BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-150D07
Chromosome6 (Build37)
Map Location 74,953,906 - 75,126,794
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream genenone
Downstream geneEG668132, LOC668136, LOC621306, LOC100042942, LOC668143, EG668145, EG546907
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-150D07.bB6Ng01-150D07.g
ACCDH946346DH946347
length1,1341,089
definitionDH946346|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150D07, 5' end.DH946347|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-150D07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,125,656 - 75,126,794)(74,953,906 - 74,954,923)
sequence
gaattcacattatgccctaggaaggactgagtgaatacaataacaaacat
attttttttcttttactcaaacataatgaactatgtggctgatcaacaat
acttagtggttgcccgaatgcataagcttgttatatataactctggagtc
accatttgattgtctaaaagaggcaaatgtatttttgtgggtttgtgtct
atgtgagtgcttataaagtatgaaaacatatgtataagcaaaagtggtat
atgccagtgatattgagaaatcctaatggtcagtggagcgtgtgacttct
gtagagcctcttttctctacccaaagaactagcaacatttaagatggaga
ataccatttggattagttgccatgataaatctgatgtgaggaattcacga
taatcaagcagcatatattttcctgccaaatgccagtagtgggagagagc
tctgggagatggctcagcagtttaaagttcttactgttcctgcagaagga
ccaggctttgtcccctgcccaccctcatccaacagtttgtaaatactcta
gttctaagggatcaatgggctatgccttctcagctatttgcaggcattac
atacacatggtgcacatgcatgtttgacaacacatatgaaataagatatt
tatatttaaattttaattattaattttatgattataatactgcattcata
ttttagctgatcagtttctctcaggtattcctattttagatagtcagttt
ccatcctaaattatctttgctgatacagttttgcctgggaaacactttga
agagctgtttaccttggctgtgaagtagttcaacttgtcttatatgaaag
tattgccaacagattctagactttgtacatttgaattaattccggctgaa
atcaagttagatattgtgtgttcacatcactgaccgcgtttagaatacta
agtagaggcacatatgatttgcacagcagcatctgtataggctttagctg
tagactatatcactaggagcagaactcagaggatgacttgagcttttcaa
gcttcatcacatttttctttcgatggattcatccatcttccttcttcggg
gatagttaaacctaatcacaaggagcactccagc
gaattctttgttcagttctgagccccattttttaatggggttatttgatt
ttctgaagtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtccc
ctatctgatttaggataggtaaagatcctttcccaatctgttggtggtct
ttttgtcttattgacagtgtcttttgccttgcagaaactttggagtttca
ttaggtcccatttgtcaattctcgatcttacagcacaagccattgctgtt
ctgttcaagaatttttcccctgtgcccatatcttcaaggcttttccccac
tttctcctctataagtttcagtgtctcttgttttatgtgaagttccttga
tccacttagatttgaccttagtacaaggagataagtatggatcgattcgc
attcttctacatgataacaaccagttgtgccagcaccatttgttgaaaat
gctgtctttcttccactggatggttttagctcccttgtcgaagatcaagt
gaccacaggtgtgtgggttcatttctgggtcttcaattctattccattgg
tctacttgtctgtctttataccagaaaaaaaaaaaagagagagagagagg
agagacaatttggtacaggatagtggaaggacttctgctattgatttttc
tacttgttcctgttaatattatgtttacaattctaaccaatcccgtaagg
tctaaaaattaaaaaggaatgttcttacatctttcatgatggaaagaaaa
aataaataaatcagactttacttgctgagtacatgatcctgtggagagaa
atctttagagatgcactaaaacttataaaaatttaaaggttacaaaatac
atgttcaatatatatacaaaaaatgtcttatatccatgtaatggcaataa
aagtaatccaatattgaaaaaactgtaacatcagacaggcgtggtggcac
acatctttaatcccagcactcggaagcagaggcagcagatttctgagtcg
agcatctgatctatagagtgagatccaggtcagcaggctatacagagaaa
ccctgtctcaaaaacccaacctaaggaacaaacaacaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr6_75125656_75126794
seq2: B6Ng01-150D07.b_45_1178 (reverse)

seq1  GCTGGAGTGCTTCCTGTGATTAAGTTTAACTACTCCCGGAGAAGGGAGAT  50
      ||||||||||| | |||||||| |||||||||  |||| |||||| ||||
seq2  GCTGGAGTGCTCCTTGTGATTAGGTTTAACTATCCCCGAAGAAGGAAGAT  50

