BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129G06
Chromosome6 (Build37)
Map Location 45,044,477 - 45,045,607
singlet/doubletsinglet
Overlap geneCntnap2
Upstream geneLOC100040210
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129G06.b
ACCDH930985
length1,120
definitionDH930985|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129G06, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattctattgcaaattctttttcaggagcaaattaaacatttggttttc
agactatcatatttctgtgaaagtgagaattgtgtcactggaaaacagat
gagctatactgtgaggggttgtcaatgaagccatatttaccctgaaggaa
aatatagaatttttaataaaaaaatacaatacaaactctaccccaaatat
atcaagtctcataaagtaacctcgttagcatggccatcaccttacagata
atggataattttctggtaaaggccccaatgggattctatggtgtcatttg
gaacacagaactgttagttgctcattaggtcgatagatgccaaatctgta
tttaaatttgaagttcttacaaatatgaaagcattcctctttccttataa
agcaacaaactatattgtgtcatatactttaaagcaattatgtagtcata
acttaagacaatcatttgtgaatcttgaaagagcataaatgtttttttcc
aatcaaaagtccatattaagtttttcctaccatgacgtatataagtgaaa
ctagcaaaaatctgtgtcaacactttttgtaacatacatgcacagaaagt
gaaatttcaatggtcactggaacattcataaatcccactgtatattcata
attaatagtgcaaggaagtcaagcataacaaaaaagtacaggtgcctttt
ggcaagccttatagtcagagtctagcctgactggtgaatcattgatgcca
cataaataaaaggtttgttaacagaatagagtctcatttcccaggtcact
aactgaaatttgatcctggtatgtgctttgggaaaaatagaagttaacag
atattgtactcaaatcattatttaagagtatagttaagcttcccacataa
taatgctgcagtatgagaactaaccactattcttcctgtgaggccctatc
actataactgcttctctgatcagcttgtttttttctgttgagtctgtctg
ttcagctgcacagcatctgctcccattgggtatcccatctttcagatgca
gtctacatgatgactaaaaacaagtggagagttgtgattcctccctaata
caataatctggtctcagaga
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_45044477_45045607
seq2: B6Ng01-129G06.b_49_1168 (reverse)

seq1  TCTCTGGAGACCAGATTATGTGTAATTAGGGGAGGAATCACAACTCT-CA  49
      ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||
seq2  TCTCT-GAGACCAGATTAT-TGT-ATTA-GGGAGGAATCACAACTCTCCA  46

seq1  CTTGTTTTTAGTTCATCATGTAAGACTGCATCTGAAAAGATGGGATTACC  99
      ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||
seq2  CTTGTTTTTAG-TCATCATGT-AGACTGCATCTG-AAAGATGGGA-TACC  92

seq1  CAATGGGAAGCAAGATGCTGTGCAGCCTGAACAGACAGAACTCAACAGAA  149
      ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  CAATGGG-AGC-AGATGCTGTGCAG-CTGAACAGACAG-ACTCAACAGAA  138

seq1  AAAAACAAGCTGATCAGAGAAGCAGTTATAGTGATAGGGCCTCACAGGAA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAGCTGATCAGAGAAGCAGTTATAGTGATAGGGCCTCACAGGAA  188

seq1  GGATAGTGGTTAGTTCTCATACTGCAGCATTATTATGTGGGAAGCTTAAC  249
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGTGGTTAGTTCTCATACTGCAGCATTATTATGTGGGAAGCTTAAC  238

seq1  TATACTCTTAAATAATGATTTGAGTACAATATCTGTTAACTTCTATTTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTCTTAAATAATGATTTGAGTACAATATCTGTTAACTTCTATTTTT  288

seq1  CCCAAAGCACATACCAGGATCAAATTTCAGTTAGTGACCTGGGAAATGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAAAGCACATACCAGGATCAAATTTCAGTTAGTGACCTGGGAAATGAG  338

seq1  ACTCTATTCTGTTAACAAACCTTTTATTTATGTGGCATCAATGATTCACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTATTCTGTTAACAAACCTTTTATTTATGTGGCATCAATGATTCACC  388

seq1  AGTCAGGCTAGACTCTGACTATAAGGCTTGCCAAAAGGCACCTGTACTTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGGCTAGACTCTGACTATAAGGCTTGCCAAAAGGCACCTGTACTTT  438

seq1  TTTGTTATGCTTGACTTCCTTGCACTATTAATTATGAATATACAGTGGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTATGCTTGACTTCCTTGCACTATTAATTATGAATATACAGTGGGA  488

seq1  TTTATGAATGTTCCAGTGACCATTGAAATTTCACTTTCTGTGCATGTATG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGAATGTTCCAGTGACCATTGAAATTTCACTTTCTGTGCATGTATG  538

seq1  TTACAAAAAGTGTTGACACAGATTTTTGCTAGTTTCACTTATATACGTCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAAAAAGTGTTGACACAGATTTTTGCTAGTTTCACTTATATACGTCA  588

seq1  TGGTAGGAAAAACTTAATATGGACTTTTGATTGGAAAAAAACATTTATGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGGAAAAACTTAATATGGACTTTTGATTGGAAAAAAACATTTATGC  638

seq1  TCTTTCAAGATTCACAAATGATTGTCTTAAGTTATGACTACATAATTGCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAAGATTCACAAATGATTGTCTTAAGTTATGACTACATAATTGCT  688

seq1  TTAAAGTATATGACACAATATAGTTTGTTGCTTTATAAGGAAAGAGGAAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGTATATGACACAATATAGTTTGTTGCTTTATAAGGAAAGAGGAAT  738

seq1  GCTTTCATATTTGTAAGAACTTCAAATTTAAATACAGATTTGGCATCTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCATATTTGTAAGAACTTCAAATTTAAATACAGATTTGGCATCTAT  788

seq1  CGACCTAATGAGCAACTAACAGTTCTGTGTTCCAAATGACACCATAGAAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACCTAATGAGCAACTAACAGTTCTGTGTTCCAAATGACACCATAGAAT  838

seq1  CCCATTGGGGCCTTTACCAGAAAATTATCCATTATCTGTAAGGTGATGGC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTGGGGCCTTTACCAGAAAATTATCCATTATCTGTAAGGTGATGGC  888

seq1  CATGCTAACGAGGTTACTTTATGAGACTTGATATATTTGGGGTAGAGTTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTAACGAGGTTACTTTATGAGACTTGATATATTTGGGGTAGAGTTT  938

seq1  GTATTGTATTTTTTTATTAAAAATTCTATATTTTCCTTCAGGGTAAATAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTGTATTTTTTTATTAAAAATTCTATATTTTCCTTCAGGGTAAATAT  988

seq1  GGCTTCATTGACAACCCCTCACAGTATAGCTCATCTGTTTTCCAGTGACA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTCATTGACAACCCCTCACAGTATAGCTCATCTGTTTTCCAGTGACA  1038

seq1  CAATTCTCACTTTCACAGAAATATGATAGTCTGAAAACCAAATGTTTAAT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCTCACTTTCACAGAAATATGATAGTCTGAAAACCAAATGTTTAAT  1088

seq1  TTGCTCCTGAAAAAGAATTTGCAATAGAATTC  1131
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCCTGAAAAAGAATTTGCAATAGAATTC  1120