGGTCTGATGTGGTCGATGCATGTGTGTTAGTTATGAACTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGACAGGTCTGATGTGGTCGATGCATGTGTGTTAGTTATGAACTTG  100

seq1  AGGTAGGAAGAGTAAGGGAAGCTGCAGTAAGATGCATTATTACCCAAGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTAGGAAGAGTAAGGGAAGCTGCAGTAAGATGCATTATTACCCAAGGC  150

seq1  AGGCTTCAGGTTCTAAAGACTCATAGAAACACTGAGTGAATAGGGACTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTCAGGTTCTAAAGACTCATAGAAACACTGAGTGAATAGGGACTGA  200

seq1  GTCTAATCCTGTTCTTTAGTCAGATACAACAAAGCACCTTTGCCTTACCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTAATCCTGTTCTTTAGTCAGATACAACAAAGCACCTTTGCCTTACCT  250

seq1  ACCTGTCTCTTATGGTTATAATTTGTGGCAGAGTGTTACCACCATAGGTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGTCTCTTATGGTTATAATTTGTGGCAGAGTGTTACCACCATAGGTT  300

seq1  TGGGGGGCAGGCTATGTTTTAATCTTAAGCTTTGTGTGGTCTTGGGAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGGCAGGCTATGTTTTAATCTTAAGCTTTGTGTGGTCTTGGGAACA  350

seq1  TCAGCTCTTCTGTGTCTCTGATTTTCTACCTACAAAATGGGTACTTTACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCTCTTCTGTGTCTCTGATTTTCTACCTACAAAATGGGTACTTTACC  400

seq1  CACTCTATAGGGCTATTGTGCTAAGACCAAGTAATATATGAAATGCTTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCTATAGGGCTATTGTGCTAAGACCAAGTAATATATGAAATGCTTAC  450

seq1  AACAAGGCTAAATAAATACTAACTCTCCAGTAAATGCTATCATTTCTAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGGCTAAATAAATACTAACTCTCCAGTAAATGCTATCATTTCTAAT  500

seq1  ATTGTCACCAAAGATGGAAAATTCTACTGGCATGGTGTGATATGGTGCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTCACCAAAGATGGAAAATTCTACTGGCATGGTGTGATATGGTGCTG  550

seq1  GGATCAAACTCAAGGTCTTGTGCATACTAAGCAAGCACTCTAGCACAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCAAACTCAAGGTCTTGTGCATACTAAGCAAGCACTCTAGCACAGAG  600

seq1  CTACATTTCCAGTCAAATCTCTCCCTTAAAACTTCAGAACCTGCCATGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATTTCCAGTCAAATCTCTCCCTTAAAACTTCAGAACCTGCCATGTA  650

seq1  AGAATGAAGATCTGAGTTTAGGTCCCCAACACTCATGGGAATATCAAGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGAAGATCTGAGTTTAGGTCCCCAACACTCATGGGAATATCAAGAC  700

seq1  ACAATGGCCTGCATCAGTGCTTGGAAGGAGTGACAGGGGGGGTCTCAGGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATGGCCTGCATCAGTGCTTGGAAGGAGTGACAGGGGGGGTCTCAGGA  750

seq1  ACTTGTTGACCTGGCAGTCTAGATAAACCAGTCAGCTCAATGTTCAGTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGTTGACCTGGCAGTCTAGATAAACCAGTCAGCTCAATGTTCAGTGA  800

seq1  GAGTCATTACCTCAAGAGAATAAGATGGAGAACAATTGAAGAAGATACTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCATTACCTCAAGAGAATAAGATGGAGAACAATTGAAGAAGATACTG  850

seq1  GATATTGAGTTCTGACCTCCCTACATACATTCACATGTGTGCATATGCAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTGAGTTCTGACCTCCCTACATACATTCACATGTGTGCATATGCAC  900

seq1  ATATATACATATGAACATGTACAAATACTACTAAAAATTAAATTCAGAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATATACATATGAACATGTACAAATACTACTAAAAATTAAATTCAGAGT  950

seq1  AACTAAATAGCTAGAAAAAAAAAACGATTTTAGCTTTAAATAGATAGCAA  1000
      ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AACTAAATAGCTAG--AAAAAAAACGATTTTAGCTTT-AATAGATAGCAA  997

