BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-144C04
Chromosome6 (Build37)
Map Location 146,751,722 - 146,907,142
singlet/doubletdoublet
Overlap geneArntl2, 1700023A16Rik, Ppfibp1, 1700034J05Rik
Upstream geneRassf8, Bhlhb3, Sspn, Itpr2, 4933424B01Rik, Fgfr1op2, Tm7sf3, Surb7, EG626175, Stk38l, LOC621842
Downstream gene2210417D09Rik, Mrps35, EG545893, Klhdc5, EG665288, LOC100039641, Pthlh, EG622129, Ccdc91, LOC100039712, LOC100039727, LOC100039736
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-144C04.bB6Ng01-144C04.g
ACCDH941890DH941891
length1,073998
definitionDH941890|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144C04, 5' end.DH941891|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-144C04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(146,906,057 - 146,907,142)(146,751,722 - 146,752,729)
sequence
gaattcttagggtggcactggaaagctgtactgtaacaagtcctctgggt
gacaaggaagcacactcaagttcagaaaccactgacagtcaccaataaca
tctctgtgtctacgtccgtccgtctagtcgctgtattttactctgcacta
ggaactgcttggcattcaaaagctgtatttaataccagagcaagcctctt
tccccggcaatgccaccctccctgtgagatcccacactgtctgccatgag
gtgacatccaggattgtttccatagagctcgacagatactcgtgtcctta
gtgcagggggcactggccttcctgatctgagcacaccaccttgatcctac
actcacaacagagaccctgctggttactggaattcatgccagcatctggt
aatcctaggtcactgtttctcaaggtgaaatcagcaagcagaagaatcac
ctggaagacaagatggtgcagttgggagaatcatgaattccgggttagcc
tgggctacagagtatgcctgtctctctcacacaattacctggaaggtcct
gttcctagtctatttagccagcaagtcctagggatagggcatgagaatcc
acactttcaatacacagtgggattgaatttttatggccattgatgaaatg
catcttgataattaaccatgggtcaaatcaactgcttctgggtttataag
aaccctgaggtcaactaaaacaaaggggtaatttttgctctagcttgtgg
ctcacttcttaaacatttcctgtgaaacgtgaaacacccacctcacactt
tgtgttcaccctagatttacctgtgaagactctgggctaattttcttatc
agacagagttttgcctggttcaaattatggaattaaactccagggctact
gaactttacaaagctcagcccagatactgtgagacatattgacgtatttt
ctgtctactttcctttacttaagtcatttggaactgtcagttcttcaagc
tttagcaaatggagcatgggatttcaaactaacgagacatgcagaatatc
gatcaaattgtgatgtactgtaa
gaattctctcacctaacaactgaatggtgttgtcaggttcgagtgtcagc
cagaggagcagagagtcagaatacaaagcagtctggaagctcagggtggg
ctgtcagcaggcaggccgggggtctctgccgcagctgtccaccagcagtg
ttttctctaggaagaagcctcagctatgtctcaggcccttcgatggatta
ggtctgcttgggagcgtttccttgcccgatggtatcccaacagtgggaac
cagtcacctctcggctggctcgtcagaggcagtgagcccctgtgggttga
tttaggagagactaaggctggcaaactgatctatgcagggtctgctaagc
ctgcttagggaagactgagttacacaaagcttgaggtggtgctctaacca
ggcttgtagggaaccgcaggaaggaaaatgttccgcctctaacgcaactg
aggttgctgagaaaggtctccgtgaagatttgccaggaagccaccagtta
ggttcccgtcccataacaaaacaatcaggcattgtacaggccacagggca
ggatggcgggtttggtctcctcggaagcgctgaccaactctgcacatgaa
gctccctggtgggtttctgatctcactggctcatgagaggcttgcacact
gtgctggtgctgtggtggatcgggaggaagagaagatccaaaccgctaag
atatgaaatgagtgagggagattcccagccatgtcctctgtgacgatcaa
tacctaagccgctgcccaagtgagggtctgccctctacatctccccacct
gatcttgtctccaagatgtgacagctgaactttgacaggcacagaccctg
attctgacttttcctttgtcctgtggttatctgaggatgctagaggatct
gagctcatagatgattggcaagtgggacctctgtggccagccttgcatca
aactgtcctccgtgctctccatctgagtgctggggctagatttgcatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_146906057_146907142
seq2: B6Ng01-144C04.b_43_1115 (reverse)

seq1  TTACAGGTAACATCCACAATTTGATCGATA-TCTGCATGTCCTCCTTTAT  49
      ||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |   |
seq2  TTACAG--TACAT-CACAATTTGATCGATATTCTGCATGT-CTCGT---T  43

seq1  GTTTTGAAATCCCATGCTTCCATTTTGCTAAAGCTTGAAGAAACTGACAG  99
        ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGTTTGAAATCCCATGC-TCCA-TTTGCTAAAGCTTGAAG-AACTGACAG  90

