BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-147B15
Chromosome6 (Build37)
Map Location 18,103,385 - 18,266,345
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC636450, LOC100040751, Cftr
Upstream geneEG232599, Cav2, Cav1, Met, Capza2, St7, Wnt2, Asz1, LOC386426
Downstream geneCttnbp2, EG545829, Lsm8, Ankrd7, LOC626180
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-147B15.bB6Ng01-147B15.g
ACCDH944074DH944075
length924818
definitionDH944074|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147B15, 5' end.DH944075|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-147B15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,265,421 - 18,266,345)(18,103,385 - 18,104,203)
sequence
gaattctttacttgctcagatcattcagtcagtacttatcaaaaaccacc
cagggatccaactactgcaggaacaacagagagcagggcatgattccata
atcataggagatatggagtagccaagaggtgaattttgattcagtgtagg
aaattttgaggagccgaggcatagctatacctaggaaagtctcttttccc
aaagcaggagggtcaggatggagttcagaacaaagtgatgtgtgaaggaa
ggcttgaatggtgagaaggagcaggagtagtgctctgcaagggtttccca
ggtccagaaaccagaaggtaaaaagcagaaacaactgccccaacccgtac
catagaacagagagcagcacactgtgctctaaagaaaattaaaattcaca
gtagtggactcacaggacacatgggggctggggctgaaagtagagcagca
aagaccaaatcataaaggtcctttaagcagtcagtgtacaacaggaaccc
tgtccagcagcagcacagggaggggtgagaagtaggctaaagatgcagcc
tttagaaagccattgcatacactagcaagattttatcgaaaggacccaga
tgtagctgtctcttgtgagactatgccggggcctagcaaacacagaagtg
gatgctcacagtcagctattggatggaccacagggctcccaatggaggag
ctagagaaagtacccaaggagctaaagggatctgcaaccctataggtgga
acaacattatgaactaaccagtaccccgaagctcttgactctagctgcat
aggtatcaaaagatggcctagttggccatcactggaaagagaggcccatt
ggacacgcaaactgtatatgccccagtacaggggaacgccagggcaaaaa
atgggaatgggtggggtagggaag
gaattcctgctctgttttgagggaaggaagggaagatctgtgcattgaat
aagttccagaacctgatataactcttcatattcctcagcctgtctttgat
aggagtgagaaatatccaggatcttttgagagaaacttggctgtgatatt
tcccattcttgaagcttctggattttgtttgtttatttgtttgcttttgt
tttatatttataattagtattgttaataagtaaaaattaaatgcaatcga
gattgtacacactttttaaaaagaataactgatgataaattagtgctagt
agtgaaagaatgtagttatacaactggttcaaagttatctgagggaaata
ttttcttattctcaacaggtatttttttgtgactgtatctaatagctgta
gagaacatcttgtttttgacactaatccacaagtggggtagtcatgcagt
cctggggtagggataaagaagtggagatttaagactacaatagattttga
gaaggatattaatgctcaccacttactttaggatccaaaagctaatactt
tgctttgtccaagttttagtcaaacttaattctaagatattagatgttgc
accagcgtctgccttttttcccccctgcatcctcaacaagacaaatagcc
gataggcttttcagaaacattggtggaactagaaagtatccttattggag
ggattcatttcttttccttgctttgaaaaaaaaaaaaggttagaatttgt
ctcatgattataatgttgtacatctatgccttttgccatgttatgttatg
atgtatatgtgtatgctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_18265421_18266345
seq2: B6Ng01-147B15.b_48_971 (reverse)

seq1  CTTCCCTA-CCCACCCATTCCCATTTTTTTGGCCCTGGCGTTCCCCTGTA  49
      |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTACCCCACCCATTCCCATTTTTT--GCCCTGGCGTTCCCCTGTA  48

seq1  CTGGGGCATATACAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATG  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCATATACAGTTTGCGTGTCCAATGGGCCTCTCTTTCCAGTGATG  98

seq1  GCCAACTAGGCCATCTTTTGATACCTATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTTCG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAACTAGGCCATCTTTTGATACCTATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTTCG  148

seq1  GGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTACTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGATCCC  198

seq1  TTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGCTCCTTGGGTACTTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGAGCCCTGTGGT  248

seq1  CCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCG  298

seq1  GCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGTCTCACAAGAGACAGCTACATCTGGGTCCTTTCGATAAAATCTT  348

seq1  GCTAGTGTATGCAATGGCTTTCTAAAGGCTGCATCTTTAGCCTACTTCTC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGTGTATGCAATGGCTTTCTAAAGGCTGCATCTTTAGCCTACTTCTC  398

seq1  ACCCCTCCCTGTGCTGCTGCTGGACAGGGTTCCTGTTGTACACTGACTGC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCTCCCTGTGCTGCTGCTGGACAGGGTTCCTGTTGTACACTGACTGC  448

seq1  TTAAAGGACCTTTATGATTTGGTCTTTGCTGCTCTACTTTCAGCCCCAGC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGACCTTTATGATTTGGTCTTTGCTGCTCTACTTTCAGCCCCAGC  498

seq1  CCCCATGTGTCCTGTGAGTCCACTACTGTGAATTTTAATTTTCTTTAGAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCATGTGTCCTGTGAGTCCACTACTGTGAATTTTAATTTTCTTTAGAG  548

seq1  CACAGTGTGCTGCTCTCTGTTCTATGGTACGGGTTGGGGCAGTTGTTTCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTGTGCTGCTCTCTGTTCTATGGTACGGGTTGGGGCAGTTGTTTCT  598