seq1  CAAGAATCTCCA-CAGTTAGCTGAGTGCCATGACTTGAAAAGCCTAACCC  1049
      | ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  C-AGAATCTTCACCAGTTAGCTGAGTG-CATGACTTGAAAAGCCTAACCC  1045

seq1  ATTTAAATATACAGTAGATAGTGCCAG-CACAAAGCCCTGTTCTTT-ATA  1097
      |||||| || |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||
seq2  ATTTAATTA-ACAGTAGAAAGTGCCAGCCACAAAGGCCTGTTCTTTAATA  1094

seq1  ATAAGCAACATTTCCGGTACCAACGCATG-TTCCCCGTAGACTTTTGCTT  1146
      |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |
seq2  ATAAGC-ACAATTCCGGTACCAACGCATGTTTCCCCGTA-AC-TTTGC-T  1140

seq1  CACATTT-ATTCCTAACAACCTCATGTCTCCTGCTCCCTAGAAGCTGAAA  1195
      ||||||| |||||||  | |||||  ||| ||||||||| ||||| |  |
seq2  CACATTTAATTCCTACAACCCTCAATTCT-CTGCTCCCT-GAAGCCGTGA  1188

seq1  ATTAGAAAGTAAAGGGAGAAAGTTCTCA  1223
      | | ||| ||||  || |||||||||||
seq2  AAT-GAAGGTAA--GGGGAAAGTTCTCA  1213

seq1: chr6_92389102_92389715
seq2: B6Ng01-126O12.g_69_683 (reverse)

seq1  GGCACACCTGACTAAAGAGTATCTAACATACATATTTTCTCCAAAAAACA  50
      | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACACCTGATTAAAGAGTATCTAACATACATATTTTCTCCAAAAAACA  50

seq1  AACAGCAGCCTTCTTGCCCTTGGGAAAATTAG-ATACATCACAATTCTCC  99
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  AACAGCAGCCTTCTTGCCCTTGGGAAAATTAGAATACATCACAATTCTCC  100

seq1  ACAGCACTTTGAACAATAAAGCACCTGCAAAAAACCCCAAGTAACCAACC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGCACTTTGAACAATAAAGCACCTGCAAAAAACCCCAAGTAACCAACC  150

seq1  CAACAAACAAACAAAATAACCTACCAAATGTGAAAACATAGTACCAATTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAAACAAACAAAATAACCTACCAAATGTGAAAACATAGTACCAATTA  200

seq1  GACCATTTGATATGATCTCAAGTATAAAGGCCGAATATTTGGCCTTGGCT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCATTTGATATGATCTCAAGTATAAAGGCCGAATATTTGGCCTTGGCT  250

seq1  TTGTCCTGTTAATGACCATGAAAACACTATGCATGCTGATTTGGGGATTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCCTGTTAATGACCATGAAAACACTATGCATGCTGATTTGGGGATTG  300

seq1  CAAAGAAATGTTAATGAGGAGGTAAATTTGTGACTATGGGATCACAAACA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGAAATGTTAATGAGGAGGTAAATTTGTGACTATGGGATCACAAACA  350

seq1  ATGGGCATCAACTAAATTATAAGCTATCTGCCATGCCCTAGAGTAAAGGT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGCATCAACTAAATTATAAGCTATCTGCCATGCCCTAGAGTAAAGGT  400

seq1  GGATCCAGGATTTAAATTTATAGCTGATGTCAAAGCTCATTCTTATCATC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATCCAGGATTTAAATTTATAGCTGATGTCAAAGCTCATTCTTATCATC  450

seq1  TCCAAGAATACATCAGGATTATACTCTGCCCTGTGTATTTGATGGATTAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAGAATACATCAGGATTATACTCTGCCCTGTGTATTTGATGGATTAT  500

seq1  AAGCAAATGTAGTCACCTTTCATTCTTTGAGCTTGCAAGTCTTGCTAAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAATGTAGTCACCTTTCATTCTTTGAGCTTGCAAGTCTTGCTAAAA  550

seq1  CCACGAATAGGAAACAGGGCAGCTAGAGTTCTAATTGGGAAAATCTTGTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGAATAGGAAACAGGGCAGCTAGAGTTCTAATTGGGAAAATCTTGTA  600

seq1  GATCACTTTGAATTC  614
      |||||||||||||||
seq2  GATCACTTTGAATTC  615