seq1  GGATGAATCCATCTGAAGGAAAATGTGATGAAAGCTTGAAAAGGCTCCAA  100
      |||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||
seq2  GGATGAATCCATCGAAAGAAAAATGTGATG-AAGCTTGAAAA-GCT-CAA  97

seq1  GTCATCCTCTGAGTTCTTGCTTCCTAGTGATATAGTCTACAGCTAAAGCC  150
      |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATCCTCTGAGTTC-TGC-TCCTAGTGATATAGTCTACAGCTAAAGCC  145

seq1  TATACAGATGCTGCTGTGCAAATCATATGTGCCTCTACTTAGTATTCTAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAGATGCTGCTGTGCAAATCATATGTGCCTCTACTTAGTATTCTAA  195

seq1  ACGCGGTCAGTGATGTGAACACACAATATCTAACTTGATTTCAGCCGGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGCGGTCAGTGATGTGAACACACAATATCTAACTTGATTTCAGCCGGAA  245

seq1  TTAATTCAAATGTACAAAGTCTAGAATCTGTTGGCAATACTTTCATATAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCAAATGTACAAAGTCTAGAATCTGTTGGCAATACTTTCATATAA  295

seq1  GACAAGTTGAACTACTTCACAGCCAAGGTAAACAGCTCTTCAAAGTGTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGTTGAACTACTTCACAGCCAAGGTAAACAGCTCTTCAAAGTGTTT  345

seq1  CCCAGGCAAAACTGTATCAGCAAAGATAATTTAGGATGGAAACTGACTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCAAAACTGTATCAGCAAAGATAATTTAGGATGGAAACTGACTAT  395

seq1  CTAAAATAGGAATACCTGAGAGAAACTGATCAGCTAAAATATGAATGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAATAGGAATACCTGAGAGAAACTGATCAGCTAAAATATGAATGCAG  445

seq1  TATTATAATCATAAAATTAATAATTAAAATTTAAATATAAATATCTTATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATAATCATAAAATTAATAATTAAAATTTAAATATAAATATCTTATT  495

seq1  TCATATGTGTTGTCAAACATGCATGTGCACCATGTGTATGTAATGCCTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATGTGTTGTCAAACATGCATGTGCACCATGTGTATGTAATGCCTGC  545

seq1  AAATAGCTGAGAAGGCATAGCCCATTGATCCCTTAGAACTAGAGTATTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGCTGAGAAGGCATAGCCCATTGATCCCTTAGAACTAGAGTATTTA  595

seq1  CAAACTGTTGGATGAGGGTGGGCAGGGGACAAAGCCTGGTCCTTCTGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACTGTTGGATGAGGGTGGGCAGGGGACAAAGCCTGGTCCTTCTGCAG  645

seq1  GAACAGTAAGAACTTTAAACTGCTGAGCCATCTCCCAGAGCTCTCTCCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGTAAGAACTTTAAACTGCTGAGCCATCTCCCAGAGCTCTCTCCCA  695

seq1  CTACTGGCATTTGGCAGGAAAATATATGCTGCTTGATTATCGTGAATTCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGGCATTTGGCAGGAAAATATATGCTGCTTGATTATCGTGAATTCC  745

seq1  TCACATCAGATTTATCATGGCAACTAATCCAAATGGTATTCTCCATCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCAGATTTATCATGGCAACTAATCCAAATGGTATTCTCCATCTTA  795

seq1  AATGTTGCTAGTTCTTTGGGTAGAGAAAAGAGGCTCTACAGAAGTCACAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTTGCTAGTTCTTTGGGTAGAGAAAAGAGGCTCTACAGAAGTCACAC  845

seq1  GCTCCACTGACCATTAGGATTTCTCAATATCACTGGCATATACCACTTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCACTGACCATTAGGATTTCTCAATATCACTGGCATATACCACTTTT  895

seq1  GCTTATACATATGTTTTCATACTTTATAAGCACTCACATAGACACAAACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTATACATATGTTTTCATACTTTATAAGCACTCACATAGACACAAACC  945

seq1  CACAAAAATACATTTGCCTCTTTTAGACAATCAAATGGTGACTCCAGAGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAAATACATTTGCCTCTTTTAGACAATCAAATGGTGACTCCAGAGT  995

seq1  TATATATAACAAGCTTATGCATTCGGGCAACCACTAAGTATTGTTGATCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATAACAAGCTTATGCATTCGGGCAACCACTAAGTATTGTTGATCA  1045