seq1  TTTCCAAATGACTTAAGTAAAGGAAAGTAGACAGAAAATACCTTCAATAT  149
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||
seq2  -TTCCAAATGACTTAAGTAAAGGAAAGTAGACAGAAAATA-CGTCAATAT  138

seq1  GGTCTCACAGTATCTGGGCTGAGCTTTGTAAAGTTCAGTAGCCCTGGAGT  199
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -GTCTCACAGTATCTGGGCTGAGCTTTGTAAAGTTCAGTAGCCCTGGAGT  187

seq1  TTAATTCCATAAATTTGAACCAGGCAAAACTCTGTCTGATAAGAAAATTA  249
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCCAT-AATTTGAACCAGGCAAAACTCTGTCTGATAAGAAAATTA  236

seq1  GCCCAGAGTCTTCACAGGTAAATCTAGGGTGAACACAAAGTGTGAGGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGAGTCTTCACAGGTAAATCTAGGGTGAACACAAAGTGTGAGGTGG  286

seq1  GTGTTTCACGTTTCACAGGAAATGTTTAAGAAGTGAGCCACAAGCTAGAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTCACGTTTCACAGGAAATGTTTAAGAAGTGAGCCACAAGCTAGAG  336

seq1  CAAAAATTACCCCTTTGTTTTAGTTGACCTCAGGGTTCTTATAAACCCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAAATTACCCCTTTGTTTTAGTTGACCTCAGGGTTCTTATAAACCCAG  386

seq1  AAGCAGTTGATTTGACCCATGGTTAATTATCAAGATGCATTTCATCAATG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGTTGATTTGACCCATGGTTAATTATCAAGATGCATTTCATCAATG  436

seq1  GCCATAAAAATTCAATCCCACTGTGTATTGAAAGTGTGGATTCTCATGCC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATAAAAATTCAATCCCACTGTGTATTGAAAGTGTGGATTCTCATGCC  486

seq1  CTATCCCTAGGACTTGCTGGCTAAATAGACTAGGAACAGGACCTTCCAGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCCCTAGGACTTGCTGGCTAAATAGACTAGGAACAGGACCTTCCAGG  536

seq1  TAATTGTGTGAGAGAGACAGGCATACTCTGTAGCCCAGGCTAACCCGGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTGTGAGAGAGACAGGCATACTCTGTAGCCCAGGCTAACCCGGAA  586

seq1  TTCATGATTCTCCCAACTGCACCATCTTGTCTTCCAGGTGATTCTTCTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATGATTCTCCCAACTGCACCATCTTGTCTTCCAGGTGATTCTTCTGC  636

seq1  TTGCTGATTTCACCTTGAGAAACAGTGACCTAGGATTACCAGATGCTGGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGATTTCACCTTGAGAAACAGTGACCTAGGATTACCAGATGCTGGC  686

seq1  ATGAATTCCAGTAACCAGCAGGGTCTCTGTTGTGAGTGTAGGATCAAGGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTCCAGTAACCAGCAGGGTCTCTGTTGTGAGTGTAGGATCAAGGT  736

seq1  GGTGTGCTCAGATCAGGAAGGCCAGTGCCCCCTGCACTAAGGACACGAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTGCTCAGATCAGGAAGGCCAGTGCCCCCTGCACTAAGGACACGAGT  786

seq1  ATCTGTCGAGCTCTATGGAAACAATCCTGGATGTCACCTCATGGCAGACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTCGAGCTCTATGGAAACAATCCTGGATGTCACCTCATGGCAGACA  836

seq1  GTGTGGGATCTCACAGGGAGGGTGGCATTGCCGGGGAAAGAGGCTTGCTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGGGATCTCACAGGGAGGGTGGCATTGCCGGGGAAAGAGGCTTGCTC  886

seq1  TGGTATTAAATACAGCTTTTGAATGCCAAGCAGTTCCTAGTGCAGAGTAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATTAAATACAGCTTTTGAATGCCAAGCAGTTCCTAGTGCAGAGTAA  936

seq1  AATACAGCGACTAGACGGACGGACGTAGACACAGAGATGTTATTGGTGAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACAGCGACTAGACGGACGGACGTAGACACAGAGATGTTATTGGTGAC  986

seq1  TGTCAGTGGTTTCTGAACTTGAGTGTGCTTCCTTGTCACCCAGAGGACTT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAGTGGTTTCTGAACTTGAGTGTGCTTCCTTGTCACCCAGAGGACTT  1036

seq1  GTTACAGTACAGCTTTCCAGTGCCACCCTAAGAATTC  1086
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACAGTACAGCTTTCCAGTGCCACCCTAAGAATTC  1073