seq1  GCTTTTTACCTTCTGGTTTCTGGACCTGGGAAACCCTTGCAGAGCACTAC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTTTACCTTCTGGTTTCTGGACCTGGGAAACCCTTGCAGAGCACTAC  648

seq1  TCCTGCTCCTTCTCACCATTCAAGCCTTCCTTCACACATCACTTTGTTCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCTCCTTCTCACCATTCAAGCCTTCCTTCACACATCACTTTGTTCT  698

seq1  GAACTCCATCCTGACCCTCCTGCTTTGGGAAAAGAGACTTTCCTAGGTAT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTCCATCCTGACCCTCCTGCTTTGGGAAAAGAGACTTTCCTAGGTAT  748

seq1  AGCTATGCCTCGGCTCCTCAAAATTTCCTACACTGAATCAAAATTCACCT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATGCCTCGGCTCCTCAAAATTTCCTACACTGAATCAAAATTCACCT  798

seq1  CTTGGCTACTCCATATCTCCTATGATTATGGAATCATGCCCTGCTCTCTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCTACTCCATATCTCCTATGATTATGGAATCATGCCCTGCTCTCTG  848

seq1  TTGTTCCTGCAGTAGTTGGATCCCTGGGTGGTTTTTGATAAGTACTGACT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTCCTGCAGTAGTTGGATCCCTGGGTGGTTTTTGATAAGTACTGACT  898

seq1  GAATGATCTGAGCAAGTAAAGAATTC  925
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGATCTGAGCAAGTAAAGAATTC  924

seq1: chr6_18103385_18104203
seq2: B6Ng01-147B15.g_69_886

seq1  GAATTCCTGCTCTGTTTTGAGGGAAGGAAGGGAAGATCTGTGCATTGAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGCTCTGTTTTGAGGGAAGGAAGGGAAGATCTGTGCATTGAAT  50

seq1  AAGTTCCAGAACCTGATATAACTCTTCATATTCCTCAGCCTGTCTTTGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCCAGAACCTGATATAACTCTTCATATTCCTCAGCCTGTCTTTGAT  100

seq1  AGGAGTGAGAAATATCCAGGATCTTTTGAGAGAAACTTGGCTGTGATATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGTGAGAAATATCCAGGATCTTTTGAGAGAAACTTGGCTGTGATATT  150

seq1  TCCCATTCTTGAAGCTTCTGGATTTTGTTTGTTTATTTGTTTGCTTTTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCATTCTTGAAGCTTCTGGATTTTGTTTGTTTATTTGTTTGCTTTTGT  200

seq1  TTTATATTTATAATTAGTATTGTTAATAAGTAAAAATTAAATGCAATCGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATATTTATAATTAGTATTGTTAATAAGTAAAAATTAAATGCAATCGA  250

seq1  GATTGTACACACTTTTTAAAAAGAATAACTGATGATAAATTAGTGCTAGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGTACACACTTTTTAAAAAGAATAACTGATGATAAATTAGTGCTAGT  300

seq1  AGTGAAAGAATGTAGTTATACAACTGGTTCAAAGTTATCTGAGGGAAATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAAGAATGTAGTTATACAACTGGTTCAAAGTTATCTGAGGGAAATA  350

seq1  TTTTCTTATTCTCAACAGGTATTTTTTTGTGACTGTATCTAATAGCTGTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTATTCTCAACAGGTATTTTTTTGTGACTGTATCTAATAGCTGTA  400

seq1  GAGAACATCTTGTTTTTGACACTAATCCACAAGTGGGGTAGTCATGCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACATCTTGTTTTTGACACTAATCCACAAGTGGGGTAGTCATGCAGT  450

seq1  CCTGGGGTAGGGATAAAGAAGTGGAGATTTAAGACTACAATAGATTTTGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGTAGGGATAAAGAAGTGGAGATTTAAGACTACAATAGATTTTGA  500

seq1  GAAGGATATTAATGCTCACCACTTACTTTAGGATCCAAAAGCTAATACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGATATTAATGCTCACCACTTACTTTAGGATCCAAAAGCTAATACTT  550

seq1  TGCTTTGTCCAAGTTTTAGTCAAACTTAATTCTAAGATATTAGATGTTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTGTCCAAGTTTTAGTCAAACTTAATTCTAAGATATTAGATGTTGC  600

seq1  ACCAGCGTCTGCCTTTTTTCCCCCCTGCATCCTCAACAAGACAAATAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGCGTCTGCCTTTTTTCCCCCCTGCATCCTCAACAAGACAAATAGCC  650

seq1  GATAGGCTTTTCAGAAACATTGGTGGAACTAGAAAGTATCCTTATTGGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGCTTTTCAGAAACATTGGTGGAACTAGAAAGTATCCTTATTGGAG  700

seq1  GGATTCATTTCTTTTCCTTGCTTTGAAAAAAAAAAAAGGTTAGAATTTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTCATTTCTTTTCCTTGCTTTGAAAAAAAAAAAAGGTTAGAATTTGT  750

seq1  CTCATGATTATAATGTTGTACATCTATGCCTTTTGCCATGTTTATGTAAT  800
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||
seq2  CTCATGATTATAATGTTGTACATCTATGCCTTTTGCCATG-TTATGTTAT  799

seq1  GATGTATATGTGTATGCTC  819
      |||||||||||||||||||
seq2  GATGTATATGTGTATGCTC  818