seq1  GCCACATAGTTCATTATGTTTGAGTAAAAGAAAAAAAATATGTTTGTTAT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACATAGTTCATTATGTTTGAGTAAAAGAAAAAAAATATGTTTGTTAT  1095

seq1  TGTATTCACTCAGTCCTTCCTAGGGCATAATGTGAATTC  1139
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCACTCAGTCCTTCCTAGGGCATAATGTGAATTC  1134

seq1: chr6_74953906_74954923
seq2: B6Ng01-150D07.g_148_1156

seq1  ATATGTTGGATATTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTGGATATTAGTCCCCTATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTT  50

seq1  TCCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAATCTGTTGGTGGTCTTTTTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCCTT  100

seq1  GCAGAAACTTTGGAGTTTCATTAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAAACTTTGGAGTTTCATTAGGTCCCATTTGTCAATTCTCGATCTTA  150

seq1  CAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGTTCAAGAATTTTTCCCCTGTGCCCATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACAAGCCATTGCTGTTCTGTTCAAGAATTTTTCCCCTGTGCCCATA  200

seq1  TCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCAAGGCTTTTCCCCACTTTCTCCTCTATAAGTTTCAGTGTCTCTTG  250

seq1  TTTTATGTGAAGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATGTGAAGTTCCTTGATCCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAG  300

seq1  ATAAGTATGGATCGATTCGCATTCTTCTACATGATAACAACCAGTTGTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTATGGATCGATTCGCATTCTTCTACATGATAACAACCAGTTGTGC  350

seq1  CAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCACCATTTGTTGAAAATGCTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGC  400

seq1  TCCCTTGTCGAAGATCAAGTGACCACAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTGTCGAAGATCAAGTGACCACAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGT  450

seq1  CTTCAATTCTATTCCATTGGTCTACTTGTCTGTCTTTATACCAGAAAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAATTCTATTCCATTGGTCTACTTGTCTGTCTTTATACCAGAAAAAA  500

seq1  AAAAAAGAGAGAGAGAGAGGAGAGACAATTTGGTACAGGATAGTGGAAGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGAGAGAGAGAGAGGAGAGACAATTTGGTACAGGATAGTGGAAGG  550

seq1  ACTTCTGCTATTGATTTTTCTACTTGTTCCTGTTAATATTATGTTTACAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTGCTATTGATTTTTCTACTTGTTCCTGTTAATATTATGTTTACAA  600

seq1  TTCTAACCAATCCCGTAAGGTCTAAAAATTAAAAAGGAATGTTCTTACAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTAACCAATCCCGTAAGGTCTAAAAATTAAAAAGGAATGTTCTTACAT  650

seq1  CTTTCATGATGGAAAGAAAAAATAAATAAATCAGACTTTACTTGCTGAGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCATGATGGAAAGAAAAAATAAATAAATCAGACTTTACTTGCTGAGT  700

seq1  ACATGATCCTGTGGAGAGAAATCCTTAGAGATGCACTAAAACTTATAAAA  750
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGATCCTGTGGAGAGAAATCTTTAGAGATGCACTAAAACTTATAAAA  750

seq1  ATTTAAAGGTTACAAAATACATGTTCAATATATATACAAAAAATGTCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAGGTTACAAAATACATGTTCAATATATATACAAAAAATGTCTTA  800

seq1  TATCCATGTAATGGCAATAAAAGTAATCCAATATTGAAAAAAACTGTAAC  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TATCCATGTAATGGCAATAAAAGTAATCCAATATTG-AAAAAACTGTAAC  849

seq1  ATCCAGACAGGCGTGGTGGCACACACCTTTAATCCCAGCACTCGGAGGCA  900
      || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||
seq2  AT-CAGACAGGCGTGGTGGCACACATCTTTAATCCCAGCACTCGGAAGCA  898

seq1  GAGGCAGGCAGATTTCTGAGTTCGAGGCCAATCTGATCTATAGAGTGAGA  950
      |||||| ||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCA-GCAGATTTCTGAG-TCGAG---CATCTGATCTATAGAGTGAGA  943

seq1  TCCAGGTCAGCCAGGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAAACCAAAA  1000
      |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||
seq2  TCCAGGTCAGC--AGGCTATACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAACCC--AA  989

seq1  CTAAAAGAACAA--AACAAA  1018
      |  || ||||||  ||||||
seq2  CCTAAGGAACAAACAACAAA  1009