seq1: chr6_146751722_146752729
seq2: B6Ng01-144C04.g_68_1065

seq1  GAATTCTCTCACCTAACAACTGAATGGTGTTGTCAGGTTCGAGTGTCAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTCACCTAACAACTGAATGGTGTTGTCAGGTTCGAGTGTCAGC  50

seq1  CAGAGGAGCAGAGAGTCAGAATACAAAGCAGTCTGGAAGCTCAGGGTGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGCAGAGAGTCAGAATACAAAGCAGTCTGGAAGCTCAGGGTGGG  100

seq1  CTGTCAGCAGGCAGGCCGGGGGTCTCTGCCGCAGCTGTCCACCAGCAGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCAGCAGGCAGGCCGGGGGTCTCTGCCGCAGCTGTCCACCAGCAGTG  150

seq1  TTTTCTCTAGGAAGAAGCCTCAGCTATGTCTCAGGCCCTTCGATGGATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTCTAGGAAGAAGCCTCAGCTATGTCTCAGGCCCTTCGATGGATTA  200

seq1  GGTCTGCTTGGGAGCGTTTCCTTGCCCGATGGTATCCCAACAGTGGGAAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGCTTGGGAGCGTTTCCTTGCCCGATGGTATCCCAACAGTGGGAAC  250

seq1  CAGTCACCTCTCGGCTGGCTCGTCAGAGGCAGTGAGCCCCTGTGGGTTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACCTCTCGGCTGGCTCGTCAGAGGCAGTGAGCCCCTGTGGGTTGA  300

seq1  TTTAGGAGAGACTAAGGCTGGCAAACTGATCTATGCAGGGTCTGCTAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGAGAGACTAAGGCTGGCAAACTGATCTATGCAGGGTCTGCTAAGC  350

seq1  CTGCTTAGGGAAGACTGAGTTACACAAAGCTTGAGGTGGTGCTCTAACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTAGGGAAGACTGAGTTACACAAAGCTTGAGGTGGTGCTCTAACCA  400

seq1  GGCTTGTAGGGAACCGCAGGAAGGAAAATGTTCCGCCTCTAACGCAACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTAGGGAACCGCAGGAAGGAAAATGTTCCGCCTCTAACGCAACTG  450

seq1  AGGTTGCTGAGAAAGGTCTCCGTGAAGATTTGCCAGGAAGCCACCAGTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTGCTGAGAAAGGTCTCCGTGAAGATTTGCCAGGAAGCCACCAGTTA  500

seq1  GGTTCCCGTCCCATAACAAAACAATCAGGCATTGTACAGGCCACAGGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCCCGTCCCATAACAAAACAATCAGGCATTGTACAGGCCACAGGGCA  550

seq1  GGATGGCGGGTTTGGTCTCCTCGGAAGCGCTGACCAACTCTGCACATGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGCGGGTTTGGTCTCCTCGGAAGCGCTGACCAACTCTGCACATGAA  600

seq1  GCTCCCTGGTGGGTTTCTGATCTCACTGGCTCATGAGAGGCTTGCACACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTGGTGGGTTTCTGATCTCACTGGCTCATGAGAGGCTTGCACACT  650

seq1  GTGCTGGTGCTGTGGTGGATCGGGAGGAAGAGAAGATCCAAACCGCTAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTGGTGCTGTGGTGGATCGGGAGGAAGAGAAGATCCAAACCGCTAAG  700

seq1  ATATGAAATGAGTGAGGGAGATTCCCAGCCATGTCCTCTGTGACGATCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAATGAGTGAGGGAGATTCCCAGCCATGTCCTCTGTGACGATCAA  750

seq1  TACCTAAGCCGCTGCCCAAGTGAGGGTCTGCCCTCTACATCTCCCCACCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAAGCCGCTGCCCAAGTGAGGGTCTGCCCTCTACATCTCCCCACCT  800

seq1  GATCTTGTCTCCAAGATGTGACAGCTGAACTTTGACAGGCACAGAGCCTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GATCTTGTCTCCAAGATGTGACAGCTGAACTTTGACAGGCACAGACCCTG  850

seq1  ATTCTGACTTTTCCTTTGGTCCTGTGGTTTATCTGAGGATGCTAGAGGAT  900
      ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGACTTTTCCTTT-GTCCTGTGG-TTATCTGAGGATGCTAGAGGAT  898

seq1  CTGAGCTCATAGATGATTGGCAAGTGGGACCTCCTGTGGCCCAGCCTTGC  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2  CTGAGCTCATAGATGATTGGCAAGTGGGACCT-CTGTGG-CCAGCCTTGC  946

seq1  TTCAAACCTGCCCTCCCGTGCCTCTCCCTCCTGAGTGCTGGGGCTAGAGT  1000
       ||||| ||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||  
seq2  ATCAAA-CTGTCCT-CCGTG-CTCTCCAT-CTGAGTGCTGGGGCTAGA--  990

seq1  TTTGCATG  1008
      ||||||||
seq2  TTTGCATG  998